演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

S100P

S100 calcium binding protein P

S100P 是 S-100 家族的鈣結合蛋白,可能參與細胞鈣訊號;其作用包括與其他蛋白質互動,並可能透過 RAGE 促進細胞增殖。

Homo sapiens4p16.1UniProt P25815
OFFICIAL SYMBOL
S100P
CHROMOSOME
4
UNIPROT
P25815
PDB / ALPHAFOLD
1J55
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

S100P(S100 calcium binding protein P)是由蛋白質編碼基因產生的 S-100 家族成員,蛋白質長度為 95 個胺基酸。其主要特色是具有兩個 EF-hand 結構域,與鈣結合蛋白的家族特徵相符。來源資料將 S100P 描述為可能的鈣感測蛋白,並指出它可依賴鈣離子與其他蛋白質互動,因此與細胞鈣訊號及多種生理過程相關。這些資料提供了 S100P 的基本分子身分與概括角色;至於其互動方式及可能涉及的細胞作用,則需依個別情境理解。

Official symbol
S100P
Gene name
S100 calcium binding protein P
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10504
UniProt
P25815
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44p16.1
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25S100Ppq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr4:6,693,821–6,697,171
Gene span
3,351 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000296370 ★6,693,878–6,697,1702
ENST000010905576,693,821–6,697,1702
ENST000010905596,693,821–6,697,1713
ENST000010905606,693,821–6,697,1702
ENST000010905616,693,821–6,697,1702
ENST000010905626,693,821–6,697,1702
ENST000011376126,693,821–6,697,1712
ENST000010905586,693,835–6,697,1712

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

S100P 可能作為鈣感測蛋白,參與細胞鈣訊號。其作用方式之一是在鈣離子存在時與其他蛋白質互動;來源列出的例子包括 EZR 與 PPP5C。這些鈣依賴性互動將 S100P 與細胞內的蛋白質調節聯繫起來,但現有資料並未將其作用限定於單一途徑或細胞功能。

在上皮細胞中,S100P 可透過與 EZR 的互動,間接參與微絨毛形成。相關作用涉及微絨毛中的細胞骨架調節:S100P 的二聚體形式可結合並活化 EZR,使 EZR 暴露其 F-actin 結合位點。這提供了 S100P 連結鈣訊號與微絨毛相關生理過程的一種方式;資料描述的是間接參與,而非 S100P 本身直接構成微絨毛或直接形成 F-actin 結構。

S100P 也可能以自分泌方式刺激細胞增殖,途徑涉及活化晚期糖化終產物受體 RAGE。此描述支持其可能參與細胞增殖調節,但以「可能」表達,並未將此作用推廣為所有細胞或情境下都會發生的結果。

