基因總覽
RPS6KA6(ribosomal protein S6 kinase A6)是蛋白質編碼基因,產物屬於絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。資料指出,此激酶具有不依賴生長因子的活性。現有來源未提供足以進一步說明其家族分類或整體結構特色的資料。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000262752 ★ | 84,058,350–84,188,199 | 22 |
| ENST00000620340 | 84,058,346–84,186,141 | 22 |
| ENST00000911418 | 84,058,350–84,188,476 | 21 |
| ENST00000911419 | 84,058,350–84,188,476 | 16 |
| ENST00000911420 | 84,058,350–84,188,476 | 22 |
| ENST00001134825 | 84,058,350–84,188,476 | 22 |
| ENST00001106235 | 84,094,036–84,188,476 | 21 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6KA6 的產物是一種持續具有活性的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。其激酶活性不依賴生長因子,與需要生長因子刺激才啟動的活性不同;來源未進一步說明其活性調控方式或特定的生長因子條件。
此酵素可催化蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基磷酸化。反應中,ATP 提供磷酸基,底物分別轉變為磷酸化的絲胺酸或蘇胺酸蛋白質,同時生成 ADP 與 H⁺。這些反應描述了其激酶活性的基本化學形式,來源未列出具體底物或受調控的下游蛋白質。
RPS6KA6 可能參與 p53/TP53 依賴的細胞生長停滯訊號。此描述指出的是可能參與訊號傳遞,並未提供足以界定其作用步驟或因果方向的細節,因此不能據此推定它如何影響 p53/TP53 或細胞生長停滯。
此外,來源指出 RPS6KA6 在胚胎發育期間可能具有抑制作用,但未明確說明抑制的對象、作用機制或發育階段。這項功能描述保留為可能的作用,不延伸為已確立的胚胎發育機制。
Promoter 與基因調控
>RPS6KA6 ENST00000262752 GRCh38 chrX:84188099-84189199 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTTAAACTTTCAGCTCTGAAGTGTTTTGATGAGAAGCATCTTGATTATCCCCCGTATAAGATTATACTT TATCTCTGTTATATCGCCAGCTCCCAGTACAATGTGTGGCTTAGAGTAGCGAAGTAGTAAAGCTCGCTTT GAAGAAGGTACTAAAAACTATGATTATTGTCACTACAGACCCAACATTCTCAGAGGGGGCTGGAGGATGG GCTAGCTTCGGAATCATGCCTTTGTTGCCACAAGTGGAGTTCATTAAGTGGCATATGTTTGCCTGTGTGT GTGCATGTGTGAAGAGAAACATTGTGTGTTATCAATAGTGTGAAGGCAACCAGCAGGAGCATCCTGAGAG GGACAAGTAAGGTGGGGGCTAGAGAGGACAGGTATATTTATTTTTTTAAATGGGGGTTATCCTGCCTTTA CCTTCTAGGAGGATAATGTATGATGTACTAAAATCCCTGCCCTAGTATTTGTCACTAAGTATCGAAATGG GCGTGGTTTGGCATATAAGACACCTGCTCTTCGTGAGCCCTGCAAAGAGATACTCTTGGAGTCCTACCCT TACCCTGATTCCTCAAGTGCTCTGGAGGGTCCCCCAGTTCCAGCATCCTTTTTGAGAATCCTGCCGCCCG CCAGCAATGCTGCTCCGTGGACTTGAGAGGGCCTGCTGAGCATGTGTGAAGAGCGCTGCGCATGCTCCGT GGAGTGGGCAGGTTTACCGAGGCGCTAGCAGGGGCTTTTACTACTGTTCAGTCGCCTCCCCAGCCCAGCA CGCCCCCCTCCCCTCTATCCCACCACCCACCACGCGGTCCCCCGCATCCACCCCGCCCCTCTATCCCGCC CCCTTCACCCCAAGCTGGGGAATCTCCATTGACGTTTGGGTGACGCCGCTGTGCCGCCGCCGTGGGGGGG TCCAGGCGCCGCACAGGTAACGCCGCCGCTGCCGCCATATTGACAGAGCAGGGAGCGGGGAGGGGACCCG AGGAAGTGGGGTGTTGGGGGAGTCACCACCGAGCGGCTGTCGTTGTGGTGGCAGTGGTGAGCGCGAGCCG AGCGGCAGCTCTTGGAGAGGCAGCACAGAGTTGTCTTCTCTATGGGAATCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6KA6_1 ↗ | X:84,188,013 | 負股 | 84,188,003–84,188,062 |
| RPS6KA6_2 ↗ | X:84,188,181 | 負股 | 84,188,171–84,188,230 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_5PRMBS · CTCF_binding_site · 84186814–84186835 · regulatory
ENSRX_CBCJX · enhancer · 84187026–84188188 · regulatory
ENSRX_5PRMHX · CTCF_binding_site · 84187925–84187946 · regulatory
ENSRX_938F84 · promoter · 84188189–84188689 · regulatory
