基因總覽
SAP30 的正式名稱為 Sin3A associated protein 30，屬於蛋白質編碼基因，產物歸於 SAP30 family。這項蛋白質與轉錄抑制相關，並參與 Sin3 組蛋白去乙醯化酶複合體的功能性招募。來源資料指出其可在複合體中作用於組蛋白八聚體，但對核小體中的組蛋白不具去乙醯化活性；詳細作用條件見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296504 ★ | 173,370,954–173,377,532 | 4 |
| ENST00000932477 | 173,370,908–173,380,480 | 3 |
| ENST00001127091 | 173,370,908–173,377,534 | 4 |
| ENST00001141339 | 173,370,908–173,380,480 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SAP30 參與將 Sin3 組蛋白去乙醯化酶複合體招募至特定一部分 N-CoR 共抑制複合體。此招募作用與 N-CoR 所介導的轉錄抑制相關，資料指出 SAP30 能促進這類抑制功能。
其去乙醯化作用受底物狀態限制：SAP30 在複合體中可作用於組蛋白八聚體；但對核小體中的組蛋白，則沒有去乙醯化活性。因此，來源所述的功能不能概括為對所有組蛋白底物皆具有去乙醯化作用，而須保留複合體與底物形式的差異。
在微生物感染相關情境中，SAP30 也與 HHV-1 的 TK 和 gC 基因轉錄抑制有關。來源未進一步說明此作用的分子步驟或條件，故可確定的範圍僅限於其涉及這兩個病毒基因的轉錄抑制。
Promoter 與基因調控
>SAP30 ENST00000296504 GRCh38 chr4:173369954-173371054 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGCGCTTTTCAGGACTCAGGAAATGCGCTTTCTGCTCCCCGCGCCCGGTAGAGCTAATGCAGGGAAGTTT CTGGGAACATTCGACCAGCGTTTGTATTGGTGAGGTTCCAAGTTTCCTTTAAAATGATATGACTCCGCCC TTCTCCAAAACCGTTTGAGGAGAAATGGAAAAGGTTGGGCGTGGAGGTGAAAAGGAGCCCTGTTGTCAAC TGGTCCGTACTCCACCTCAGGAGGCGGCCAACTTGGTGCGCCCAAGAATAAAAACATTTCCCTTGTAAGA ACATGCAAGTGTTTAGAAACGCCCCCCCACCCCCCCGCAAGGCGTTTGTGAGGGGGACCTGTCACAGTTG AGAAGTCAGGATGGGCGTTTTCCTCCCAGGAGGTGCCCTATTAATTTGCGGCCTCGATAGTTGGTCAAGC CGGGATGTTAGCTGCGGAACCTCCAGGACCGAAGAGCGCCAATTCTCCTGAGTTCTCCTTGGTTTGGGTT TCCCACAAAAGAGTGGTCACACCAAAAACTCTGTCTCCACAAATGCGAAACGGGCTCGAAACTTTTTTTT CCCCACACGATCACTTCCCACACCACTCCCATCCCTTTATGTTTCGCCTCAGGAGTCGAGGAACTTCTCT GAAAACCAATTCTACGATATTCCAGCAGCTAAACACAGCCCGAATTCCCTAGAAACAGAGAGAGCGAGAG AAAACACTGTAAACCCCAATCACACGCTCCTGTTTTCCCGGTACTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGT GGGTCCGTGGCCGCGCTATGCATGCTAGGATTAGTAGTTCCTCCGTCCCTCATGGCGCGGGGTCAGGGCG GAGCTCAGGTTGACTCTGCAGCAGAGAACTACAATTCCCATGGGGCCGCGCGGCAGAAAGAAAGGGGCGG GACGGGAGGGGGCGCGTCGCGCTTGCGCAGGTCCCGGGGCCGGAGGGAGGCGGAGGCGTAGCGGTCCAAC TGCTGAAGTCCCCATGTGACAGTGAGCGGGGTCCCCGCTCCAGGAGACGCTCGAGTCTGCGTCCCGGCCC TCAGCACTGTCCACTGTTTCGGTGCCAGCAGAGACCAGCAGGCCCGGGACA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SAP30_3 ↗ | 4:173,369,938 | 正股 | 173,369,889–173,369,948 |
| SAP30_1 ↗ | 4:173,370,954 | 正股 | 173,370,905–173,370,964 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_94JRX7 · enhancer · 173367310–173367688 · regulatory
ENSR4_94JRXD · enhancer · 173368033–173368306 · regulatory
ENSR4_94JRXP · enhancer · 173369083–173369505 · regulatory
ENSR4_B39DZG · promoter · 173369506–173370303 · regulatory
ENSR4_874LXC · promoter · 173370711–173370964 · regulatory
ENSR4_53HR2HW · CTCF_binding_site · 173370861–173370882 · regulatory