此外,S100P 與 PPP5C 的互動具有鈣依賴性,並可調節 PPP5C 活性。整體資料顯示,S100P 可能透過鈣感測及與不同蛋白質的互動,連結細胞鈣訊號、蛋白質活性調節、上皮細胞微絨毛形成及細胞增殖;各項功能的條件與作用方式仍依個別互動而異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 6693878 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>S100P ENST00000296370 GRCh38 chr4:6692878-6693978 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCCACCCTCCTGTCTCCAGCTCCTCCTCCTCTGAGAGGCTTCCCCAAACCCTGCCATAAAACCCAGAAA
TATGACTCCAGTTCTCCACTCCCTCCCCTTTCTGTGTAGAAACCAGCCTAAAGAAACCCTCTGGCCTGCT
TTATTTGACTGTAGGTCATAAGAGCTCCATTCCAGAAAGAGTCCTGCCCCACACCTAGAAGGAAGGAGAG
CTGCTCAGAGAGGCCCCAGGGAATCTGACTCAACAGGCCCTACCAGGCTCTCCTCTTGGTCTGTGAGCAT
CCAGCCTTACTTTTGTATCCAATCATATTTCCATACTTCGCTGAACTGTGTTTATGGATAGTTTCCACCA
GATCTTTGGATCTTCATCTTGAAGGCTGCCGTGCCACATAAGCTATGATCAAATACATCTGTTATGCTCT
TCTCCTATTCATCTGCCTTCTGCCCGTTGATTTTCAGCAAACTCCCAGAGGATGAAGGGGAGTTTTCTGT
TTGGCCCCACAGGGGAGGAGCGAGCGAGATTGACGTGGAAGCTGGGCCTCTGAAGGACACAGAGTGCTCT
AAGAAAGGGACGATGGGGCAGATCCATGTTCACAAACACGCCCATGTGAATTCACTCTCAGATGTCTCCT
CGTGTCAGCACGCTGGGTGCCAGCACGCTCTGATATTGACACAAAGGGCCACGGAGTCACCACTCACTCC
ACACACACTCACCCCGTGCCCACTTACCCAGGGAGGGCCAGGAATGAGGATGCCACTGTGGCTCAGTGAT
GGCGCCGAGACACAGGTGAACACTGTAAAATGTGGATGCCTGGAGGCAGCCCACACCCTGGGCCTTGGCT
GGGGGAAAGGTTCCAGAAACGTCATCACAACGATGCATTTCATCAGAACTGAGCACATGAATGGGGAGGG
GCAGGACTTCCTGAATGTCCCAACCCCACTGTCCCACCCTCTGTGTCAATATGAGGCTGCCTTATAAAGC
ACCAAGAGGCTGCCAGTGGGACATTTTCTCGGCCCTGCCAGCCCCCAGGAGGAAGGTGGGTCTGAATCTA
GCACCATGACGGAACTAGAGACAGCCATGGGCATGATCATAGACGTCTTTT
S100P 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
S100P_1 ↗4:6,693,878正股6,693,829–6,693,888

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_94MND · promoter · 6688508–6689008 · regulatory

ENSR4_CMWW · enhancer · 6689009–6690533 · regulatory

ENSR4_87BDW · promoter · 6690534–6690728 · regulatory

ENSR4_94MPS · promoter · 6693388–6693888 · regulatory

ENSR4_CMXD · enhancer · 6695552–6696992 · regulatory

· motif · 6689067–6689080 · motif

· motif · 6689094–6689109 · motif

· motif · 6689258–6689271 · motif

· motif · 6695590–6695605 · motif

· motif · 6695782–6695797 · motif

· motif · 6696383–6696396 · motif

· motif · 6696383–6696396 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:95 aa

1 aa95 aa結構域
依 P25815 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

S100P 屬於 S-100 家族,蛋白質長度為 95 個胺基酸。其序列註解包含兩個 EF-hand 結構域:EF-hand 1 位於第 12 至 47 個胺基酸,EF-hand 2 位於第 49 至 84 個胺基酸。

結構域EF-hand 112–47 aa
結構域EF-hand 249–84 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1J55…

PDB · 1J55

X-ray · 2.00 A · A=1-95

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm;Cell projection, microvillus membrane

S100P 可位於細胞核、細胞質及微絨毛膜。 它在細胞核中與 S100PBP 共定位;在微絨毛中則與 EZR 共定位,而後者具有鈣依賴性。 資料未提供其他定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, microvillus membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 18 個夥伴 · 最多顯示 50 個
S100PS100PAGERARCCAPZA1HTTIL11MYH9NEFLS100A1S100A1S100BS100ZTERF2IPTFIP11TGFBITP53UBL4AWFS1Cacybp
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

