基因總覽
TRIM10（tripartite motif containing 10）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 TRIM/RBCC 家族，長 481 個胺基酸。蛋白質含有 RING-type zinc finger、B box-type zinc finger，以及位於 C 端的 B30.2/SPRY domain，具 E3 ubiquitin-protein ligase 活性。這些名稱與結構特徵界定了其家族及蛋白質基本性質；具體的分子作用與生物學角色如下述功能所述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000449742 ★ | 30,151,943–30,161,211 | 7 |
| ENST00001137542 | 30,151,943–30,161,288 | 7 |
| ENST00000376704 | 30,151,945–30,161,288 | 8 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
TRIM10 是 E3 ubiquitin-protein ligase，可催化 ubiquitin 從 E2 ubiquitin-conjugating enzyme 轉移至受體蛋白的 lysine。來源將其描述為終末紅系細胞分化與存活所必需的因子，但此項功能標註為依相似性推定，應保留其推論性質。
在 cGAS-STING 訊號中，TRIM10 透過促進 STING1 的 Lys-27 與 Lys-29 連結型多聚泛素化，正向調節此訊號並促進 STING1 活化。這項作用使 TRIM10 的泛素化酵素活性與免疫訊號調節相連；資料未進一步說明其對下游反應的具體影響。
TRIM10 也參與干擾素/JAK/STAT 訊號途徑的免疫反應調節。它可抑制 STAT1 與 STAT2 的磷酸化，而且這項作用不依賴其 E3 ligase 活性。機制上，TRIM10 與 IFNAR1 的細胞內結構域互作，並抑制 TYK2 與 IFNAR1 的結合，從而限制此途徑中的受體相關訊號作用。
此外，TRIM10 可能直接結合 PTEN，促進 PTEN 泛素化及其蛋白酶體降解，並因此活化 hypertrophic signaling。這項描述同樣標註為依相似性推定，故其結合、降解及訊號結果應視為來源提出的可能作用，而非此處已確立的普遍結論。
Promoter 與基因調控
>TRIM10 ENST00000449742 GRCh38 chr6:30161111-30162211 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCCTCCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCGGCC AGCACGCCAGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAACCAGGATGGTCTA GATTTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGC GCCCGGCCAACACACCGGATTTCAAAGGCTTTTCACAAATTTAAAAATGTAAAATATCTTATTAATGACT TTTTATATGGATCACATATTGAAATGATAATATTTTGGAAATATAGGACTAAATAAAATAACATCATTAA AATTACTTTCACCTGTTTAGACTATTTTTATATGGCCACTAGGAAATTTTAAATTGCATATGTGGCTCAC TTTGCGTTTATGTTGAATAGCATTGCTCGGAAGACAGATCTGACAGCAAATTATTTATGGTCACTCACCT TCTTACTTGTGTGCCTAGGGCAAGCTGAATAACCTGGCTGGGCCTCAGCTTTCTCATTTATGAAATGGAG ATCCTAATAGCACTGATGTTGCAGAGCAGACACAGAAATAAGATCATACTTTTAAATTGCTTGTATCAAT GTAAGTTGTACCGTCATTGTAAATAAATTCTGGCCAAATTGCTTGTATCAATGTAAGTTGTACCGTCATT GTAAATAAATTCTGGCCGTTAGTAGTTTTCTTTCTCCTCCCCATCATAGGGAATATTCCAGCCTCTTTTG AGGCCTGCAGCAGGCCAGTTGAGGCATCACCATTGAAGTTGCTGGTGCAGTGTACACCCTGGCACAAGGA CCTTATCTGAGCCCCCACACTCTCCTGCTTGCTGATGGGCAAGCCCTGGGCTGGCTGATACCTCCAATCT CTTTGGAGACAGCTGGCCATATGGCAGAAAGGCTGGAATGGCATCTCCACTCTGTGACCCAGTCTCCCAC TTGCCCCCAAAAGAATATTTCTTCTGACAGTGGACAGCTGACATATCACCACTTTCCTTCTACTGTGAGT GTCTCTGGATGGGCAGAAAGGAATGGCCAGCCCCTGGTTATGGTCATCTAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TRIM10_2 ↗ | 6:30,160,899 | 負股 | 30,160,889–30,160,948 |
| TRIM10_1 ↗ | 6:30,161,211 | 負股 | 30,161,201–30,161,260 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9FZ6R · enhancer · 30156201–30156556 · regulatory
ENSR6_9FZ8R · promoter · 30163060–30163556 · regulatory
· motif · 30161364–30161370 · motif
· motif · 30163043–30163053 · motif
· motif · 30163146–30163156 · motif
· motif · 30163201–30163216 · motif
· motif · 30163325–30163335 · motif
· motif · 30163329–30163344 · motif
· motif · 30163334–30163346 · motif
· motif · 30163445–30163460 · motif
· motif · 30163446–30163460 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：481 aa
