演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPLP0PRLP0

ribosomal protein lateral stalk subunit P0

RPLP0 是編碼 ribosomal protein lateral stalk subunit P0 的人類蛋白質編碼基因;其產物在功能上相當於 E. coli 的 L10 蛋白。

Homo sapiens12q24.23UniProt P05388
OFFICIAL SYMBOL
RPLP0
CHROMOSOME
12
UNIPROT
P05388
PDB / ALPHAFOLD
4V6X
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPLP0 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein lateral stalk subunit P0。其產物 ribosomal protein P0 在功能上相當於 E. coli 蛋白質 L10。現有資料未提供更多可用於描述其基本性質或結構特色的資訊。

Official symbol
RPLP0
Gene name
ribosomal protein lateral stalk subunit P0
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10371
UniProt
P05388
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PRLP0P0L10ERPP0LP0uL10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.23
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegRPLP0pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:120,196,698–120,201,235
Gene span
4,538 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000392514 ★120,196,699–120,201,1118
ENST00000551150120,196,699–120,201,1147
ENST00000552292120,196,699–120,197,8082
ENST00000313104120,196,699–120,201,2117
ENST00000546989120,196,699–120,201,2118
ENST00000228306120,196,699–120,201,2118
ENST00000874747120,196,699–120,201,2118
ENST00000874748120,196,699–120,201,2117
ENST00000874749120,196,699–120,201,2118
ENST00000874750120,196,699–120,201,2118
ENST00000874751120,196,699–120,201,2118
ENST00000874752120,196,699–120,201,2118

顯示 12/62 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ribosomal protein P0 在功能上相當於 E. coli 蛋白質 L10。來源未進一步說明這項功能等同性所涉及的分子作用方式、相關生物學過程或生理意義,因此不延伸推定其他功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 120201111 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPLP0 ENST00000392514 GRCh38 chr12:120201011-120202111 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACCCAGGCTAGAGTGCAATGGTGTGATCTTAGCTCACTGCAGAGCTCACAGCTCCCGGGTTCAAGCGATT
CTTCTGCCTCGGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACGGGCATGCGCCACCCCACCTGGCTAATTTTTGTATT
TTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCC
GCCTCGTCCTCCCGAAGTGCTGGGAGTATAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGGTTTTAAAGGATCCC
TCTGTTTTGGTAGGCGGAAAAACTAGAGAAGACGAGAGACCATTCTGAGGCCGGGCGCGGCGGGTCACGC
CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGA
GAACATGATGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAATTAGCCGAGCACGGTGGCGGGCGCCT
GTAGTCCCAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTCAG
CCGAGATGGCGCCACTGCGCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGACACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA
GAGAAACCATTCTGTTTCTAAGCATGTGCAATTATGTCTCAGCTCCACGTCATACCTTTTAGTTTGCTGA
GCTCGCCAGGTGGCACAGGGAACCGGGACTCCGAATTCGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCCCAGCAGGT
GGCAGCAGCTCAGAGCAAGCTCCTCCAACGCGAGGCAGCGCCTTCCTTCGCGACCCTACTTAAAGGCGGC
TTTCCGTTGGCTGGAGTGGCAGCGATATTATCCAATGGTTGCCTGTATTCGTTCAGCTTTGTCTGACGGG
CGATGGCGCAGCCAATAGACAGGAGCGCTATCCGCGGTTTCTGATTGGCTACTTTGTTCGCATTATAAAA
GGCACGCGCGGGCGCGAGGCCCTTCTCTCGCCAGGCGTCCTCGTGGAAGGTTCGTGTGCTAGTTAGATGG
GCGCCAGGGGTCGCCGGCGGGAAGCATGGAGGGGTCTTTGGGGGCCTTTGG
RPLP0 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPLP0_2 ↗12:120,200,823負股120,200,813–120,200,872
RPLP0_1 ↗12:120,201,107負股120,201,097–120,201,156

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_CFX33 · enhancer · 120199617–120201088 · regulatory

ENSR12_5339CLC · CTCF_binding_site · 120201045–120201066 · regulatory

ENSR12_93QP6G · promoter · 120201089–120201382 · regulatory

ENSR12_5339CM3 · CTCF_binding_site · 120201190–120201211 · regulatory

ENSR12_5339CMP · CTCF_binding_site · 120201334–120201355 · regulatory

ENSR12_CFX36 · enhancer · 120201383–120202526 · regulatory

ENSR12_5339CMZ · CTCF_binding_site · 120201393–120201414 · regulatory

· motif · 120196421–120196443 · motif

· motif · 120196421–120196443 · motif

· motif · 120199912–120199921 · motif

· motif · 120200017–120200028 · motif

· motif · 120200128–120200136 · motif

· motif · 120201047–120201063 · motif

· motif · 120201076–120201092 · motif

· motif · 120201116–120201127 · motif

· motif · 120201116–120201127 · motif

· motif · 120201122–120201133 · motif

· motif · 120201162–120201179 · motif

· motif · 120201192–120201208 · motif

· motif · 120201336–120201352 · motif

· motif · 120201395–120201411 · motif

· motif · 120201411–120201422 · motif

· motif · 120201473–120201493 · motif

· motif · 120201811–120201822 · motif

· motif · 120202082–120202094 · motif

· motif · 120202189–120202209 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:317 aa

