基因總覽
S100B 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 S100 calcium binding protein B。其產物 Protein S100-B 屬於 S-100 family，是可結合鋅與鈣的小型蛋白質，在星狀膠細胞中高度表現，也是腦內含量豐富的可溶性蛋白質之一。蛋白質全長 92 個胺基酸，具有兩個 EF-hand 區域。它可形成由兩條 alpha chains、兩條 beta chains，或一條 alpha chain 與一條 beta chain組成的二聚體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000291700 ★ | 46,598,604–46,605,082 | 3 |
| ENST00001108035 | 46,598,355–46,605,208 | 3 |
| ENST00001108036 | 46,598,355–46,605,208 | 3 |
| ENST00001130085 | 46,598,355–46,605,208 | 3 |
| ENST00000877393 | 46,598,508–46,605,090 | 3 |
| ENST00000963271 | 46,598,508–46,605,208 | 3 |
| ENST00001026254 | 46,598,509–46,605,208 | 4 |
| ENST00000877391 | 46,598,510–46,605,208 | 3 |
| ENST00000877392 | 46,598,510–46,605,208 | 3 |
| ENST00001131637 | 46,598,604–46,605,208 | 3 |
| ENST00001091833 | 46,598,936–46,605,208 | 3 |
| ENST00000994182 | 46,598,951–46,605,208 | 4 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
S100B 可結合鋅與鈣，但對兩種離子的結合特性不同：它對鈣的結合較弱，對鋅則結合緊密；每個單體對兩種離子各有不同親和力的結合位點。生理濃度的鉀離子會拮抗兩種二價陽離子的結合，尤其影響高親和力的鈣結合位點；此離子調節描述依相似性推定。
在神經相關作用方面，S100B 被描述為神經滋養因子，可促進星狀膠細胞增生與軸突增殖；這些角色同樣是依相似性推定。它也可能由脂肪細胞提供神經滋養作用，促進交感神經對產熱脂肪組織的支配，此項功能亦屬相似性推定。
S100B 可結合 STK38，並藉由解除該激酶內部的自抑制性分子內作用，啟動 STK38；此機制為依相似性推定。心肌梗塞後，S100B 與 AGER 的互作可能透過活化 ERK1/2 與 p53/TP53 訊息傳遞，參與心肌細胞凋亡，來源將此關係表述為可能作用。
S100B 可能協助 ATAD3A 在細胞質中的加工，避免其聚集並促進其定位至粒線體。它也可能藉由與其他蛋白質互作，例如含 TPR 的蛋白質，調節其活性，進而參與鈣依賴性的生理調控；這些功能分別有來源所述的可能性或相似性限制。
Promoter 與基因調控
>S100B ENST00000291700 GRCh38 chr21:46604982-46606082 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTGGGAAACCCTTTCACGGCCACTTTGAAACTGGGTTGGGAGAAGGACGTGATGCTGGGTCAGGCATCC ATTGGGGACCATGGACATTTTTGGAGAGTTTGGGCCAATGTTCTTGTGTAATTTGTCAGAAGGAACACCT ACTTCTTCATTCTTGTGAAGAAGAACCCATAAACTGGCCCCCGTGTTCAGAGGCTCCAGTCGAGCGAGTT GAGGGGACAGCTGGACTTCTCCTTCCTCAGGCTGGCTGGAGGCTTCAGCAAGGGGGCACACCGTCCACAC GCCTCTGTAAAACAGCGTTCGAACGGGACATCTCTAAGGCATCGTCCAACTCTGAGAGTCTGTGACCTTC CACCCTGGGGTGGAGGGAAAGGCCTTGGGATACAGTCCACACATCACGTTTTCCCCTAAAAGTACCACCC GTTTTAGTCCCTGCAGACACTGGCCTCAGCAGCTTCTCTGAGGCAGCCCCGTTGAGCCCAGGGCTGACCA CAGACAAGCACTACTGTCCACAGAACTTCACGCCCAGTGGGGCCAGACTTGGAGGATGGCAGAGGAGAGA AGCTCCAGGGGCCTCTCCATTAGAAACCAACTTGCAGGCCACTTAATCTCCTATGCTCAGCCTGTACTTG GAAGCTGCTTGTTCTTGGCTGCACATTTGCTTTGTTTGAATCAATTAATCCAAGTCTCTCTCCTCTCCCC ACCCCCAACCTTGCCTTTAGGGTGACATCAATATTCATGTAATAAAGAAATCGCACAAAAAGCTGACTCC CCACTTCCTGCCCTACAGGCCCTTTTTTCTTCCTCAGCCCATGTGCAATCCTGGCTCCCAGCAAGTCCCC GGGGCTGCTTGGTCAATGCAGCCCTGTGTGCAGGCCTGGCAGCCCTGCCACCCCCGCCTTCGGCTCCCAT TGGCTGCCACGGCCTGCAGTGGGCTGCACCAGGGTTCATCCATCCTCCCTGGGCAGAGGGAATAAGAGGC TGCCTCTGCCCACCAGTCCTGCCGCCCAGGACCCGCAGCAGAGACGACGCCTGCAGCAAGGAGACCAGGA AGGGGTGAGACAAGGAAGAGGTGAGAAAGAGCCAGGCCAAGAGGACGCTCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| S100B_1 ↗ | 21:46,605,082 | 負股 | 46,605,072–46,605,131 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_9NHFR · enhancer · 46603238–46603564 · regulatory
ENSR21_9NHGC · promoter · 46605072–46605577 · regulatory
ENSR21_5DXZDN · CTCF_binding_site · 46605811–46605832 · regulatory
ENSR21_BC8PR · enhancer · 46605984–46606523 · regulatory
· motif · 46604485–46604494 · motif
· motif · 46604485–46604494 · motif
· motif · 46605813–46605829 · motif
· motif · 46606257–46606268 · motif
· motif · 46607452–46607474 · motif
· motif · 46607452–46607474 · motif