TRIM10 長 481 個胺基酸，屬於 TRIM/RBCC family。其序列註解包括第 16–61 位的 RING-type zinc finger、第 94–135 位的 B box-type zinc finger，以及第 292–481 位的 B30.2/SPRY domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 TRIM10 的細胞定位標註於細胞質；未提供定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- PSMA1P25786 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TTC23Q5W5X9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZNF148Q9UQR1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GEMP55040 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCNM1Q9BWG6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM35Q9UPQ4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM44Q96DX7 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZNF414Q96IQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF620Q6ZNG0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
TRIM10 與 IFNAR1 互作；此互作會阻止 IFNAR1 與 TYK2 結合。來源未指出這是特定複合體的一部分。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRIM10 是 E3 ubiquitin-protein ligase，依相似性推定對終末紅系細胞分化與存活至關重要，也可能結合 PTEN 並促進其泛素化、蛋白酶體降解及 hypertrophic signaling 活化。它可促進 STING1 的 Lys-27、Lys-29 連結型多聚泛素化以促進活化；另可不依賴 E3 ligase 活性抑制 STAT1、STAT2 磷酸化，並透過與 IFNAR1 互作抑制 TYK2 結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源E3 ubiquitin-protein ligase that plays an essential role in the differentiation and survival of terminal erythroid cells (By similarity). May directly bind to PTEN and promote its ubiquitination, resulting in its proteasomal degradation and activation of hypertrophic signaling (By similarity). Acts as a positive regulator of cGAS-STING signaling by mediating 'Lys-27'- and 'Lys-29'-linked polyubiquitination of STING1, promoting STING1 activation. In addition, plays a role in immune response regulation by repressing the phosphorylation of STAT1 and STAT2 in the interferon/JAK/STAT signaling pathway independent of its E3 ligase activity. Mechanistically, interacts with the intracellular domain of IFNAR1 and thereby inhibits the association between TYK2 and IFNAR1 PMID 33811647 ↗ · PMID 36972172 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 36972172 ↗ · PMID 40821731 ↗ |
| 分子活性 | TRIM10 涉及蛋白質修飾，具體包括蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | TRIM10 與 IFNAR1 互作；此互作會阻止 IFNAR1 與 TYK2 結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with IFNAR1; this interaction prevents association of IFNAR1 with TYK2 PMID 33811647 ↗ |
| 細胞定位 | TRIM10 的細胞內定位為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTCTGACAGTGGACAGCTGACATATCACCACTTTCCTTC40TACTGTGAGTGTCTCTGGATGGGCAGAAAGGAATGGCCAG80CCCCTGGTTATGGTCATCTAAGGTCACCTCTGAAATGCTG120TGAGCCCCTCTTCCTTCCTCTCCTCTGCTATTTCCCATCT160CTGCTGTTGGCAGGAGAATAGAACCCTGGCTGCCAGAGAT200GCAAGTGTGTGACGATATGGGTGCTGGTGCATATTTAGTA240TGTGCCTGTGTCCAGCCATGTGCATGTGTGGGTGTGTGAG280TGTGTGACCCAGCCCTTCCCCCGTGGCCAAGCAGAGAGAG320TGGCCTTGAGGAAGCCATAGCAGCAGGACCAGCATGGCCT360CTGCTGCCTCTGTGACCAGCCTGGCAGATGAAGTCAACTG400CCCCATCTGTCAGGGTACCCTGAGGGAGCCGGTCACTATC440GACTGCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCT480ACTGTGAGATACCAGGCCCAGACCTGGAGGAGTCCCCTAC520TTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTC560CGGCCCAACTGGCAGCTGGCTAACGTGGTGGAGAACATTG600AGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGA640GGATGTCTGCCAAGAGCACGGAGAGAAGATCTACTTCTTC680TGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGG720AGGCTGGGGAGCACGCTACCCACACCATGCGCTTCCTGGA760GGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAGTGT800CTTAAATGTCTAAGAAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAA840TCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGTCCTCCTGAC880TCAGGTGTCCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTC920GCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGGAACAGCAGAGCATCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。