基因總覽
RPS6KA3 是蛋白質編碼基因，其產物為 ribosomal protein S6 kinase A3。這是一種絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶，屬於 AGC Ser/Thr protein kinase family 的 S6 kinase subfamily。其蛋白質具有多個蛋白激酶結構域，能透過磷酸化作用調節細胞內訊號與其他蛋白質的活性。來源所述的功能涉及轉錄調控、蛋白質翻譯、細胞增殖與存活；其具體作用方式與不同刺激下的角色見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000379565 ★ | 20,149,911–20,266,909 | 22 |
| ENST00000643085 | 20,149,911–20,266,606 | 24 |
| ENST00000645270 | 20,149,911–20,266,627 | 25 |
| ENST00000643402 | 20,149,911–20,267,519 | 24 |
| ENST00000644368 | 20,149,911–20,266,659 | 23 |
| ENST00000647265 | 20,149,911–20,265,617 | 24 |
| ENST00000457145 | 20,149,911–20,218,959 | 21 |
| ENST00000646610 | 20,149,911–20,267,100 | 22 |
| ENST00000643337 | 20,149,911–20,267,405 | 23 |
| ENST00000642835 | 20,149,911–20,267,089 | 25 |
| ENST00000644893 | 20,149,911–20,267,066 | 24 |
| ENST00000916291 | 20,149,911–20,267,062 | 22 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6KA3 位於 ERK 訊號下游，可將生長因子或壓力刺激轉化為下游蛋白質的磷酸化反應，影響轉錄因子活性與細胞反應。在成纖維細胞中，EGF 刺激後的 CREB1 磷酸化及 histone H3 的 Ser-10 磷酸化需要 RPS6KA3，並與多個即時早期基因後續的轉錄活化相關。受 EGF 或 PMA 等促有絲分裂刺激時，RPS6KA3 也會磷酸化並活化 NR4A1/NUR77、ETV1/ER81 及輔因子 CREBBP。胰島素訊號則可透過 RPS6KA3 磷酸化 GSK3B 的 Ser-9、抑制其活性，間接影響多個基因的轉錄調控。
在蛋白質合成方面，血清或 EGF 刺激可促使 RPS6KA3 以不依賴 mTOR 的方式磷酸化 RPS6，並藉由促進翻譯起始前複合體組裝，推動翻譯起始。胰島素刺激下，RPS6KA3 磷酸化 EIF4B，增強 EIF4B 與 EIF3 複合體的親和力，進而刺激帽依賴型翻譯。它也參與 mTOR 的營養感知路徑：直接磷酸化 TSC2 的 Ser-1798，強烈抑制 TSC2 壓制 mTOR 訊號的能力；此外，RPS6KA3 介導 RPTOR 磷酸化以調節 mTORC1 活性，並可能在不依賴 PI3K/AKT 的情況下促進對 rapamycin 敏感的訊號。
RPS6KA3 亦參與細胞存活與細胞週期調節。它磷酸化促凋亡蛋白 BAD 和 DAPK1，抑制兩者的促凋亡功能；在肝毒物 carbon tetrachloride（CCl4）作用下，則可透過磷酸化 CEBPB 促進肝星狀細胞存活。依相似性資料，RPS6KA3 磷酸化 CDKN1B 後，促進其與 14-3-3 蛋白結合，阻止 CDKN1B 移入細胞核並抑制 G1 期進程。
其他情境中的功能包括：在 LPS 刺激的樹突細胞中參與 TLR4 誘導的大胞飲作用；在骨髓瘤細胞中，作為 FGFR3 介導轉化訊號的效應因子，而 FGFR3 會直接磷酸化 RPS6KA3 的 Tyr-529。RPS6KA3 也可磷酸化 SOS1 的 Ser-1134 與 Ser-1161，形成 YWHAB 和 YWHAE 的結合位點，進而負向調節 EGF 誘導的 MAPK1/3 磷酸化。此外，它磷酸化 EPHA2 的 Ser-897，相關訊號路徑參與細胞遷移；在成骨細胞分化中，則透過磷酸化 ATF4 提升其轉錄活性。
Promoter 與基因調控
>RPS6KA3 ENST00000379565 GRCh38 chrX:20266809-20267909 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGCAGGAACCCCGCGCTCCTGCCTACAAGATATTTTTAAATAATTCTCCAACCTCTACCGAGAGGGACAG CCTTAAGGAACCTCCCTGTTTTCCCCTCTTGAAGATTTAGGTAGCAGACGTGGGGCGGGGGGCAGCGGTT CCAGGGTCGCAGCTGAAGGCCGAGAGCTCTGCGCACTTGGGGAGGAGAATTTGGGCTGGGGGCGGTGCGG GGGAAGCGACTAATACAAGAGGAATTAATCCCAAATAGCCACAATTTAACAAAAGAGCGTCAACTTGAAA AGACTTGAATCAAACCGGGAGCCGAGCCCCCAGGAGGCTCCTAGGCACGAAGCCTCCCTTGCCTCCGTCG GGGGAGATGGGGGGCAGGTGATTTCCCAGCATGTGACCCTGAAGAGGGAGGGTCTTGGGCCATTACGGGA TGCGCCCAGAGACTAGGCGCGTCCGCACGCACGCACCCCCGGAGGAGACAAGCCGAAAAGACACTCCGCA CCCCTCCCCGGGTCCTTGGCTCGGGACTGCGCCCCCGGTACTTTGCCCACCTCCCTCCCCAGCTGGGCGG GGACCACTGTTCTCCCTCATTCCCAAGGAGCCTCCGACCTCCTTGGACCCTTGGCGGTGAAAGGCTCCCA GCCTTCGCCCCTCCTGCCTTTCCCATTTCTTTCCCCCGCCTCCCGCCGACGCCCCCAGATCTGTTGGGCT CGCCCTTCCTGAAAGTAGGCGAGGCCCAGAAGCTGAGGTTGGGGCGCAGAAGGAGGGGGGTGGGAAGAGG GAGGAGCGGAGCGCAGCGGCCGGGGGCGTGTCTTCCACTAGCCCAGCCCCTGGGTGCGCGCGGCGGTGGT GGCGGCGGCCGAGCCTCGCTTTGAGAGACAGGTATCGCTTAGGCGCCATGTTGTGAGCGGAAGTGGGGGA GCGCGCGGCGGTCGCTGTTCTGCTGGGAGCGGGCGCGGGAACCGGCGGGGGGGGCGGAGCCGTAGTCCCG GCGGCGGAAGGAGGAGAGGAAGAAAGGGGCGAGACCCGGTGCCCAGCGGAGGCGCGAGGCTCTCGCTCAG CGCGCGGGCGTCTCTGGCCAGGCGCGCGGCTTTCGGGCGGTCGGCGTCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6KA3_2 ↗ | X:20,266,637 | 負股 | 20,266,627–20,266,686 |
