基因總覽
RPS2 是蛋白質編碼基因，產物為 ribosomal protein S2，屬於普遍存在的核糖體蛋白 uS5 家族。此蛋白是大型核糖核蛋白複合體——核糖體的組成成分之一；核糖體負責在細胞中合成蛋白質。其序列註解包含 S5 DRBM 結構域，以及位於蛋白質 N 端的無序區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343262 ★ | 1,962,058–1,964,826 | 7 |
| ENST00000526522 | 1,961,987–1,965,510 | 5 |
| ENST00000530225 | 1,961,987–1,965,510 | 5 |
| ENST00000872227 | 1,961,987–1,965,510 | 6 |
| ENST00000872228 | 1,961,987–1,964,829 | 6 |
| ENST00000872229 | 1,961,987–1,964,829 | 7 |
| ENST00000872230 | 1,961,987–1,964,829 | 6 |
| ENST00000872231 | 1,961,987–1,964,829 | 6 |
| ENST00000872232 | 1,961,987–1,965,510 | 5 |
| ENST00000872233 | 1,961,987–1,964,829 | 7 |
| ENST00000872234 | 1,961,987–1,964,826 | 7 |
| ENST00000929923 | 1,961,987–1,964,889 | 7 |
顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS2 的產物參與 40S 核糖體小次單元的組裝與功能。核糖體由大小次單元構成，負責將遺傳訊息轉譯為蛋白質；其中小次單元會結合信使 RNA（mRNA），並藉由選擇相符的胺醯轉移 RNA（tRNA），讀取 mRNA 所編碼的訊息。RPS2 是此小次單元的組成成分之一。
在核糖體蛋白質合成過程中，大次單元的胜肽轉移酶中心催化胜肽鍵形成，使 tRNA 帶入的胺基酸聚合成多肽鏈。新生多肽由大次單元內的通道離開核糖體，並可在通道出口與蛋白質因子互動；這些因子參與新生鏈的酵素處理、定位，以及膜插入。這些過程描述核糖體的整體運作，來源未進一步指出 RPS2 在其中直接執行哪一項反應。
RPS2 也參與核仁內前體 18S 核糖體 RNA（pre-18S rRNA）的加工及核糖體組裝。另有相似性推論指出，RPS2 的突變會影響轉譯保真度的控制；此項功能描述標示為 By similarity，應視為相似性推論，而非此來源所列的直接實驗證據。
Promoter 與基因調控
>RPS2 ENST00000343262 GRCh38 chr16:1964726-1965826 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGGAAGCCTCTGAGCTTCCCATCCTTGCTAGTGCTCTGCTGGCTCCACCTGGAGCCCTTTGGACCAAGG CATTTTACCTGCCAGTGTAGTTCACTTGAGATGCGCATGGCCACAAGACTGTTCGTAGTCTGGCTCCTCC ACTTAAGAGGCGTCGGACCTTACACATCACCTGCCAACCTCCCATATCCTACCCTTGTGTCCAAAGCCAG GAAAGAAGAGGAGGCATCTCGCTAGGGTTCTCCCCGCCACAGCGTGAACATATGCACTTGCCGCCAGGCT GATAGGCGAGTCGGGGCCCCAAGAACACCCGCATGCAGTGAGTTAGACAAAACAGCTTTATTTGAAAGAC GTGGGACAGCCAAGTTCCCCCAACCCCGCGGTCCTGGCGACGTCGGTGTCAGGCGTGGGAGGACCAGTGT CCTGCGGAGAAAGAACAAGGTTAGGGGTCTGCAGTCGGGGTCAGGAGTCAGGGGCCAGACCTCGCGAGCG ACCGCACCCGGGGGGGAGGCGGCAGCGCCTGTCGGGGCCTGGGTTTCACCGCCGCACATGGGGCAGCGCG CGGTGAGCTGAGGCCCCCGGGGGCTCTGGGCGCCGAATCTCACCCGCGGCCACGGCCAAAGCCGGGGGCG ATTTTCAACCAACGCCGGTCTCGAAGACCACCAGCGAGACGCCAGTGGTCAACGCGGCAGGACCTACCTA AGTGAAGAGGAGAGCGCAATGGAGGCGCGGACGTTTATAGCCACTCTTCGGGTGGATTCCCGAGCCGCGG CTGGGGACGGAGGCGCCGGCGTTTATAGTCGCTTTTCGGGTGACGTAGATTCCCGGGCCGCGGCTGGGGC CGGACGGGCAAGAGCACTCAGAGCCCGGTGAGGGCGGGGCACCGCGGAGCCAATCACAGGTTGTCTTATA GGAGCTCGGCCCGCTCCCGCTTGGGGCGGGGCTGCGGAGATCTCGCGGCGCTTGGCGTGCTATAAAAGCT GCTTCCCAGTAGGTCTCGTTCTTCTTTTCCGACAAAACACGTGAGTCCTGTTGGTCGCTGCAGCGGGCCT CTGCGTGGGCGGCGGGAATCCGCGGACATCGGGTCGGGTCTAGGCTCCCGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS2_2 ↗ | 16:1,964,589 | 負股 | 1,964,579–1,964,638 |
| RPS2_1 ↗ | 16:1,964,826 | 負股 | 1,964,816–1,964,875 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_9R3C · promoter · 1964036–1964536 · regulatory
