基因總覽
SNORD12C 是人類非蛋白質編碼 RNA 基因，正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 12C。來源記錄的類型為 RNA, small nucleolar。此基因座位於 20q13.13。目前可用來源提供名稱、分類與基因座資料，尚未提供可採用的功能敘述；功能與產物資訊依後續取得的來源註解補充。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000386307 ★ | 49,278,940–49,279,028 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SNORD12C ENST00000386307 GRCh38 chr20:49277940-49279040 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTGGCGGGTCGGCGCGGGCGCCGGGGTTCGCGGCGAGGCAAGGAAGAATCAGGGGCAGGGGCAGTTGCG GGGCCACTCACCCGGCTCCGGCGCGTCCTTTCACTGCCGCCGGCGAGTGCTGGGGCTTCGGCCCAGGCAG GTCGGTGGCCCCGCCCGGCGCCGCGCACTTTCGGTTTCCGTTCCCCGCAGACCCTGGGCGGAGCCGGGCG GGCGGCCCAGAGGAGGAGAAGGAGGAGGCGGGGGCCCAGGGTGGAGAGCACGAGGGCCTGGCCCAGGCAC GGCCGGCGCCTCCGCCCTCGAGGAGGGCGTCACCTCAGCTCCCCCCGGCGGCGGAGCCGGCGGGCTCAGG CGGGCGCGGCTGAGGGGAGCGGACCGCGGGGGGCGGGAGATGACTGCGCCCAAGGCCTTTGCGGGCCTCA GCCGGCCCCAGAGGAAGGGGAACCCGTCGAGCGGTTTGGTGCGTGTGAAGCGCGACATGGCGAGGAAGCG GACAAGCCCGGGTGGCCCGGCGTGTAGAGGGAAGGGGGCGGGGCTAGACGCGGCCTGGACAACTACTAGA GCGCCTCGGGCTGTGCTGCTCGAGACTACATTTCCCAGAGCGACGCGCGCGGAGCGGGCGGGAAAGAGAG CGTTTCGGGTCCAGTGCGCAGGTGCGAAAGCCATCTTTGGTTATATAAGGGAGGTTCAGGAAGCCATTCG TTCTTTCGCGTCTGCGGTGCCCGGAGTGTGGTACTTCTCCTAGTTGCAGTCAGGCTTCATACGCTATTGT CCTGCCCGTAAGTTCCCGTTTTGTGTGTGGTGAGTGGAAACTCCATGTTCTTCGTTGGAGACCTCTGGTC CTCCCTTCCCTTCTTTGTGCCGTCGTCTCTGCGGCCAGCCCTAATCTCCTTCTCGTGGCTTCTCCGTCTC TGACCCCAAATAGGCCTTAAGGGCGTGGGAGAAATGAGTTTCTGGAGCTGGAAAAGCCACTGCCTTCTGC ACGGGCCTGAGAAGCCCTTGGCTGGTGTAAATGATGACTTCACTTTTTTCCCCATCAGATCGACAATGCT GACGTCTTATATTTTGCCAGTTAGTTCTGATACATCGGCCTCAAAAGGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_9PK4F · promoter · 49276906–49277406 · regulatory
ENSR20_5FKXH3 · CTCF_binding_site · 49277374–49277395 · regulatory
ENSR20_BCR3B · enhancer · 49277407–49278046 · regulatory
ENSR20_83G57G · promoter · 49278047–49278261 · regulatory
ENSR20_5FKXM5 · CTCF_binding_site · 49278254–49278275 · regulatory
ENSR20_83G57K · enhancer · 49278262–49278415 · regulatory
ENSR20_83G57N · promoter · 49278416–49278652 · regulatory
ENSR20_9PK4X · promoter · 49278684–49279184 · regulatory
ENSR20_9PK54 · enhancer · 49279185–49279630 · regulatory
ENSR20_9PK58 · promoter · 49279631–49280131 · regulatory
ENSR20_5FKXXD · CTCF_binding_site · 49280043–49280064 · regulatory
· motif · 49274065–49274076 · motif
· motif · 49274448–49274459 · motif
· motif · 49276575–49276590 · motif
· motif · 49276602–49276615 · motif
· motif · 49276821–49276834 · motif
· motif · 49276821–49276834 · motif
· motif · 49277237–49277248 · motif
· motif · 49277238–49277249 · motif
· motif · 49277376–49277392 · motif
· motif · 49277916–49277929 · motif
· motif · 49277961–49277976 · motif
· motif · 49278105–49278115 · motif
· motif · 49278105–49278119 · motif
· motif · 49278105–49278119 · motif
· motif · 49278105–49278125 · motif
· motif · 49278112–49278126 · motif
· motif · 49278173–49278183 · motif
· motif · 49278256–49278272 · motif
· motif · 49278318–49278328 · motif
· motif · 49278463–49278473 · motif
· motif · 49278584–49278595 · motif
· motif · 49278584–49278595 · motif
· motif · 49278586–49278595 · motif
· motif · 49278588–49278600 · motif
· motif · 49278799–49278816 · motif
· motif · 49278849–49278856 · motif
· motif · 49278981–49278992 · motif
· motif · 49279067–49279077 · motif
· motif · 49279094–49279107 · motif
· motif · 49279135–49279149 · motif
· motif · 49279243–49279252 · motif
· motif · 49279243–49279252 · motif
· motif · 49279407–49279419 · motif
· motif · 49279409–49279416 · motif
· motif · 49280045–49280061 · motif
· motif · 49280325–49280336 · motif
· motif · 49280329–49280343 · motif
· motif · 49280693–49280707 · motif
· motif · 49280693–49280707 · motif
· motif · 49281160–49281174 · motif
· motif · 49281160–49281174 · motif
· motif · 49281457–49281468 · motif
· motif · 49283065–49283078 · motif
· motif · 49283065–49283078 · motif
· motif · 49283427–49283440 · motif
· motif · 49283427–49283440 · motif
· motif · 49283939–49283950 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD12C 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000386307 ★ | snoRNA | 89 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
GCTGGTGTAAATGATGACTTCACTTTTTTCCCCATCAGAT40CGACAATGCTGACGTCTTATATTTTGCCAGTTAGTTCTGA80TACATCGGC89cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。