S100P 可形成同源二聚體,也可與 S100A1 形成異源二聚體;另與 S100PBP、S100Z 及 CACYBP 互動,其中與 CACYBP 的互動依賴鈣離子。二聚體形式可結合並活化 EZR,讓其 F-actin 結合位點暴露。S100P 亦透過 TPR repeats 與 PPP5C 互動,此結合具鈣依賴性並可調節 PPP5C 活性。微生物感染情境下,S100P 與 P. falciparum(菌株 3D7、FVO)的 MSP1 次單元 p33 互動;該互動會阻斷 S100P 的發炎與趨化活性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能S100P 可能作為鈣感測蛋白,參與細胞鈣訊號。它依賴鈣離子與其他蛋白質互動,例如 EZR、PPP5C,並可間接參與上皮細胞微絨毛形成;此外,也可能透過活化 RAGE,以自分泌方式刺激細胞增殖。含實驗來源
證據與來源

May function as calcium sensor and contribute to cellular calcium signaling. In a calcium-dependent manner, functions by interacting with other proteins, such as EZR and PPP5C, and indirectly plays a role in physiological processes like the formation of microvilli in epithelial cells. May stimulate cell proliferation in an autocrine manner via activation of the receptor for activated glycation end products (RAGE)

PMID 14617629 ↗ · PMID 19111582 ↗ · PMID 22399290 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用S100P 可形成同源二聚體,並與 S100A1 形成異源二聚體;也會與 S100PBP、S100Z 互動。它與 CACYBP 的互動依賴鈣離子。S100P 二聚體可結合並活化 EZR,使其 F-actin 結合位點暴露;與 PPP5C 的互動則經由 TPR repeats、具有鈣依賴性,並可調節 PPP5C 活性。含實驗來源
證據與來源

Homodimer and heterodimer with S100A1. Interacts with S100PBP and S100Z. Interacts with CACYBP in a calcium-dependent manner. Dimeric form binds to and activates EZR/Ezrin by unmasking its F-actin binding sites. Interacts with PPP5C (via TPR repeats); the interaction is calcium-dependent and modulates PPP5C activity

PMID 12808036 ↗ · PMID 15171681 ↗ · PMID 15632002 ↗ · PMID 19111582 ↗ · PMID 22399290 ↗

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交互作用在微生物感染情境下,S100P 會與 P. falciparum 的 3D7 和 FVO 菌株所含 MSP1 次單元 p33 互動;此互動會阻斷 S100P 的發炎與趨化活性。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with P.falciparum (strains 3D7 and FVO) MSP1 subunit p33; the interaction blocks S100P inflammatory and chemotactic activities

PMID 22431641 ↗

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細胞定位S100P 位於細胞核、細胞質及微絨毛膜;它在細胞核中與 S100PBP 共定位,在微絨毛中則與 EZR 共定位,且與 EZR 的共定位具有鈣依賴性。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm; Cell projection, microvillus membrane; Colocalizes with S100PBP in the nucleus. Colocalizes with EZR in the microvilli in a calcium-dependent manner

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000296370 · 471 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACATTTTCTCGGCCCTGCCAGCCCCCAGGAGGAAGGTGGG40
41TCTGAATCTAGCACCATGACGGAACTAGAGACAGCCATGG80
81GCATGATCATAGACGTCTTTTCCCGATATTCGGGCAGCGA120
121GGGCAGCACGCAGACCCTGACCAAGGGGGAGCTCAAGGTG160
161CTGATGGAGAAGGAGCTACCAGGCTTCCTGCAGAGTGGAA200
201AAGACAAGGATGCCGTGGATAAATTGCTCAAGGACCTGGA240
241CGCCAATGGAGATGCCCAGGTGGACTTCAGTGAGTTCATA280
281GTGTTCGTGGCTGCAATCACGTCTGCCTGTCACAAGTACT320
321TTGAGAAGGCAGGACTCAAATGATGCCCTGGAGATGTCAC360
361AGATTCCTGGCAGAGCCATGGTCCCAGGCTTCCCAAAAGT400
401GTTTGTTGGCAATTATTCCCCTAGGCTGAGCCTGCTCATG440
441TACCTCTGATTAATAAATGCTTATGAAATGA471

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。