| RPS6KA3_1 ↗ | X:20,266,882 | 負股 | 20,266,872–20,266,931 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_B62KM · enhancer · 20263258–20263916 · regulatory
ENSRX_B62KW · enhancer · 20265090–20265606 · regulatory
ENSRX_9B36Z · promoter · 20265607–20266107 · regulatory
ENSRX_C42B4 · promoter · 20266596–20268009 · regulatory
ENSRX_9B38C · enhancer · 20270425–20270860 · regulatory
ENSRX_8L4HF · enhancer · 20271782–20272030 · regulatory
· motif · 20263547–20263555 · motif
· motif · 20265354–20265367 · motif
· motif · 20265354–20265367 · motif
· motif · 20265389–20265402 · motif
· motif · 20265452–20265465 · motif
· motif · 20265510–20265523 · motif
· motif · 20265977–20265990 · motif
· motif · 20267005–20267014 · motif
· motif · 20267005–20267016 · motif
· motif · 20267032–20267045 · motif
· motif · 20267110–20267123 · motif
· motif · 20267219–20267232 · motif
· motif · 20267225–20267238 · motif
· motif · 20267230–20267241 · motif
· motif · 20267953–20267966 · motif
· motif · 20267959–20267972 · motif
· motif · 20270419–20270433 · motif
· motif · 20270419–20270433 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：740 aa
Ribosomal protein S6 kinase A3 長 740 個胺基酸，屬於 protein kinase superfamily，並歸入 AGC Ser/Thr protein kinase family 的 S6 kinase subfamily。蛋白質含有 Protein kinase 1（第 68–327 位）、AGC-kinase C-terminal（第 328–397 位）及 Protein kinase 2（第 422–679 位）區域；第 1–38 位另註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位隨刺激改變的條件或不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 27 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BAG6P46379-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSNK2BP67870 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNAO1P09471 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLF11O14901 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAPK1P28482 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NEK6Q9HC98-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF2Q15599 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PABIR3Q6P4D5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIK3R1P27986-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SPRED2Q7Z698 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
在靜止細胞中，RPS6KA3 與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體；促有絲分裂刺激後，兩者會短暫解離。另有資料記載 RPS6KA3 與 NFATC4、ETV1/ER81 及 FGFR1 互作，但未進一步界定這些互作是否形成複合體。
疾病與遺傳關聯