· motif · 84186816–84186832 · motif
· motif · 84187927–84187943 · motif
· motif · 84188250–84188260 · motif
· motif · 84188502–84188513 · motif
· motif · 84188502–84188513 · motif
· motif · 84188522–84188533 · motif
· motif · 84188522–84188533 · motif
· motif · 84189335–84189349 · motif
· motif · 84189336–84189349 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:745 aa
Ribosomal protein S6 kinase alpha-6 長 745 個胺基酸,屬於 AGC Ser/Thr protein kinase family 的 S6 kinase subfamily。其註解包含兩個 Protein kinase 區域,分別位於胺基酸 73–330 與 426–683;胺基酸 331–400 為 AGC-kinase C-terminal 區域。N 端胺基酸 1–28 標示為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPS6KA6 主要位於細胞質,另有細胞核定位的註記。 來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SPRED2Q7Z698 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
在血清飢餓細胞中,RPS6KA6 與 MAPK3/ERK1 形成複合體;同一條件下,來源指出它不與 MAPK9 或 MAPK14 形成複合體。這些資料描述的是複合體形成情形,未提供其他功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS6KA6 是持續具有活性的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,其激酶活性不依賴生長因子。它可能參與 p53/TP53 依賴的細胞生長停滯訊號,並可能在胚胎發育期間發揮抑制作用;來源未詳述相關機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Constitutively active serine/threonine-protein kinase that exhibits growth-factor-independent kinase activity and that may participate in p53/TP53-dependent cell growth arrest signaling and play an inhibitory role during embryogenesis PMID 15042092 ↗ · PMID 15632195 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 在血清飢餓細胞中,RPS6KA6 與 MAPK3/ERK1 形成複合體;在相同細胞條件下,來源指出 RPS6KA6 不與 MAPK9 或 MAPK14 形成複合體。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | RPS6KA6 的定位註記包括細胞質、細胞溶質與細胞核,並指出其主要位於細胞質。來源未說明這些定位是否隨條件改變。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCACCACCGAGCGGCTGTCGTTGTGGTGGCAGTGGTGA40GCGCGAGCCGAGCGGCAGCTCTTGGAGAGGCAGCACAGAG80TTGTCTTCTCTATGGGAATCACCGGGCGGCGGCGGCGGCG120ACCCCCAGCTCCCAGCCTCTGAGAGACCCGGCGGCGAGGG160CAGCGCTCGCTGAAGGCGGGGCTGGGGGTCGCGGCGGCGG200CGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGCCAGTTCAATAGACA240GGATGCGCGGCCGCGCCAGCGGTAGGCGGCAGCTCCTGTT280TGAGTGCTCCTGAAGGGGAGATGCTACCATTCGCTCCTCA320GGACGAGCCCTGGGACCGAGAAATGGAAGTGTTCAGCGGC360GGCGGCGCGAGCAGCGGCGAGGTAAATGGTCTTAAAATGG400TTGATGAGCCAATGGAAGAGGGAGAAGCAGATTCTTGTCA440TGATGAAGGAGTTGTTAAAGAAATCCCTATTACTCATCAT480GTTAAGGAAGGCTATGAGAAAGCAGATCCTGCACAGTTTG520AGTTGCTCAAGGTTCTTGGTCAGGGGTCATTTGGAAAGGT560TTTTCTTGTTAGAAAGAAGACCGGTCCTGATGCTGGGCAG600CTCTATGCAATGAAGGTGTTAAAAAAAGCCTCTTTAAAAG640TTCGAGACAGAGTTCGGACAAAGATGGAGAGGGATATACT680GGTGGAAGTAAATCATCCATTTATTGTCAAATTGCACTAT720GCCTTTCAGACTGAAGGGAAACTGTACTTAATACTGGATT760TTCTCAGGGGAGGAGATGTTTTCACAAGATTATCCAAAGA800GGTTCTGTTTACAGAGGAAGATGTGAAATTCTACCTCGCA840GAACTGGCCCTTGCTTTGGATCATCTGCACCAATTAGGAA880TTGTTTATAGAGACCTGAAGCCAGAAAACATTTTGCTTGA920TGAAATAGGACATATCAAATTAACAGATTTTGGACTCAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。