基因總覽
RPS6KA5(ribosomal protein S6 kinase A5)是蛋白質編碼基因,產物屬於 AGC Ser/Thr protein kinase 家族中的 S6 kinase 子家族。其蛋白質具有兩個 protein kinase 結構域,並含有 AGC-kinase C-terminal 區域;整體屬於蛋白激酶超家族。這些基本特徵將 RPS6KA5 定位為可執行蛋白質磷酸化的激酶,並為其調節轉錄相關蛋白及基因表現的角色提供分子基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000614987 ★ | 90,847,861–91,060,641 | 17 |
| ENST00000536315 | 90,847,861–91,060,134 | 17 |
| ENST00000886635 | 90,847,861–91,060,682 | 16 |
| ENST00000886636 | 90,847,861–91,060,682 | 17 |
| ENST00000886637 | 90,847,861–91,060,682 | 17 |
| ENST00000886638 | 90,847,861–91,060,682 | 16 |
| ENST00000886639 | 90,847,861–91,060,682 | 17 |
| ENST00000946930 | 90,847,861–91,060,682 | 16 |
| ENST00000946931 | 90,847,861–91,060,682 | 16 |
| ENST00000946932 | 90,847,861–91,060,682 | 16 |
| ENST00000946933 | 90,847,861–91,060,682 | 15 |
| ENST00001038762 | 90,847,861–91,060,682 | 16 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6KA5 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基。細胞受到有絲分裂原或壓力刺激時,例如 UV-C 照射、表皮生長因子(EGF)或 anisomycin,RPS6KA5 會磷酸化轉錄因子 CREB1 與 ATF1,並參與多種轉錄因子的活性調節。
在不同刺激與細胞情境下,RPS6KA5 對轉錄調控有不同作用。TNF 訊號或 glucocorticoid 作用時,它參與控制 RELA 的轉錄活性;在細胞質中與 glucocorticoid receptor NR3C1 結合,並有助於抑制 RELA 及發炎基因表現。骨骼肌母細胞遭遇氧化壓力時,RPS6KA5 是 RELA Ser-276 磷酸化所需的因子。促紅血球生成素刺激的細胞中,它則是 STAT3 Ser-727 磷酸化及調節其轉錄潛能所必需。它也會磷酸化 ETV1/ER81 的 Ser-191 與 Ser-216,調節該因子促進轉錄的能力;這項作用可能與發育及乳房腫瘤形成有關。
RPS6KA5 也透過組蛋白磷酸化影響基因轉錄。磷酸化組蛋白 H2A 的 Ser-1 可直接抑制轉錄;對組蛋白 H3 Ser-10 的磷酸化則可在有絲分裂原、壓力刺激或 EGF 反應下促進多個即時早期基因轉錄,包括原致癌基因 c-fos/FOS 與 c-jun/JUN。它也可能磷酸化組蛋白 H3 Ser-28,並介導 HMGN1/HMG14 在有絲分裂原或壓力刺激下的磷酸化。
在脂多醣刺激的原代巨噬細胞中,RPS6KA5 位於 TLR4 下游,作用是限制促發炎細胞激素的產生;其可能透過 CREB1 與 ATF1 促進 MAP kinase phosphatase DUSP1 和抗發炎細胞激素 IL10 的轉錄。此外,它會在生長因子經 MEK/ERK 路徑傳遞訊號時磷酸化 TRIM7 Ser-107,進而刺激 TRIM7 的 ubiquitin ligase 活性;在神經細胞中,則參與興奮毒性損傷下游效應所介導的細胞死亡。
Promoter 與基因調控
>RPS6KA5 ENST00000614987 GRCh38 chr14:91060541-91061641 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATTGCTGGTATTTCTCTCTTATCCATCCTTTACGTTGGTTATCTCAAATGCCTCCTTGCCCTAAAAGCTT TCCCCAGTTCCTCGTCTGGGAATAATTATTGCCATCCGTGCGAGATTCTCTAACGCTTTGTACGACTGCT TTATTTCAAATTCTGCTTTATAGTTCTTTTGTGTACACACACAGATTGTTTCTCACGTTCTATTGAAAGC TGCTTAGGGGAGGAATTGTATTCTATTTTGTTAATCTCTGCATCCTTTCGGCGCCTAGTAAGAGTCTTGT ACGAAACAGAAATGTCTCTCCTTCGTAAAATTCCTCATCGGGAGCTGGGACTGTGAATTTTTGTAACGTT TAAGAACTATCTGTTATTTAAGAACAAACACTCTGCTTAACTTGTTTAGGGTTCACTAGAGCGAGTAAGA CCTTTTTAGGGCACGCCGTCTCGCTGGTTGTCACACACGCATGGATCGCTGCCGGGACCCTTAGGTTTGT CTGCAAACACGTGGGTGATAAGCGCTACCCTCCAGGCCCCTCCTCTGTCCACGGTGATTGGCGGACCAAA CGTTCCAATCATCCCTCCCCGCCTCTTTCGGCAGTAGCCAATCAGAGACCCCGAGCGCCTCCTGACTACT AGACACTGTTTACTAACAGATCGAAGCTGGGGAATAAGGGGTGTGACCGTTCTGGGGAGGTCAGGGAAGG GAAGGTCTTGACTGCGAGTGCGCACCAGAGGAAATGGGCGGGGCAGAGCTTTGGGTCTCACCAATCGGAG TGGCGGCGCTCCTCCCTCTCCTGCCTCCCCGCCAAGCAACAACAATTCGAGGAGCGAGGCGGGGAGGCTC GTGAAACGTCACAGCGTACTGCCCAATGGGAACCGGCGTTGGCAGACGCGCGCGCCCTGTGTCCAATCAG CGAAGGCGGCTCGAATGGCTCCCTTACCTTGCTGGCTGTGGGCGGAGCGGCCTGAGGAGGCGGCGGTGGA GCAGGGGGCGGTTTGGTTGCGCGGTACTAGCGGTGCCCGCCGAAGGGGGAGGAGGCGAGGAGCGAGCCGT GCGGCCAGAGCGGGAAAGAGACTCGTCTTTGCGTCCGAGTTCTGGAGCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6KA5_1 ↗ | 14:91,060,636 | 負股 | 91,060,626–91,060,685 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_BN3WX · enhancer · 91057990–91058590 · regulatory
ENSR14_84N9P5 · enhancer · 91058847–91059036 · regulatory
