基因總覽
RPS5 是蛋白質編碼基因，其產物 ribosomal protein S5 屬於普遍存在的核糖體蛋白 uS7 家族。這個蛋白質是小型核糖體次單元的組成成員；核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。除成熟核糖體外，RPS5 也屬於小型次單元 processome，這是形成真核生物小型核糖體次單元的第一個前驅複合體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000196551 ★ | 58,387,269–58,394,804 | 6 |
| ENST00000851167 | 58,380,570–58,394,810 | 6 |
| ENST00000951621 | 58,381,354–58,394,810 | 6 |
| ENST00001094335 | 58,381,385–58,394,810 | 6 |
| ENST00000601521 | 58,386,360–58,394,810 | 7 |
| ENST00000951622 | 58,386,360–58,394,810 | 5 |
| ENST00001094336 | 58,386,360–58,394,810 | 4 |
| ENST00000596314 | 58,386,507–58,394,736 | 6 |
| ENST00000851168 | 58,386,774–58,394,810 | 6 |
| ENST00001094337 | 58,386,774–58,394,810 | 5 |
| ENST00001094338 | 58,386,774–58,394,810 | 4 |
| ENST00000912985 | 58,386,780–58,394,810 | 6 |
顯示 12/47 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS5 的產物 ribosomal protein S5 是小型核糖體次單元的組成成員。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質；因此，RPS5 同時出現在執行蛋白質合成的核糖體，以及核糖體生成過程中的前驅複合體中。
在成熟核糖體形成之前，RPS5 參與小型次單元 processome。這個複合體是第一個真核生物小型核糖體次單元前驅，並於核仁中組裝。組裝期間，多種核糖體生合成因子、RNA 伴護蛋白與核糖體蛋白會與新生的前體核糖體 RNA（pre-rRNA）結合，協同處理其成熟所需的 RNA 結構與加工步驟。
這些因子共同促進 RNA 折疊、修飾、構形重排與切割；此外，RNA exosome 也會針對前核糖體 RNA 進行選擇性降解。來源描述的是這些參與者在 processome 組裝期間的協同作用，並未將其中任何單一加工步驟指定為 RPS5 獨自執行的功能。由此可見，RPS5 的來源支持角色涵蓋小型核糖體次單元的組成，以及其前驅複合體中的核糖體生成過程。
Promoter 與基因調控
>RPS5 ENST00000196551 GRCh38 chr19:58386269-58387369 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATCCCTCCTTTCAACCTTTGGCCAGAAACCTACGTTTCTGACCCTTGGAGAGGTCGGCCAGTTCAAGAG GCACCCCTGAGAGCCACGTCTGCAGACACGAGGGCCTCGTGACGTGAGCCCTGAGGGCAGGGGGCTGCAA CCCCTCGCGCGGGCTCCCCGGCCGTGGAGGACACAAGGACAAACACGAAGGGTCCCCGACCTGCCGACCC CCTCCTCCCGGACACCGCGCGTAGCCTGTAGGCTACCTCCGCGCTCCACCCAGAGACGGGTCGCGCTGCT CCCGCCGCCGCAACCCCGGGCCCTCGTGCCGGCGGTCTCCCCTCTTCCACGGGCGAGATTACTGCATAGC AGAGGTGAAGGGCGCGGAGGCTGTGGGGGAACCCAGCGTGGTATGGCAGGAAAGGTCGAGCAGGGAAACA GGCCCAGCCAGAGGCTCGGGATCCGGGGCTCGCGAGCGTGGTGCTCCTGGGCCGGGCGGTGGGGGAGGGG CCGCGTGTGGCAGGCACATGCGCACGGCAACCTGGACCTGCGGAGGGCGGCGGTGACCACTGGGCCTCAC TCCGCTAACCCAGGTCCGCATCAGGCGCGTGCCGGTGAGGCGGCTGTGGCCGCGGCGAGGAGTCAGAGGG AACTGAACTGGCTACTCCCGCGGCAGGTGGGATTTAAGGTCAGCAGCTGAACAAAGAAGCGAGCGCTGGC CAGACTTTTTTCTTTATTAGACATGGCTGCGTTGGTCTCACGGAAATCTCTGCGCTTTTGCAGGCGCCCA CAAGACAGGGCAACTACGGGGTAGCGGACATCCGCCAGGCACGCTTCTAGGGCCGCTTCTGCAACTGCGC ATGCGCTTGGGCTGCACCCATTCCGTCTAGCCCAAAAGGTTCCTCTACAACCTTCCTCCGGATTGGTCTA TAGGGACACGATGGCCTTTTACGCAAGCGTCACCCGTGCTGACCCGGAAGTTTTCTTCCCAGTTAAAAGT GTTGGCCCGCGGCGCGCGGCCTCTTCCTGTCTGTACCAGGGCGGCGCGTGGTCTACGCCGAGTGACAGAG ACGCTCAGGCTGTGTTCTCAGGTGAGACCGCCGCGGGGCCGGGGATCCTAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS5_1 ↗ | 19:58,387,269 | 正股 | 58,387,220–58,387,279 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：204 aa
