演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN NON-CODING RNA GENE

SNORA74AU19

small nucleolar RNA, H/ACA box 74A

SNORA74A 為人類非蛋白質編碼 RNA 基因,此頁收錄已核對的名稱、分類與基因座資訊。

Homo sapiens5q31.2
OFFICIAL SYMBOL
SNORA74A
CHROMOSOME
5
RNA TYPE
snoRNA
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SNORA74A 是人類非蛋白質編碼 RNA 基因,正式名稱為 small nucleolar RNA, H/ACA box 74A。來源記錄的類型為 RNA, small nucleolar。此基因座位於 5q31.2。目前可用來源提供名稱、分類與基因座資料,尚未提供可採用的功能敘述;功能與產物資訊依後續取得的來源註解補充。

Official symbol
SNORA74A
Gene name
small nucleolar RNA, H/ACA box 74A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Non-coding RNA
HGNC ID
HGNC:10119
RNA type
RNA, small nucleolar
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
U19RNU19

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q31.2
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegSNORA74Apq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:139,278,781–139,278,978
Gene span
198 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000364089 ★139,278,781–139,278,9781

顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前可用來源未提供可採用的功能註解。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 139278781 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SNORA74A ENST00000364089 GRCh38 chr5:139277781-139278881 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATTGACAGTAATTGTATATGTTATATGGGGTACAACATGAGGTTTTCATACATGTTTACATTGTGGAAT
GAGTAAATCATGCTAGTTAACACATCTAGCACCTCACATACTTATATTTTGTTGTGGTGAAAACATTTAG
TATCTTTTAGCAATTTTGAAATATACAGGCCAGGCACGGTGGCTCGCACCTGTATTCCCAGCACTTTGGG
AGGCTGAGGTGGGAGGATCATTTGAACCCAGGAGTTTGAGACAAGCCTGGGCAACAGAAAGAGATCTCAT
CTCTATAAAAAACAAAAAAGAAATTAGGTGGGTGTGTTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTGCTTGGGAG
GCTAAGCTGGGAGGATCACTTGACCCAGGAGATTGAGACTACAGTGAACCATGGTCATGCCACTGCACTC
AGTCTAGACAGAGTGAGACCCTATCTCAAAAAATATATATATATATATACACACACACACACAATGCATT
GCTATTTATTATATTCTGTGTACTAGATCACTAAGTTTGCTTGTCTTCCTTTTTAGGATGACTTGAAAGT
AGGGCATCCTTCACCCATCTGAAGGGAGGAAATAGTGGCAGGTGACAGTCTGCATGTGCAGTTTTCAGGT
AAATATCCCTATTCATTCCAACATTGACTACCTCCTCTGTGCCAGGCCTGTGGGCTAGTTGGTATCTATC
AGGAAACAAATGGGAGGTAAATTAACCTGTATTTGTAAGATCCATGAAGGAAAGGACAATATATCTTGTT
TTATTCACTGCTAGATCCCAATCGCAGTGCTTGGCACATGGCAGGACCTCCCTGAATGTTGCATAAAACA
ACTGAAAACACAGAAGGGGATTCCTGTTAAAGGGTTTGACAACAGGGTCTGCAATTAGTGCTTCCACGCC
TGTTTTGCAGTCAATATTCAACTGATACGTCTTCTACCTGGAGTGCCTAGGTATCTGAAACAAATAATGA
GAAAGCTGTTTCAGGAATCATCCAGCGGTTGTCAGCTATCCAGGCTCATGTGGTGCCTGTGATGGTGTTA
CACTGTTGGAAGAGCAAACACTGTCTTTATTGAGGTTTGGCTCCAAGCACT
SNORA74A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_B32M9J · promoter · 139273262–139274141 · regulatory

ENSR5_537QH2K · CTCF_binding_site · 139274109–139274130 · regulatory

ENSR5_B32M9N · enhancer · 139274142–139275123 · regulatory

ENSR5_537QH39 · CTCF_binding_site · 139274260–139274281 · regulatory

ENSR5_CHS5X · enhancer · 139275394–139276764 · regulatory

ENSR5_B32MBB · enhancer · 139278563–139279330 · regulatory

ENSR5_9439M9 · enhancer · 139281030–139281382 · regulatory

ENSR5_9439MG · enhancer · 139281617–139281973 · regulatory

ENSR5_864KB7 · enhancer · 139282257–139282434 · regulatory

ENSR5_9439N2 · enhancer · 139283686–139283954 · regulatory

· motif · 139273792–139273805 · motif

· motif · 139273967–139273980 · motif

· motif · 139273967–139273984 · motif

· motif · 139274024–139274036 · motif

· motif · 139274026–139274033 · motif

· motif · 139274026–139274039 · motif

· motif · 139274036–139274046 · motif

· motif · 139274051–139274061 · motif

· motif · 139274071–139274081 · motif

· motif · 139274099–139274112 · motif

· motif · 139274111–139274127 · motif

· motif · 139274151–139274160 · motif

· motif · 139274151–139274160 · motif

· motif · 139274151–139274160 · motif

· motif · 139274151–139274160 · motif

· motif · 139274262–139274278 · motif

· motif · 139274355–139274368 · motif

· motif · 139274355–139274368 · motif

· motif · 139274497–139274508 · motif

· motif · 139274509–139274520 · motif

· motif · 139274793–139274808 · motif

· motif · 139276690–139276702 · motif

· motif · 139279982–139279993 · motif

· motif · 139281311–139281324 · motif

· motif · 139281627–139281639 · motif

· motif · 139281629–139281644 · motif

· motif · 139281631–139281646 · motif

· motif · 139281836–139281847 · motif

· motif · 139282055–139282068 · motif

· motif · 139282055–139282068 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / RNA TRANSCRIPTS

RNA 轉錄本與序列

Non-coding RNA

SNORA74A 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000364089 ★snoRNA198 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

RNA 細胞內定位

動物細胞結構與RNA定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

0 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000364089 · 198 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1TCCAGCGGTTGTCAGCTATCCAGGCTCATGTGGTGCCTGT40
41GATGGTGTTACACTGTTGGAAGAGCAAACACTGTCTTTAT80
81TGAGGTTTGGCTCCAAGCACTGTTTTGGTGTTGTAGCTGA120
121GTACCTTTGGGCAGTGTTTTGCACCTCTGAGAGTGGAATG160
161ACTCCTGTGGAGTTGATCCTAGTCTGGGTGCAAACAAT198

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。