基因總覽
S100A4（S100 calcium binding protein A4）是由蛋白質編碼基因 S100A4 產生的鈣結合蛋白，屬於 S-100 家族。來源將其描述為參與多種細胞過程的蛋白質，相關作用涵蓋細胞移動、血管新生、細胞分化、細胞凋亡與自噬。這些功能涉及細胞內與細胞外情境；其細胞內作用包括與其他蛋白質互作，細胞外則與淋巴細胞相關活動有關。其蛋白質序列長 101 個胺基酸，具有兩個 EF-hand 結構域，是此蛋白質的主要結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000368716 ★ | 153,543,621–153,545,806 | 3 |
| ENST00000368715 | 153,543,613–153,545,145 | 3 |
| ENST00000354332 | 153,543,613–153,545,994 | 4 |
| ENST00000368714 | 153,543,613–153,550,151 | 3 |
| ENST00000854969 | 153,543,613–153,545,994 | 4 |
| ENST00000854970 | 153,543,613–153,545,806 | 3 |
| ENST00000854972 | 153,543,613–153,545,806 | 3 |
| ENST00000854973 | 153,543,613–153,545,765 | 3 |
| ENST00000854974 | 153,543,613–153,545,407 | 3 |
| ENST00000942410 | 153,543,613–153,545,806 | 3 |
| ENST00000942412 | 153,543,613–153,545,994 | 4 |
| ENST00000942413 | 153,543,613–153,545,806 | 4 |
顯示 12/37 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
S100A4 參與多種細胞活動，包括細胞移動、血管新生、細胞分化、細胞凋亡與自噬。來源提供的具體作用機制主要涉及細胞移動與免疫細胞活動，並指出其功能會依所在情境及互作分子而異。
在細胞內，S100A4 與非肌肉型肌球蛋白重鏈 IIA（NMMHC IIA／MYH9）互作，可增加細胞移動與侵襲能力。依相似性推定的機制，S100A4 促進肌球蛋白絲解聚，使可溶性 myosin-IIA 增加，進而形成穩定的細胞突起，有助於趨化性移動；這項機制的證據屬於相似性推定，而非來源所述的直接實驗證實。
在細胞核內，S100A4 可結合 TP53 的 C 端轉錄活化結構域，並降低 TP53 蛋白質量，因而調節 TP53 的促凋亡功能。這項作用顯示，S100A4 可透過影響另一蛋白質的量，改變其相關細胞功能；來源未提供更廣泛的下游機制細節。
在細胞外，S100A4 可刺激 T 淋巴細胞產生細胞激素，包括 granulocyte colony-stimulating factor 與 CCL24；此作用依相似性推定。此外，S100A4 與 PGLYRP1 形成的趨化複合體可促進 T 淋巴細胞移動，涉及 CCR5 與 CXCR3 受體。這些資料指出，S100A4 的作用不僅與細胞自身的移動能力相關，也涉及細胞外訊號對淋巴細胞移動的調節。
Promoter 與基因調控
>S100A4 ENST00000368716 GRCh38 chr1:153545706-153546806 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AATTATAACTCCCCTATTTCATGCCATTTCACCTCTAACTCTCCACCCCAACCTGGATTCTTCATTCCTG ACACTCATCCCAACTTTAAATGGCCCCTCCTGATACCCTCTCCGAACCTGAGATCTATCCGTGAGCCCCC ACGCCTCACTGCCACTCCACTCCATCACTACCTCACCCAGGACCTTTCCCACTGACGTTCCTGAGGTGGT CCCAGAGCCTCCTTTGGGTGTGAGCCTGTTCCCCTCCAGATCCCCCCGCCCCGACCCTGAGCCTTACTTG GCATGGCAGACAGTACCGGGCATGGGGATCCCCACCCCAGTTTTTGTTTCTGAATCTTTATTTTTTTAAG AGACAAGGTCCTCTGTGTTGCTCAGGCTGGAGAGCAGTGGCTTGAGCATAGCCAACTGCAGTCTCGAACT CCTGGGCTCAAATGATCCTCCTGTCTCAGCTTCCTGACTAGCTGGGACTACAGGCTACAGCCATGCTGCC CAGCTAATTAAAAAAAAAAATTGTTTTTCCTTTTTATAGAGACAGAAGTCTCTCTATGTTGCCTAGGCTG GTCTTGAACTCCTGGCCTCAGGCGATCCTCCCATCTCCCCCCTAGCTTTTGTGTCACCACATTTCCAGGG CAATCTCCCACCTGTCACCCACCACCCCCTGCATCTCCTTTCCTAGGTCCCCATGGGACTACTCCCTGTC CCCCATGCTCCAGGCACAGGCTGCCCCTTCCTCCACCTCTCTAAAACTCAGGCTGAGCTATGTACACTGG GTGGTGCCCATCTCATCCAGTCCCCTGCTAGTAACCGCTAGGGCTTACCCGTTACCCACGGGTGCCCACC TGGGAACAGGAGGCTTGGTTCCACGGCTGGGCTGGTGGAGGGTGCTGTGGCACTTACCGCATCAGCCCAC AGCAGGAAGGCAGTATCCGCTCTCCCCTGTCCCCTGCTATGGGCAGGGCCTGGCTGGGGTATAAATAGGT CAGACCTCTGGGCCGTCCCCATTCTTCCCCTCTCTACAACCCTCTCTCCTCAGCGCTTCTTCTTTCTTGG TTTGGTGAGTTGTGTTGGCCTGACTGGCATGCAAGGGGTGTCAGAGGCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| S100A4_2 ↗ | 1:153,545,104 | 負股 | 153,545,094–153,545,153 |
