基因總覽
SNORA65 的正式名稱為 small nucleolar RNA, H/ACA box 65,屬於非編碼 RNA。其名稱指出它歸於 H/ACA box 小核仁 RNA 類別;現有資料未提供更具體的 RNA 結構特徵或產物資訊。資料將其列為預測可能參與 RNA 加工的 RNA,並預測其位於核仁;這些描述屬於預測,不能視為已確立的功能或定位。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000364432 ★ | 127,448,501–127,448,630 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料預測 SNORA65 可能參與 RNA 加工,但未說明涉及哪些 RNA、加工步驟或分子作用方式。因此,這項功能資訊僅支持其與 RNA 加工相關的推測,無法據此進一步描述具體機制、作用對象或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>SNORA65 ENST00000364432 GRCh38 chr9:127448530-127449630 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATTCAGAACAGACAGGCCCAGGTATTTGCTTGTGCTTGGTTTCGGGAGAGGAGGGTGGGGGGACAGGTAG CAACCCTCTGGGATTCCTGAAGAGTATTTCTGCCACCAGTGGTGAGCCGAGAGTGATTTCACCTTGTTGG GGAGGCTTTGTCAAGAGTACGGACCTAGGGCAAAGACTTGGACAGTGTGTGGCCATGATTTTTGAGAGCC AGCGTGCATGGCAGTATTCACTGGAGGTGGAGTATTCACTCAGGAATCTCTTCTGCAGATTGAGGTGGTG CCTTCTGCCTCTGCCCTGATCATCAAAGCCCTCAAGGAACCACCAAGAGACAGAAAGAAACAGAAAAACA GTAAGTTGTCTTTTCCCTAGTTTGGTTTTGGTAATGGTTTGTGAGATGTTTGATATATGTGGCTGTGTTT TCCCTTAAAGGAAACCTGGGGTTGACATGGGTATTGGGTGTTGATATGGTTAGGGCTGCTAGAGCCAGGT AGTATGAAAAAGTGCCACGTATGCTGGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTGGGAGGCTGAGGCGGG TGGATCAGTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCCACCAAAAAA TACAAAATTAGCCTGGTGGTGCTCGCCTGTAGACCTGGCTACTCAGACGGCTGAGGCAGGAGAATCACTC GAACCCAGGAGGTGGAGGTTGTAGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGTG AGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTGCCATGTAGTCCCTGTGTGGGGCAGGCCCCAATCAGTGCA TGTGGGAGGAAGATGTCAGCAATAATGACCTATAATCAGGAGACCACATACAGGTGGCAGGTACTGGGCA GTTTAACTCCCTGGCAATTTAAGCTTGTCATTTCTCTAAAACAGTTTCTGCCATGTCAGATTTGTGAAGG CTTGGTTTTGCCCTCAGCCACCCGCCACTGCACCTGACCAGGTCTCTGTTGGCTGGTGCAATCCAGTGGT GAGCTGATAGTAAACCCCAGCTTAGGAAACAGGGTTGTTCTTCATGTGGAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_BX9X7 · promoter · 127451363–127452265 · regulatory
ENSR9_534ZDXQ · CTCF_binding_site · 127452253–127452274 · regulatory
ENSR9_BX9XB · enhancer · 127452266–127453048 · regulatory
ENSR9_534ZF2Z · CTCF_binding_site · 127452728–127452749 · regulatory
· motif · 127443924–127443938 · motif
· motif · 127443924–127443938 · motif
· motif · 127444319–127444333 · motif
· motif · 127444654–127444671 · motif
· motif · 127444822–127444839 · motif
· motif · 127445075–127445089 · motif
· motif · 127445075–127445089 · motif
· motif · 127445233–127445247 · motif
· motif · 127445233–127445247 · motif
· motif · 127445613–127445624 · motif
· motif · 127446734–127446742 · motif
· motif · 127447725–127447736 · motif
· motif · 127447912–127447925 · motif
· motif · 127447912–127447925 · motif
· motif · 127449282–127449302 · motif
· motif · 127450417–127450428 · motif
· motif · 127450781–127450790 · motif
· motif · 127450967–127450989 · motif
· motif · 127450967–127450989 · motif
· motif · 127451077–127451086 · motif
· motif · 127451371–127451384 · motif
· motif · 127451406–127451415 · motif
· motif · 127451456–127451469 · motif
· motif · 127451597–127451619 · motif
· motif · 127451597–127451619 · motif
· motif · 127451977–127451992 · motif
· motif · 127452255–127452271 · motif
· motif · 127452728–127452740 · motif
· motif · 127452730–127452746 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORA65 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000364432 ★ | snoRNA | 130 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
資料預測 SNORA65 位於核仁;此定位屬於預測,來源未提供其他細胞區室、定位變化條件或不同 RNA 形式之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的RNA定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
DNA 與 RNA 序列
CCCGCCACTGCACCTGACCAGGTCTCTGTTGGCTGGTGCA40ATCCAGTGGTGAGCTGATAGTAAACCCCAGCTTAGGAAAC80AGGGTTGTTCTTCATGTGGATGACTCTGTGCCGAAAGCAT120GGGAACAGCC130cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。