基因總覽
RPLP1 是蛋白質編碼基因,其產物名稱為 ribosomal protein lateral stalk subunit P1。此蛋白質屬於真核生物核糖體蛋白質 P1/P2 家族,長度為 114 個胺基酸。序列註解指出,第 69 至 114 個胺基酸構成一段無序區域。這些資訊描述其家族歸屬與基本序列特徵;其參與蛋白質合成的作用另於功能段說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000260379 ★ | 69,452,818–69,456,205 | 4 |
| ENST00000357790 | 69,452,656–69,456,205 | 3 |
| ENST00000560274 | 69,452,656–69,456,205 | 2 |
| ENST00000859701 | 69,452,656–69,456,205 | 4 |
| ENST00000911446 | 69,452,656–69,455,554 | 4 |
| ENST00000911447 | 69,452,656–69,456,205 | 4 |
| ENST00000911451 | 69,452,656–69,455,546 | 2 |
| ENST00000911454 | 69,452,656–69,455,546 | 4 |
| ENST00001091621 | 69,452,656–69,455,554 | 4 |
| ENST00001091623 | 69,452,656–69,455,553 | 4 |
| ENST00001091625 | 69,452,656–69,456,205 | 3 |
| ENST00001091626 | 69,452,656–69,456,205 | 4 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPLP1 的產物在蛋白質合成的延伸階段扮演重要角色。此來源指出其功能與蛋白質合成中的特定階段相關,但未進一步說明其分子作用方式、參與的具體步驟或對合成效率的影響,因此不宜據此推演更詳細的機制。
Promoter 與基因調控
>RPLP1 ENST00000260379 GRCh38 chr15:69451818-69452918 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAAGAAGGTGCCCCCCCCCCACCAAAAAAAAAGATATATATACATAGAACTAACTTTCCGGTAAACTAAG CAAATTCCACGAGGAATGCAAAGATGACCATTTTTGAAGGTAGGAATTTAAATTGGGTTTAGATAACAAA TAACGGGTTGTAGACAGCTTACCCATAATCCCTCCTTCCCCCAAGCACTAGGCAGTGAAGTTAGACTTCT GGATTCCACCTCCACGCTCACCGCGCGGCACTATGCAATCTTCGGTTAGTTACCAGGTCTAAGTTAGGCT TCTGGATTCCAACTCCACGCTCCACCGCGCGGAACTATGCAATCTTGAGTTAGCTACCGGGTCTAAGTTA GGCTTCTAGATTCCAAATCCACGCTCCACTGCGCGGTAACTACATAATCTTGGGCTAGTTTACCAGCTCT AAGACTTAATTTTGCCATATGCAAGATGGAGATAACATCCAACTCCTGGTGTGTGAGGATTACGTGAATC CTTGCAGAATGTGGCTCAGTGCCTGGGACATAGTAAGCGCTCTACGGCTTCTGCTAGCATAACGCTGTTA GTTTCTCTCATCCTCCTACATCTACCTATCTCAACCAAGGTCCTGCGCTAAGCAGGGGCCTCCAAGCTGG GACGCAGCCCTTACTCTCAGGGTCAGCGCCGGCTGGGAAGGCCGCGACCTAACCAGGAGATTACGAACAA TGTCACCAGGGCCACAGCGGAGCTCCTGCCAAGTCAAGCAACTCATGGAACCAACGGAGGCGAAGTCCGA ATACCTAGGCAACCCTAACCTAAAAGTGTTTTTAACGTTCTCAGGTCCTATAATTTACCCAAATAAAGTG GGACCGTATTTGCAGGCGCTGAGAAACTTTCTCAACAGTAAGAACCAATCAGGCGCAGTGCGCAGGCGCC TTCAGTGGGTCCTGGGTCCGCCTCTTCCGCCCGGTGCGGGCGCCGATTGGTCCGCGTGGACACATAAGAG GCTGCGTATAGGCGCGAGAGCCCCTTTCCTCAGCTGCCGCCAAGGTGCTCGGTCCTTCCGAGGAAGCTAA GGCTGCGTTGGGGTGAGGCCCTCACTTCATCCGGCGACTAGCACCGCGTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPLP1_1 ↗ | 15:69,452,820 | 正股 | 69,452,771–69,452,830 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR15_8435KT · enhancer · 69451472–69451602 · regulatory
ENSR15_BHR65 · promoter · 69452324–69452894 · regulatory
