演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SACSARSACS

sacsin molecular chaperone

SACS 編碼 sacsin molecular chaperone,是一種調節 Hsp70 分子伴侶系統的共伴侶蛋白;其基因變異與痙攣性共濟失調 Charlevoix-Saguenay 型相關。

Homo sapiens13q12.12UniProt Q9NZJ4
OFFICIAL SYMBOL
SACS
CHROMOSOME
13
UNIPROT
Q9NZJ4
PDB / ALPHAFOLD
5V44
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SACS(sacsin molecular chaperone)是蛋白質編碼基因,產物為大型蛋白質 Sacsin,長 4,579 個胺基酸。其序列包含 N 端 Ubiquitin-like 結構域,以及位於 C 端的 J 與 HEPN 結構域;靠近 C 端另有數段被註記為無序區域。現有資料將 Sacsin 歸為共伴侶蛋白,並指出其可調節 Hsp70 分子伴侶系統。基因位於第 13 號染色體 13q12.12。

Official symbol
SACS
Gene name
sacsin molecular chaperone
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10519
UniProt
Q9NZJ4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ARSACSKIAA0730DKFZp686B15167DNAJC29SPAX6PPP1R138

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1313q12.12
chr13 · 114,364,328 bp · GRCh38chr13p13 · 1–4600000 · gvarchr13p12 · 4600001–10100000 · stalkchr13p11.2 · 10100001–16500000 · gvarchr13p11.1 · 16500001–17700000 · acenchr13q11 · 17700001–18900000 · acenchr13q12.11 · 18900001–22600000 · gnegchr13q12.12 · 22600001–24900000 · gpos25chr13q12.13 · 24900001–27200000 · gnegchr13q12.2 · 27200001–28300000 · gpos25chr13q12.3 · 28300001–31600000 · gnegchr13q13.1 · 31600001–33400000 · gpos50chr13q13.2 · 33400001–34900000 · gnegchr13q13.3 · 34900001–39500000 · gpos75chr13q14.11 · 39500001–44600000 · gnegchr13q14.12 · 44600001–45200000 · gpos25chr13q14.13 · 45200001–46700000 · gnegchr13q14.2 · 46700001–50300000 · gpos50chr13q14.3 · 50300001–54700000 · gnegchr13q21.1 · 54700001–59000000 · gpos100chr13q21.2 · 59000001–61800000 · gnegchr13q21.31 · 61800001–65200000 · gpos75chr13q21.32 · 65200001–68100000 · gnegchr13q21.33 · 68100001–72800000 · gpos100chr13q22.1 · 72800001–74900000 · gnegchr13q22.2 · 74900001–76700000 · gpos50chr13q22.3 · 76700001–78500000 · gnegchr13q31.1 · 78500001–87100000 · gpos100chr13q31.2 · 87100001–89400000 · gnegchr13q31.3 · 89400001–94400000 · gpos100chr13q32.1 · 94400001–97500000 · gnegchr13q32.2 · 97500001–98700000 · gpos25chr13q32.3 · 98700001–101100000 · gnegchr13q33.1 · 101100001–104200000 · gpos100chr13q33.2 · 104200001–106400000 · gnegchr13q33.3 · 106400001–109600000 · gpos100chr13q34 · 109600001–114364328 · gnegSACSpq1 bp114,364,328 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr13:23,288,689–23,433,763
Gene span
145,075 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000382292 ★23,328,830–23,433,70210
ENST0000068321023,288,689–23,433,75210
ENST0000068277523,310,748–23,433,75210
ENST0000068449723,322,301–23,433,75210
ENST0000040236423,328,826–23,375,5438
ENST0000102339023,328,828–23,433,75211
ENST0000045547023,328,830–23,433,75211
ENST0000068294423,328,830–23,433,75211
ENST0000113181823,328,830–23,433,75210
ENST0000042315623,328,833–23,433,75210
ENST0000068336723,328,862–23,375,6009
ENST0000068348923,328,929–23,433,75211

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Sacsin 被描述為共伴侶蛋白,主要角色是調節 Hsp70 分子伴侶系統。這項註解指出它參與伴侶機制的調控,但未進一步說明調節所涉及的分子步驟、底物範圍或具體作用方向,因此不宜據此推定更細的反應機制。

來源也指出,Sacsin 可能參與其他與共濟失調相關蛋白質的處理。這項描述帶有可能性,並未列出相關蛋白質的名稱,也未界定「處理」所指的具體過程;因此可確定的範圍僅是其可能與這類蛋白質的處理有關,不能延伸為特定蛋白質的折疊、降解或其他機制。

