基因總覽
RPS6KA1 是蛋白質編碼基因，產物正式名稱為 ribosomal protein S6 kinase A1，亦稱 Ribosomal protein S6 kinase alpha-1。其蛋白質長 735 個胺基酸，屬於 protein kinase superfamily，並歸入 AGC Ser/Thr protein kinase 家族的 S6 kinase 亞家族。這些分類界定了它作為激酶的基本性質；蛋白質序列中可辨識兩個 Protein kinase 區域，並含有 AGC-kinase C-terminal 區域。RPS6KA1 的主要角色是接收細胞訊號並透過磷酸化調節下游分子，涉及轉錄、轉譯與細胞命運等面向。具體的底物、刺激條件與生物學作用依情境而異，詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374168 ★ | 26,529,761–26,575,025 | 22 |
| ENST00000374166 | 26,529,746–26,575,032 | 22 |
| ENST00000892920 | 26,529,746–26,575,032 | 21 |
| ENST00000952527 | 26,529,746–26,575,032 | 22 |
| ENST00000952528 | 26,529,746–26,575,032 | 22 |
| ENST00001001564 | 26,529,746–26,575,032 | 21 |
| ENST00001071564 | 26,529,746–26,575,032 | 21 |
| ENST00001071567 | 26,529,746–26,575,032 | 21 |
| ENST00001071569 | 26,529,746–26,575,022 | 20 |
| ENST00001144002 | 26,529,746–26,575,032 | 22 |
| ENST00000526792 | 26,531,218–26,575,032 | 22 |
| ENST00000529454 | 26,531,328–26,554,251 | 7 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6KA1 是位於 ERK（MAPK1/ERK2 與 MAPK3/ERK1）訊號下游的絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶，可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質的絲胺酸或蘇胺酸殘基。受促有絲分裂或壓力刺激時，它能磷酸化並促進 CREB1、ETV1/ER81 與 NR4A1/NUR77 等轉錄因子的活性，也可作用於輔因子 CREBBP。在纖維母細胞中，RPS6KA1 是 EGF 刺激 CREB1 磷酸化所需的因子，後續可促使多個即時早期基因轉錄；胰島素訊號下，它也能透過磷酸化 GSK3B 的 Ser-9、抑制其活性，間接影響多個基因的轉錄調控。
它亦調節蛋白質合成。血清或 EGF 刺激時，RPS6KA1 可透過不依賴 mTOR 的機制磷酸化 RPS6，促進轉譯起始複合體組裝；胰島素訊號則促使它磷酸化 EIF4B，增強 EIF4B 與 EIF3 複合體的親和力，刺激帽依賴性轉譯。mTORC1 活化時，RPS6KA1 會磷酸化 EIF4B 的 Ser-406 與 Ser-422，促進 SLC4A7 mRNA 轉譯，增加 SLC4A7 蛋白量與功能。它還能直接磷酸化 TSC2 的 Ser-1798，降低 TSC2 抑制 mTOR 訊號的能力；對 RPTOR 與 DEPTOR 的磷酸化則參與 mTORC1 活性調節及 mTORC1、mTORC2 的回饋調控。RPTOR 相關作用可能促進不依賴 PI3K/AKT 路徑、且對 rapamycin 敏感的訊號。
在細胞存活與增殖方面，RPS6KA1 磷酸化促凋亡蛋白 BAD 與 DAPK1，可抑制其促凋亡功能。肝毒物 carbon tetrachloride（CCl4）引發的情境下，它透過磷酸化 CEBPB 促進肝星狀細胞存活；TGFA 則可經由 CEBPB 磷酸化誘導肝細胞增殖。它也會磷酸化細胞週期抑制因子 CDKN1B，促進其與 14-3-3 蛋白結合，阻止 CDKN1B 移入細胞核並抑制 G1 期進程。此外，RPS6KA1 磷酸化 EPHA2 的 Ser-897；RPS6KA-EPHA2 訊號路徑與細胞遷移調控有關。
在感染 Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus/HHV-8 且 RPS6KA1 持續活化時，它可促進病毒裂解期基因晚期的轉錄與轉譯。這項作用與其他細胞訊號功能分屬不同情境，不能據此推定一般未感染細胞中的作用。
Promoter 與基因調控
>RPS6KA1 ENST00000374168 GRCh38 chr1:26528761-26529861 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGCCTTTCACTCCAAGTCCCACCAAGCCTCGGTTCATCCTGGGAGCCTGGTCCCTCCTCAGAGAGTCGC AAACCCAAACTAGTCCAGAGCTGGGGCTGCAGGTGACTCCAGGGAGACCTGACCTGAAAGGACCCCCTTC AAGTGATAGGGCAGAGCACAGATTGCAAAAACGCATATTAAGAAATCACTCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT CATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCGGGGAGTCAGAGACCA GCCTAGGTAACAAAGCGAAACTTCGTGTCTCTCTCTCTCTCACTATATACACACATACATACATATATGT GCATATATATAATATTTATTTATACATATTTATTTATATATGTAATATTTATATACATTATGTAAAATCA ATCGATCAATCAATCACTCTGTGGTGGCACTATGGGTCCTGATGGTGGTAACAACTGCTGATGCCCATCT TGGCCTGGGGCACTGAGATCGCCCGGAGATCACAGTGTTAGCTTCAGGGCGGGGTAGAAATTAGAGGATA GGGGATCTCTAGGGCCTGGTGAGTTGAGGGCCTAAGGGGAGTGGGTCTCAGGCTCCTTCCAAGCCTCAGC CTAGATCAGGCCCAGGAACCCAGTGTGAATGTGTGTGCTGGGGTCGGGGATAAGGTGCTTCTCTCCCGTT