ENSR15_932KC6 · enhancer · 69455614–69455929 · regulatory
ENSR15_D5G37 · enhancer · 69456190–69458326 · regulatory
· motif · 69452716–69452727 · motif
· motif · 69452716–69452727 · motif
· motif · 69453016–69453033 · motif
· motif · 69453113–69453122 · motif
· motif · 69453113–69453124 · motif
· motif · 69453113–69453124 · motif
· motif · 69453214–69453231 · motif
· motif · 69453446–69453454 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:114 aa
ribosomal protein lateral stalk subunit P1 長 114 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白質 P1/P2 家族。序列第 69 至 114 個胺基酸被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CSNK2A1P68400 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RPLP2P05387 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SUOXP51687 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPLP1 與 RPLP2 形成異源二聚體,位於大型核糖體次單元的側向柄部。來源描述的是兩者組成二聚體及其所在位置,未提供其他結合或功能關係的細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPLP1 在蛋白質合成的延伸階段扮演重要角色;來源未進一步列明其具體作用方式、作用對象或其他相關條件。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | RPLP1 與 RPLP2 形成異源二聚體,並位於大型核糖體次單元的側向柄部;此敘述未提供其他互作條件或功能細節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with RPLP2 at the lateral ribosomal stalk of the large ribosomal subunit PMID 22135285 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCCCTTTCCTCAGCTGCCGCCAAGGTGCTCGGTCCTTCCG40AGGAAGCTAAGGCTGCGTTGGGGTGAGGCCCTCACTTCAT80CCGGCGACTAGCACCGCGTCCGGCAGCGCCAGCCCTACAC120TCGCCCGCGCCATGGCCTCTGTCTCCGAGCTCGCCTGCAT160CTACTCGGCCCTCATTCTGCACGACGATGAGGTGACAGTC200ACGGAGGATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTG240TAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTGTTTGCAAAGGC280CCTGGCCAACGTCAACATTGGGAGCCTCATCTGCAATGTA320GGGGCCGGTGGACCTGCTCCAGCAGCTGGTGCTGCACCAG360CAGGAGGTCCTGCCCCCTCCACTGCTGCTGCTCCAGCTGA400GGAGAAGAAAGTGGAAGCAAAGAAAGAAGAATCCGAGGAG440TCTGATGATGACATGGGCTTTGGTCTTTTTGACTAAACCT480CTTTTATAACATGTTCAATAAAAAGCTGAACTTTACTGCT520GTTGGTCTTGTCCATAGTTTTGGAATGTGCTCTGCAAAAA560TGGTCTGTTTTGTAATGTTGGCTTTCAGCCTATTCTGCCA600TGACACAGGCTGGATTTTCCCTGCCACCATTGCCGGATGT640GAGATTTAGACAATCCTGATGCTAACAAGAAGGCACCTCA680TGGTACAGTGTTGAAAACTGCACTGGGGTGGCAGGAGGAA720GGATCAGAGCAGATGCTTTGTCCAGGTTACCTGTGTAAAC760TTGATGATTATAAGGTGTGTCCCCTACACTGGGGGTGGAG800GGTAATACAGACCAGCTTTAGAAAGCCTCCTGGGTATTTA840CCCTATACAACCCTGCCTAAGAACGAACTTTGACGTATGC880TGAATGTTGACTGCTACATCCCAAGGTTGTAAAAAAACAA920GACTTAGCTATGTAATGTCTCACCAAATGTTTGGGAGTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。