就生物學意義而言,資料支持 Sacsin 同時具有調節 Hsp70 伴侶系統的共伴侶角色,以及可能參與其他共濟失調相關蛋白質處理的功能線索。現有功能描述未提供實驗系統、特定生理條件或上述可能作用的直接結果,故其對細胞過程的具體影響仍無法由此來源進一步界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23433702 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SACS ENST00000382292 GRCh38 chr13:23433602-23434702 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGACACCATTTCTCCCCAATAGAAATGTGCTTTGTTTGTGATTATTCAGTCCTTTTGTTAGAACAGGTCT
CCCACCTATCTCCCAGGAAATAATATGTACACAAATCTGTGAGTCTAGGATGTGAAGGAGACACCATTAG
ATGTGGCATCTTCTGGGTCAGACCAGTGCAGGGCCAGGTACAAGAAGCAGGGGCTCTCCTTCCCCAGTTG
CTGCTGACATTTGGGGCTTGCTTTGGTCTTCTCCCAGGAGAGATCATTTGAGCCTTTTCAGGTCTGGAGT
TGTTTGAACTGACTTAAGAGGAATTTTCCGCAGGAACGAAGCAATAAGAAGCTTCCGAGATCCAGTATTT
CCAGATAAGCCAAAATTCTAGATTTATATGGATAAAGCAGGCAGTTCTACTAGGAGACTATCATGAGGAA
TATGATGTACCCAGGCCAGTGGCAGGATAGCTGTGCGCCGAAATGAAATAAATGCTGGTGGTATTTCACA
TACCCCATCAGAGGAAGCAAGAAAATAGAGTTACAATATTTTGTATTATTAAATTGAGACTAGCAATTTC
AACTTAGAACAGGATCAATTGTATAGCATTTCACAGTTTACCACACATTTTGAGTGAATGCTTTTTTTTT
TAACCATTGGAACCTCATAAACAACTCCAAATAACATACAAAAAGCAGATTGTGAGCTACAACATTACCA
GGTCACAGGTCTTCATTTCCCATGAGGTACTCGAGACCCATGAGTGACTTGTCTAAGGTCACACAACTGG
TGTTTAATAGAGCCAGTCTTCTGTTAGCCATACCTACTGCTAAAAATTAGCCTTTGCAAGTGAAGAGAAC
AAAAACGTGTGGTTGGTTGTCACCCCCACAATGAACGACAATGCTGCACTTGCAGCATTATTGACACCTA
AGGTTGATGACAGTCCTGTCTCTTTAAGAAGAAAAAAAAAGGCTGCTGGGTAGGGGGAGCGACTGACTGC
GGCAGGAGCCGCCTGGACCCAGTGCGGCTGCGGGACAGTCACGCTGGGAACTGCTGATGGCACTGGAGGA
AAACAAAGGCCGAGAGACCCTGATGCCCACAGCCCCCAGTAAGTCCAAGGT
SACS 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SACS_1 ↗13:23,433,702負股23,433,692–23,433,751

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR13_B6MK8 · enhancer · 23433110–23433690 · regulatory

ENSR13_9CB5L · promoter · 23433691–23434003 · regulatory

ENSR13_8NLBZ · enhancer · 23436732–23436973 · regulatory

· motif · 23437774–23437783 · motif

· motif · 23437774–23437783 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:4579 aa

1 aa4579 aa結構域功能區域
依 Q9NZJ4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Sacsin 長 4,579 個胺基酸。序列第 9–84 位為 Ubiquitin-like 結構域,第 4,306–4,393 位為 J 結構域,第 4,451–4,567 位為 HEPN 結構域。另有三段區域被註記為無序區,分別位於第 4,248–4,273、4,279–4,298 及 4,405–4,427 位。

結構域Ubiquitin-like9–84 aa
結構域J4306–4393 aa
結構域HEPN4451–4567 aa
功能區域Disordered4248–4273 aa
功能區域Disordered4279–4298 aa
功能區域Disordered4405–4427 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5V44…

PDB · 5V44

X-ray · 1.56 A · A/B/C=89-336

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

Sacsin 主要位於細胞質,少部分位於細胞核;資料亦指出其與粒線體標記 Hsp60 有部分重疊。 此處描述的是 Sacsin 的定位及其與標記的重疊,未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ARSACSSACS
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SACS 變異與痙攣性共濟失調 Charlevoix-Saguenay 型(Spastic ataxia Charlevoix-Saguenay type)相關,來源並指出此病由影響該基因的變異所致。其特徵包括早發性小腦共濟失調、痙攣、視網膜髓鞘過度形成、錐體徵象,以及軸突性與脫髓鞘性神經病變;後者伴隨感覺神經傳導喪失及運動傳導速度降低。其他表現包括構音障礙、遠端肌肉萎縮、眼球震顫、共同追視障礙、視網膜條紋,以及常見的二尖瓣脫垂。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Sacsin 是共伴侶蛋白,可調節 Hsp70 分子伴侶系統;此外,它可能參與其他與共濟失調相關蛋白質的處理。來源未列出這些蛋白質,也未說明「處理」的具體機制,因此後者應保留為可能的功能。含實驗來源
證據與來源