· motif · 46607532–46607547 · motif
· motif · 46608961–46608974 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：92 aa
Protein S100-B 長 92 個胺基酸，屬於 S-100 family。其序列註解包含兩個 EF-hand 區域：EF-hand 1 位於第 13 至 48 個胺基酸，EF-hand 2 位於第 49 至 84 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
S100B 位於細胞質與細胞核，也可被分泌至細胞外。 與 CLSTN3 的 CLSTN3beta 異構型互作會促進 S100B 分泌至培養介質；來源未說明此定位變化的其他條件或時間動態。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 43 個夥伴
- A2MP01023 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AGERQ15109 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- APLP2Q06481-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BLMHQ13867 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAMK2AQ9UQM7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CANXP27824-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAPZA1P52907 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CPNE8Q86YQ8-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRCT1Q9UGL9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSNK1DP48730-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DAB1O75553-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DYNC1I1O14576-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERBB3P21860 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPA1AP0DMV8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LRP1Q07954-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDM2Q00987 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MDM4O15151 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MLLT11Q13015 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MYH9P35579 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NBL1P41271-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEDD8Q15843 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPP1CAP62136 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKACAP17612 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
S100B 可形成同源或異源二聚體：由兩條 alpha chains、兩條 beta chains，或各一條 alpha 與 beta chain組成。二聚體可結合兩個 STK38 分子，也可與兩個 CAPZA1 分子互作。其他互作包括 CACYBP（鈣依賴性）、ATAD3A（可能在細胞質中、ATAD3A 前往粒線體前發生）、S100A6 與 AGER。S100B 透過 PPP5C 的 TPR repeats 與其互作，此結合具鈣依賴性並調節 PPP5C 活性；與 TPPP 互作則抑制 TPPP 二聚化。與 CLSTN3 的 CLSTN3beta 異構型互作會促進分泌。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | S100B 是可結合鋅與鈣的小型蛋白質，在星狀膠細胞中高度表現，也是腦內含量豐富的可溶性蛋白質之一。它對鈣的結合較弱、對鋅的結合較緊密，每個單體具有親和力不同的結合位點；生理濃度的鉀離子會拮抗兩種離子的結合，尤其影響高親和力鈣結合位點。依相似性推定，S100B 可促進星狀膠細胞增生、軸突增殖及產熱脂肪組織的交感神經支配；也可能透過解除 STK38 的自抑制作用啟動該激酶。心肌梗塞後與 AGER 的互作可能參與心肌細胞凋亡，並涉及 ERK1/2 與 p53/TP53 訊息傳遞。另可能協助 ATAD3A 細胞質加工、避免聚集並促進其粒線體定位，也可能透過互作調節其他蛋白質活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Small zinc- and- and calcium-binding protein that is highly expressed in astrocytes and constitutes one of the most abundant soluble proteins in brain. Weakly binds calcium but binds zinc very tightly-distinct binding sites with different affinities exist for both ions on each monomer. Physiological concentrations of potassium ion antagonize the binding of both divalent cations, especially affecting high-affinity calcium-binding sites (By similarity). Acts as a neurotrophic factor that promotes astrocytosis and axonal proliferation (By similarity). Involved in innervation of thermogenic adipose tissue by acting as an