ENSR14_BN3X6 · enhancer · 91059380–91060123 · regulatory
ENSR14_BN3X9 · promoter · 91060124–91061131 · regulatory
ENSR14_5RF9WJ · CTCF_binding_site · 91060304–91060325 · regulatory
ENSR14_BN3XM · enhancer · 91062700–91063536 · regulatory
· motif · 91060004–91060013 · motif
· motif · 91060004–91060013 · motif
· motif · 91060004–91060020 · motif
· motif · 91060004–91060020 · motif
· motif · 91060006–91060022 · motif
· motif · 91060006–91060022 · motif
· motif · 91060048–91060057 · motif
· motif · 91060067–91060082 · motif
· motif · 91060306–91060322 · motif
· motif · 91060626–91060643 · motif
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· motif · 91060668–91060681 · motif
· motif · 91060684–91060694 · motif
· motif · 91060898–91060908 · motif
· motif · 91060918–91060929 · motif
· motif · 91060918–91060929 · motif
· motif · 91060965–91060975 · motif
· motif · 91061106–91061116 · motif
· motif · 91061137–91061146 · motif
· motif · 91061137–91061146 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:802 aa
RPS6KA5 蛋白質長 802 個胺基酸,具有兩個 protein kinase 結構域,分別位於第 49–318 與第 426–687 個胺基酸;第 319–387 個胺基酸為 AGC-kinase C-terminal 區域。序列註解指出,N 端第 1–23 個胺基酸及 C 端第 741–802 個胺基酸區域屬於無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPS6KA5 主要位於細胞核,也可見於細胞質;在 glucocorticoid 作用下,蛋白質會輸出至細胞質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CSNK2BP67870 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTNNA3Q9UI47-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KDM3AQ9Y4C1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- MAP3K20Q9NYL2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MAPK14Q16539 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
在靜止細胞中,RPS6KA5 可與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體;有絲分裂原刺激後,複合體會短暫解離。它也會與 MAPK14/p38-alpha 形成關聯。活化的 RPS6KA5 與 RELA 結合並磷酸化該蛋白;此外,RPS6KA5 會與 CREBBP 及 EP300 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS6KA5 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,在有絲分裂原或壓力刺激下磷酸化 CREB1、ATF1,並調節 RELA、STAT3 與 ETV1/ER81 的轉錄功能。它可藉由組蛋白磷酸化調節基因表現,並參與發炎基因調控;在脂多醣刺激的原代巨噬細胞中可能限制促發炎細胞激素產生。另參與神經細胞興奮毒性損傷下游的細胞死亡,並可在 MEK/ERK 訊號下磷酸化 TRIM7。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase that is required for the mitogen or stress-induced phosphorylation of the transcription factors CREB1 and ATF1 and for the regulation of the transcription factors RELA, STAT3 and ETV1/ER81, and that contributes to gene activation by histone phosphorylation and functions in the regulation of inflammatory genes. Phosphorylates CREB1 and ATF1 in response to mitogenic or stress stimuli such as UV-C irradiation, epidermal growth factor (EGF) and anisomycin. Plays an essential role in the control of RELA transcriptional activity in response to TNF and upon glucocorticoid, associates in the cytoplasm with the glucocorticoid receptor NR3C1 and contributes to RELA inhibition and repression of inflammatory gene expression. In skeletal myoblasts is required for phosphorylation of RELA at 'Ser-276' during oxidative stress. In erythropoietin-stimulated cells, is necessary for the 'Ser-727' phosphorylation of STAT3 and regulation of its transcriptional potential. Phosphorylates ETV1/ER81 at 'Ser-191' and 'Ser-216', and thereby regulates its ability to stimulate transcription, which may be important during development and breast tumor