基因總覽
SAA3P 的正式名稱為 serum amyloid A3, pseudogene，屬於偽基因。現有資料提供其基因分類與名稱，未說明它是否產生 RNA 或蛋白質，也未提供家族特徵、序列結構或其他基本分子性質。因此，不能據此將 SAA3P 描述為具有特定蛋白質產物或結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000533267 ★ | 18,112,626–18,116,078 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
現有功能註記均屬預測：SAA3P 預測可能具有 Toll-like receptor 4 結合活性及趨化吸引活性，並預測可能參與對 stilbenoid 的反應。這些資訊表示可能的功能關聯，不能視為已證實的作用。資料未提供支持這些預測的實驗細節或作用機制，因此無法進一步說明其分子作用方式。
Promoter 與基因調控
>SAA3P ENST00000533267 GRCh38 chr11:18115978-18117078 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGCACACTTTTAAATAACCAGATCTCAAAAGAATTCACTCACTATCACGACGACAGTACCAAGGGGGAT GCTGTTAAACCTTTCATGAGAAACAGCCTTCCTGATTCAATCACCGCCCTCTAGGCTCCACTCCCAACAT TGGGAATTACAATTGAACATGAAATTTGGGTGGGGACACAGATCCAAACCATATCAACTTCTATCAAAGA AGAGAATGACTTGAATAAAACGAGAAAGTAGATTTCCAGCATTGAATGGTTCCAAAGGGAGTAAAATAAT TGTGACAGGATGTGATCATTGGCCCTCAATTTCTGCCTGAAGAAGAGTAGGAAAAAGGAGGTCTGGACAT CACATGCCCTGCTTTATGAAGCAGCTCCTCCAAGTACACCATGACCAGTGGCTGTGGATGGTTGACAACT CCCCTCCTCTTCCCCCTCTTCTACTGTCTACTCCTGGGACCAAGTGAGCCACGCCAGCTCAGATACTACA CTGACCACAGGGAATCCCACCTTTTCCAAGGAATGGAAGTTGTGTAGGGAATATTCAAATGTTGCTTAGC ATTGCCTTAGATAAGAACCAAAGGGACAGGGAAATCCTCTGACAGCTATCTGCCTTATAACTTTCATTTT ACTGTGCCTAAAATATGCTCAGAACCCAGAAAGAGGCATAATTCCTAATTTTGGCAGGCTCTAATCTAAA ATAATGATTCTCAAACATGGTGTGACTTTTGTCTATTTGCTTTATCCTGGGTCACTGCTCCTCTTCTGTC AGATACTGGGATTCCAATGAGACAAATGGAAATGGAGACGTAGACCCTCTGACCTTCTATCTTTTATCTA TACACATACACCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTAAAACCGAGTGGGTTTTTTTCTT GGAATGAAAGAATGGACTAACATTACAAAAAATAAAAACTTGAAACAGAATGTGTATTATCCTTGGTTGT GTTTCCTTGGCCCTGCAGCAGGATGAAGCTCTCCACTGGCATCATTTTCTGCTCCCTGGTCCTGGGTGTC AGCAGCCAAGGATGGTTAACATTCCTCAAGGCAGCTGGCCAAGGTGAGGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_B5L3W · enhancer · 18115267–18116011 · regulatory
ENSR11_56938W · CTCF_binding_site · 18115674–18115695 · regulatory
ENSR11_56939D · CTCF_binding_site · 18115778–18115799 · regulatory
· motif · 18115640–18115653 · motif
· motif · 18115640–18115653 · motif
· motif · 18115676–18115692 · motif
· motif · 18115780–18115796 · motif
基因座與轉錄註解
SAA3P 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000533267 ★ | transcribed_unitary_pseudogene | 365 nt | 3 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SAA3P 預測可能具有 Toll-like receptor 4 結合活性與趨化吸引活性，也預測可能參與對 stilbenoid 的反應；這些功能與參與關係尚屬預測。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable Toll-like receptor 4 binding activity and chemoattractant activity. Predicted to be involved in response to stilbenoid. Predicted to act upstream of or within several processes, including I-kappaB phosphorylation; cell chemotaxis; and cellular response to interleukin-1. Predicted to be located in obsolete extracellular space. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
GGATGAAGCTCTCCACTGGCATCATTTTCTGCTCCCTGGT40CCTGGGTGTCAGCAGCCAAGGATGGTTAACATTCCTCAAG80GCAGCTGGTCCAGGGACTAAAGACATGTGGAAAGCCTACT120CTGACATGAAAGAAGCCAATTACAAAAAATTCAGACAAAT160ACTTCCATGCTTGGGGGAACTATGATGCTGTACAAAGGGG200GCTTGGGGCTGTCTGGGCTACAGAAGTGACTACAGCGATG240CCAGAGAGAACGTCCAGAGACTCACAGGAGACCATGCAGA280GGATTCGCTGGCTGGCCAGGCTACCAACAAATGGGGCCAG320AGTGGCAAAGACCCCAATCACTTCCGACCTGCTGGCCTGC360CAGAG365cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。