演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPS15RIG

ribosomal protein S15

RPS15 編碼 ribosomal protein S15,屬於普遍存在的 uS19 核糖體蛋白家族,是小型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiens19p13.3UniProt P62841
OFFICIAL SYMBOL
RPS15
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P62841
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPS15 是一個蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein S15 屬於 universal ribosomal protein uS19 family。此蛋白質是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質;RPS15 因此是核糖體組成的一部分。來源未提供其胺基酸序列、結構域或其他結構特色。

Official symbol
RPS15
Gene name
ribosomal protein S15
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10388
UniProt
P62841
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RIGMGC111130S15uS19

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25RPS15pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:1,438,149–1,440,508
Gene span
2,360 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000592588 ★1,438,396–1,440,4954
ENST000005896561,438,149–1,440,5084
ENST000005860961,438,149–1,440,4943
ENST000009277751,438,149–1,440,4974
ENST000009277761,438,149–1,440,4944
ENST000010839381,438,149–1,440,4943
ENST000010839401,438,149–1,440,5084
ENST000010839421,438,149–1,440,5085
ENST000010921681,438,149–1,440,5084
ENST000010921691,438,149–1,440,5084
ENST000010921701,438,149–1,440,5084
ENST000010921711,438,149–1,440,4974

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ribosomal protein S15 的已知角色是構成小型核糖體次單元。核糖體由 RNA 與蛋白質組成,是細胞合成蛋白質的核糖核蛋白複合體;RPS15 的功能敘述因此指向其作為核糖體結構組成成分,而非來源所描述的獨立催化或調控作用。

核糖體負責細胞內的蛋白質合成,而 RPS15 所屬的小型次單元則是該複合體的一部分。依現有資料,可將其生物學意義概括為參與構成執行蛋白質合成的核糖體。來源沒有進一步說明 RPS15 如何與核糖體 RNA 或其他核糖體蛋白協同,也未描述其對翻譯效率、特定 RNA 或特定蛋白質產物的影響。

目前提供的功能資訊未指出 RPS15 的作用是否受特定細胞條件、刺激或發育階段調節,也沒有列出基因或蛋白質受擾動後的實驗結果。因此,能支持的結論限於它是小型核糖體次單元的組成成分,以及核糖體整體負責細胞內蛋白質合成;不能據此推定更細緻的分子機制或其他生物學作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1438396 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPS15 ENST00000592588 GRCh38 chr19:1437396-1438496 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCACTTTGGGAGGCCAAAGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAACATGGCCTGGCCAAC
ATGGAGAAACCGTGTCTTTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCACGGTAACAGGTGCCTGTAATCCCAG
CTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCAC
ACCACTGCACTCCAGCCAGGGCAACAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTCACTCCTACA
TAGTTCTAGTTACTCCTTCTCTTTGAGCTATCATTATTCACATTACATTTACATATCTTAACAAACCCAG
TGATATTCCTAACTTTATTTTTGAGGCAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCCGTTGGCGCGA
TCACGGCTCACTGCAGCCTTGACCTCCTGGGCTGAAGGCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAATTTTTTGT
ACTTTTTATTCTTTTATGTCCGTGTGTACACAAATTTTTGTATTTTTTTGTAGAGAGGCAGTCTCACTGT
GTTGTCCTTACTAACTTTATATACAAAATTTTATCTGTTAAAGCCGGAATGGTTCTTTTCAGCGAGGCCC
TGTCCCTGCTCCAGTATCTGTAATGAATTCTCGTGTTCCTCCCACAGTGGGACCTGAACCGCCAAACCGC
ACCTACGAGCAAACGGTAGGCGCTCCATAAATACTTGTTGATGTGGGTGCCATCGTGTAGATGACGGAGC
ACGAACCCGAGGCTCAGACAGGGGCGGCGACTTGTCCAAAGTCCCACTCCGTGGAGGAAGCGGCTCTGCA
GACCTCAGGCGGCGGCTGCTCTAATCCCTGCAGCCTGTGTTTTGCCCTCCAGACGGCAGAGGGCGCGTGT
TCGCCGCCGGGAAAGCGGAAGCGCGTGTGCGCGCACGGCCGAGGGGGCGGGACATGCCGGCAGTCTCGCG
ATAACTGCGCAGGCGCGGACCAAAGCGATCTCTTCTGAGGATCCGGCAAGATGGTGAGTGTTGCGATTTG
GCGCGTCTCTGCCGGGCCTATCCGGCTCCATCCAACCTCTGACCGTCTCGC
RPS15 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPS15_1 ↗19:1,438,405正股1,438,356–1,438,415

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_B9NT · enhancer · 1436385–1436964 · regulatory

ENSR19_B9P3 · promoter · 1437868–1438432 · regulatory

ENSR19_5C5LQ · CTCF_binding_site · 1438284–1438305 · regulatory

ENSR19_D3X8 · enhancer · 1442841–1445286 · regulatory

· motif · 1438089–1438097 · motif

· motif · 1438197–1438212 · motif

· motif · 1438286–1438302 · motif

· motif · 1438315–1438328 · motif

· motif · 1438317–1438328 · motif

· motif · 1438317–1438328 · motif

· motif · 1438325–1438336 · motif

· motif · 1438381–1438392 · motif

· motif · 1438381–1438392 · motif

· motif · 1438515–1438532 · motif

· motif · 1440143–1440154 · motif

· motif · 1440143–1440154 · motif

· motif · 1440145–1440154 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:145 aa

ribosomal protein S15 屬於 universal ribosomal protein uS19 family。現有來源未提供其胺基酸長度、結構域、功能區域或序列註解,因此無法進一步描述蛋白質結構細節。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · SP=1-145

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

ribosomal protein S15 的定位資料標示為細胞質。 來源未提供定位隨條件改變的資訊,也未區分異構型或描述細胞內動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RIGRPS15G2E3LRRK2PPIA
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPS15 被記載為小型核糖體次單元的組成成分,支持其屬於該核糖體複合體。來源未提供與特定蛋白質或 RNA 直接結合的資料,也未列出其他互作對象。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein S15 是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein S15 是小型核糖體次單元的組成成分。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein S15 位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000592588 · 501 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CAAAGCGATCTCTTCTGAGGATCCGGCAAGATGGCAGAAG40
41TAGAGCAGAAGAAGAAGCGGACCTTCCGCAAGTTCACCTA80
81CCGCGGCGTGGACCTCGACCAGCTGCTGGACATGTCCTAC120
121GAGCAGCTGATGCAGCTGTACAGTGCGCGCCAGCGGCGGC160
161GGCTGAACCGGGGCCTGCGGCGGAAGCAGCACTCCCTGCT200
201GAAGCGCCTGCGCAAGGCCAAGAAGGAGGCGCCGCCCATG240
241GAGAAGCCGGAAGTGGTGAAGACGCACCTGCGGGACATGA280
281TCATCCTACCCGAGATGGTGGGCAGCATGGTGGGCGTCTA320
321CAACGGCAAGACCTTCAACCAGGTGGAGATCAAGCCCGAG360
361ATGATCGGCCACTACCTGGGCGAGTTCTCCATCACCTACA400
401AGCCCGTAAAGCATGGCCGGCCCGGCATCGGGGCCACCCA440
441CTCCTCCCGCTTCATCCCTCTCAAGTAATGGCTCAGCTAA480
481TAAAGGCGCACATGACTCCAG501

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。