基因總覽
RPS21 是蛋白質編碼基因，產物為 ribosomal protein S21，屬於真核生物核糖體蛋白 eS21 家族。此蛋白是小型核糖體次單元的組成成分；核糖體本身是大型核糖核蛋白複合體，負責細胞內蛋白質的合成。現有資料未提供其胺基酸序列、結構域或其他結構特徵，因此不作進一步推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343986 ★ | 62,387,103–62,388,520 | 6 |
| ENST00001075744 | 62,365,598–62,388,680 | 6 |
| ENST00000863379 | 62,385,948–62,388,680 | 8 |
| ENST00000955608 | 62,385,948–62,388,680 | 8 |
| ENST00000934821 | 62,385,996–62,388,680 | 7 |
| ENST00000934822 | 62,385,996–62,388,680 | 6 |
| ENST00000934820 | 62,386,001–62,388,680 | 6 |
| ENST00000934826 | 62,386,001–62,388,680 | 6 |
| ENST00000934833 | 62,386,001–62,388,680 | 5 |
| ENST00001075745 | 62,386,001–62,388,520 | 6 |
| ENST00000934823 | 62,386,976–62,388,680 | 6 |
| ENST00000934824 | 62,386,980–62,388,680 | 6 |
顯示 12/50 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS21 的產物 ribosomal protein S21 是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成，是細胞合成蛋白質的複合體；因此，RPS21 的來源支持功能，是作為該核糖體結構的一部分參與蛋白質合成系統。
現有資料將其定位於小型次單元，並未進一步描述它在核糖體中的具體位置、與核糖體 RNA 的接觸方式，或對轉譯各步驟的個別影響。依據這些資訊，可說明其與核糖體及蛋白質合成的關聯，但無法據此指定更細緻的分子機制或其他細胞功能。
Promoter 與基因調控
>RPS21 ENST00000343986 GRCh38 chr20:62386103-62387203 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCACCTGGCCACTGAGTCTTAAGTTTTCTGAGGCTAGTTCTACATCCTAGGATCATGTCCCCCGCCCAGA GAAGACCCCAACATAGGCCGCGCTGCTCCCTCCGTCTACCGGTTTGGAGCTTCTCCTGGCAACAGGGTTC AGGCTACTAACAAGGCCTTCCTCAAGACCCCACCCATAACCAACGACCATACTTCGTGGGTCCATCTTTG TAACATCTTTACTTCCTTGGAGCAAATTCCCAGGAATGGGTTTTCGGGGTCCAAGGGTATGCACCTCTAG CACTACGACAAACGCGGCCAACACGCTTCAGGGAAACGGTGCCCCAGTTTGCATTCTGCTTCCCCTGCCC TGCCCTGGGGGTCTGACTGGTGAAACATGGGATGGCAGAGTGGTCGGGTGTTTCAGATTCCACGGTGGGC CGGGGTCTTTTCCTACCCTCGGGAGCCGTCTGAATTTCTCCTCTGCCGAGTTCCTGCGGGTGTCCTTCGC CCACCGGCCCGGGGGAGTGAGTAGCAGGCACCAGGTGAGCAGGCCTCCGCTCGCAGCGGCTACGTGCACG GGCAGGAGCACCGCCCCACGCCCCAGGTGGCCGCAGGGTGAGGGGACCGGAGGGCGGGAGGCGCACAATG GGGGGCACGCCCGTATCTCTAGCCCGGCCGGCAGCGGGCAGCGAGGCTCAGTCCTCGCCCCTTCTCCCAG CTGCTATTCGGGGCTCCCGAGGCGCTCAGAGGGGTCGACTGCGTCCGTGGGGCACAACCCAGGGGCCAGG CTAAGACGCCACACACGGCAACGACCCTCAACGACAACGACCCCCACGACGCCCCGCGCCCCAGGGCCAG CAGGCTGGGGTCCGAGAACCTCCTTGCCGGAAGCGGAAGTGCGTCACGGCGACGGCCGGCAAGCACGCAC CGCGCAGACTCGCTGTGGTGGCGTGACCCGGAAGCGCTCGCCGAGGCCCCTCCTTGCCCGCCGATATCTC TGCCGGGTGACTAGCTGCTTCCTTTCTCTCTCGCGCGCGGTGTGGTGGCAGCAGGTGTGGCGCGCGGCGC GGGCTTCGGGCTCAGGGCTGGGGCTGGGGCGGGAGTGGGGGCTTGGACGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS21_1 ↗ | 20:62,387,104 | 正股 | 62,387,055–62,387,114 |
| RPS21_2 ↗ | 20:62,387,322 | 正股 | 62,387,273–62,387,332 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_C875M · enhancer · 62382344–62383397 · regulatory
ENSR20_5JN6KP · CTCF_binding_site · 62382457–62382478 · regulatory
