基因總覽
RYK 的正式名稱為 receptor like tyrosine kinase，屬於蛋白質編碼基因，其產物為 607 個胺基酸的單次穿膜蛋白，歸於 protein kinase 超家族中的 Tyr protein kinase 家族。蛋白質具有細胞外區、跨膜區與細胞質區，另含 WIF domain 及 protein kinase domain。這些結構特徵描述了 RYK 的膜蛋白架構與家族歸屬；其參與 Wnt 訊號及神經元相關過程的作用，詳述於功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000623711 ★ | 134,157,133–134,250,859 | 15 |
| ENST00000907584 | 134,127,408–134,250,929 | 16 |
| ENST00001115776 | 134,127,408–134,250,929 | 14 |
| ENST00001115777 | 134,127,408–134,250,929 | 14 |
| ENST00000912303 | 134,152,639–134,250,929 | 16 |
| ENST00000907585 | 134,152,646–134,250,929 | 16 |
| ENST00000946529 | 134,154,152–134,250,929 | 13 |
| ENST00000946530 | 134,157,130–134,250,929 | 13 |
| ENST00000946531 | 134,157,131–134,250,929 | 11 |
| ENST00000912306 | 134,157,132–134,250,929 | 11 |
| ENST00000912304 | 134,157,133–134,250,929 | 16 |
| ENST00000912305 | 134,157,133–134,250,929 | 14 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RYK 可能與 FZD8 一同作為 Wnt 蛋白的共受體。相關 Wnt 蛋白包括 WNT1、WNT3、WNT3A 與 WNT5A；來源將此功能描述為可能參與，並未將其表述為確定作用。這項共受體角色是目前資料所述的訊號相關功能。
RYK 也與多項神經發育相關過程有關，包括神經元分化、軸突導引、胼胝體建立及神經突生長。這些作用涵蓋神經元命運與形態發展，以及軸突延伸和路徑建立；資料並指出 RYK 的 C 端片段與神經元發育密切相關。
在 WNT3 刺激下，RYK 受體會於跨膜區發生 C 端切割。切割後的細胞內 C 端產物可由細胞質移至細胞核，並在神經元發育中扮演重要角色。因此，RYK 的功能不只涉及細胞膜上的共受體作用，也包括刺激後產生的細胞內片段及其核內轉移。來源未進一步說明此片段如何調控核內作用，故不延伸推定其分子機制。
Promoter 與基因調控
>RYK ENST00000623711 GRCh38 chr3:134250759-134251859 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTGCAATCAAGCATACACACAACACACAGAAACATGGACGTGGACACAAATACGCACGGAGACACATAC ACTTTTGCACACAGTTTCATATTATTGGAAGGCTGTCGAAGCCTGGTATGGACCACAGATTAACAACCCC AAAGGCAGGTTGATTATAGTGATGCAGAACGATTATAAAAAAAATAACAATTTGGCAGGGCGCGGTGGCT TACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTCAGTTGATCACGTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCA ACCCGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGTCGGGCATGGTTGCGGGC GCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCTAGGAGGCAGAGGTTGCAG TGAGCCGAGATCGTGCCAGTGCACTCCAGCTTGGGTGACGGAGCAAGACTTCGTCTCAAAATAAATAAAT AAAAATATAAAAATAAATAAAATTTTGTAACGTAAAAATAGGGTTAGTAAAGCGTGCTAAGATCTTTCTG GAAAACAAATATATGTAGTATAAATTCTAATAATAGATACGGAAACGATAAAGTTGATCACCGATGGTAA GATAAAGGATGATTTCTATTTATTTGAGTTTTCCCACTAAACAGGAAAGCATGCTGCTTTTTCGCAACCA GAACGGCCGCATCCAGGCGTTTCCGGGGACCTGGGGCGCCCACTGAGCTGCAGGCGCGGCCGGTGGCTCC AGCCTGGCCCGTCCGTCGGGAAAGGAGGGTTACAGACAATAGACAAGCAAACATTAGACGCAGTGACCGC GTGGGGCGGGGACCGGCTCTTGCGGAGAGGGTGACCCGAGCCCTTCGCCCGCCGAGGCACTTTAAAACCC CAGCGCGTTGCCCAGGCCGGCCCGCCCAGAGCGAAAGGTGCGTGCGCGCTCCCGGGGAGGCGGCGGCGCG CACGGGCGCGTCCCGCGGGCAGCCCCCAACTCCGGACGATGCAGCGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGCGCT CCGGAGGTCTGAAGCCACTGCTGGCTGCCACGGGCCGGCGGTGCGATGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RYK_1 ↗ | 3:134,250,471 | 負股 | 134,250,461–134,250,520 |
| RYK_2 ↗ | 3:134,250,812 | 負股 | 134,250,802–134,250,861 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_536KKBM · CTCF_binding_site · 134248668–134248689 · regulatory
ENSR3_536KKCK · CTCF_binding_site · 134248869–134248890 · regulatory
ENSR3_536KKG8 · CTCF_binding_site · 134249440–134249461 · regulatory
ENSR3_536KKJM · CTCF_binding_site · 134249962–134249983 · regulatory
ENSR3_BZMCW · promoter · 134250734–134251321 · regulatory
ENSR3_536KKNM · CTCF_binding_site · 134250822–134250843 · regulatory
ENSR3_BZMD3 · enhancer · 134251794–134252484 · regulatory
ENSR3_85XKJB · enhancer · 134253939–134254111 · regulatory
· motif · 134247196–134247205 · motif
· motif · 134247196–134247205 · motif
· motif · 134248670–134248686 · motif
· motif · 134248871–134248887 · motif
· motif · 134249442–134249458 · motif
· motif · 134249964–134249980 · motif
· motif · 134249986–134249994 · motif