ribosomal protein S5 屬於普遍存在的 uS7 核糖體蛋白家族。來源未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein S5 的定位記錄包括細胞質與細胞核核仁；來源未描述定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPS5 是小型核糖體次單元的組成成員，也屬於小型次單元 processome。後者由 70 多種蛋白質及 RNA 伴護分子 small nucleolar RNA (snoRNA) U3 組成。來源說明其複合體成員關係，未另外指出 RPS5 與特定成員之間的直接實體結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS5 是小型核糖體次單元的組成成員；核糖體是負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。RPS5 也屬於小型次單元 processome，這是第一個真核生物小型核糖體次單元前驅。processome 在核仁中組裝時，多種核糖體生合成因子、RNA 伴護蛋白與核糖體蛋白會和新生 pre-rRNA 結合，協同促成 RNA 折疊、修飾、重排與切割，並由 RNA exosome 選擇性降解前核糖體 RNA。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Part of the small subunit (SSU) processome, first precursor of the small eukaryotic ribosomal subunit. During the assembly of the SSU processome in the nucleolus, many ribosome biogenesis factors, an RNA chaperone and ribosomal proteins associate with the nascent pre-rRNA and work in concert to generate RNA folding, modifications, rearrangements and cleavage as well as targeted degradation of pre-ribosomal RNA by the RNA exosome PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
| 交互作用 | RPS5 是小型核糖體次單元的組成成員，也參與小型次單元 processome。該 processome 由 70 多種蛋白質及 RNA 伴護分子 small nucleolar RNA (snoRNA) U3 組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. Part of the small subunit (SSU) processome, composed of more than 70 proteins and the RNA chaperone small nucleolar RNA (snoRNA) U3 PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
| 細胞定位 | ribosomal protein S5 的定位記錄包括細胞質與細胞核核仁。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTTCCTGTCTGTACCAGGGCGGCGCGTGGTCTACGCCG40AGTGACAGAGACGCTCAGGCTGTGTTCTCAGGATGACCGA80GTGGGAGACAGCAGCACCAGCGGTGGCAGAGACCCCAGAC120ATCAAGCTCTTTGGGAAGTGGAGCACCGATGATGTGCAGA160TCAATGACATTTCCCTGCAGGATTACATTGCAGTGAAGGA200GAAGTATGCCAAGTACCTGCCTCACAGTGCAGGGCGGTAT240GCCGCCAAACGCTTCCGCAAAGCTCAGTGTCCCATTGTGG280AGCGCCTCACTAACTCCATGATGATGCACGGCCGCAACAA320CGGCAAGAAGCTCATGACTGTGCGCATCGTCAAGCATGCC360TTCGAGATCATACACCTGCTCACAGGCGAGAACCCTCTGC400AGGTCCTGGTGAACGCCATCATCAACAGTGGTCCCCGGGA440GGACTCCACACGCATTGGGCGCGCCGGGACTGTGAGACGA480CAGGCTGTGGATGTGTCCCCCCTGCGCCGTGTGAACCAGG520CCATCTGGCTGCTGTGCACAGGCGCTCGTGAGGCTGCCTT560CCGGAACATTAAGACCATTGCTGAGTGCCTGGCAGATGAG600CTCATCAATGCTGCCAAGGGCTCCTCGAACTCCTATGCCA640TTAAGAAGAAGGACGAGCTGGAGCGTGTGGCCAAGTCCAA680CCGCTGATTTTCCCAGCTGCTGCCCAATAAACCTGTCTGC720CCTTTGGGGCAGTCCCAGCCA741cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。