adipocyte-derived neurotrophic factor that promotes sympathetic innervation of adipose tissue (By similarity). Binds to and initiates the activation of STK38 by releasing autoinhibitory intramolecular interactions within the kinase (By similarity). Interaction with AGER after myocardial infarction may play a role in myocyte apoptosis by activating ERK1/2 and p53/TP53 signaling (By similarity). Could assist ATAD3A cytoplasmic processing, preventing aggregation and favoring mitochondrial localization. May mediate calcium-dependent regulation on many physiological processes by interacting with other proteins, such as TPR-containing proteins, and modulating their activity PMID 20351179 ↗ · PMID 20950652 ↗ · PMID 22399290 ↗ · PMID 6487634 ↗ |
| 交互作用 | S100B 可形成由兩條 alpha chains、兩條 beta chains，或各一條 alpha 與 beta chain組成的二聚體；該二聚體可結合兩個 STK38 分子或兩個 CAPZA1 分子。S100B 也與 CACYBP（鈣依賴性）、ATAD3A、S100A6、AGER、PPP5C、TPPP 及 CLSTN3 的 CLSTN3beta 異構型互作。ATAD3A 互作可能發生於細胞質中、其粒線體標靶之前；與 PPP5C 的互作經由 TPR repeats、具鈣依賴性並調節其活性；與 TPPP 的互作抑制 TPPP 二聚化，而與 CLSTN3beta 的互作促進分泌。 | 含實驗來源 | 證據與來源Dimer of either two alpha chains, or two beta chains, or one alpha and one beta chain. The S100B dimer binds two molecules of STK38 (By similarity). Interacts with CACYBP in a calcium-dependent manner (By similarity). Interacts with ATAD3A; this interaction probably occurs in the cytosol prior to ATAD3A mitochondrial targeting. Interacts with S100A6. The S100B dimer interacts with two molecules of CAPZA1. Interacts with AGER. Interacts with PPP5C (via TPR repeats); the interaction is calcium-dependent and modulates PPP5C activity. Interacts with TPPP; this interaction inhibits TPPP dimerization. Interacts with isoform CLSTN3beta of CLSTN3; interaction promotes secretion (By similarity) PMID 12480931 ↗ · PMID 20351179 ↗ · PMID 20943659 ↗ · PMID 20950652 ↗ · PMID 22399290 ↗ · PMID 33831707 ↗ · PMID 9925766 ↗ |
| 細胞定位 | S100B 可位於細胞質與細胞核，也會被分泌；與 CLSTN3 的 CLSTN3beta 異構型互作會促進其分泌至培養介質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Secreted; Secretion into the medium is promoted by interaction with isoform CLSTN3beta of CLSTN3 PMID 9925766 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCCGCCCAGGACCCGCAGCAGAGACGACGCCTGCAGCAAG40GAGACCAGGAAGGGGTGAGACAAGGAAGAGGATGTCTGAG80CTGGAGAAGGCCATGGTGGCCCTCATCGACGTTTTCCACC120AATATTCTGGAAGGGAGGGAGACAAGCACAAGCTGAAGAA160ATCCGAACTGAAGGAGCTCATCAACAATGAGCTTTCCCAT200TTCTTAGAGGAAATCAAAGAGCAGGAGGTTGTGGACAAAG240TCATGGAAACACTGGACAATGATGGAGACGGCGAATGTGA280CTTCCAGGAATTCATGGCCTTTGTTGCCATGGTTACTACT320GCCTGCCACGAGTTCTTTGAACATGAGTGAGATTAGAAAG360CAGCCAAACCTTTCCTGTAACAGAGACGGTCATGCAAGAA400AGCAGACAGCAAGGGCTTGCAGCCTAGTAGGAGCTGAGCT440TTCCAGCCGTGTTGTAGCTAATTAGGAAGCTTGATTTGCT480TTGTGATTGAAAAATTGAAAACCTCTTTCCAAAGGCTGTT520TTAACGGCCTGCATCATTCTTTCTGCTATATTAGGCCTGT560GTGTAAGCTGACTGGCCCCAGGGACTCTTGTTAACAGTAA600CTTAGGAGTCAGGTCTCAGTGATAAAGCGTGCACCGTGCA640GCCCGCCATGGCCGTGTAGACCCTAACCCGGAGGGAACCC680TGACTACAGAAATTACCCCGGGGCACCCTTAAAACTTCCA720CTACCTTTAAAAAACAAAGCCTTATCCAGCATTATTTGAA760AACACTGCTGTTCTTTAAATGCGTTCCTCATCCATGCAGA800TAACAGCTGGTTGGCCGGTGTGGCCCTGCAAGGGCGTGGT840GGCTTCGGCCTGCTTCCCGGGATGCGCCTGATCACCAGGT880GAACGCTCAGCGCTGGCAGCGCTCCTGGAAAAAGCAACTC920CATCAGAACTCGCAATCCGAGCCAGCTCTGGGGGCTCCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。