formation. Directly represses transcription via phosphorylation of 'Ser-1' of histone H2A. Phosphorylates 'Ser-10' of histone H3 in response to mitogenics, stress stimuli and EGF, which results in the transcriptional activation of several immediate early genes, including proto-oncogenes c-fos/FOS and c-jun/JUN. May also phosphorylate 'Ser-28' of histone H3. Mediates the mitogen- and stress-induced phosphorylation of high mobility group protein 1 (HMGN1/HMG14). In lipopolysaccharide-stimulated primary macrophages, acts downstream of the Toll-like receptor TLR4 to limit the production of pro-inflammatory cytokines (By similarity). Functions probably by inducing transcription of the MAP kinase phosphatase DUSP1 and the anti-inflammatory cytokine interleukin 10 (IL10), via CREB1 and ATF1 transcription factors (By similarity). Plays a role in neuronal cell death by mediating the downstream effects of excitotoxic injury (By similarity). Phosphorylates TRIM7 at 'Ser-107' in response to growth factor signaling via the MEK/ERK pathway, thereby stimulating its ubiquitin ligase activity PMID 11909979 ↗ · PMID 12569367 ↗ · PMID 12628924 ↗ · PMID 12763138 ↗ · PMID 12773393 ↗ · PMID 15010469 ↗ · PMID 18511904 ↗ · PMID 25851810 ↗ · PMID 9687510 ↗ · PMID 9873047 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) PMID 12628924 ↗ · PMID 9687510 ↗ · PMID 9873047 ↗ |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 12628924 ↗ · PMID 9687510 ↗ · PMID 9873047 ↗ |
| 交互作用 | 靜止細胞中,RPS6KA5 與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成的複合體會在有絲分裂原刺激後短暫解離。RPS6KA5 也與 MAPK14/p38-alpha 關聯;活化後會結合並磷酸化 NF-kappa-B p65 次單元 RELA,且與 CREBBP、EP300 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a complex with either MAPK1/ERK2 or MAPK3/ERK1 in quiescent cells which transiently dissociates following mitogenic stimulation. Also associates with MAPK14/p38-alpha. Activated RPS6KA5 associates with and phosphorylates the NF-kappa-B p65 subunit RELA. Interacts with CREBBP and EP300 PMID 12569367 ↗ · PMID 12628924 ↗ |
| 細胞定位 | RPS6KA5 主要位於細胞核,也存在於細胞質;在 glucocorticoid 反應下,RPS6KA5 會由細胞核輸出至細胞質。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Predominantly nuclear. Exported into cytoplasm in response to glucocorticoid |
核酸與蛋白質序列
GCGGTACTAGCGGTGCCCGCCGAAGGGGGAGGAGGCGAGG40AGCGAGCCGTGCGGCCAGAGCGGGAAAGAGACTCGTCTTT80GCGTCCGAGTTCTGGAGCCGCCGCACCCCGACTCCTGGGG120CCGCGGCAGCGGCTGCGAGGGGACGGGCGTCCGCTGTCTC160CTGGGTTCCCCTCGTAGCGACCCGCGGGATCGGAAAAAAA200GGAGAAGATGGAGGAGGAGGGTGGCAGCAGCGGCGGCGCC240GCGGGGACCAGCGCGGACGGCGGCGACGGAGGAGAGCAGC280TCCTCACTGTCAAGCACGAGCTGCGGACTGCTAATTTGAC320AGGACATGCTGAGAAGGTGGGAATAGAAAATTTTGAGCTC360CTGAAGGTCCTAGGAACTGGAGCTTATGGAAAAGTATTTC400TAGTTCGTAAAATAAGTGGCCATGATACTGGAAAGCTGTA440TGCCATGAAAGTTTTGAAAAAGGCAACAATCGTTCAAAAG480GCCAAAACCACAGAGCATACAAGGACAGAACGACAAGTCC520TGGAACACATTAGGCAGTCGCCATTTTTGGTAACATTACA560TTATGCTTTCCAGACAGAAACCAAACTTCATCTCATTTTA600GATTATATAAATGGTGGTGAACTTTTTACTCATCTTTCTC640AAAGAGAGCGTTTCACAGAGCATGAGGTGCAGATTTATGT680TGGAGAGATTGTGCTTGCCCTCGAACATCTCCACAAGTTG720GGGATTATATATCGTGATATTAAGCTTGAGAATATTCTAC760TTGATTCTAATGGCCATGTGGTGCTGACAGATTTTGGTCT800GAGTAAGGAGTTTGTGGCTGATGAAACTGAAAGAGCATAT840TCCTTTTGTGGAACTATTGAATACATGGCACCAGATATTG880TCAGAGGGGGAGATTCAGGACATGACAAGGCAGTTGACTG920GTGGAGTTTGGGTGTTCTAATGTATGAATTACTAACTGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。