基因總覽
SNORD53（small nucleolar RNA, C/D box 53）屬於非編碼 RNA，名稱指出其為 C/D box 類小核仁 RNA。現有資料未提供其序列、結構細節或其他分子特性；對其功能與細胞內位置的描述均為預測。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000579969 ★ | 28,927,067–28,927,144 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料預測 SNORD53 可能參與 RNA processing，但未提供其作用方式、參與的具體步驟或相關生物學條件，因此無法進一步說明其分子機制。
Promoter 與基因調控
>SNORD53 ENST00000579969 GRCh38 chr2:28926067-28927167 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGACAATAGGAGAGTTAAGAGTAGAACCATTTACTATTTTGAGCAGACTGTTTCTTAAAAGGATGATGA ACTGATACGTTTTCTTTAAAACCTGTTACGTTTAAAAATTCTGTTGAACTTTAAAAAATAAATGTGAAAA ATTCAAGCAGTTCATAGCTGAGGAAAGTAAACCTTGGTACCCAATGTCTTCAGAATTACCATTTTTCTTA ACTGCCGTCAGTCTGAGTGGTGATCGTGGTTAACAATTGAGTGTGGAAGTCTTCCATACTTTTTAATATT TTATAAAAATGCACAAGTAGTCATTTATTTTTCATTTTGTTCTTATTCCCAGTTGCTTTGTTTGACACTC TTTTTTTTTTCTTTCCTCTCATCTTCCCCTTTAAAAAAAATATATTTTCAGGCTTTAAACTCCAGAGAAC CTCATATGTGTTTAGTAAGAGATATTTCAAACTGCTGGGCCCCCAAAGTAGAAACAGCTATAACAAAGGT GAGCACATTACAAATTTGAAGTTTTAAGAAAAAGAATATTTCTTTGGGTGAATGGAACTGTTACTTAGTA TTATGATTAAACTGAGTTTTTTATTCTTTAATATCTTTATTCTCTTGTCTTATAAATTTTGTGGGATTAT GGTTTTAGATGTCAAGATTGTACTCCTGATTTGTTGAGTGAATGAATGAATAGAAGACTAGCAGTTGAAG ACCTTGGATGTGGTTCTTCCCTGCCCACCATGCATGATCATCTGGGCCAGGAAGAATGTAGGGATAAATA TCAATATCAGATTTATCAGTAGATAGTTTTTATCAATCTCAGTACTTAAAAGAGCATTACTTTGCTGAGA GGAATGCTGTATTTCAGGGTGTAATAAAACCGTCATGGGGCTAGAATATAATACCACAAAAGCATAGGAG CATCATCATGGTGCTCCATTTTGCATATAACTTGGTGTCTACATGTAGGGGACGTGTTTCGTGGTTTAGT GAGAAAGGGAAAGCCAAGACATGCTATGATGACATCCATATGGTTTCGCTGCTGGCTGAGTTTCAGAGAT GACACCTTTCTCTTGGCTGTCTGAGCATTTCTGGCAGAGATTGAATTCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_58RP7J · CTCF_binding_site · 28927903–28927924 · regulatory
ENSR2_9FH2D · enhancer · 28927934–28928306 · regulatory
· motif · 28927905–28927921 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD53 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000579969 ★ | snoRNA | 78 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD53 被預測位於核仁；此位置屬預測資訊，資料未說明定位是否會隨條件改變。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD53 被預測可能參與 RNA processing，並被預測位於核仁。這兩項描述均為預測性註記；來源未提供支持其功能或定位判斷的實驗細節，也未說明可能涉及的處理步驟或條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD53 被預測位於核仁。這是預測性的細胞內定位描述，來源未提供定位判斷的實驗細節，也未說明此位置是否受條件影響或是否存在其他定位。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
ATGCTATGATGACATCCATATGGTTTCGCTGCTGGCTGAG40TTTCAGAGATGACACCTTTCTCTTGGCTGTCTGAGCAT78cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。