ENSR16_9R3J · promoter · 1964621–1965125 · regulatory
ENSR16_C797 · enhancer · 1965126–1966211 · regulatory
· motif · 1961585–1961596 · motif
· motif · 1961822–1961833 · motif
· motif · 1961824–1961833 · motif
· motif · 1963602–1963619 · motif
· motif · 1963657–1963668 · motif
· motif · 1963905–1963918 · motif
· motif · 1963905–1963918 · motif
· motif · 1964617–1964627 · motif
· motif · 1964625–1964636 · motif
· motif · 1964764–1964777 · motif
· motif · 1964802–1964811 · motif
· motif · 1964802–1964811 · motif
· motif · 1964810–1964821 · motif
· motif · 1964885–1964895 · motif
· motif · 1964947–1964957 · motif
· motif · 1965137–1965154 · motif
· motif · 1965357–1965370 · motif
· motif · 1965360–1965372 · motif
· motif · 1965363–1965370 · motif
· motif · 1965377–1965390 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：293 aa
ribosomal protein S2 長 293 個胺基酸，屬於普遍存在的核糖體蛋白 uS5 家族。序列註解指出，其第 102 至 165 位胺基酸為 S5 DRBM 結構域；第 1 至 56 位胺基酸則被標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
與 ZNF277 形成複合體時，RPS2 可能位於核仁及細胞質；此定位描述帶有可能性，並限定於與 ZNF277 結合的情境。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- AKT1P31749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LRRK2Q5S007 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NAT10Q9H0A0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PDCD2Q16342 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRMT3O60678 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- RPS9P46781 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RPS2 是小核糖體次單元的組成成分。核糖體外，RPS2 可透過 ZNF277 的鋅指結構域與其直接結合；此互動會與 PRMT3 結合 RPS2 競爭，且 RPS2 也與 PRMT3 互動。RPS2 另直接、共轉譯地與 PDCD2 互動，協助將 uS5 伴護至細胞核內的組裝位置；它也與 PDCD2L 互動，與 PDCD2L 的伴護功能相關。當 RPS2 的 Lys-54 與 Lys-58 發生單泛素化時，則有與 RIOK3 互動的記錄。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS2 是核糖體的組成成分；核糖體小次單元結合 mRNA，並選擇相符的胺醯 tRNA 讀取訊息，大次單元的胜肽轉移酶中心則催化胜肽鍵形成。新生多肽經大次單元通道離開並與蛋白質因子互動。RPS2 另參與 40S 次單元組裝與功能、前體 18S rRNA 的核仁加工及核糖體組裝；其突變影響轉譯保真度控制的描述屬 By similarity。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the ribosome, a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. The small ribosomal subunit (SSU) binds messenger RNAs (mRNAs) and translates the encoded message by selecting cognate aminoacyl-transfer RNA (tRNA) molecules. The large subunit (LSU) contains the ribosomal catalytic site termed the peptidyl transferase center (PTC), which catalyzes the formation of peptide bonds, thereby polymerizing the amino acids delivered by tRNAs into a polypeptide chain. The nascent polypeptides leave the ribosome through a tunnel in the LSU and interact with protein factors that function in enzymatic processing, targeting, and the membrane insertion of nascent chains at the exit of the ribosomal tunnel. Plays a role in the assembly and function of the 40S ribosomal subunit (By similarity). Mutations in this protein affects the control of translational fidelity (By similarity). Involved in nucleolar processing of pre-18S ribosomal RNA and ribosome assembly (By similarity) PMID 23636399 ↗ |
