基因總覽
S100A11 的正式名稱為 S100 calcium binding protein A11,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸入 S-100 家族。現有資料未提供更詳細的家族特徵或蛋白質整體結構描述;已知的基本功能角色是協助角質形成細胞分化與角質化。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000271638 ★ | 152,032,506–152,037,004 | 3 |
| ENST00000876489 | 152,032,504–152,037,147 | 3 |
| ENST00000932478 | 152,032,504–152,037,147 | 3 |
| ENST00000932479 | 152,032,506–152,037,147 | 3 |
| ENST00000932480 | 152,032,506–152,037,147 | 3 |
| ENST00001100788 | 152,032,506–152,037,147 | 2 |
| ENST00001100789 | 152,032,506–152,037,147 | 3 |
| ENST00001143545 | 152,032,506–152,037,147 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
S100A11 的蛋白質產物有助於角質形成細胞分化及角質化。這兩項過程與角質形成細胞的成熟及角質層形成相關,但現有資料僅指出其促進作用,未說明具體的分子機制、作用條件或參與途徑,因此不宜進一步推定其如何調節這些過程。
Promoter 與基因調控
>S100A11 ENST00000271638 GRCh38 chr1:152036904-152038004 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCG ATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCGGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG GAACTACAGGCGCCCGCCACCACGTCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCGCG TTAGCCAGGATGGTCCCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA CAGGAGTGAGCCGCTGCGCCCGGCCTGTTTTTGTTTGTTTTTTGAGACATTGTTCCGCTCTTGTTGCCCA GGCGGCTGGAGTGCAACGGCGCGATCTCAGCTCGCTGCAAACTCCACCTCCCGGGTTCAATCGATATTTC TGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGTATTACAGGCGTGTGCCACCACGCCAGGCTAATTTTGTATTTTTAG TAGAGACAGGGGTTTCACCATGTTAGTCAGGCTGATCTCAAACTCCTGACCTCATGTGATCTACCCGCCT CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGCGCCCGGCCCACTGCTGTTTCCAAAAGAGA CCTTTTTTGCCTATCTAACCTAAATGCCCAGAATGAGCTCATACATGGGAAAGACCCACGGACATGGACA GACTTCCCGAAGACTACTGTGCAAAACTTATAATTCTAAAAAGTCAAAAATCTTCAGGAATCACAGGACG GGGTGGAGGGGGCCGGGGGGAAAGAGGAGGGAAAAGAGGGAAAGGAGGGAGAGTGAGACTGCTTAAATCG CTGGAGAGGACGGTGGGTTTATTTGAGTCTTAAAGCTCAGTTCTGTGGTTAGCGCCGGCCGCGGTCCCAG GCCCAGCCCGGGAGGCGGGGAGGGGCGGGGCAGGCGCGGAAGCTGTCTGAGTAAGGCTTGGGCAAGGCTG GGCCGGGAAGGGCGTGGGTTGAGGAGAGGCTCCAGACCCGCACGCCGCGCGCACAGAGCTCTCAGCGCCG CTCCCAGCCACAGCCTCCCGCGCCTCGCTCAGCTCCAACATGGTAAGCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| S100A11_1 ↗ | 1:152,036,972 | 負股 | 152,036,962–152,037,021 |
| S100A11_2 ↗ | 1:152,048,079 | 負股 | 152,048,069–152,048,128 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_948CC8 · promoter · 152036994–152037494 · regulatory
ENSR1_B356NB · enhancer · 152038011–152038860 · regulatory
· motif · 152034487–152034501 · motif
· motif · 152034493–152034502 · motif
· motif · 152034493–152034504 · motif
· motif · 152034550–152034561 · motif
· motif · 152034571–152034585 · motif
· motif · 152034571–152034585 · motif
· motif · 152034674–152034687 · motif
· motif · 152034674–152034687 · motif
· motif · 152035660–152035674 · motif
· motif · 152036306–152036319 · motif
· motif · 152036505–152036517 · motif
· motif · 152036508–152036515 · motif
· motif · 152036625–152036640 · motif
· motif · 152036642–152036653 · motif
· motif · 152036642–152036653 · motif
· motif · 152036642–152036655 · motif
· motif · 152036642–152036656 · motif
· motif · 152037107–152037122 · motif
· motif · 152037114–152037122 · motif
· motif · 152038402–152038415 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:105 aa
Protein S100-A11 長 105 個胺基酸,屬於 S-100 家族。序列註解標示兩個 EF-hand 結構域:EF-hand 1 位於第 13–49 個胺基酸,EF-hand 2 位於第 55–90 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
S100A11 蛋白質被記錄於細胞質與細胞核。 現有資料未提供定位改變的條件、細胞狀態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- S100BP04271 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TNFP01375 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TRPM4Q8TD43 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
S100A11 可形成由二硫鍵連結的同源二聚體。資料描述的是同一蛋白質形成的二聚體,未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | S100A11 有助於角質形成細胞分化與角質化。現有敘述指出這兩項作用,但未提供具體機制、發生條件或其他實驗情境,因此不延伸推論其作用方式。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | S100A11 可形成同源二聚體,兩個相同的蛋白質亞基以二硫鍵連結。此敘述未指出其他互作蛋白或該二聚體所參與的功能。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | S100A11 蛋白質的定位記錄包括細胞質與細胞核。現有敘述未說明其在兩處之間轉移的條件、定位變化或不同異構型的差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGGAGAGGCTCCAGACCCGCACGCCGCGCGCACAGAGCT40CTCAGCGCCGCTCCCAGCCACAGCCTCCCGCGCCTCGCTC80AGCTCCAACATGGCAAAAATCTCCAGCCCTACAGAGACTG120AGCGGTGCATCGAGTCCCTGATTGCTGTCTTCCAGAAGTA160TGCTGGAAAGGATGGTTATAACTACACTCTCTCCAAGACA200GAGTTCCTAAGCTTCATGAATACAGAACTAGCTGCCTTCA240CAAAGAACCAGAAGGACCCTGGTGTCCTTGACCGCATGAT280GAAGAAACTGGACACCAACAGTGATGGTCAGCTAGATTTC320TCAGAATTTCTTAATCTGATTGGTGGCCTAGCTATGGCTT360GCCATGACTCCTTCCTCAAGGCTGTCCCTTCCCAGAAGCG400GACCTGAGGACCCCTTGGCCCTGGCCTTCAAACCCACCCC440CTTTCCTTCCAGCCTTTCTGTCATCATCTCCACAGCCCAC480CCATCCCCTGAGCACACTAACCACCTCATGCAGGCCCCAC520CTGCCAATAGTAATAAAGCAATGTCACTTTTTTAAAACAT560GAA563cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。