基因總覽
SNORA72（small nucleolar RNA, H/ACA box 72）屬於非編碼 RNA，名稱將其歸入 H/ACA box 小核仁 RNA。現有資料確認其基因類型為非編碼 RNA，並未提供 RNA 長度、序列或更細的結構資訊，因此不宜據此推定其具體結構特徵。資料庫將 SNORA72 與 RNA 加工相關聯，但此功能描述屬預測；其細胞定位也同樣是預測，而非此處列出的實驗確認結果。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000384339 ★ | 98,042,086–98,042,217 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料預測 SNORA72 可能參與 RNA 加工，但未進一步說明它作用於哪一類 RNA、參與加工的哪個步驟，或以何種分子方式發揮作用。因此，這項註記支持的是與 RNA 加工相關的預測性功能，不能據此推定特定底物、作用機制或已確認的生物學結果。
Promoter 與基因調控
>SNORA72 ENST00000384339 GRCh38 chr8:98042117-98043217 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGGTGGAAGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACGATCCGCCTGAGCGACAGAATGAGATTCCA TCTCAAAAAAAAAAGTACATAATACCTACTTTAGAGATTGTCATGGAAATATAAAGTATGTGGTCCTTAC TAATGCTAGATAATGCTTTGCTTTCTTTTATTTGCATCTTACCCTCTTCCGTGAGTATTGATACTGTCTT AAACATAGTAGGGGTTGATTAGATATTTGCTGGTTGCCCCTTCACTTGCAAGGGATACATACAAATGTTG GTTTGTATTGGATAATGAATATGATGTTTTTAAGAGTAATATGTGATTTTGTTACTTTTTGAAGGCCTTA ACAACATTAACACTAGTAAAAGAAGTAGTAACATTTAGTCTGTCAGTCACTTGGTATCGCATTTATTTAT TTGCCCATTTTGGTTCCCAAAGGAAATCTGAAATAGAGTACTATGCTATGTTGGCTAAAACTGGTGTCCA TCACTACAGTGGCAATAATATTGAACTGGGCACAGCATGCGGAAAATACTACAGAGTGTGCACACTGGCT ATCATTGATCCAGGTATGCTTTTTAAATCATAAAGTCTTTTTTTTTTTTGCCTTTCTAATGTAATGTCTG GACAAGTATTTCTTACTACGCAAATGTCTTTGGTTCCTAAATTCAGATAGAATATGGATCTAGCAAGGCA TATCGTGTAGTTGTATTTTGTAGAGAATTGGTAATGAATGCCAATACATTATAATTGGCTTTATTATAAG TTAAAATTTTTACTGTCAGATAATGAATTTCATTTGATGAAGTACCTATGAAATAATGACATAGATTTGG TAAAAGGTGAAATTATAAGGAGAGAATAATCTGGCAAAACAGAAGAAAGTAATTCTTGCTTCTTGAGAAC AGACATGTAAAATTAGCTTGAGAAAAAAAAAAGTGCCAAAAAATCTACATCATTCTGTTTTCCAATTGTG AATCTTTGATTCATAGAATACTGCGAATATTCTCGCTGTTCTGATTTTGTAATAGTCAGGACAGGCTAAA CATTCGCTATATTAAGACCATGCATGTGTCCCCAAACCTAGTTCTTTCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_BPGBL · enhancer · 98036836–98037433 · regulatory
ENSR8_5T3L8D · CTCF_binding_site · 98037292–98037313 · regulatory
ENSR8_84TSBM · enhancer · 98039135–98039303 · regulatory
ENSR8_BPGC3 · enhancer · 98039776–98040644 · regulatory
ENSR8_BPGCM · enhancer · 98043830–98044588 · regulatory
ENSR8_84TSGC · promoter · 98045504–98045669 · regulatory
ENSR8_CCPNG · enhancer · 98045670–98046861 · regulatory
· motif · 98037294–98037310 · motif
· motif · 98037929–98037944 · motif
· motif · 98037934–98037946 · motif
· motif · 98037937–98037944 · motif
· motif · 98040014–98040023 · motif
· motif · 98040509–98040520 · motif
· motif · 98045447–98045462 · motif
· motif · 98045580–98045591 · motif
· motif · 98045582–98045591 · motif
· motif · 98045596–98045605 · motif
· motif · 98046083–98046098 · motif
· motif · 98046268–98046285 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORA72 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000384339 ★ | snoRNA | 132 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORA72 被預測位於核仁；現有資料未提供定位變化條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
DNA 與 RNA 序列
CTGCGAATATTCTCGCTGTTCTGATTTTGTAATAGTCAGG40ACAGGCTAAACATTCGCTATATTAAGACCATGCATGTGTC80CCCAAACCTAGTTCTTTCCCTAGGTCTGGTTTTATAAATG120CTGGTGATAAAC132cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。