基因總覽
SNORD35A(small nucleolar RNA, C/D box 35A)屬於非編碼 RNA,名稱顯示它是 C/D box 類小核仁 RNA。現有資料將其列為 RNA 分子,而非蛋白質產物;未提供其序列、長度或更細部的結構資訊。資料庫摘要所列的功能與定位均為預測,指出它可能參與 RNA 加工,並可能位於核仁。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000363389 ★ | 49,491,175–49,491,260 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料預測 SNORD35A 可能參與 RNA 加工,但未提供其直接作用方式、作用對象或加工步驟,因此無法進一步界定它在此過程中的分子機制。
此外,資料預測 SNORD35A 可能作用於葡萄糖代謝過程、胰島素分泌及活性氧物種代謝過程的上游或其中。這表示其可能與上述生物學過程有所關聯,但來源未說明作用方向、涉及的細胞或生理條件,也未提供可判定因果關係的證據。這些描述均屬預測,不應視為已確立的直接調控作用。
來源亦未說明 SNORD35A 如何影響上述代謝或分泌過程,或其與 RNA 加工之間是否存在功能連結。因此,現有資訊僅支持將這些項目視為預測的功能關聯,無法據此推定具體機制或生物學後果。
Promoter 與基因調控
>SNORD35A ENST00000363389 GRCh38 chr19:49490175-49491275 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGCAGTGGTGGGACCCTCAGGCGGCTCGGCCCTGCTAAGCCTTTCCCTCCCTCTAGGCCGGAAGGTGGT GGTCGTACGCTGTGAAGGCATCAACATTTCTGGCAATTTCTACAGAAACAAGTGTAAGTTAGGACCTGGG AGGAGCACTGGAGAGGGTCTCCCTGTGGGGTGTTGAGGCTCTGAAAGCAATTGCAGCCGTGTTGGGAGAG GCTACTTGGGGTTTCTGAGAAGGCCCTTGGAAGTGGGGTTTTGGGGGTGCTGGTAGACTGGGCAGGCCTC ACACTCTCCCCTCTCCCTAGTGAAGTACCTGGCTTTCCTCCGCAAGCGGATGAACACCAACCCTTCCCGA GGCCCCTACCACTTCCGGGCCCCCAGCCGCATCTTCTGGCGGACCGTGCGAGGTGAGCAGAGCGTGGGGA CTGCAGGTGGTGACGGGCAGGCGGCCGGTGATGAGAACTTCTCCCACTCACATTCGAGTTTCCCGACCAT GAGATGACTCCACATGCACTACCATCTGAGGCCACCCCATGGGCCCACCTCAGTGGGGTGGGTGGGCATC CTTATGAGGCCCTCTGACTGGGCCTGCTATCTGTCACCCAACAGGTATGCTGCCCCACAAAACCAAGCGA GGCCAGGCCGCTCTGGACCGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGGTGAGCTATG CCAAACCCCACAGGCAGCGGCCTTACCTGTGGCGTCCATGATGTTCCGCAACTACCTACATTGTTTGATC CTCATGAAAGCAGCACTGGCTGAGACGCCAGTCCAGCCGACCTCCTTCCCTGTCTGTCCCTCCCGGGCTC TTAAGCCCCTCTCTTTCTCTAACAGAAAAAGCGGATGGTGGTTCCTGCTGCCCTCAAGGTCGTGCGTCTG AAGCCTACAAGAAAGGTGAGTCCCAGCTTACGCTGCACCATCTACTTGGGAGATTTCAGGCCTGCTGAGG GACCTGGGGACCTGGAGCCTGGCAGATGATGTCCTTATCTCACGATGGTCTGCGGATGTCCCTGTGGGAA TGGCGACAATGCCAATGGCTTAGCTGATGCCAGGAGGCTTGGGTGGGTGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BCS6L · promoter · 49487020–49487618 · regulatory
ENSR19_5FM9ZG · CTCF_binding_site · 49490229–49490250 · regulatory
ENSR19_BCS7W · promoter · 49495942–49496464 · regulatory
· motif · 49487083–49487094 · motif
· motif · 49487268–49487278 · motif
· motif · 49487289–49487299 · motif
· motif · 49487407–49487422 · motif
· motif · 49487428–49487439 · motif
· motif · 49487430–49487439 · motif
· motif · 49487472–49487485 · motif
· motif · 49487472–49487485 · motif
· motif · 49487489–49487500 · motif
· motif · 49487489–49487500 · motif
· motif · 49487547–49487556 · motif
· motif · 49487628–49487638 · motif
· motif · 49487994–49488005 · motif
· motif · 49487994–49488005 · motif
· motif · 49488103–49488115 · motif
· motif · 49489320–49489334 · motif
· motif · 49489320–49489334 · motif
· motif · 49489890–49489907 · motif
· motif · 49490231–49490247 · motif
· motif · 49492570–49492587 · motif
· motif · 49492600–49492613 · motif
· motif · 49492889–49492906 · motif
· motif · 49492898–49492906 · motif
· motif · 49493746–49493768 · motif
· motif · 49493746–49493768 · motif
· motif · 49495805–49495816 · motif
· motif · 49496105–49496118 · motif
· motif · 49496105–49496118 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD35A 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000363389 ★ | snoRNA | 86 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
資料預測 SNORD35A 位於核仁;未提供其他定位、定位變化條件或異構型差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的RNA定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD35A 被預測可能參與 RNA 加工,也可能作用於葡萄糖代謝過程、胰島素分泌及活性氧物種代謝過程的上游或其中;其定位則被預測在核仁。這些描述均屬預測,來源未提供具體機制或作用方向。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to act upstream of or within glucose metabolic process; insulin secretion; and reactive oxygen species metabolic process. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD35A 被預測位於核仁;此定位資訊屬預測,來源未提供定位變化條件或異構型差異。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
GGCAGATGATGTCCTTATCTCACGATGGTCTGCGGATGTC40CCTGTGGGAATGGCGACAATGCCAATGGCTTAGCTGATGC80CAGGAG86cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。