基因總覽
SAA2（serum amyloid A2）是由蛋白質編碼基因 SAA2 產生的蛋白質，屬於 SAA 家族。來源將其描述為主要急性期反應物，並指出它是 HDL 複合體的載脂蛋白。其蛋白質長度為 122 個胺基酸，含有位於第 1 至 18 個胺基酸的訊號序列；第 88 至 122 個胺基酸則被註記為無序區。這些資料勾勒出其家族歸屬、基本序列特徵與主要身分。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000256733 ★ | 18,245,240–18,248,668 | 4 |
| ENST00001126117 | 18,238,236–18,248,668 | 4 |
| ENST00000997149 | 18,238,265–18,248,668 | 4 |
| ENST00000414546 | 18,239,029–18,248,668 | 4 |
| ENST00001093491 | 18,239,029–18,248,640 | 4 |
| ENST00001126118 | 18,239,029–18,248,668 | 3 |
| ENST00001126119 | 18,239,180–18,248,668 | 4 |
| ENST00000530400 | 18,240,203–18,248,635 | 3 |
| ENST00001093492 | 18,241,149–18,248,668 | 4 |
| ENST00001093496 | 18,242,125–18,248,635 | 3 |
| ENST00001093494 | 18,242,128–18,248,668 | 5 |
| ENST00001093493 | 18,242,129–18,248,640 | 4 |
顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SAA2 被註記為主要急性期反應物。這項描述指出它與急性期反應有關，但來源未進一步說明其在此反應中的分子作用、作用對象或下游效應，因此不宜據此延伸推論特定機制。
此外，SAA2 是 HDL 複合體的載脂蛋白。這表示來源將它列為該複合體的蛋白質成分之一；現有資料未提供其與 HDL 其他成分的結合方式，也沒有描述它對複合體功能或脂質運輸的具體影響。
上述註解概括了 SAA2 的主要功能身分，但未交代其作用發生的細胞或組織情境，也未說明急性期反應與 HDL 複合體關聯之間是否存在直接連結。因而，現有資料支持將 SAA2 描述為主要急性期反應物及 HDL 複合體載脂蛋白，不能據此補充未載明的生物學過程或功能後果。
Promoter 與基因調控
>SAA2 ENST00000256733 GRCh38 chr11:18248568-18249668 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCTGGCCCATTTCTAAATTGCTTGTTTGTTTGTTATTACAAATGCCTAGCCCTCAGGGTATGAACATGG ACTGGAGAAGAAGAAACCAGAGTTGCTGCTATGTCCACCAGCCTCTCTGCATGTCCTGGCCTCAGCCCCC CTGGGCTCTGGTACTGACCCATCTCTGGCCACCATGCTCCTCCATAAGCCTCTGCAGAGCTAATCTGACC CTGTTGATGTTCTCATGAGAGAGTGATCTGCATGCCCCCTGCACCCCTCCGTGATAATACAGCAGACCAA GAGCTCTCCCACCCTTCCCTGCCTGGATGCTGGGCACGTCCCCAGCTGGGCTGCCTATTTAACGCACCAC ACTCTCATTCTCCCAAGGTGGGGCTCCAGGACTAGGCTGGGGCAGCAGAAAGTCCCCCTCTCTACATTGT CCTTGGCTCAGGAGCCAACTTAGAAAAAGCATTTCCAAATTGGCTAAGCCAGCGGAGCAGAGATTTTCTG TGCTGAGAAATATCAGGACATCCAGAGGGGTGGAAGGAGGCTTCCAGGGCACACATGAGATGTGGCAGGG GTAGGCTGTCCGTTTTAAAGCTTAAAGCTTTAGACATGAACTCACAGGGATTTCAGTCAGGGTCATCTGC CATGTGGCCCAGCAGGGCCCATCCTGAGGAAATGACCGGTATAGTCAGGAGCTGGCTGAAGAGCTGCCCT CACTCCACACCTTCCAGCAGCCCAGGTGCCGCCATCACGGGGCTCCCACTGGCATCTCTGCAGCTGCACT TCCCCCAATGCTGAGGAGCAGAGCTGATCTAGCACCCTGTCCATTGCCAAGGCACAGCAAACCTCTCTTG TTCCCATAGGTTACACAACTGGGATAAATGACCCGGGATGAAGAAACCACCGGCATCCAGGAACTTGTCT TAGACCAGTTTGTAGGGGAAATGACCTGCAGGGACTTTCCCCAGGGACCACATCCAGCTTTTCTTCCCTC CCAAGAGACCAGCAAGGCTCACTATAAATAGCAGCCACCTCTCCCTGGCAGACAGGGACCCGCAGCTCAG CTACAGCACAGATCAGGTGAGGAGCACACCAAGGAGTGATTTTTAAAACTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SAA2_2 ↗ | 11:18,248,635 | 負股 | 18,248,625–18,248,684 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_998HX · enhancer · 18243819–18244234 · regulatory
ENSR11_B5LQT · enhancer · 18246266–18247191 · regulatory