| S100A4_1 ↗ | 1:153,545,806 | 負股 | 153,545,796–153,545,855 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_B35GPL · enhancer · 153540206–153540923 · regulatory
ENSR1_948XGF · promoter · 153540924–153541424 · regulatory
ENSR1_948XGM · promoter · 153541755–153542255 · regulatory
ENSR1_B35GQB · promoter · 153545053–153545751 · regulatory
ENSR1_7C2R34 · promoter · 153545792–153545872 · regulatory
ENSR1_948XHS · enhancer · 153545873–153546267 · regulatory
ENSR1_53C5579 · CTCF_binding_site · 153546027–153546048 · regulatory
ENSR1_B35GQW · promoter · 153549116–153549748 · regulatory
ENSR1_7C2R84 · promoter · 153550126–153550226 · regulatory
· motif · 153541094–153541111 · motif
· motif · 153546029–153546045 · motif
· motif · 153548545–153548558 · motif
· motif · 153549213–153549226 · motif
· motif · 153549213–153549226 · motif
· motif · 153549273–153549288 · motif
· motif · 153549283–153549296 · motif
· motif · 153549283–153549296 · motif
· motif · 153549492–153549505 · motif
· motif · 153549492–153549505 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：101 aa
S100A4 蛋白質長 101 個胺基酸，屬於 S-100 家族，序列中有兩個 EF-hand 結構域：EF-hand 1 位於第 12 至 47 個胺基酸，EF-hand 2 位於第 50 至 85 個胺基酸。來源將其描述為鈣結合蛋白。
蛋白質三維結構
細胞內定位
S100A4 的註記位置包括細胞質、細胞核及細胞外分泌。 來源未說明這些位置如何隨條件改變，也未提供不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- AREGP15514 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- BTCP35070 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CACYBPQ9HB71 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ERBB3P21860 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ERBB4Q15303 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- EZRP15311 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDM2Q00987 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYH9P35579 · UniProt INTERACTION · 20 experiments
- S100A1P23297 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- S100BP04271 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- TRPM4Q8TD43 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
