基因總覽
RRBP1 是蛋白質編碼基因，產物名稱為 ribosome binding protein 1。這是一種長 1,410 個胺基酸的單次跨膜蛋白，定位於內質網膜。其序列呈現明確的膜拓撲分區：N 端短區段位於腔內，接著是跨膜螺旋，其後的大部分蛋白質位於細胞質側。蛋白質序列中還註記了多個連續重複區，主要分布於中段。這些基本特徵構成其作為內質網膜蛋白的分子架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377813 ★ | 17,613,679–17,682,242 | 25 |
| ENST00000470422 | 17,613,678–17,623,330 | 13 |
| ENST00000360807 | 17,613,678–17,682,295 | 25 |
| ENST00000455029 | 17,613,678–17,682,060 | 24 |
| ENST00000377807 | 17,613,678–17,682,295 | 26 |
| ENST00000246043 | 17,613,678–17,660,507 | 23 |
| ENST00000853412 | 17,613,678–17,682,295 | 25 |
| ENST00000853413 | 17,613,678–17,682,295 | 25 |
| ENST00000853414 | 17,613,678–17,682,295 | 25 |
| ENST00000923164 | 17,613,678–17,682,295 | 25 |
| ENST00000971286 | 17,613,678–17,682,295 | 24 |
| ENST00001132312 | 17,613,678–17,682,295 | 25 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ribosome binding protein 1 的主要角色是作為核糖體受體，並介導核糖體與內質網膜之間的互動。這項描述指出它參與連接核糖體與膜的過程，但來源未進一步說明其辨識方式、分子接觸界面或互動是否由其他因子調節，因此不宜據此延伸至更具體的結合機制。
從細胞結構關係來看，核糖體與內質網膜的互動，涉及核糖體接近並與膜建立關聯。RRBP1 被描述為此處的受體及介導者，意味其功能與核糖體在內質網膜上的定位或連結有關；然而，現有資訊沒有交代核糖體被招募的條件、參與的核糖體類型，或這種互動對蛋白質合成等下游流程的影響。
因此，來源支持的功能重點限於核糖體受體角色，以及促成核糖體和內質網膜互動。資料未提供可據以描述其調控路徑、細胞生理效應或不同情境下功能變化的細節；上述功能說明也不應被擴大解讀為已確立特定下游結果。
Promoter 與基因調控
>RRBP1 ENST00000377813 GRCh38 chr20:17682142-17683242 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATCAAGCCTAAAATTATTTTAATTTAAAGACTTGACTAATTATGAAGACTGAGTGTTGGCTGATATTGGG GAGAAAGTCAGGGAATGAGGAAGTACCAGTTGCTCCGTTTTGTGGGACACGGATGAGTTTTCTTAGGTTA GAACCTCTCACCTTCCCCAACGCATGGAATAAAACGCCACAGAGTGGATTGTAATTATTGCTCTGCCGGC TGTGATTTGGTTGAGTATCTTAAATAGACCGTGCCTCAGTTGTACCCTCCCTAACAACGAGGGCGATGAC ATCCGCTTCAATTCCTCGTGCACCTTCTGGCTCTTCCACCCCAATTCCTCCATTTACTGAAGGAAATTCC TTCTGGTGCTGATTGCAATCTCTTTGATGATAAGAACTTGCTCTCCCTGGGCTGACCCCCAGCAGAGCTT GTCCTCATACCCGGCGGCCCGAGGGGGCGCTGCTTCGGGGGAAGTTAGTTGGGTTTAAATAAAGCAGCTT CCTTGGCTGTTCGCGGTTGCGCAACCCTGTTCAGCCACCGCCATGTCAGCCCAGCGGTATCCAGAGGCGC AGGCCCGGGGTCGCCGGGACCCGAACCTTCTGCTTCCCGCCTAGGCAGAGCCGGATCCTAGTCAGAGACT GCTGGGAGCGCCGCGGGCCCAGAGTGGGCGGAGCTGGCCGGAGACCCCCCCCTCGGTGGGCGGGGCGTTC CTGCTCCGCCCCGCCCCGCGCACGGCCGAGCGCCGCGCCGCTCGGCCCCGCCTCTCCCCAGCCCTGCCCC CTTCACCTCCCCGCAGCTCCTCCCCTCTCCCATTGGCCGAGGTGGAGACCCTCCTCTCTGCCCAATGGCC GCCGCCGCGGCTCGGCCACCCGCGTCCTGACTGGCCAGCGACCGGCAGAGTGGCGGGGTGCGGACCAATG GGAAGAGGCGGCTCGATGAATGGCTGGCCCGGGTGGGGAAGGCAGGAGGCGGCGATCCCGGCGGAGGGGG CCGTTCGCCAGCTCTGAGGCAGAAAGTGCCACGACTCCACACGCGCGCACGCAGCCAGCGAGCGGCCGGA GCGGACGGCAGACGGGGCGGGCGGCGTCAGGGTCGCAGCGTCTACAGCTGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RRBP1_1 ↗ | 20:17,682,242 | 負股 | 17,682,232–17,682,291 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_992GB · enhancer · 17678343–17678675 · regulatory
ENSR20_DTNH · enhancer · 17679843–17682049 · regulatory
ENSR20_5669KP · CTCF_binding_site · 17680178–17680199 · regulatory
ENSR20_5669L3 · CTCF_binding_site · 17680251–17680272 · regulatory
ENSR20_5669QW · CTCF_binding_site · 17681296–17681317 · regulatory
ENSR20_5669RZ · CTCF_binding_site · 17681529–17681550 · regulatory
ENSR20_B5HQ7 · promoter · 17682050–17682785 · regulatory
ENSR20_8J32Z · enhancer · 17684240–17684458 · regulatory