· motif · 134250364–134250373 · motif
· motif · 134250506–134250519 · motif
· motif · 134250567–134250580 · motif
· motif · 134250570–134250583 · motif
· motif · 134250573–134250586 · motif
· motif · 134250656–134250669 · motif
· motif · 134250659–134250672 · motif
· motif · 134250662–134250675 · motif
· motif · 134250703–134250716 · motif
· motif · 134250739–134250752 · motif
· motif · 134250815–134250828 · motif
· motif · 134250818–134250831 · motif
· motif · 134250824–134250837 · motif
· motif · 134250824–134250840 · motif
· motif · 134251018–134251035 · motif
· motif · 134251133–134251142 · motif
· motif · 134251148–134251165 · motif
· motif · 134251189–134251200 · motif
· motif · 134251253–134251264 · motif
· motif · 134254097–134254109 · motif
· motif · 134254100–134254107 · motif
· motif · 134254229–134254236 · motif
· motif · 134254264–134254276 · motif
· motif · 134254267–134254274 · motif
· motif · 134255566–134255579 · motif
· motif · 134255591–134255604 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：607 aa
RYK 蛋白長 607 個胺基酸，具有 N 端訊號肽、細胞外區、單次螺旋跨膜區及細胞質區。註解指出其細胞外區含 WIF domain，細胞質區含 protein kinase domain；另有兩段標示為無序區，分別位於 N 端及細胞質區。蛋白質歸屬於 protein kinase 超家族的 Tyr protein kinase 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RYK 是細胞膜上的單次穿膜蛋白，亦有細胞質與細胞核定位記錄。 在已完成神經元分化的細胞中，RYK 經切割產生的 C 端部分會由細胞質移至細胞核；此定位變化描述的是切割片段，而非完整受體。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RYK 與 DVL1 有交互作用，所述結合涉及 DVL1 的 PDZ domain。資料未指出兩者是否形成特定複合體，也未描述該交互作用對 RYK 或 DVL1 功能的影響。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RYK 可能與 FZD8 一同作為 WNT1、WNT3、WNT3A、WNT5A 等 Wnt 蛋白的共受體，並參與神經元分化、軸突導引、胼胝體建立及神經突生長。受到 WNT3 刺激時，受體在跨膜區發生 C 端切割；細胞內 C 端產物隨後由細胞質移至細胞核，並在神經元發育中扮演重要角色。 | 含實驗來源 | 證據與來源May be a coreceptor along with FZD8 of Wnt proteins, such as WNT1, WNT3, WNT3A and WNT5A. Involved in neuron differentiation, axon guidance, corpus callosum establishment and neurite outgrowth. In response to WNT3 stimulation, receptor C-terminal cleavage occurs in its transmembrane region and allows the C-terminal intracellular product to translocate from the cytoplasm to the nucleus where it plays a crucial role in neuronal development PMID 15454084 ↗ |
| 交互作用 | RYK 與 DVL1 交互作用；此交互作用涉及 DVL1 的 PDZ domain。資料未進一步說明其結合條件、形成的複合體或對功能的影響。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RYK 定位於細胞膜，為單次穿膜的第一型膜蛋白，並有細胞核及細胞質定位記錄。在已完成神經元分化的細胞中，切割後的 C 端部分會由細胞質移至細胞核。 | 推論支持 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Nucleus; Cytoplasm; In cells that have undergone neuronal differentiation, the C-terminal cleaved part is translocated from the cytoplasm to the nucleus |
核酸與蛋白質序列
AGCCCCCAACTCCGGACGATGCAGCGAGGAGGCGGCGGCG40GCGGCGCGCTCCGGAGGTCTGAAGCCACTGCTGGCTGCCA80CGGGCCGGCGGTGCGATGAGCTGGGCAGCCGCCCCCGGCT120CGGGGCTGTGAGCGGCTCGGGGCCGGGGGTGGGCGGCGGT160GCGGCGGGCGGCCGACGCTCCTCTTCGGCGGCGGCGGCGG200CGGCCATGCGTGGGGCGGCGCGGCTGGGGCGGCCGGGCCG240GAGTTGCCTCCCGGGGGCCCGCGGCCTGAGGGCCCCGCCG280CCGCCGCCGCTGCTGCTTCTGCTTGCGCTGTTGCCGCTGC320TGCCCGCGCCTGGCGCTGCCGCCGCCCCCGCCCCGCGGCC360CCCGGAGCTGCAGTCGGCTTCCGCGGGGCCCAGCGTGAGT400CTCTACCTGAGCGAGGACGAGGTGCGCCGGCTGATCGGTC440TTGATGCAGAACTTTATTATGTGAGAAATGACCTTATTAG480TCACTACGCTCTATCCTTTAGTCTGTTAGTACCCAGTGAG520ACAAATTTCCTGCACTTCACCTGGCATGCGAAGTCCAAGG560TTGAATATAAGCTGGGATTCCAAGTGGACAATGTTTTGGC600AATGGATATGCCCCAGGTCAACATTTCTGTTCAGGGGGAA640GTTCCACGCACTTTATCAGTGTTTCGGGTAGAGCTTTCCT680GTACTGGCAAAGTAGATTCTGAAGTTATGATACTAATGCA720GCTCAACTTGACAGTAAATTCTTCAAAAAATTTTACCGTC760TTAAATTTTAAACGAAGGAAAATGTGCTACAAAAAACTTG800AAGAAGTAAAAACTTCAGCCTTGGACAAAAACACTAGCAG840AACTATTTATGATCCTGTACATGCAGCTCCAACCACTTCT880ACGCGTGTGTTTTATATTAGTGTAGGGGTTTGTTGTGCAG920TAATATTTCTCGTAGCAATAATATTAGCTGTTTTGCACCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。