影響 RPS6KA3 的基因變異與 Coffin-Lowry syndrome 相關。此 X 聯鎖疾病可伴隨智能障礙、臉部與手指形態異常、進行性骨骼畸形、生長遲緩、聽力缺損及陣發性運動障礙。影響此基因的變異也與 X-linked intellectual developmental disorder 19 有關；其特徵為一般智力功能顯著低於平均，並伴隨適應行為受損，且在發育期顯現。資料將兩者列為基因變異相關疾病，未在此提供特定變異的細節。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS6KA3 是 ERK 下游的絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶，參與刺激誘導的轉錄因子活化、翻譯調節、mTOR 訊號、細胞增殖與存活；其作用會因刺激及細胞情境而異，部分細節依相似性資料推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase that acts downstream of ERK (MAPK1/ERK2 and MAPK3/ERK1) signaling and mediates mitogenic and stress-induced activation of the transcription factors CREB1, ETV1/ER81 and NR4A1/NUR77, regulates translation through RPS6 and EIF4B phosphorylation, and mediates cellular proliferation, survival, and differentiation by modulating mTOR signaling and repressing pro-apoptotic function of BAD and DAPK1. In fibroblast, is required for EGF-stimulated phosphorylation of CREB1 and histone H3 at 'Ser-10', which results in the subsequent transcriptional activation of several immediate-early genes. In response to mitogenic stimulation (EGF and PMA), phosphorylates and activates NR4A1/NUR77 and ETV1/ER81 transcription factors and the cofactor CREBBP. Upon insulin-derived signal, acts indirectly on the transcription regulation of several genes by phosphorylating GSK3B at 'Ser-9' and inhibiting its activity. Phosphorylates RPS6 in response to serum or EGF via an mTOR-independent mechanism and promotes translation initiation by facilitating assembly of the preinitiation complex. In response to insulin, phosphorylates EIF4B, enhancing EIF4B affinity for the EIF3 complex and stimulating cap-dependent translation. Is involved in the mTOR nutrient-sensing pathway by directly phosphorylating TSC2 at 'Ser-1798', which potently inhibits TSC2 ability to suppress mTOR signaling, and mediates phosphorylation of RPTOR, which regulates mTORC1 activity and may promote rapamycin-sensitive signaling independently of the PI3K/AKT pathway. Mediates cell survival by phosphorylating the pro-apoptotic proteins BAD and DAPK1 and suppressing their pro-apoptotic function. Promotes the survival of hepatic stellate cells by phosphorylating CEBPB in response to the hepatotoxin carbon tetrachloride (CCl4). Is involved in cell cycle regulation by phosphorylating the CDK inhibitor CDKN1B, which promotes CDKN1B association with 14-3-3 proteins and prevents its translocation to the nucleus and inhibition of G1 progression (By similarity). In LPS-stimulated dendritic cells, is involved in TLR4-induced macropinocytosis, and in myeloma cells, acts as effector of FGFR3-mediated transformation signaling, after direct phosphorylation at Tyr-529 by FGFR3 (By similarity). Negatively regulates EGF-induced MAPK1/3 phosphorylation via phosphorylation of SOS1 (By similarity). Phosphorylates SOS1 at 'Ser-1134' and 'Ser-1161' that create YWHAB and YWHAE binding sites and which contribute to the negative regulation of MAPK1/3 phosphorylation (By similarity). Phosphorylates EPHA2 at 'Ser-897', the RPS6KA-EPHA2 signaling pathway controls cell migration. Acts as a regulator of osteoblast differentiation by mediating phosphorylation of ATF4, thereby promoting ATF4 transactivation