基因總覽
SNORA69 的正式名稱為 small nucleolar RNA, H/ACA box 69，屬於非編碼 RNA，並非蛋白質編碼基因。它屬於 box ACA small nucleolar RNA 家族；此類 RNA 的結構特徵包括雙髮夾構形，以及位於 RNA 3′端前 3 個核苷酸處的共識 ACA 基序。SNORA69 也與 ribosomal protein L39 基因共同轉錄。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000383895 ★ | 119,787,353–119,787,484 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORA69 所屬的 box ACA small nucleolar RNA 家族可能參與 rRNA 成熟。現有資料僅指出這項可能角色，未進一步說明 SNORA69 在成熟過程中的具體作用方式或其影響，因此不宜據此推定更詳細的分子機制。
Promoter 與基因調控
>SNORA69 ENST00000383895 GRCh38 chrX:119787384-119788484 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATCTTGGCTTACCGCAACCTCTGCCTCCCAAGTTCAAGCGATTCTCTTGCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG GATTACAGGTGCCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTT GGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATTCACGCGCCTCTGCCTCCCAACATGCTGGGATTACA GGCATGAGCCACCGCGCCCAGCCAGAACTTGATTCGACTTGTATGGCAAAGCTAGTGGGATTGGTTTGCT AAGAAGACTTAAAGGGGTGGCTTCTTAGGGCTAAAGTTGAGGGCCTATTTCCTTGGTTCATTTAGCTAGT TAGATGTGAAAATTGCCACCCATTGTAATGTTATGGGCTAGTTAATTGCTTACCATTTGTTTACTGGATA CTAGACACTGTCCTTTATTATTTGATACATCTACTTGAACGTGGGTTTCTCTGTGTCCTGCCTGATGGTG GGACCTGCTTGTGAAGAGTGAAAGAAGTATATATAAACCAGGCACAGTGCTTCATACTTATAATCCCAGC ACTTTGGGAGAGGCCAACGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAATTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGG GAGACCACCCCCGTCCATCTCTACCAAAAATATAAATTAGCTGGACTTGGTGGCACGTGCTTGTAGTCCT AACTATTTAGCAGGCTGAAGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAATTCACAGGCTGCAGTGAGCTGTGAT CCGGCCGCTGCATTGTAGCCTGGGCAACAGTGTGACCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAATGTATGTAAAACT CAACGCCTAGTTCAATAAATAACCTGCTATTAAACTCTGTGGTCTCCTAGAATTGGGAAGGTATTTTGTA CGTAAGATTATATACCCTTGACCCAGATAATTGACCCAATGGAATGATTTTCATTGTTTTAGCTATCTTC CAGCGTTAAAAATGTTTTTGAAAGCAGGTTGCAATTACAGTGCTTCATTTTGTGGAAGTACTGCCATTAT CCTGCTGAAAGAAAAGCCGTGTTAATCATTTTTGATTTTGCCTTTATGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_93QJP3 · enhancer · 119784891–119785311 · regulatory
ENSRX_5336PD8 · CTCF_binding_site · 119785652–119785673 · regulatory
ENSRX_BTQTW · enhancer · 119790749–119791619 · regulatory
ENSRX_5336QB8 · CTCF_binding_site · 119791050–119791071 · regulatory
ENSRX_93QJQZ · promoter · 119791620–119791990 · regulatory
ENSRX_BTQW3 · enhancer · 119791991–119792669 · regulatory
· motif · 119784838–119784853 · motif
· motif · 119784843–119784855 · motif
· motif · 119784846–119784853 · motif
· motif · 119785654–119785670 · motif
· motif · 119791052–119791068 · motif
· motif · 119791165–119791182 · motif
· motif · 119791605–119791615 · motif
· motif · 119791812–119791825 · motif
· motif · 119791812–119791825 · motif
· motif · 119791964–119791973 · motif
· motif · 119792064–119792073 · motif
· motif · 119792123–119792132 · motif
· motif · 119792123–119792132 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORA69 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000383895 ★ | snoRNA | 132 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORA69 編碼的 RNA 屬於 box ACA small nucleolar RNA 家族，具有雙髮夾結構，且 ACA 共識基序位於 RNA 3′端前 3 個核苷酸處。此類 RNA 可能參與 rRNA 成熟；SNORA69 亦與 ribosomal protein L39 基因共同轉錄。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene encodes a member of the family of box ACA small nucleolar RNAs, characterized by a consensus ACA motif positioned 3 nucleotides from the 3' end of the RNAs and a double-hairpin structure. The box ACA small nucleolar RNAs may play a role in rRNA maturation. This gene is co-transcribed with the ribosomal protein L39 gene. |
DNA 與 RNA 序列
AAAGCAGGTTGCAATTACAGTGCTTCATTTTGTGGAAGTA40CTGCCATTATCCTGCTGAAAGAAAAGCCGTGTTAATCATT80TTTGATTTTGCCTTTATGAGGGTAAAATCATGACAGATTG120ACATGGACAATT132cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。