GGAAGGAGAAGGAACATCTGGGCTGGGATTCCAAAAGAGCTGAGCGGGGGAGAACGGTGGCCCTGGTGTG GTGTGTCCAGGGGTACACCACTGGAAGGGAAGGAGCCAGCAGGGCCTCTCCGGCGGAGCCGAGCGCGGGC CGGGGGCTCGCGGCAGGGGCGGGGCCGGCCCTCGGGGCGCGGCGGGGGCGGGGGTCCGCGCTGGGAATGC CGCGCCGCGGGGGCTGGGGCGGGGCTTCTCCGGCTCCGCCCCCGCGCAGGTAGCCAATGGGCGCGGCGGC GCCGGGTGACGGAGGGAGCCGAAGTGCTAGTGCCGCGGCGGCGGCGGCGGACGGCCCAGCCGGAGCGCGA GGGGCTCGGGGGGGCGCGGCGGTTCGGGTCGCAGAGCCAGGGACCCCAGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6KA1_1 ↗ | 1:26,529,761 | 正股 | 26,529,712–26,529,771 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_B7966 · promoter · 26529271–26529788 · regulatory
ENSR1_588H2G · CTCF_binding_site · 26529859–26529880 · regulatory
ENSR1_588H56 · CTCF_binding_site · 26530445–26530466 · regulatory
ENSR1_9DJBR · promoter · 26530728–26531228 · regulatory
ENSR1_B796H · enhancer · 26531229–26532157 · regulatory
· motif · 26529616–26529629 · motif
· motif · 26529639–26529652 · motif
· motif · 26529705–26529718 · motif
· motif · 26529772–26529785 · motif
· motif · 26529778–26529791 · motif
· motif · 26529861–26529877 · motif
· motif · 26529975–26529986 · motif
· motif · 26529977–26529986 · motif
· motif · 26530445–26530457 · motif
· motif · 26530447–26530463 · motif
· motif · 26530448–26530455 · motif
· motif · 26530468–26530483 · motif
· motif · 26530658–26530667 · motif
· motif · 26530751–26530763 · motif
· motif · 26530754–26530761 · motif
· motif · 26530817–26530830 · motif
· motif · 26530820–26530832 · motif
· motif · 26530823–26530830 · motif
· motif · 26530829–26530841 · motif
· motif · 26530831–26530838 · motif
· motif · 26530867–26530878 · motif
· motif · 26530867–26530878 · motif
· motif · 26531407–26531420 · motif
· motif · 26531516–26531525 · motif
· motif · 26531516–26531527 · motif
· motif · 26531516–26531527 · motif
· motif · 26531609–26531631 · motif
· motif · 26531609–26531631 · motif
· motif · 26531646–26531657 · motif
· motif · 26531783–26531792 · motif
· motif · 26531783–26531794 · motif
· motif · 26532951–26532962 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：735 aa
Ribosomal protein S6 kinase A1 長 735 個胺基酸，屬於 protein kinase superfamily、AGC Ser/Thr protein kinase 家族及 S6 kinase 亞家族。序列註解包含兩個 Protein kinase 區域，分別位於胺基酸 62–321 與 418–675；兩者之間另有 AGC-kinase C-terminal 區域，位於 322–391。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPS6KA1 的註解定位包括細胞核與細胞質。 來源未提供不同刺激下的定位改變、異構型差異或定位動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 74 個夥伴
- AHNAKQ09666 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- AKAP8O43823 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- APBA3O96018 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARHGAP21Q5T5U3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARHGEF11O15085 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARHGEF12Q9NZN5-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CARD11Q9BXL7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CASKO14936 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CDKN1BP46527 