ENSR4_53HR2J4 · CTCF_binding_site · 173370899–173370920 · regulatory
· motif · 173367949–173367971 · motif
· motif · 173367949–173367971 · motif
· motif · 173369752–173369760 · motif
· motif · 173369835–173369846 · motif
· motif · 173369859–173369870 · motif
· motif · 173369881–173369892 · motif
· motif · 173369881–173369892 · motif
· motif · 173369885–173369896 · motif
· motif · 173369913–173369924 · motif
· motif · 173369913–173369924 · motif
· motif · 173369940–173369951 · motif
· motif · 173369940–173369951 · motif
· motif · 173369948–173369959 · motif
· motif · 173369948–173369959 · motif
· motif · 173370107–173370118 · motif
· motif · 173370442–173370453 · motif
· motif · 173370827–173370840 · motif
· motif · 173370827–173370840 · motif
· motif · 173370856–173370866 · motif
· motif · 173370863–173370879 · motif
· motif · 173370866–173370879 · motif
· motif · 173370871–173370881 · motif
· motif · 173370881–173370892 · motif
· motif · 173370881–173370892 · motif
· motif · 173370901–173370917 · motif
· motif · 173370910–173370923 · motif
· motif · 173370915–173370925 · motif
· motif · 173371191–173371207 · motif
· motif · 173371229–173371246 · motif
· motif · 173371238–173371255 · motif
· motif · 173371325–173371342 · motif
· motif · 173371520–173371535 · motif
· motif · 173371591–173371608 · motif
· motif · 173372109–173372126 · motif
· motif · 173372118–173372126 · motif
· motif · 173372221–173372236 · motif
· motif · 173374779–173374790 · motif
· motif · 173374783–173374797 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：220 aa
SAP30 蛋白長 220 個胺基酸，屬於 SAP30 family。其第 67–115 位胺基酸區段註記為非典型鋅指；第 123–143 位為無序區。第 1–129 位與 NCOR1 互作相關，第 130–220 位則與 SIN3A 互作相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SAP30 的定位註記為細胞核；來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- APBB2Q92870-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG3O95817 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DR1Q01658 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ELAVL4P26378-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTF2BQ00403 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTF3C3Q9Y5Q9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDRG1Q92597 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIAS4Q8N2W9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNCAP37840 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SAP30 是組蛋白去乙醯化酶複合體的組成成分；相似性推斷資料指出，該複合體至少包含 SIN3A、HDAC1 與 HDAC2。另有相似性推斷指出，SAP30 位於包含 SINHCAF、SIN3A、HDAC1、SAP30、RBBP4、OGT 與 TET1 的複合體中。互作資料記載 SAP30 與 HDAC1、HCFC1、SAP30BP 有互作；與 SIN3A、SIN3B、HDAC2、RBBP4、NCOR1 及 SAMSN1 的互作則標示為相似性推斷。