· motif · 17679130–17679152 · motif
· motif · 17679130–17679152 · motif
· motif · 17679434–17679445 · motif
· motif · 17680108–17680120 · motif
· motif · 17680180–17680196 · motif
· motif · 17680253–17680269 · motif
· motif · 17680326–17680339 · motif
· motif · 17680326–17680339 · motif
· motif · 17680532–17680545 · motif
· motif · 17680535–17680547 · motif
· motif · 17680538–17680545 · motif
· motif · 17680911–17680922 · motif
· motif · 17680949–17680956 · motif
· motif · 17681298–17681314 · motif
· motif · 17681531–17681547 · motif
· motif · 17682129–17682139 · motif
· motif · 17682472–17682482 · motif
· motif · 17682488–17682498 · motif
· motif · 17682525–17682535 · motif
· motif · 17682547–17682557 · motif
· motif · 17682560–17682570 · motif
· motif · 17682579–17682589 · motif
· motif · 17682676–17682687 · motif
· motif · 17682707–17682717 · motif
· motif · 17682728–17682737 · motif
· motif · 17682728–17682737 · motif
· motif · 17682734–17682749 · motif
· motif · 17682834–17682841 · motif
· motif · 17683572–17683586 · motif
· motif · 17683572–17683586 · motif
· motif · 17684232–17684247 · motif
· motif · 17684232–17684247 · motif
· motif · 17684433–17684448 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1410 aa
ribosome binding protein 1 長 1,410 個胺基酸。其第 1–7 位胺基酸為腔內區段，第 8–28 位形成跨膜螺旋，第 29–1,410 位位於細胞質側。第 197–564 位註記有多個連續重複區，其中第 527–534 位與第 545–554 位的重複標示為近似。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RRBP1 是內質網膜上的單次跨膜蛋白。 來源未提供其定位會隨條件改變的資訊，也未列出異構型之間的定位差異；此處描述的是 RRBP1 本身，而非其互作對象的定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- ANK2Q01484 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYNJ2BPP57105 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosome binding protein 1 可作為核糖體受體，並介導核糖體與內質網膜之間的互動。 | 推論支持 | 證據與來源Acts as a ribosome receptor and mediates interaction between the ribosome and the endoplasmic reticulum membrane |
| 細胞定位 | ribosome binding protein 1 位於內質網膜，並屬於單次跨膜的第三型膜蛋白。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGAAAGTGCCACGACTCCACACGCGCGCACGCAGCCAGCG40AGCGGCCGGAGCGGACGGCAGACGGGGCGGGCGGCGTCAG80GGTCGCAGCGTCTACAGCTGCTCGGGGGCGGTTTCTTGGC120GGAGGCTTGGCCGGCTCCTCTCTCCCGGCTCCGCGGCGGC160TGCGAAGGCGGCGGCTCCTGCCCTCTCGCTTTCCCTCTCG200CGTCTCTGGCTGCAGAAAGAAGCTTCCGGTTCTGAGGTCC240TGGAGGTGCCATTTCCCTCTCTGTTGAAGCAAAGGCCGGG280GCAGACCTCCTAGTGAAAGGAAAGCAAGCCAGGATGGATA320TTTACGACACTCAAACCTTGGGGGTTGTGGTCTTTGGAGG360ATTCATGGTTGTTTCTGCCATTGGCATCTTCCTGGTGTCG400ACTTTCTCCATGAAGGAAACGTCATATGAAGAAGCCCTAG440CCAACCAGCGCAAGGAGATGGCGAAAACTCACCACCAGAA480AGTCGAGAAGAAAAAGAAGGAGAAAACAGTGGAGAAGAAA520GGAAAGACCAAGAAAAAGGAAGAGAAACCTAATGGGAAGA560TACCTGATCATGATCCAGCCCCCAATGTGACTGTCCTCCT600TCGAGAACCAGTGCGGGCTCCTGCTGTGGCTGTGGCTCCA640ACCCCAGTGCAGCCCCCCATTATCGTTGCTCCTGTCGCCA680CAGTTCCAGCCATGCCCCAGGAGAAGCTGGCCTCCTCCCC720CAAGGACAAAAAGAAGAAGGAGAAAAAAGTGGCAAAAGTG760GAACCAGCTGTCAGCTCTGTAGTGAATTCCATCCAGGTTC800TCACTTCGAAGGCTGCCATCTTGGAAACTGCTCCCAAGGA840GGTGCCGATGGTGGTGGTGCCCCCAGTGGGTGCCAAGGGC880AACACACCAGCCACTGGCACTACTCAGGGCAAAAAGGCGG920AGGGGACTCAGAATCAAAGCAAAAAGGCTGAAGGAGCCCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。