演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPS20S20

ribosomal protein S20

RPS20 編碼 ribosomal protein S20,屬於 universal ribosomal protein uS10 family,是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體負責在細胞內合成蛋白質。

Homo sapiens8q12.1UniProt P60866
OFFICIAL SYMBOL
RPS20
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P60866
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPS20 是蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein S20 屬於 universal ribosomal protein uS10 family。此蛋白質是小型核糖體次單元的組成成分;小型次單元隸屬於核糖體這種大型核糖核蛋白複合體。核糖體的基本角色是在細胞內合成蛋白質。現有資料支持其家族歸屬與核糖體組成身分,但未提供蛋白質長度、結構域或更細緻的結構特徵。

Official symbol
RPS20
Gene name
ribosomal protein S20
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10405
UniProt
P60866
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
S20uS10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q12.1
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegRPS20pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:56,020,034–56,074,575
Gene span
54,542 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000009589 ★56,073,054–56,074,5064
ENST0000112873056,020,034–56,074,5754
ENST0000110371656,020,039–56,074,5755
ENST0000110371756,067,252–56,074,5756
ENST0000061865656,067,254–56,074,1445
ENST0000110371956,067,254–56,074,5755
ENST0000110371856,067,256–56,074,5756
ENST0000051980756,067,295–56,074,5756
ENST0000110372056,068,117–56,074,5755
ENST0000108144056,072,975–56,074,5754
ENST0000052434956,073,042–56,074,5063
ENST0000110372256,073,047–56,074,5754

顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPS20 的產物 ribosomal protein S20 是小型核糖體次單元的組成成分。它所屬的核糖體是大型核糖核蛋白複合體,包含 RNA 與蛋白質成分,負責在細胞內合成蛋白質。

因此,來源所支持的功能重點是 ribosomal protein S20 作為小型次單元成分,參與核糖體這套蛋白質合成機構。資料並未進一步說明它在核糖體中的具體位置、與 RNA 的接觸方式,或對蛋白質合成各步驟的個別作用;也未描述移除或改變此蛋白質後對細胞的影響。據此可將其功能概括為核糖體組成相關,而不延伸推論特定分子機制或調控作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 56074506 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPS20 ENST00000009589 GRCh38 chr8:56074406-56075506 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCCTGGACGGAGGGGTCAGAGCTCTGTCCCTCCCCATTTCAGAGTGTTTGAGCAAATAACTCTTTCGGC
TCAGAGCTTCAGGTGGAAAGTAATATGAGATGATTTTACTCTTCTTTCTGCCCTGTATCAAAATCCATCT
CAGTGATTTCCACGTATTTAGCCCCGGCTTCTTGCTCAGGTGTAGGTGAGCTCACCCTGCGCTCTCTCCC
ACTGCTCAGCTCAGTTGACCATTCGGGTTTTCCACTATACTTGGTCACTTATGTGATTATGAACAGATGT
TCAGTATTAAGAAGACCCTGGGGGATCTTATCCAATGACTTTATCCAACAGAAAGGAGATGAGGTATCAG
GACTGGGTGGCTAGCCAGGTTCCAGGCCGGGCCTCAGGATAGCTGCGCAGCCTGGCATTTTCGCCTCACT
TTCCAGAAGGACGAGAAGCCAAGTTCAGGTCCTTTCCAGAAATAGATGTAGATACTTCTGCTGGACTGGG
AAGCCAGGAGCTGAAATATCACAACAGGACGTTTCAGGCTATGAAAAATAACTGCTTACTAATTCTAACG
TAAGTTATCCAGATTACGAGAAGCATTTCTGCCAATGCTCATGTCAGCTAAGCTCAGAGAAGTTACCTCA
TCCTCAGAGAGCAACGAATGGTATGGTCTATGTAGAAAGCAAAATTTGCAACGGAAAAACCAGAGTTCGT
GTGCACTTTATGAGGAAGAGGGTTAGGTGCACCAGACAGAGGAGTTTCTCAGGTTTCCGTGTCGCCTGTT
CTCTCGACCAGGTGGCCCTCTCGGCGCAGGCGGGGACCCCACCCTGCGGGACTTCGGCTCCTCCGTGCGG
ACAGGGGGCGCCCGCAGCCGTGCCTTTCCCGCCAACTCCACTAGTGCTCCAGCTCGCCCTTGTGCGACCG
CCTCTAGGGCCCGGGATATTTCCTGTTCCGGGGCGTGTGGGACCCGGATGCAAGCGTGCTATATAAGCGT
TGCTCAAGTCCCACCCCTTTCTTTTTGAGGAAGACGCGGTCGTAAGGGCTGAGGATTTTTGGTCCGCACG
CTCCTGCTCCTGACTCACCGCTGTTCGCTCTCGCCGAGGAACAAGTCGGTC
RPS20 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPS20_2 ↗8:56,073,746負股56,073,736–56,073,795
RPS20_1 ↗8:56,074,506負股56,074,496–56,074,555