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SAP30 參與將 Sin3 組蛋白去乙醯化酶複合體招募至特定一部分 N-CoR 共抑制複合體，並可透過 N-CoR 促進轉錄抑制。在複合體中，它能去乙醯化組蛋白八聚體，但對核小體中的組蛋白沒有去乙醯化活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in the functional recruitment of the Sin3-histone deacetylase complex (HDAC) to a specific subset of N-CoR corepressor complexes. Capable of transcription repression by N-CoR. Active in deacetylating core histone octamers (when in a complex) but inactive in deacetylating nucleosomal histones PMID 9651585 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染相關情境中，SAP30 參與抑制 HHV-1 的 TK 與 gC 基因轉錄；來源未進一步限定感染條件或說明作用機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Involved in transcriptional repression of HHV-1 genes TK and gC PMID 21221920 ↗ |
| 交互作用 | SAP30 是組蛋白去乙醯化酶複合體的成分；相似性推斷資料列出含 SIN3A、HDAC1、HDAC2 的複合體，以及含 SINHCAF、SIN3A、HDAC1、SAP30、RBBP4、OGT、TET1 的複合體。另有實驗互作記錄涉及 HDAC1、HCFC1、SAP30BP；與 SIN3A、SIN3B、HDAC2、RBBP4、NCOR1、SAMSN1 的互作屬相似性推斷。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the histone deacetylase complex that includes at least SIN3A, HDAC1 and HDAC2 (By similarity). Found in a complex composed of at least SINHCAF, SIN3A, HDAC1, SAP30, RBBP4, OGT and TET1 (By similarity). Interacts with HDAC1. Interacts with SIN3A, SIN3B, HDAC2, RBBP4 and NCOR1 (By similarity). Interacts with SAMSN1 (By similarity). Interacts with HCFC1. Interacts with SAP30BP PMID 12670868 ↗ · PMID 15496587 ↗ · PMID 9651585 ↗ |
| 細胞定位 | SAP30 的細胞定位記錄為細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTGAGCGGGGTCCCCGCTCCAGGAGACGCTCGAGTCTGC40GTCCCGGCCCTCAGCACTGTCCACTGTTTCGGTGCCAGCA80GAGACCAGCAGGCCCGGGACAGTTGGTGTTTGGCCGTGCC120GCTGTCTAACTTGGTGTGCAGAGTGAATTGCCGCTGCCGG160AGCGGAGAGAGGCGGAGCGGCCAGGAGAGAGGGGATTTCT200GTCAGCGCCGGCCTCGGGAGCTCGGAGACATGAACGGCTT240CACGCCTGACGAGATGAGCCGCGGCGGGGATGCGGCCGCC280GCAGTGGCCGCAGTGGTCGCTGCCGCGGCCGCCGCCGCCT320CGGCGGGGAACGGGACCGGCGCGGGCACCGGGGCTGAGGT360GCCGGGCGCGGGGGCGGTCTCAGCGGCTGGGCCCCCGGGG400GCGGCCGGGCCGGGCCCCGGGCAACTGTGCTGCCTGCGGG440AGGATGGTGAGCGGTGCGGCCGGGCGGCAGGCAACGCCAG480CTTCAGCAAGAGGATCCAGAAGAGCATCTCCCAGAAGAAG520GTGAAGATCGAGCTGGATAAGAGCGCAAGGCATCTTTACA560TATGTGATTATCATAAAAACTTAATTCAGAGTGTTCGAAA600CAGAAGAAAGAGAAAAGGGAGTGATGATGATGGAGGTGAT640TCACCTGTTCAAGATATTGATACCCCAGAGGTTGATTTAT680ACCAATTACAAGTAAATACACTTAGGAGATACAAAAGACA720CTTCAAGCTACCAACCAGACCAGGACTTAATAAAGCACAA760CTTGTTGAGATAGTTGGTTGCCACTTTAGGTCTATTCCAG800TGAATGAAAAAGACACCTTAACATATTTCATCTACTCAGT840GAAGAATGACAAGAACAAATCAGATCTCAAGGTTGATAGT880GGTGTTCACTAGGAGACGTGGAATTGAGACTAATAACTTG920GATGTTAACACTGTTTACTGTTTTTTCACATGTAGAAATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。