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- DLG5Q8TDM6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ERBINQ96RT1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FRMPD1Q5SYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FRMPD3Q5JV73 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GIPC2Q8TF65 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GOPCQ9HD26 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GORASP1Q9BQQ3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
在靜止細胞中，RPS6KA1 分別可與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體；有促有絲分裂刺激後，這些複合體會短暫解離。來源另記載 RPS6KA1 與 ETV1/ER81、FGFR1 有交互作用，但未進一步說明其複合體組成。感染 Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus/HHV-8 時，RPS6KA1 與病毒蛋白 ORF45 交互作用，且此交互作用可使 RPS6KA1 活化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS6KA1 位於 ERK 訊號下游，參與轉錄因子活化、蛋白質轉譯與 mTOR 訊號調節，並藉由磷酸化 BAD、DAPK1 等分子影響細胞存活。不同作用依刺激而異，涵蓋 EGF、PMA、胰島素、血清及 mTORC1 活化等情境，也涉及細胞增殖、分化、細胞週期與遷移。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase that acts downstream of ERK (MAPK1/ERK2 and MAPK3/ERK1) signaling and mediates mitogenic and stress-induced activation of the transcription factors CREB1, ETV1/ER81 and NR4A1/NUR77, regulates translation through RPS6 and EIF4B phosphorylation, and mediates cellular proliferation, survival, and differentiation by modulating mTOR signaling and repressing pro-apoptotic function of BAD and DAPK1. In fibroblast, is required for EGF-stimulated phosphorylation of CREB1, which results in the subsequent transcriptional activation of several immediate-early genes. In response to mitogenic stimulation (EGF and PMA), phosphorylates and activates NR4A1/NUR77 and ETV1/ER81 transcription factors and the cofactor CREBBP. Upon insulin-derived signal, acts indirectly on the transcription regulation of several genes by phosphorylating GSK3B at 'Ser-9' and inhibiting its activity. Phosphorylates RPS6 in response to serum or EGF via an mTOR-independent mechanism and promotes translation initiation by facilitating assembly of the pre-initiation complex. In response to insulin, phosphorylates EIF4B, enhancing EIF4B affinity for the EIF3 complex and stimulating cap-dependent translation. Is involved in the mTOR nutrient-sensing pathway by directly phosphorylating TSC2 at 'Ser-1798', which potently inhibits TSC2 ability to suppress mTOR signaling, and mediates phosphorylation of RPTOR, which regulates mTORC1 activity and may promote rapamycin-sensitive signaling independently of the PI3K/AKT pathway. Also involved in feedback regulation of mTORC1 and mTORC2 by phosphorylating DEPTOR. Mediates cell survival by phosphorylating the pro-apoptotic proteins BAD and DAPK1 and suppressing their pro-apoptotic function. Promotes the survival of hepatic stellate cells by phosphorylating CEBPB in response to the hepatotoxin carbon tetrachloride (CCl4). Mediates induction of hepatocyte proliferation by TGFA through phosphorylation of CEBPB. Is involved in cell cycle regulation by phosphorylating the CDK inhibitor CDKN1B, which promotes CDKN1B