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_C7K82 · enhancer · 56069892–56070987 · regulatory

ENSR8_83MHRR · enhancer · 56071483–56071621 · regulatory

ENSR8_9S8X9 · promoter · 56074346–56074703 · regulatory

ENSR8_BF5GP · enhancer · 56074704–56075483 · regulatory

ENSR8_83MHZB · open_chromatin_region · 56079210–56079400 · regulatory

· motif · 56069517–56069532 · motif

· motif · 56069522–56069534 · motif

· motif · 56069525–56069532 · motif

· motif · 56073648–56073657 · motif

· motif · 56073650–56073661 · motif

· motif · 56073650–56073661 · motif

· motif · 56073652–56073661 · motif

· motif · 56073667–56073676 · motif

· motif · 56073771–56073780 · motif

· motif · 56074015–56074026 · motif

· motif · 56074118–56074127 · motif

· motif · 56074509–56074519 · motif

· motif · 56074545–56074554 · motif

· motif · 56074558–56074568 · motif

· motif · 56074569–56074580 · motif

· motif · 56074571–56074580 · motif

· motif · 56074631–56074642 · motif

· motif · 56074992–56075007 · motif

· motif · 56074992–56075007 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:119 aa

ribosomal protein S20 屬於 universal ribosomal protein uS10 family。現有資料僅提供其家族分類,未列出胺基酸長度、結構域、功能區域或其他序列註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · SU=1-119

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

資料將 RPS20 產物的定位標示為細胞質;未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
S20RPS20LRRK2NEDD8RPL4ORF9b
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPS20 產物是 40S small ribosomal subunit 的組成成分,支持其參與該次單元複合體。資料未指出特定的直接結合對象,也未描述其他功能性互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein S20 是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein S20 是 40S small ribosomal subunit 的組成成分。含實驗來源
證據與來源

Component of the 40S small ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein S20 位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000009589 · 519 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTTTTGAGGAAGACGCGGTCGTAAGGGCTGAGGATTTTT40
41GGTCCGCACGCTCCTGCTCCTGACTCACCGCTGTTCGCTC80
81TCGCCGAGGAACAAGTCGGTCAGGAAGCCCGCGCGCAACA120
121GCCATGGCTTTTAAGGATACCGGAAAAACACCCGTGGAGC160
161CGGAGGTGGCAATTCACCGAATTCGAATCACCCTAACAAG200
201CCGCAACGTAAAATCCTTGGAAAAGGTGTGTGCTGACTTG240
241ATAAGAGGCGCAAAAGAAAAGAATCTCAAAGTGAAAGGAC280
281CAGTTCGAATGCCTACCAAGACTTTGAGAATCACTACAAG320
321AAAAACTCCTTGTGGTGAAGGTTCTAAGACGTGGGATCGT360
361TTCCAGATGAGAATTCACAAGCGACTCATTGACTTGCACA400
401GTCCTTCTGAGATTGTTAAGCAGATTACTTCCATCAGTAT440
441TGAGCCAGGAGTTGAGGTGGAAGTCACCATTGCAGATGCT480
481TAAGTCAACTATTTTAATAAATTGATGACCAGTTGTTAA519

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。