基因總覽
RPS25 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein S25。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eS25 家族，為小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責細胞內的蛋白質合成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000527673 ★ | 119,015,717–119,018,343 | 5 |
| ENST00000891654 | 119,014,665–119,018,724 | 4 |
| ENST00000937795 | 119,014,665–119,018,724 | 5 |
| ENST00000937796 | 119,014,665–119,018,724 | 5 |
| ENST00000937797 | 119,014,665–119,018,724 | 5 |
| ENST00000942362 | 119,014,665–119,018,724 | 5 |
| ENST00001093270 | 119,014,665–119,018,724 | 5 |
| ENST00001093276 | 119,014,665–119,018,724 | 4 |
| ENST00001142693 | 119,014,665–119,018,724 | 5 |
| ENST00001077962 | 119,015,708–119,018,724 | 5 |
| ENST00000891655 | 119,015,712–119,018,724 | 4 |
| ENST00000937798 | 119,015,712–119,018,724 | 4 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS25 的產物是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成，是細胞內合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體；因此，RPS25 的來源支持角色是作為核糖體組成的一部分，參與承載蛋白質合成的核糖體結構。
現有資料未進一步描述 RPS25 的分子作用方式、參與的特定生物學過程，或其對蛋白質合成的個別影響，也沒有提供其缺失或改變時的功能結果。因此，功能說明限於其在小型核糖體次單元中的組成角色，以及核糖體整體負責細胞內蛋白質合成這一背景。
Promoter 與基因調控
>RPS25 ENST00000527673 GRCh38 chr11:119018243-119019343 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGCCGTTCAGGAGACGGGGGACTTACGAGTGGAACATGGAGGCCAGCATAAGCTTCTCATTAGAAGTGAG GCGGGGCCGGCCAAATCGAATGGACACCGGGTAATTAGCAGGGTTACCCAGATACTCCAGCACCTCTTTC CCGTCGGCCGTGTACCTGCCATTCACGTCCATGCCATTGATGGCCAGCACTGCATGACCCACTGCAGAGG TGAAGCTAACGGTCAGCGAAGGTGCAGCCCGGGGATTCCGCCGAGGGGACAAGGGACCCGACACAACCCC TTTTCCCCCAACCCCGCACCTACAACCAGCCCACTTCTACAGCACTGGGGCCCTCCCACCCCCGCACCCG CCACGGGCCCGAGCCTAGCCCACCTCGGATGCCGTCCCGCTGGCCGAAAGCAACCAACACACGCTCATCG TGTAGCTTGAGCAGCAGATCCAGCGGATAACTGAAAGTTTTCTCAGCCTCAGCCCGTGGCGCGTAGCTGT CCAACTGGTAAATCAAGCCGCCAGCTTTGTTCACCACATACACACTAAAAATCGCCATCGCTGCCTTGCC GCTCGGAAACTGGTATTCAGCCTCTACCCGACGGCCCCTCCCCGGAACCGCATCACAGCACTTGCCGCCG GCCCCACCCCAGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCGCGCCCCCCGTGCAGCCACCTGCTGCACTTG CGCACTGGGAGCGACACGCTCGGGCATAAGTAGTGCCGGAAAGTTAGCTGCCGAGACCTGGTGGATTGCT TTTCGTTTATCAGTGCAGGAAAACAGCGCTATAGTATGCGTCACAACTAGCGCAGACTCCGGCAGTATTT AGGCGGTGCGGCTTGGGAACTAGAATCCACTTCCTGTCTTCCGCCTCAGGCTAGAGGGCGAGCGCTTCGC CGTGGGACTTCTTCTGCCTGGCTCCGCCTTTTGCCCCGGAAGTACTCACAGCGGACGGTGGTTTTTGGGC CCGTTTCTGAGCAGCGCTTCCTTTTTGTCCGACATCTTGACGAGGCTGCGGTGTCTGCTGCTATTCTCCG AGCTTCGCAATGGTAAGCTTCAGGGGTGTGAAGTCGCCGGCGTTCTTGGGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS25_1 ↗ | 11:119,018,343 | 負股 | 119,018,333–119,018,392 |
| RPS25_2 ↗ | 11:119,018,637 | 負股 | 119,018,627–119,018,686 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_532ZSB7 · CTCF_binding_site · 119015387–119015408 · regulatory
ENSR11_93Q8H8 · promoter · 119018333–119018776 · regulatory
· motif · 119015389–119015405 · motif
· motif · 119015657–119015668 · motif
· motif · 119017546–119017557 · motif
· motif · 119018121–119018134 · motif
· motif · 119018208–119018219 · motif
· motif · 119018259–119018271 · motif
· motif · 119018390–119018399 · motif
· motif · 119018390–119018401 · motif
· motif · 119018390–119018401 · motif
· motif · 119018467–119018476 · motif
· motif · 119018640–119018651 · motif
· motif · 119018640–119018651 · motif
· motif · 119018794–119018804 · motif
· motif · 119018996–119019009 · motif
· motif · 119021356–119021368 · motif
· motif · 119021403–119021417 · motif
· motif · 119021404–119021417 · motif
· motif · 119021457–119021472 · motif
· motif · 119021836–119021851 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：125 aa
RPS25 蛋白長 125 個胺基酸，屬於真核生物核糖體蛋白 eS25 家族。其第 1 至 38 位胺基酸區段註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPS25 的細胞定位資料為細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- HMBOX1Q6NT76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NKAPD1Q6ZUT1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STAC3Q96MF2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- THAP1Q9NVV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSPYL2Q9H2G4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZBTB14O43829 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPS25 是小型核糖體次單元的組成成分；資料未提供其與特定蛋白質的直接結合資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS25 是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ |
| 交互作用 | RPS25 是小型核糖體次單元的組成成分。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPS25 的定位為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTTTGTCCGACATCTTGACGAGGCTGCGGTGTCTGCTG40CTATTCTCCGAGCTTCGCAATGCCGCCTAAGGACGACAAG80AAGAAGAAGGACGCTGGAAAGTCGGCCAAGAAAGACAAAG120ACCCAGTGAACAAATCCGGGGGCAAGGCCAAAAAGAAGAA160GTGGTCCAAAGGCAAAGTTCGGGACAAGCTCAATAACTTA200GTCTTGTTTGACAAAGCTACCTATGATAAACTCTGTAAGG240AAGTTCCCAACTATAAACTTATAACCCCAGCTGTGGTCTC280TGAGAGACTGAAGATTCGAGGCTCCCTGGCCAGGGCAGCC320CTTCAGGAGCTCCTTAGTAAAGGACTTATCAAACTGGTTT360CAAAGCACAGAGCTCAAGTAATTTACACCAGAAATACCAA400GGGTGGAGATGCTCCAGCTGCTGGTGAAGATGCATGAATA440GGTCCAACCAGCTGTACATTTGGAAAAATAAAACTTTATT480AAA483cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。