基因總覽
RPS4Y1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein S4 Y-linked 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 Yp11.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000250784 ★ | 2,841,602–2,867,268 | 7 |
| ENST00001080526 | 2,841,568–2,867,268 | 7 |
| ENST00001080528 | 2,841,568–2,867,268 | 6 |
| ENST00001080538 | 2,841,568–2,867,268 | 6 |
| ENST00001080540 | 2,841,568–2,867,268 | 6 |
| ENST00001093022 | 2,841,568–2,867,268 | 6 |
| ENST00001093023 | 2,841,568–2,867,268 | 6 |
| ENST00001093024 | 2,841,568–2,867,268 | 7 |
| ENST00001093025 | 2,841,568–2,867,268 | 7 |
| ENST00001093026 | 2,841,568–2,867,268 | 5 |
| ENST00001131388 | 2,841,568–2,867,268 | 7 |
| ENST00000430575 | 2,841,920–2,866,862 | 7 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>RPS4Y1 ENST00000250784 GRCh38 chrY:2840602-2841702 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCC TCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGC CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA TCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTACAGAAGTGAGCCACCGTGC CCGGCCTGGCTGGTTGTTTTTTGTATATCAATTCTGTCAGGCGGACGCGCGTGAAAAATTCCAATGGAAG CTGTGACCACACACACGCCTGCGCAGTACAACTTACATAGCGGACTTCACTCTCTTAAAAGTGAATTGTT TTGCAGGTTTTACGACATGGACAGAGCTGTGCAGCCATCATCACGAGCTAATCCAAAGCAAGGTATTCGA CTTAAAATTCAAATGCCATGAAACCTATCCTTTCAATGTTTACGGTACAGACGATTTTAGTACTTTCCCA AACCTATGAAATTGGCCCCAATCCTGAACAAGGAATGATTTGTCTCTGAAACAAATCATGATTTTGCAAT CACAGCATGTCACAGTCACAAGGAATCATATAGGTTATTTCTCACGATTGGCATTTTTTTTTAAGGCTCC TAAATCGTGCTGTTTCAGGACTTTTGCTAAATATTTTGAAGGTCGGCGAAAGATAAGTTTAAGAGTGTAA ACTGCGTCCTCCCAGCTCAGCCAACTTGACGGGGGGTAGGCACAACAAAAAGTCCTGCGGCATAACTGAC ACCTGTAAATCAGTATCAGAAACTGAAAATGCTAAGAAATTCAGTTCCAGGATATGAACTCTACAGCGGA AGAATAAGAAACCGGAACTAAACTTCTCACTCATCTGACTTCCTGCGGTTTACGACAACAGACTTTGGTT GCACCGGAAAAGAACAGATTCTCTTCCGTCGCAGAGTTTCGCCATGGTAAGACCGATAGTTCCTAACTCC TAGTATATCTGCCTCCATCATTTGAAAAAGGGCCGTTCTACCTTGGCGATG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRY_848WD · promoter · 2841395–2841612 · regulatory
ENSRY_935G9 · enhancer · 2841613–2842002 · regulatory
· motif · 2841308–2841322 · motif
· motif · 2841308–2841322 · motif
· motif · 2841522–2841531 · motif
· motif · 2841824–2841833 · motif
· motif · 2841824–2841833 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：263 aa
RPS4Y1 的蛋白質長 263 個胺基酸，屬於真核核糖體蛋白 eS4 家族。其第 42–104 位胺基酸區段註記為 S4 RNA-binding 結構域。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTCTTCCGTCGCAGAGTTTCGCCATGGCCCGGGGCCCCAA40GAAGCACTTAAAGCGTGTTGCAGCGCCGAAGCATTGGATG80CTTGACAAACTAACGGGTGTATTTGCACCTCGTCCATCGA120CAGGTCCCCACAAGCTGAGGGAATGTCTTCCTCTGATCGT160CTTCCTCAGGAATAGACTCAAGTATGCGTTGACTGGAGAT200GAGGTAAAGAAGATATGTATGCAACGTTTCATCAAAATTG240ATGGCAAGGTTCGAGTGGATGTCACATACCCTGCTGGATT280CATGGATGTCATCAGCATCGAGAAGACAGGTGAACATTTC320CGCCTGGTCTATGACACCAAGGGCCGTTTTGCTGTTCACC360GCATCACAGTGGAAGAGGCAAAGTACAAGTTGTGCAAAGT400GAGGAAGATTACTGTGGGAGTGAAGGGAATCCCTCACCTG440GTGACTCATGATGCTCGAACCATCCGCTACCCAGATCCTG480TCATCAAGGTGAACGATACTGTGCAGATTGATTTAGGGAC520TGGCAAGATAATCAACTTTATCAAATTTGATACAGGCAAT560TTGTGTATGGTGATTGGTGGAGCCAACCTCGGTCGTGTTG600GTGTGATCACCAACAGGGAAAGACATCCTGGTTCTTTTGA640TGTGGTGCATGTGAAGGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCC680ACGAGGCTTTCCAACATTTTTGTCATTGGCAATGGCAATA720AACCTTGGATTTCCCTGCCCAGGGGAAAGGGCATTCGACT760TACTGTTGCTGAAGAGAGAGATAAGAGGCTGGCCACCAAA800CAGAGCAGTGGCTAAATTGCAGTAGCAGCATATCTTTTTT840TCTTTGCACAAATAAACAGTGAATTCTCGTTTCTTAATGT880GTTTTTTCCCCCTTGTGGATAATAGTAGGGTTTGAATTTG920CTCATGATTTTGGCACTGTCTTAAGATCTCTAGGAATACC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。