association with 14-3-3 proteins and prevents its translocation to the nucleus and inhibition of G1 progression. Phosphorylates EPHA2 at 'Ser-897', the RPS6KA-EPHA2 signaling pathway controls cell migration. In response to mTORC1 activation, phosphorylates EIF4B at 'Ser-406' and 'Ser-422' which stimulates bicarbonate cotransporter SLC4A7 mRNA translation, increasing SLC4A7 protein abundance and function PMID 10679322 ↗ · PMID 11684016 ↗ · PMID 12213813 ↗ · PMID 15117958 ↗ · PMID 15342917 ↗ · PMID 16213824 ↗ · PMID 16223362 ↗ · PMID 16763566 ↗ · PMID 17360704 ↗ · PMID 18722121 ↗ · PMID 22017876 ↗ · PMID 26158630 ↗ · PMID 35772404 ↗ · PMID 9430688 ↗ · PMID 18508509 ↗ · PMID 18813292 ↗ |
| 功能 | 在 Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus/HHV-8 感染期間，當 RPS6KA1 持續活化時，可促進病毒裂解期基因晚期的轉錄與轉譯；此敘述限定於該感染情境。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Promotes the late transcription and translation of viral lytic genes during Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus/HHV-8 infection, when constitutively activated PMID 30842327 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 在靜止細胞中，RPS6KA1 可分別與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體，並在有促有絲分裂刺激後短暫解離。來源另指出它與 ETV1/ER81 及 FGFR1 有交互作用，但未在此敘述中說明這些交互作用的條件或功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a complex with either MAPK1/ERK2 or MAPK3/ERK1 in quiescent cells. Transiently dissociates following mitogenic stimulation. Interacts with ETV1/ER81 and FGFR1 PMID 12213813 ↗ · PMID 12832467 ↗ · PMID 15117958 ↗ · PMID 15342917 ↗ · PMID 17965187 ↗ |
| 交互作用 | 在 Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus/HHV-8 感染情境中，RPS6KA1 與病毒蛋白 ORF45 交互作用；這項交互作用可使 RPS6KA1 活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus/HHV-8 protein ORF45; this interaction allows RPS6KA1 activation PMID 30842327 ↗ |
| 細胞定位 | RPS6KA1 的細胞內定位註記包括細胞核與細胞質；此筆資料未提供定位改變的刺激條件、異構型差異或動態資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GAAGTGCTAGTGCCGCGGCGGCGGCGGCGGACGGCCCAGC40CGGAGCGCGAGGGGCTCGGGGGGGCGCGGCGGTTCGGGTC80GCAGAGCCAGGGACCCCAGGACCCGGGAGGCGGCGCAGCC120GGGGCCGCCGGAGGAGCGCGGGTGACCTGGCGGCGGCGAG160ATGCCGCTCGCCCAGCTCAAGGAGCCCTGGCCGCTCATGG200AGCTAGTGCCTCTGGACCCGGAGAATGGACAGACCTCAGG240GGAAGAAGCTGGACTTCAGCCGTCCAAGGATGAGGGCGTC280CTCAAGGAGATCTCCATCACGCACCACGTCAAGGCTGGCT320CTGAGAAGGCTGATCCATCCCATTTCGAGCTCCTCAAGGT360TCTGGGCCAGGGATCCTTTGGCAAAGTCTTCCTGGTGCGG400AAAGTCACCCGGCCTGACAGTGGGCACCTGTATGCTATGA440AGGTGCTGAAGAAGGCAACGCTGAAAGTACGTGACCGCGT480CCGGACCAAGATGGAGAGAGACATCCTGGCTGATGTAAAT520CACCCATTCGTGGTGAAGCTGCACTATGCCTTCCAGACCG560AGGGCAAGCTCTATCTCATTCTGGACTTCCTGCGTGGTGG600GGACCTCTTCACCCGGCTCTCAAAAGAGGTGATGTTCACG640GAGGAGGATGTGAAGTTTTACCTGGCTGAGCTGGCTCTGG680GCCTGGATCACCTGCACAGCCTGGGTATCATTTACAGAGA720CCTCAAGCCTGAGAACATCCTTCTGGATGAGGAGGGCCAC760ATCAAACTCACTGACTTTGGCCTGAGCAAAGAGGCCATTG800ACCACGAGAAGAAGGCCTATTCTTTCTGCGGGACAGTGGA840GTACATGGCCCCTGAGGTCGTCAACCGCCAGGGCCACTCC880CATAGTGCGGACTGGTGGTCCTATGGGGTGTTGATGTTTG920AGATGCTGACGGGCTCCCTGCCCTTCCAGGGGAAGGACCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。