基因總覽
SNORA68 的正式名稱為 small nucleolar RNA, H/ACA box 68,屬於非編碼 RNA。現有資料將它歸為 H/ACA box 小核仁 RNA;不過,所提供的來源沒有說明其序列、長度、二級結構或其他分子結構特徵,也未提供更細的家族分類與 RNA 產物特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000384437 ★ | 17,862,588–17,862,720 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
資料預測 SNORA68 可能參與 RNA processing(RNA 加工)。這項描述是預測性註記,並未提供其參與的具體加工步驟、作用方式或底物,因此無法據此判定它在 RNA 加工中的分子機制或特定功能。
Promoter 與基因調控
>SNORA68 ENST00000384437 GRCh38 chr19:17861588-17862688 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCATCACATCAGACATCAGAGCCCCGGGTTGTGTTTCTGCCTGGGTCACGGGACTGGAGCAGAGCTTAT GTGCCATTTCCCTGATTAGAAAGCCAGGGACCCAGGGAGCGGGTGGGTGGCATGGTGGGACACCTTGGTT GGTGCTGTCTTCCCTGGGCCCTGTCTGTTAAGTGAGGAGAGGTGATGGCTATCTGGTCAGTGGGTGGTAG CTAGGTTGGCCCAGACAGGTTCCAGGAGACTTGAGTTCAGGAACTGCATCTGGGGCTGGGTTGGTGTCCG TGGCAGAAGCCTGGACTTCAGGCTGTTGCCATGGGAAGTTCCCTTACCTCACGCTCCCTGAGGATGCCTG AAGGTAGGTGGGGCTGGGAAACTGAGGCACAAGAGTCTGGCCATAGAGTAGGCCTGGAGCCTGGGGTGTG CTTTAGAGGCAGAGGGTTCAGTGAGGATGGGGCTAGGGCACATCGGCTTGCTGCTCTCACATCTCCCTGT GGCCTCTCCTTGGCAGGTGTTTGAGAAGTCCCCCCTGCGGGTGAAGAACTTCGGGATCTGGCTGCGCTAT GACTCCCGGAGCGGCACCCACAACATGTACCGGGAATACCGGGACCTGACCACCGCAGGCGCTGTCACCC AGTGCTGTAAGCTGCCTGTCCCGCCTCCAGCTTTTTAGACCCTCCTTGACTCCCTCACACTGAGGCAGGG CAAGTGCCAGAGGTTCCCAGTGCAGGAGAGTCTCAGGACTGGTGGCGGGGCACAGGAAGACAAAAGGATG CCCCAGGCCCCAGATGGCGCTTTTCTGAGAGCCCTGCCAGGCTCGGTTGTAAATCACATCACATCTGGAA ACTCCCTTTTTGGGTCTGCACCTTGTTTAGACTGGGATCCACATCACCACTGTTTTCTGGGACCCACTGA GAACCGAATTGAACCCCTGCCTAGTGTTGGGAGCTGGCACCTTTTCCCTGGCTCACCTGCCAGGGTCTGT GAGACCCCCACACCTCCCTGATTGCACCTAAACCCAAGAATCACTGTTTCTTATAGCGGTGGTTTAAACA GAGGTGCAAACAGCAAGCGGATCTTGTCGCCTTTGGGGGGCTGTGGCCGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_B5JNT · promoter · 17859420–17859942 · regulatory
ENSR19_567FCD · CTCF_binding_site · 17859605–17859626 · regulatory
ENSR19_994DZ · promoter · 17860273–17860773 · regulatory
ENSR19_B5JP3 · enhancer · 17860774–17861305 · regulatory
· motif · 17859508–17859518 · motif
· motif · 17859607–17859623 · motif
· motif · 17859715–17859724 · motif
· motif · 17859784–17859793 · motif
· motif · 17859863–17859873 · motif
· motif · 17860121–17860131 · motif
· motif · 17860132–17860148 · motif
· motif · 17860132–17860148 · motif
· motif · 17860278–17860298 · motif
· motif · 17860279–17860299 · motif
· motif · 17860506–17860526 · motif
· motif · 17864385–17864393 · motif
· motif · 17864427–17864442 · motif
· motif · 17864427–17864442 · motif
· motif · 17864864–17864880 · motif
· motif · 17865494–17865506 · motif
· motif · 17866129–17866138 · motif
· motif · 17866129–17866138 · motif
· motif · 17866131–17866147 · motif
· motif · 17866131–17866147 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORA68 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000384437 ★ | snoRNA | 133 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORA68 被預測位於核仁;來源未提供實驗驗證、定位變化條件或不同 RNA 形式之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的RNA定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 SNORA68 可能參與 RNA 加工,並可能位於核仁;這些屬於預測性描述,未提供具體加工步驟或定位的實驗細節。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORA68 被預測位於核仁;此定位描述屬預測性資訊,未附帶實驗驗證或其他條件。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
ATTGCACCTAAACCCAAGAATCACTGTTTCTTATAGCGGT40GGTTTAAACAGAGGTGCAAACAGCAAGCGGATCTTGTCGC80CTTTGGGGGGCTGTGGCCGTGCCCCTCAAAGTGAATTTGG120AGGTTCCACAACT133cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。