基因總覽
SALL3（spalt like transcription factor 3）是位於人類第 18 號染色體 18q23 的蛋白質編碼基因，所產生的蛋白質屬於 sal C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質長 1,300 個胺基酸，序列包含多個 C2H2-type zinc finger，其中第一個被註記為非典型型式；此外，序列中也有數段被預測為無序區域。資料將其功能概述為可能的轉錄因子，但未提供更細的作用機制或靶標資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000537592 ★ | 78,979,818–78,998,969 | 3 |
| ENST00000925065 | 78,979,419–79,002,126 | 3 |
| ENST00001131967 | 78,979,419–79,002,126 | 3 |
| ENST00000575389 | 78,980,275–78,997,631 | 4 |
| ENST00000536229 | 78,991,682–78,997,322 | 3 |
| ENST00000573324 | 78,994,798–79,002,677 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SALL3 的產物被註記為可能的轉錄因子，表示其可能參與轉錄調控；不過，現有資料未進一步說明它所辨識的 DNA 序列、調控哪些基因，或對轉錄造成何種方向與程度的影響，因此不能據此指定更具體的分子機制或生物學過程。
Promoter 與基因調控
>SALL3 ENST00000537592 GRCh38 chr18:78978818-78979918 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCGGGGGCACATCCTGGCGGCCGCTCGGGGAGAGAGGACACGCGCGGGAAGGAGCGCGGCGGGTGCAC GGCCGCGGGTGGGAGTACGCGCCTGTGCGCGCGGGGCGAGGGCGAGGGCGCGTGCGTGTGACCGCGGGGA GGGGGCGGGCGCGTGTGCGGGGAGCGCGCCGCGCCAGGGGCCGAGTGTGTGGGGCCGATCCAGAAGTGCG CAGCCCCCTCACCTGGCCCCCGTGTCATCCCCGAAATCCCGGGAAAGGGTGGGCCGCGCGCGGGAGTTTG GTGGAGTTGGAACTTTCGGTCGCGCTCGCTGCCCACTCCGCTGGCGCCCGGTGGCCCGTGGTGAAGGGGG ACTAGGGTGGGGAACACCGGGGCCCTGCGGTCCCCTCCCTTTCCTGTATTTAAGAAGCCGCCGGCGGCGC AGAGGCCCAGGCGGGCTGGCGCGGGGGCGAGGCGGCCCGGTGGCAGCAGCGGGCGGGGCGGGCGCTCCGG AGTCGGTGGGGCCCGCGGGTTGGGGGGCGGGGAGAGGGGGGAGTGGAAGGGAGGGGGAACGCAGGGGAGG GAGAGGAGGGGAGGAGCCGCGCGGCCCGCGCCGCTTCCGAACCGGAAAGTTGGTCTTGCCGAAGTCCTGC CACCCCGGCGTGCGCACTCCGCTCCGCTCCGGCCGCGAGCCTCCGAGCCCGGCCGGCCGCCGGGGGAAGC CCGCGGAGGGGACGCGGGGCCGGGCGAGAAGGTCCGGAGAGCGGGGGGCACCTGAGCCCGGGCGGGCCCG CCGCGCTGAGCGGCGCTGAGAGCCGCGGCGGAGCAGCGAAGGCGGCCGGCCGACCCCGCGCGCCCGGAAC AGGAGGCGCGGCGCCCGAGCGGCCCGGGCGAGACAAAGGCGCCGGGTCGGAGCCCTGCCCGCGGCCGCTC GCTCCGGGAGGGGCCGCCCGGCGGCGGCGGCGGGGGGGGCGCGGGCGGCGGCGCAGACACTCTATAAAGG GGCGAGCCCGGCGCGCCGGCGGAGACGGCGCCGCGCGGACGCCGCCAAAGTTTGCTGCCTGCGCCCTGCG GAGGGACGGCCACCGCGGCCCGCGCCGCACCCGGGCCCCGCCACAGCCGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR18_BKN78 · enhancer · 78977790–78978777 · regulatory
ENSR18_84BNRD · promoter · 78978833–78978964 · regulatory
ENSR18_BKN7F · enhancer · 78978969–78979710 · regulatory
ENSR18_936CF2 · promoter · 78979899–78980285 · regulatory
ENSR18_936CFB · enhancer · 78980886–78981174 · regulatory
ENSR18_BKN7Q · enhancer · 78981457–78981998 · regulatory
ENSR18_936CFP · enhancer · 78982319–78982600 · regulatory
ENSR18_936CG4 · enhancer · 78983587–78983860 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1300 aa
SALL3 蛋白質長 1,300 個胺基酸，屬於 sal C2H2-type zinc-finger protein family。序列註記十個 zinc finger：第一個為非典型 C2H2-type，其餘九個為 C2H2-type。另有多段區域被註記為無序區域；這些序列特徵不等同於已確立的個別功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GGAGACGGCGCCGCGCGGACGCCGCCAAAGTTTGCTGCCT40GCGCCCTGCGGAGGGACGGCCACCGCGGCCCGCGCCGCAC80CCGGGCCCCGCCACAGCCGCACCCGGGGCGGCCGAGGAGC120GCGGCGCCGGAGCCCGCGATGTGAGGCGGCGCCGGGCAGC160GCGCGCCCCGGTCCCGAGGCGCCGCGGCCCCCTCCTCGTC200GGCGCGGCCGCTAATTGCGAGCGCGGCCTCATTTGCATAG240GCCGCCGGAGTCCGCTGGAGCCCGGCCAATCGGCGCGGCC280CTCCGCTAATGGCCATGCATTATTCACCAGCCTAATTGCT320CAGCCCCATGCGCGGCCCGCGCAGCCGCCGCCGCCCCGCG360CCCCGCGCCGCGCGCCCGCCAGGCCGCCCCGCGCCGTCCC400CGCCGGCCGCCCCGCTGATGCCGCTGCCCCGCGCGGGGCC440CGAGCGCCGCTAGCAGCATGTCTCGGCGCAAGCAGGCCAA480GCCCCAGCACCTCAAGTCGGACGAGGAGCTGCTGCCGCCT520GACGGGGCTCCCGAGCACGCCGCCCCGGGGGAAGGTGCGG560AGGACGCAGACAGCGGGCCCGAGAGCCGCAGCGGGGGCGA600GGAGACCAGCGTGTGCGAGAAATGCTGCGCCGAGTTCTTC640AAGTGGGCGGACTTCCTGGAGCACCAGCGGAGCTGCACCA680AGCTCCCGCCCGTGCTGATCGTGCACGAGGACGCGCCCGC720GCCGCCCCCCGAGGACTTCCCCGAGCCTTCGCCCGCCAGC760TCCCCCAGCGAGCGCGCCGAAAGCGAGGCGGCCGAGGAGG800CGGGTGCGGAGGGCGCGGAGGGCGAGGCCAGGCCGGTGGA840GAAGGAGGCCGAGCCCATGGACGCGGAACCCGCGGGGGAC880ACGCGCGCGCCCCGGCCCCCGCCTGCGGCCCCTGCACCCC920CAACGCCCGCCTACGGCGCGCCCAGCACCAACGTGACCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。