ENSR20_5JN6MP · CTCF_binding_site · 62382891–62382912 · regulatory
ENSR20_C875W · enhancer · 62385669–62386991 · regulatory
ENSR20_9WQKS · promoter · 62386992–62387328 · regulatory
ENSR20_5JN7FK · CTCF_binding_site · 62387390–62387411 · regulatory
ENSR20_BGDB7 · enhancer · 62388784–62389663 · regulatory
· motif · 62382459–62382475 · motif
· motif · 62382893–62382909 · motif
· motif · 62386968–62386977 · motif
· motif · 62386970–62386983 · motif
· motif · 62386972–62386983 · motif
· motif · 62386972–62386983 · motif
· motif · 62386974–62386983 · motif
· motif · 62387029–62387040 · motif
· motif · 62387037–62387048 · motif
· motif · 62387037–62387048 · motif
· motif · 62387039–62387048 · motif
· motif · 62387066–62387077 · motif
· motif · 62387132–62387141 · motif
· motif · 62387238–62387250 · motif
· motif · 62387392–62387408 · motif
· motif · 62387713–62387724 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：83 aa
RPS21 的蛋白質產物屬於真核生物核糖體蛋白 eS21 家族。現有來源未提供其序列特徵、結構域、功能區域或其他蛋白質註解，因此不推定額外的結構資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPS21 曾在細胞質多核糖體中被檢測到；另有相似性證據指出，它可見於與粗糙內質網相關的核糖體。 後者屬於依相似性推定的定位，並非此來源所述的直接檢測結果。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLEKHF2Q9H8W4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RPSAP08865 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZNF76P36508 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPS21 是 40S 小型核糖體次單元的組成成分，來源支持其參與此核糖體次單元；資料未指出特定的直接結合夥伴，也未提供其他功能性互作關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS21 的產物是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質；此項功能敘述由所列研究支持。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ · PMID 25957688 ↗ |
| 交互作用 | RPS21 是 40S 小型核糖體次單元的組成成分。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the 40S small ribosomal subunit PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ · PMID 25957688 ↗ |
| 細胞定位 | RPS21 在細胞質及胞質溶膠中定位，並曾於細胞質多核糖體中檢測到；另依相似性推定，它可見於與粗糙內質網相關的核糖體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytosol; Cytoplasm; Rough endoplasmic reticulum; Detected on cytosolic polysomes. Detected in ribosomes that are associated with the rough endoplasmic reticulum (By similarity) PMID 25957688 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCTTTCTCTCTCGCGCGCGGTGTGGTGGCAGCAGGCGCAG40CCCAGCCTCGAAATGCAGAACGACGCCGGCGAGTTCGTGG80ACCTGTACGTGCCGCGGAAATGCTCCGCTAGCAATCGCAT120CATCGGTGCCAAGGACCACGCATCCATCCAGATGAACGTG160GCCGAGGTTGACAAGGTCACAGGCAGGTTTAATGGCCAGT200TTAAAACTTATGCTATCTGCGGGGCCATTCGTAGGATGGG240TGAGTCAGATGATTCCATTCTCCGATTGGCCAAGGCCGAT280GGCATCGTCTCAAAGAACTTTTGACTGGAGAGAATCACAG320ATGTGGAATATTTGTCATAAATAAATAATGAAAACCTA358cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。