ENSR11_569TR4 · CTCF_binding_site · 18247044–18247065 · regulatory
ENSR11_8JH5L · promoter · 18248625–18248856 · regulatory
· motif · 18246751–18246766 · motif
· motif · 18246756–18246768 · motif
· motif · 18246759–18246766 · motif
· motif · 18247012–18247019 · motif
· motif · 18247046–18247062 · motif
· motif · 18247070–18247083 · motif
· motif · 18247107–18247119 · motif
· motif · 18247173–18247190 · motif
· motif · 18248063–18248076 · motif
· motif · 18248063–18248076 · motif
· motif · 18248731–18248744 · motif
· motif · 18250019–18250032 · motif
· motif · 18250019–18250032 · motif
來源指出，細胞激素刺激時與 SAA2 的調控相關；但未提供刺激條件、作用方向或表現變化的具體描述，因此無法進一步判定調控效果。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：122 aa
SAA2 蛋白質長 122 個胺基酸，屬於 SAA 家族。序列第 1 至 18 個胺基酸為訊號序列；第 88 至 122 個胺基酸則被註記為無序區。來源未提供其他結構域或功能區域的描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SAA2 被註記為分泌型蛋白質。 來源未說明其定位是否隨條件或異構型改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- CIDEBQ9UHD4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SAA2 被描述為 HDL 複合體的載脂蛋白，表示它與該複合體具有成分上的關係；來源未進一步指出特定直接結合夥伴或複合體組成。
疾病與遺傳關聯
反應性、次發性類澱粉沉積症的特徵包括 SAA2 蛋白質在多種組織的細胞外累積。這些沉積物高度不溶且抗蛋白質水解，並會破壞組織結構、損害其功能。來源描述的是疾病特徵與蛋白質沉積的關聯，未提供 SAA2 變異或直接因果證據。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SAA2 被描述為主要急性期反應物，表示它與急性期反應相關；來源未進一步交代其作用機制、作用情境或具體生理效應。 | 推論支持 | |
| 交互作用 | SAA2 被描述為 HDL 複合體的載脂蛋白，表示它是該複合體相關的蛋白質成分；來源未指出特定結合夥伴或其對複合體功能的影響。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 | |
| 調控 | 來源將細胞激素刺激列為與 SAA2 調控相關的條件，但未說明調控方向、具體表現變化或刺激的實驗情境。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 反應性、次發性類澱粉沉積症涉及 SAA2 蛋白質在多種組織的細胞外累積。沉積物高度不溶且抗蛋白質水解，會破壞組織結構並損害功能；此描述未提供 SAA2 變異或直接因果證據。 | 含實驗來源 | 證據與來源Reactive, secondary amyloidosis is characterized by the extracellular accumulation in various tissues of the SAA2 protein. These deposits are highly insoluble and resistant to proteolysis; they disrupt tissue structure and compromise function PMID 1463770 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTATAAATAGCAGCCACCTCTCCCTGGCAGACAGGGACC40CGCAGCTCAGCTACAGCACAGATCAGCACCATGAAGCTTC80TCACGGGCCTGGTTTTCTGCTCCTTGGTCCTGAGTGTCAG120CAGCCGAAGCTTCTTTTCGTTCCTTGGCGAGGCTTTTGAT160GGGGCTCGGGACATGTGGAGAGCCTACTCTGACATGAGAG200AAGCCAATTACATCGGCTCAGACAAATACTTCCATGCTCG240GGGGAACTATGATGCTGCCAAAAGGGGACCTGGGGGTGCC280TGGGCTGCAGAAGTGATCAGCAATGCCAGAGAGAATATCC320AGAGACTCACAGGCCGTGGTGCGGAGGACTCGCTGGCCGA360TCAGGCTGCCAATAAATGGGGCAGGAGTGGCAGAGACCCC400AATCACTTCCGACCTGCTGGCCTGCCTGAGAAATACTGAG440CTTCCTCTTCACTCTGCTCTCAGGAGACCTGGCTATGAGG480CCCTCGGGGCAGGGATACAAAGTTAGTGAGGTCTATGTCC520AGAGAAGCTGAGATATGGCATATAATAGGCATCTAATAAA560TGCTTAAGAGGTGGAA576cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。