activity (By similarity) PMID 10436156 ↗ · PMID 16213824 ↗ · PMID 16223362 ↗ · PMID 17360704 ↗ · PMID 18722121 ↗ · PMID 26158630 ↗ · PMID 8250835 ↗ · PMID 9770464 ↗ · PMID 18508509 ↗ · PMID 18813292 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 靜止細胞中的 RPS6KA3 可與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體，促有絲分裂刺激後會短暫解離；另記載其與 NFATC4、ETV1/ER81 及 FGFR1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a complex with either MAPK1/ERK2 or MAPK3/ERK1 in quiescent cells. Transiently dissociates following mitogenic stimulation (By similarity). Interacts with NFATC4, ETV1/ER81 and FGFR1 PMID 17213202 ↗ |
| 細胞定位 | RPS6KA3 的細胞內定位記載為細胞核與細胞質；此項資料未說明定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 RPS6KA3 的基因變異與 X 聯鎖 Coffin-Lowry syndrome 相關，疾病表現可包括智能障礙、臉部及手指形態異常、進行性骨骼畸形、生長遲緩、聽力缺損與陣發性運動障礙。 | 含實驗來源 | 證據與來源Coffin-Lowry syndrome CLS An X-linked disorder characterized by intellectual disability associated with facial and digital dysmorphisms, progressive skeletal malformations, growth retardation, hearing deficit and paroxysmal movement disorders. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 303600 PMID 10094187 ↗ · PMID 10528858 ↗ · PMID 14986828 ↗ · PMID 15214012 ↗ · PMID 8955270 ↗ · PMID 9837815 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 RPS6KA3 的基因變異與 X-linked intellectual developmental disorder 19 相關；此疾病以一般智力功能顯著低於平均、適應行為受損為特徵，並在發育期間顯現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Intellectual developmental disorder, X-linked 19 XLID19 A disorder characterized by significantly below average general intellectual functioning associated with impairments in adaptive behavior and manifested during the developmental period. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 300844 PMID 10319851 ↗ · PMID 17100996 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAAGGGGCGAGACCCGGTGCCCAGCGGAGGCGCGAGGC40TCTCGCTCAGCGCGCGGGCGTCTCTGGCCAGGCGCGCGGC80TTTCGGGCGGTCGGCGTCGGCGTCGAGCCCTCTCTGGGGC120CGCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGCCGCTGCCGCT160GCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGTGGGGCTCG200GGCGGCGACGGAGCGGGGCCGGCCGTGGGGCGGGCGGGGA240GGGAGGAGGCGGTGAAGGCGGCGGGCCGGGGGGGAAGATG280CCGCTGGCGCAGCTGGCGGACCCGTGGCAGAAGATGGCTG320TGGAGAGCCCGTCCGACAGCGCTGAGAATGGACAGCAAAT360TATGGATGAACCTATGGGAGAGGAGGAGATTAACCCACAA400ACTGAAGAAGTCAGTATCAAAGAAATTGCAATCACACATC440ATGTAAAGGAAGGACATGAAAAGGCAGATCCTTCCCAGTT480TGAACTTTTAAAAGTATTAGGGCAGGGATCATTTGGAAAG520GTTTTCTTAGTTAAAAAAATCTCAGGCTCTGATGCTAGGC560AGCTTTATGCCATGAAGGTATTGAAGAAGGCCACACTGAA600AGTTCGAGACCGAGTTCGGACAAAAATGGAACGTGATATC640TTGGTAGAGGTTAATCATCCTTTTATTGTCAAGTTGCATT680ATGCTTTTCAAACTGAAGGGAAGTTGTATCTTATTTTGGA720TTTTCTCAGGGGAGGAGATTTGTTTACACGCTTATCCAAA760GAGGTGATGTTCACAGAAGAAGATGTCAAATTCTACTTGG800CTGAACTTGCACTTGCTTTAGACCATCTACATAGCCTGGG840AATAATTTATAGAGACTTAAAACCAGAAAATATACTTCTT880GATGAAGAAGGTCACATCAAGTTAACAGATTTCGGCCTAA920GTAAAGAGTCTATTGACCATGAAAAGAAGGCATATTCTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。