S100A4 可形成同源二聚體，並以鈣依賴方式與 PPFIBP1 互作。它也與 MYH9、TP53、ANXA2、CCR5、FCGR3A 及 PGLYRP1 有互作記錄；其中，S100A4–PGLYRP1 複合體具有促進淋巴細胞移動的趨化作用。與 MYH9 的互作和細胞移動增加相關，與 TP53 的互作則促進 TP53 降解；S100A4 與 FCGR3A 的互作會抑制 PKC 依賴的 FCGR3A 磷酸化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | S100A4 是鈣結合蛋白，參與細胞移動、血管新生、細胞分化、細胞凋亡與自噬。它與 MYH9 互作以增加細胞移動和侵襲；促進肌球蛋白絲解聚及可溶性 myosin-IIA 增加的機制屬相似性推定。它也可在細胞核內結合 TP53 並降低其蛋白質量；在細胞外刺激 T 淋巴細胞產生細胞激素，並與 PGLYRP1 形成促進淋巴細胞移動的趨化複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Calcium-binding protein that plays a role in various cellular processes including motility, angiogenesis, cell differentiation, apoptosis, and autophagy. Increases cell motility and invasiveness by interacting with non-muscle myosin heavy chain (NMMHC) IIA/MYH9. Mechanistically, promotes filament depolymerization and increases the amount of soluble myosin-IIA, resulting in the formation of stable protrusions facilitating chemotaxis (By similarity). Also modulates the pro-apoptotic function of TP53 by binding to its C-terminal transactivation domain within the nucleus and reducing its protein levels. Within the extracellular space, stimulates cytokine production including granulocyte colony-stimulating factor and CCL24 from T-lymphocytes (By similarity). In addition, stimulates T-lymphocyte chemotaxis by acting as a chemoattractant complex with PGLYRP1 that promotes lymphocyte migration via CCR5 and CXCR3 receptors PMID 16707441 ↗ · PMID 23752197 ↗ · PMID 26654597 ↗ · PMID 30713770 ↗ |
| 交互作用 | S100A4 可形成同源二聚體，並以鈣依賴方式與 PPFIBP1 互作。它與 PGLYRP1 形成的複合體可促進淋巴細胞移動；與 MYH9 的互作與細胞移動增加相關。另有與 ANXA2、TP53、CCR5 及 FCGR3A 的互作記錄；其中 S100A4 與 TP53 的互作促進 TP53 降解，與 FCGR3A 的互作則抑制 PKC 依賴的 FCGR3A 磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with PPFIBP1 in a calcium-dependent mode. Interacts with PGLYRP1; this complex acts as a chemoattractant that promotes lymphocyte movement. Interacts with MYH9; this interaction increases cell motility. Interacts with Annexin 2/ANXA2. Interacts with TP53; this interaction promotes TP53 degradation. Interacts with CCR5. Interacts with FCGR3A; this interaction inhibits PKC-dependent phosphorylation of FCGR3A PMID 11836260 ↗ · PMID 16707441 ↗ · PMID 23024279 ↗ · PMID 23752197 ↗ · PMID 26654597 ↗ · PMID 28669632 ↗ · PMID 30713770 ↗ · PMID 32442400 ↗ |
| 細胞定位 | S100A4 的細胞定位註記包括細胞外分泌、細胞核與細胞質。這筆資料只列出相關位置，未描述定位變化的條件、動態，或不同異構型之間的差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTCTTCCCCTCTCTACAACCCTCTCTCCTCAGCGCTTCT40TCTTTCTTGGTTTGATCCTGACTGCTGTCATGGCGTGCCC80TCTGGAGAAGGCCCTGGATGTGATGGTGTCCACCTTCCAC120AAGTACTCGGGCAAAGAGGGTGACAAGTTCAAGCTCAACA160AGTCAGAACTAAAGGAGCTGCTGACCCGGGAGCTGCCCAG200CTTCTTGGGGAAAAGGACAGATGAAGCTGCTTTCCAGAAG240CTGATGAGCAACTTGGACAGCAACAGGGACAACGAGGTGG280ACTTCCAAGAGTACTGTGTCTTCCTGTCCTGCATCGCCAT320GATGTGTAACGAATTCTTTGAAGGCTTCCCAGATAAGCAG360CCCAGGAAGAAATGAAAACTCCTCTGATGTGGTTGGGGGG400TCTGCCAGCTGGGGCCCTCCCTGTCGCCAGTGGGCACTTT440TTTTTTTCCACCCTGGCTCCTTCAGACACGTGCTTGATGC480TGAGCAAGTTCAATAAAGATTCTTGGAAGTTTT513cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。