基因總覽
SNORD58A 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 58A，屬於非編碼 RNA，並歸於 C/D box 小核仁 RNA 類別。它不是蛋白質編碼基因；目前提供的資料僅支持其 RNA 分類與預測功能，未描述其序列、長度或結構細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000383875 ★ | 49,491,283–49,491,347 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORD58A 被預測可能參與 RNA 加工。現有資料未進一步說明其作用方式、參與的 RNA 加工步驟或特定分子機制，因此無法據此界定其在相關過程中的具體角色。
Promoter 與基因調控
>SNORD58A ENST00000383875 GRCh38 chr18:49491247-49492347 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTAAATCCTCGCTGGAGGCGGTGGCTTCTTATGCGGGAGGACGTGGCGGAGGGCCTGACTTTGGGAGCC GGGGTCAGTCGGCCTCTGAGGTCCGCAGAGGGACGTGATGGGCGGGAATGGGGACTACCGGGCTCCTCCA CTGGTGGGGGCGCCGGCCCGCCGTGGGGTGCGGGCCGCCTGGGGTCCGTGCGGACTCCGGAGGTCCGGTG TCTAGTGGTGAGTGGTGGCCGCAACGAGGAAAAAGTTTTGGGGGAAAGAAAAGTCGGGTGGAGGCGTAAC ACGTTACTACAAGAGTGTTGCGTACAGGAGGGCTCTTAAAGTGGGTCATAGCCCGAAGGTGTTGAGAGAG ACGGCACTCACTACCTGCAGCCCTGACAGCAAAGGGGTTTCTGTAGAGCGGGAGGGAGGAGGTGTAGAGG GTTACGGTTGAGTTGTGCCCTGCGGATGCGTCGAGTCATTTTACGCCTGGAAGATCCAGCATTGGATTGA AACAGGCTGTATTTTCTTCCAAAGGGTTGACTGGATTGGTGAGGCCCGTGTGGCTACTTCTGTGGAAGCA GTGCTGTAGTTACTGGAAGATAAAAGGGAAAGCAAGCCCTTGGTGGGGGAAAGTATGGCTGCGATGATGG CATTTCTTAGGACACCTTTGGATTAATAATGAAAACAACTACTCTCTGAGCAGCTGTTCGAATCATCTGA TATTTATACTGAATGAGTTACTGTAAGTACGTATTGACAGAATTACACTGTACTTTCCTCTAGGTGATCT GTGAAAATGGTTCGCTATTCACTTGACCCGGAGAACCCCACGAAATGTAAGTGGACAGGAGGTAGATACC CATTTCCTACTTGGGGCTTGGCATAAGATACCAAAAATTAACCAAAACGTTTTATTTTCTAGCATGCAAA TCAAGAGGTTCCAATCTTCGTGTTCACTTTAAGGTATGCGATTCATAGTTGTGATCCAACAGTTCCTCAT GTTCCACTCAAAAAAGGTAGCTGCAGTGATGACTTTCTTAGGACACCTTTGGATTTACCGTGAAAATTAA TAAATTCTGAGCAGCCACCTTATATTTAGGCATTGATGATCAGGGTGTAAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR18_BCS6J · promoter · 49486139–49487103 · regulatory
ENSR18_74WKCX · promoter · 49487224–49487349 · regulatory
ENSR18_5FM9GZ · CTCF_binding_site · 49487312–49487333 · regulatory
ENSR18_C6WKT · enhancer · 49487350–49488398 · regulatory
ENSR18_BCS79 · promoter · 49491576–49492330 · regulatory
ENSR18_BCS7D · promoter · 49492434–49492972 · regulatory
· motif · 49487240–49487249 · motif
· motif · 49487240–49487251 · motif
· motif · 49487240–49487251 · motif
· motif · 49487305–49487316 · motif
· motif · 49487305–49487316 · motif
· motif · 49487314–49487330 · motif
· motif · 49487366–49487375 · motif
· motif · 49487366–49487377 · motif
· motif · 49487377–49487392 · motif
· motif · 49487551–49487568 · motif
· motif · 49488805–49488816 · motif
· motif · 49491900–49491915 · motif
· motif · 49491912–49491928 · motif
· motif · 49492090–49492101 · motif
· motif · 49492091–49492102 · motif
· motif · 49492152–49492169 · motif
· motif · 49492229–49492240 · motif
· motif · 49492307–49492318 · motif
· motif · 49492472–49492485 · motif
· motif · 49492493–49492504 · motif
· motif · 49492564–49492584 · motif
· motif · 49492604–49492616 · motif
· motif · 49492643–49492656 · motif
· motif · 49492866–49492877 · motif
· motif · 49493454–49493467 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD58A 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000383875 ★ | snoRNA | 65 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD58A 被預測可能位於核仁；此定位屬預測，來源未提供實驗驗證、條件差異或定位動態的資訊。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD58A 被預測可能參與 RNA 加工，並被預測可能位於核仁；這些描述屬預測性資訊，未提供具體作用機制或定位條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD58A 被預測可能位於核仁；此定位為預測，未提供實驗驗證或其他定位條件。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
CTGCAGTGATGACTTTCTTAGGACACCTTTGGATTTACCG40TGAAAATTAATAAATTCTGAGCAGC65cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。