Co-chaperone which acts as a regulator of the Hsp70 chaperone machinery and may be involved in the processing of other ataxia-linked proteins

PMID 19208651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Sacsin 主要位於細胞質,少部分分布於細胞核;此外,其定位與粒線體標記 Hsp60 有部分重疊。來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Predominantly cytoplasmic, a small portion is present in the nucleus and also shows a partial mitochondrial overlap with the mitochondrial marker Hsp60

PMID 19208651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SACS 的變異與痙攣性共濟失調 Charlevoix-Saguenay 型相關。此神經退化性疾病以早發性小腦共濟失調、痙攣、視網膜髓鞘過度形成、錐體徵象及軸突性與脫髓鞘性神經病變為特徵,並可伴隨感覺神經傳導喪失與運動傳導速度降低。其他表現包括構音障礙、遠端肌肉萎縮、眼球震顫、共同追視障礙、視網膜條紋及常見的二尖瓣脫垂。含實驗來源
證據與來源

Spastic ataxia Charlevoix-Saguenay type SACS A neurodegenerative disease characterized by early-onset cerebellar ataxia, spasticity, retinal hypermyelination, pyramidal signs, and both axonal and demyelinating neuropathy with loss of sensory nerve conduction and reduced motor conduction velocities. Other features include dysarthria, distal muscle wasting, nystagmus, defect in conjugate pursuit ocular movements, retinal striation (from prominent retinal nerves) obscuring the retinal blood vessels in places, and the frequent presence of mitral valve prolapse. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 270550

PMID 10655055 ↗ · PMID 12873855 ↗ · PMID 14718708 ↗ · PMID 15156359 ↗ · PMID 15985586 ↗ · PMID 16007637 ↗ · PMID 17290461 ↗ · PMID 17716690 ↗ · PMID 18398442 ↗ · PMID 18465152 ↗ · PMID 18484239 ↗ · PMID 19529988 ↗ · PMID 20876471 ↗ · PMID 27133561 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000382292 · 15,635 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGCGGCTGCGGGACAGTCACGCTGGGAACTGCTGATGG40
41CACTGGAGGAAAACAAAGGCCGAGAGACCCTGATGCCCAC80
81AGCCCCCAGATCACAGAAGTGAGGCCAAGATGCCCATGTC120
121ACCAGAGCCAGAAGAAAGGCTCCTACCAAAGAATATTTTA160
161CATCTGCTGAGATGAGGGTGAGAAACAAAATCCAAGAATT200
201TCTGCGACGTTTTCCCCAAGAACCTTCAAAAAGAAATACA240
241GAAAATTCTCAGATGAAAATAAATTGATTTTGCTCTGGGG280
281GAAAGCCAAAAACCTTTAGCGAATCCACACTGTTTTATCC320
321TGAGAACTTCCATGGGTCGCTGGATCAGCAGGCAACCATT360
361ATCAGACTGGAGAGTCATACTTTAAGGAATACAAATGCAA400
401CACACGACAATGTTTCCTGACATCAGATGATGAATGGACA440
441CTGAAGGGAAAAACAGGCTTTTTTTCCACCTGGCAGGAAG480
481AGCTGAACTTGGAGTACACATTTAAAGGAAGCACAGAGGG520
521AAGACTTAAACAGAAGAAAGAAGCGTACTTTCATGGTTTT560
561CACAAACAAATATCCCAGGAGAAGTGATCATGGAGACCAA600
601GGAGAACAGGTGGGTCCCGGTGACCGTGCTCCCCGGCTGC640
641GTGGGCTGCAGGACCGTCGCGGCGCTGGCGTCCTGGACCG680
681TGCGCGATGTGAAGGAACGTATCTTCGCGGAGACTGGCTT720
721CCCGGTGTCGGAGCAGCGGCTGTGGCGCGGCGGCCGCGAG760
761TTATCTGACTGGATCAAGATTGGAGATCTGACTTCCAAAA800
801ATTGTCATCTTTTTGTAAACCTTCAATCAAAAGGCTTAAA840
841AGGGGGAGGTCGATTTGGTCAGACAACGCCACCACTTGTT880
881GATTTTCTCAAGGACATTTTGAGAAGATATCCAGAAGGAG920
921GACAGATTCTTAAGGAATTAATTCAGAATGCAGAAGATGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。