基因總覽
S100P(S100 calcium binding protein P)是由蛋白質編碼基因產生的 S-100 家族成員,蛋白質長度為 95 個胺基酸。其主要特色是具有兩個 EF-hand 結構域,與鈣結合蛋白的家族特徵相符。來源資料將 S100P 描述為可能的鈣感測蛋白,並指出它可依賴鈣離子與其他蛋白質互動,因此與細胞鈣訊號及多種生理過程相關。這些資料提供了 S100P 的基本分子身分與概括角色;至於其互動方式及可能涉及的細胞作用,則需依個別情境理解。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296370 ★ | 6,693,878–6,697,170 | 2 |
| ENST00001090557 | 6,693,821–6,697,170 | 2 |
| ENST00001090559 | 6,693,821–6,697,171 | 3 |
| ENST00001090560 | 6,693,821–6,697,170 | 2 |
| ENST00001090561 | 6,693,821–6,697,170 | 2 |
| ENST00001090562 | 6,693,821–6,697,170 | 2 |
| ENST00001137612 | 6,693,821–6,697,171 | 2 |
| ENST00001090558 | 6,693,835–6,697,171 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
S100P 可能作為鈣感測蛋白,參與細胞鈣訊號。其作用方式之一是在鈣離子存在時與其他蛋白質互動;來源列出的例子包括 EZR 與 PPP5C。這些鈣依賴性互動將 S100P 與細胞內的蛋白質調節聯繫起來,但現有資料並未將其作用限定於單一途徑或細胞功能。
在上皮細胞中,S100P 可透過與 EZR 的互動,間接參與微絨毛形成。相關作用涉及微絨毛中的細胞骨架調節:S100P 的二聚體形式可結合並活化 EZR,使 EZR 暴露其 F-actin 結合位點。這提供了 S100P 連結鈣訊號與微絨毛相關生理過程的一種方式;資料描述的是間接參與,而非 S100P 本身直接構成微絨毛或直接形成 F-actin 結構。
S100P 也可能以自分泌方式刺激細胞增殖,途徑涉及活化晚期糖化終產物受體 RAGE。此描述支持其可能參與細胞增殖調節,但以「可能」表達,並未將此作用推廣為所有細胞或情境下都會發生的結果。
此外,S100P 與 PPP5C 的互動具有鈣依賴性,並可調節 PPP5C 活性。整體資料顯示,S100P 可能透過鈣感測及與不同蛋白質的互動,連結細胞鈣訊號、蛋白質活性調節、上皮細胞微絨毛形成及細胞增殖;各項功能的條件與作用方式仍依個別互動而異。
Promoter 與基因調控
>S100P ENST00000296370 GRCh38 chr4:6692878-6693978 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCCCACCCTCCTGTCTCCAGCTCCTCCTCCTCTGAGAGGCTTCCCCAAACCCTGCCATAAAACCCAGAAA TATGACTCCAGTTCTCCACTCCCTCCCCTTTCTGTGTAGAAACCAGCCTAAAGAAACCCTCTGGCCTGCT TTATTTGACTGTAGGTCATAAGAGCTCCATTCCAGAAAGAGTCCTGCCCCACACCTAGAAGGAAGGAGAG CTGCTCAGAGAGGCCCCAGGGAATCTGACTCAACAGGCCCTACCAGGCTCTCCTCTTGGTCTGTGAGCAT CCAGCCTTACTTTTGTATCCAATCATATTTCCATACTTCGCTGAACTGTGTTTATGGATAGTTTCCACCA GATCTTTGGATCTTCATCTTGAAGGCTGCCGTGCCACATAAGCTATGATCAAATACATCTGTTATGCTCT TCTCCTATTCATCTGCCTTCTGCCCGTTGATTTTCAGCAAACTCCCAGAGGATGAAGGGGAGTTTTCTGT TTGGCCCCACAGGGGAGGAGCGAGCGAGATTGACGTGGAAGCTGGGCCTCTGAAGGACACAGAGTGCTCT AAGAAAGGGACGATGGGGCAGATCCATGTTCACAAACACGCCCATGTGAATTCACTCTCAGATGTCTCCT CGTGTCAGCACGCTGGGTGCCAGCACGCTCTGATATTGACACAAAGGGCCACGGAGTCACCACTCACTCC ACACACACTCACCCCGTGCCCACTTACCCAGGGAGGGCCAGGAATGAGGATGCCACTGTGGCTCAGTGAT GGCGCCGAGACACAGGTGAACACTGTAAAATGTGGATGCCTGGAGGCAGCCCACACCCTGGGCCTTGGCT GGGGGAAAGGTTCCAGAAACGTCATCACAACGATGCATTTCATCAGAACTGAGCACATGAATGGGGAGGG GCAGGACTTCCTGAATGTCCCAACCCCACTGTCCCACCCTCTGTGTCAATATGAGGCTGCCTTATAAAGC ACCAAGAGGCTGCCAGTGGGACATTTTCTCGGCCCTGCCAGCCCCCAGGAGGAAGGTGGGTCTGAATCTA GCACCATGACGGAACTAGAGACAGCCATGGGCATGATCATAGACGTCTTTT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| S100P_1 ↗ | 4:6,693,878 | 正股 | 6,693,829–6,693,888 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR4_94MND · promoter · 6688508–6689008 · regulatory
ENSR4_CMWW · enhancer · 6689009–6690533 · regulatory
ENSR4_87BDW · promoter · 6690534–6690728 · regulatory
ENSR4_94MPS · promoter · 6693388–6693888 · regulatory
ENSR4_CMXD · enhancer · 6695552–6696992 · regulatory
· motif · 6689067–6689080 · motif
· motif · 6689094–6689109 · motif
· motif · 6689258–6689271 · motif
· motif · 6695590–6695605 · motif
· motif · 6695782–6695797 · motif
· motif · 6696383–6696396 · motif
· motif · 6696383–6696396 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:95 aa
S100P 屬於 S-100 家族,蛋白質長度為 95 個胺基酸。其序列註解包含兩個 EF-hand 結構域:EF-hand 1 位於第 12 至 47 個胺基酸,EF-hand 2 位於第 49 至 84 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
