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Human Gene Atlas›SNORD48
HUMAN NON-CODING RNA GENE

SNORD48U48

small nucleolar RNA, C/D box 48

SNORD48 是名為 small nucleolar RNA, C/D box 48 的非編碼 RNA；資料預測它可能參與 RNA processing，並位於核仁。

Homo sapiens6p21.33
OFFICIAL SYMBOL
SNORD48
CHROMOSOME
6
RNA TYPE
snoRNA
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SNORD48 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 48，屬於非編碼 RNA。現有資料未提供其轉錄本結構或更具體的分子特性；其可能參與的生物學過程及預測定位，詳見功能與定位說明。

Official symbol
SNORD48
Gene name
small nucleolar RNA, C/D box 48
Organism
Homo sapiens
Gene type
Non-coding RNA
HGNC ID
HGNC:10188
RNA type
RNA, small nucleolar
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
U48RNU48

異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.33
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegSNORD48pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:31,835,263–31,835,326
Gene span
64 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000364953 ★31,835,263–31,835,3261

顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料將 SNORD48 與 RNA processing（RNA 加工）相聯，但此功能屬預測，不能視為已確立的作用。來源未進一步說明它參與哪一種 RNA 加工步驟、如何發揮作用，或是否涉及特定分子互作，因此不宜據此推定更具體的機制或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準：負數為上游、正數為下游，包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 31835263 · 正股
查看轉錄本與 TSS ↗
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SNORD48 ENST00000364953 GRCh38 chr6:31834263-31835363 strand=1 5′→3′
相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter
TAATTTTTAAATAAATAGAGACGGGGGTTGGGTGTCACTATTTGCCCAGGCTGGTCCCGAACTCCGGGCC
TCAAATGATCCTCTGCCTGGGCCTGTCCAAAGTGTTGAGATTACAGGCGTGACCTATTACGTCCGACCTG
CCTTTTGGGTTTTTGGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTAATTGAAGGTTAGGGTGCCTGACAGTCTGCGGGAT
CGAACTGGGAGGCAAATTCAGATTTCGCTGGGGGAACGGAGTGCGAAGTGTCAGGGTAGCTGGACGCTAA
ACTGGCGCAGCTGCGCGCGCCCGCGCGCGCGCGGGAAGAGTCCCAGGGTCATTAACGGACCATGGGCTGC
TGGGAAACGGCTTAGGAGCAGCACCCGGCTGGCGCTGGCCGGCCGGCGCCGGGGACTTTCTTCCGCCTGG
CCAGACAGATCCCTGTTTTTTGTTTTTCAAAATTCAGAAAGCATCTCCGAATATTTGCCCAGAGGAGTGT
GAAACATACTTTCCTGGTCTTTCTTTCACTTTGTTTTATTTCTGTGTGGACAAACAATGGGGAAAATGCC
GCGCGTCTAGCCAGGCAGATAAGAAAACAACTATACCCGTCAGGCCCCCAACCCGGCGCCGCCATAAATG
GCCCCGGCCTCGCCATTTTAGTTCTTTTTGCGAAGTGGGCTCGTGGGTTGGCAGTATGAGAGTTGTAATG
GCCCGACTGTTGAGTGAGGGGGAGCAGGGGATCCCAACGGCTTGCGCTGCCTTTGCGCAGCAGCCGGCGG
GCGGCCACGTCGCGGCCTGGCTGGGGTAGGAGAGGGCGGTCCCCAGTGCAGTTGGGTGAACTACCGTTGC
ACACTGGAGTTTCTGGTGTCTTTGCTTGGAACTGACCTAGCTCGTGGCAGGGGGAACTCGGCTAGCGGCC
CCACAGCCCCTGCTGACTCAAAACAACTGTGAGTGGGGTTGGGCGAGTGATTGCAAAATGGGGGTGGCGG
TCGCCCGGGGATAGGAAGGGAGTGATGATGACCCCAGGTAACTCTTGAGTGTGTCGCTGATGCCATCACC
GCAGCGCTCTGACCGCCCCCTCGGTCCAGCATTTCTCAGGCTCAACGAGTT
SNORD48 位於正股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。

EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控／motif 註解

ENSR6_9GM5L · enhancer · 31831742–31832067 · regulatory

ENSR6_B8BKG · enhancer · 31832740–31833335 · regulatory

ENSR6_9GM6F · promoter · 31834426–31834928 · regulatory

· motif · 31830604–31830615 · motif

· motif · 31830703–31830712 · motif

· motif · 31830703–31830714 · motif

· motif · 31830703–31830714 · motif

· motif · 31832489–31832501 · motif

· motif · 31833585–31833597 · motif

· motif · 31833854–31833874 · motif

· motif · 31834285–31834295 · motif

· motif · 31834416–31834436 · motif

· motif · 31834558–31834569 · motif

· motif · 31834558–31834569 · motif

· motif · 31834564–31834575 · motif

· motif · 31834564–31834575 · motif

· motif · 31834579–31834594 · motif

· motif · 31834580–31834594 · motif

· motif · 31834587–31834600 · motif

· motif · 31834670–31834681 · motif

· motif · 31834670–31834681 · motif

· motif · 31834879–31834889 · motif

· motif · 31834900–31834910 · motif

· motif · 31835228–31835238 · motif

· motif · 31836601–31836612 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / RNA TRANSCRIPTS

RNA 轉錄本與序列

Non-coding RNA

SNORD48 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000364953 ★snoRNA64 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

RNA 細胞內定位

動物細胞結構與RNA定位細胞膜包圍細胞質；細胞核內有核仁，粗面內質網鄰接核膜，粒線體含內膜摺疊，高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位，器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量；未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體：外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡（示意）
定位：Nucleolus

SNORD48 被預測位於核仁；此定位屬推論，來源未提供驗證方法、細胞條件或定位變化的資訊。

NCBI Gene／RefSeq

深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。

動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SNORD48 被預測可能參與 RNA 加工，並可能位於核仁；這兩項資訊均為預測，來源未說明具體加工步驟或定位驗證情形。推論支持
證據與來源

Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
細胞定位SNORD48 被預測位於核仁；這是定位預測，來源未提供實驗驗證、細胞條件或其他定位資訊。推論支持
證據與來源

Predicted to be located in nucleolus.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000364953 · 64 nt · GRCh38
完整非編碼 RNA 轉錄本的參考序列。
1AGTGATGATGACCCCAGGTAACTCTTGAGTGTGTCGCTGA40
41TGCCATCACCGCAGCGCTCTGACC64

cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。

13 / DATA PROVENANCE

資料來源與研究連結

HGNC ↗NCBI Gene ↗Ensembl ↗EPDnewNC v001 · UCSC ↗RNAcentral ↗Alliance of Genome Resources ↗

HGNC · CC0 ↗ · Ensembl · 資料使用說明 ↗ · EPD team／SIB · CC BY 4.0 ↗ · NCBI／RefSeq · 資料政策與免責聲明 ↗ · Alliance of Genome Resources · CC BY 4.0 ↗；內容經節錄與整理，預測註解仍屬推論。

資料更新：2026-11-01