| 交互作用 | RPS2 是小核糖體次單元的成分，並與多種蛋白質互動。它透過 ZNF277 的鋅指結構域直接進行核糖體外結合，且此互動與 PRMT3 結合 RPS2 競爭；RPS2 也與 PRMT3 互動。RPS2 直接、共轉譯地與 PDCD2 結合，以協助 uS5 前往細胞核組裝位置，並與具伴護功能的 PDCD2L 互動。當 Lys-54 和 Lys-58 單泛素化時，RPS2 會與 RIOK3 互動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. Interacts with zinc finger protein ZNF277 (via zinc-finger domains); the interaction is direct; the interaction is extra-ribosomal. Interaction with ZNF277 competes with the binding of RPS2 to protein arginine methyltransferase PRMT3. Interacts with PRMT3. Interacts with PDCD2; the interaction is direct, occurs cotranslationally, and serves to chaperone uS5 to assembly sites in the nucleus. Interacts with PDCD2L; for chaperone function of PDC2L. Interacts (when monoubiquitinated at Lys-54 and Lys-58) with RIOK3 PMID 23636399 ↗ · PMID 27697862 ↗ · PMID 30530495 ↗ · PMID 33245768 ↗ · PMID 39947182 ↗ · PMID 39947183 ↗ |
| 細胞定位 | RPS2 位於細胞質及細胞核核仁。與 ZNF277 形成複合體時，RPS2 可能位於核仁與細胞質；該定位描述具有可能性，並限定於與 ZNF277 結合的情境。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus, nucleolus; Probably localized to nucleolus and cytoplasm in complex with ZNF277 PMID 23636399 ↗ · PMID 30530495 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTTCTTTTCCGACAAAACACCAAATGGCGGATGACGCCGG40TGCAGCGGGGGGGCCCGGGGGCCCTGGTGGCCCTGGGATG80GGGAACCGCGGTGGCTTCCGCGGAGGTTTCGGCAGTGGCA120TCCGGGGCCGGGGTCGCGGCCGTGGACGGGGCCGGGGCCG160AGGCCGCGGAGCTCGCGGAGGCAAGGCCGAGGATAAGGAG200TGGATGCCCGTCACCAAGTTGGGCCGCTTGGTCAAGGACA240TGAAGATCAAGTCCCTGGAGGAGATCTATCTCTTCTCCCT280GCCTATTAAGGAATCAGAGATCATTGATTTCTTCCTGGGG320GCCTCTCTCAAGGATGAGGTTTTGAAGATTATGCCAGTGC360AGAAGCAGACCCGTGCCGGCCAGCGCACCAGGTTCAAGGC400ATTTGTTGCTATCGGGGACTACAATGGCCACGTCGGTCTG440GGTGTTAAGTGCTCCAAGGAGGTGGCCACCGCCATCCGTG480GGGCCATCATCCTGGCCAAGCTCTCCATCGTCCCCGTGCG520CAGAGGCTACTGGGGGAACAAGATCGGCAAGCCCCACACT560GTCCCTTGCAAGGTGACAGGCCGCTGCGGCTCTGTGCTGG600TACGCCTCATCCCTGCACCCAGGGGCACTGGCATCGTCTC640CGCACCTGTGCCTAAGAAGCTGCTCATGATGGCTGGTATC680GATGACTGCTACACCTCAGCCCGGGGCTGCACTGCCACCC720TGGGCAACTTCGCCAAGGCCACCTTTGATGCCATTTCTAA760GACCTACAGCTACCTGACCCCCGACCTCTGGAAGGAGACT800GTATTCACCAAGTCTCCCTATCAGGAGTTCACTGACCACC840TCGTCAAGACCCACACCAGAGTCTCCGTGCAGCGGACTCA880GGCTCCAGCTGTGGCTACAACATAGGGTTTTTATACAAGA920AAAATAAAGTGAATTAAGCGTGTTA945cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。