S100P 可位於細胞核、細胞質及微絨毛膜。 它在細胞核中與 S100PBP 共定位;在微絨毛中則與 EZR 共定位,而後者具有鈣依賴性。 資料未提供其他定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cell projection, microvillus membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- AGERQ15109 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARCQ7LC44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAPZA1P52907 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- IL11P20809 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MYH9P35579 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEFLP07196 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- S100A1P23297 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- S100A1Q5T7Y6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- S100BP04271 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- S100ZQ8WXG8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TERF2IPQ9NYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TFIP11Q9UBB9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TGFBIQ15582 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBL4AP11441 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CacybpQ9CXW3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
S100P 可形成同源二聚體,也可與 S100A1 形成異源二聚體;另與 S100PBP、S100Z 及 CACYBP 互動,其中與 CACYBP 的互動依賴鈣離子。二聚體形式可結合並活化 EZR,讓其 F-actin 結合位點暴露。S100P 亦透過 TPR repeats 與 PPP5C 互動,此結合具鈣依賴性並可調節 PPP5C 活性。微生物感染情境下,S100P 與 P. falciparum(菌株 3D7、FVO)的 MSP1 次單元 p33 互動;該互動會阻斷 S100P 的發炎與趨化活性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | S100P 可能作為鈣感測蛋白,參與細胞鈣訊號。它依賴鈣離子與其他蛋白質互動,例如 EZR、PPP5C,並可間接參與上皮細胞微絨毛形成;此外,也可能透過活化 RAGE,以自分泌方式刺激細胞增殖。 | 含實驗來源 | 證據與來源May function as calcium sensor and contribute to cellular calcium signaling. In a calcium-dependent manner, functions by interacting with other proteins, such as EZR and PPP5C, and indirectly plays a role in physiological processes like the formation of microvilli in epithelial cells. May stimulate cell proliferation in an autocrine manner via activation of the receptor for activated glycation end products (RAGE) PMID 14617629 ↗ · PMID 19111582 ↗ · PMID 22399290 ↗ |
| 交互作用 | S100P 可形成同源二聚體,並與 S100A1 形成異源二聚體;也會與 S100PBP、S100Z 互動。它與 CACYBP 的互動依賴鈣離子。S100P 二聚體可結合並活化 EZR,使其 F-actin 結合位點暴露;與 PPP5C 的互動則經由 TPR repeats、具有鈣依賴性,並可調節 PPP5C 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer and heterodimer with S100A1. Interacts with S100PBP and S100Z. Interacts with CACYBP in a calcium-dependent manner. Dimeric form binds to and activates EZR/Ezrin by unmasking its F-actin binding sites. Interacts with PPP5C (via TPR repeats); the interaction is calcium-dependent and modulates PPP5C activity PMID 12808036 ↗ · PMID 15171681 ↗ · PMID 15632002 ↗ · PMID 19111582 ↗ · PMID 22399290 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,S100P 會與 P. falciparum 的 3D7 和 FVO 菌株所含 MSP1 次單元 p33 互動;此互動會阻斷 S100P 的發炎與趨化活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with P.falciparum (strains 3D7 and FVO) MSP1 subunit p33; the interaction blocks S100P inflammatory and chemotactic activities PMID 22431641 ↗ |
| 細胞定位 | S100P 位於細胞核、細胞質及微絨毛膜;它在細胞核中與 S100PBP 共定位,在微絨毛中則與 EZR 共定位,且與 EZR 的共定位具有鈣依賴性。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Cell projection, microvillus membrane; Colocalizes with S100PBP in the nucleus. Colocalizes with EZR in the microvilli in a calcium-dependent manner |
核酸與蛋白質序列
ACATTTTCTCGGCCCTGCCAGCCCCCAGGAGGAAGGTGGG40TCTGAATCTAGCACCATGACGGAACTAGAGACAGCCATGG80GCATGATCATAGACGTCTTTTCCCGATATTCGGGCAGCGA120GGGCAGCACGCAGACCCTGACCAAGGGGGAGCTCAAGGTG160CTGATGGAGAAGGAGCTACCAGGCTTCCTGCAGAGTGGAA200AAGACAAGGATGCCGTGGATAAATTGCTCAAGGACCTGGA240CGCCAATGGAGATGCCCAGGTGGACTTCAGTGAGTTCATA280GTGTTCGTGGCTGCAATCACGTCTGCCTGTCACAAGTACT320TTGAGAAGGCAGGACTCAAATGATGCCCTGGAGATGTCAC360AGATTCCTGGCAGAGCCATGGTCCCAGGCTTCCCAAAAGT400GTTTGTTGGCAATTATTCCCCTAGGCTGAGCCTGCTCATG440TACCTCTGATTAATAAATGCTTATGAAATGA471cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。