1 aa317 aa功能區域
依 P05388 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein lateral stalk subunit P0 長 317 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uL10 家族。序列註解指出第 294 至 317 個胺基酸構成一段預測為無序的區域。

功能區域Disordered294–317 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4V6X…

PDB · 4V6X

EM · 5.00 A · Cq=1-317

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm

ribosomal protein P0 位於細胞核與細胞質,也可見於含有未翻譯 mRNA 的細胞質 mRNP 顆粒。 資料未提供其定位改變的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PRLP0RPLP0CCNDBP1STAU1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ribosomal protein P0 與 P1、P2 的二聚體互相作用,形成五聚體複合體。它也被辨識於依賴 IGF2BP1、含有未翻譯 mRNA 的 mRNP 顆粒複合體中;此外,資料記載它與 APEX1 及 FMR1 isoform 6 有交互作用,但未說明這些關係是否屬於同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein P0 在功能上相當於 E. coli 蛋白質 L10;此敘述指出兩者具有功能等同性,但未提供作用機制或相關生物學過程的細節。資料庫紀錄
證據與來源

Ribosomal protein P0 is the functional equivalent of E.coli protein L10

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用P0 與 P1、P2 的二聚體互相作用形成五聚體複合體;它也出現在依賴 IGF2BP1、含未翻譯 mRNA 的 mRNP 顆粒複合體中,並與 APEX1 及 FMR1 isoform 6 交互作用。含實驗來源
證據與來源

P0 forms a pentameric complex by interaction with dimers of P1 and P2. Identified in a IGF2BP1-dependent mRNP granule complex containing untranslated mRNAs. Interacts with APEX1. Interacts with FMR1 isoform 6

PMID 17289661 ↗ · PMID 19188445 ↗ · PMID 24658146 ↗ · PMID 3323886 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位P0 位於細胞核與細胞質,並定位於含未翻譯 mRNA 的細胞質 mRNP 顆粒;資料未描述造成此定位的條件或定位變化。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm; Localized in cytoplasmic mRNP granules containing untranslated mRNAs

PMID 19188445 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000392514 · 1,105 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTCTCTCGCCAGGCGTCCTCGTGGAAGTGACATCGTCT40
41TTAAACCCTGCGTGGCAATCCCTGACGCACCGCCGTGATG80
81CCCAGGGAAGACAGGGCGACCTGGAAGTCCAACTACTTCC120
121TTAAGATCATCCAACTATTGGATGATTATCCGAAATGTTT160
161CATTGTGGGAGCAGACAATGTGGGCTCCAAGCAGATGCAG200
201CAGATCCGCATGTCCCTTCGCGGGAAGGCTGTGGTGCTGA240
241TGGGCAAGAACACCATGATGCGCAAGGCCATCCGAGGGCA280
281CCTGGAAAACAACCCAGCTCTGGAGAAACTGCTGCCTCAT320
321ATCCGGGGGAATGTGGGCTTTGTGTTCACCAAGGAGGACC360
361TCACTGAGATCAGGGACATGTTGCTGGCCAATAAGGTGCC400
401AGCTGCTGCCCGTGCTGGTGCCATTGCCCCATGTGAAGTC440
441ACTGTGCCAGCCCAGAACACTGGTCTCGGGCCCGAGAAGA480
481CCTCCTTTTTCCAGGCTTTAGGTATCACCACTAAAATCTC520
521CAGGGGCACCATTGAAATCCTGAGTGATGTGCAGCTGATC560
561AAGACTGGAGACAAAGTGGGAGCCAGCGAAGCCACGCTGC600
601TGAACATGCTCAACATCTCCCCCTTCTCCTTTGGGCTGGT640
641CATCCAGCAGGTGTTCGACAATGGCAGCATCTACAACCCT680
681GAAGTGCTTGATATCACAGAGGAAACTCTGCATTCTCGCT720
721TCCTGGAGGGTGTCCGCAATGTTGCCAGTGTCTGTCTGCA760
761GATTGGCTACCCAACTGTTGCATCAGTACCCCATTCTATC800
801ATCAACGGGTACAAACGAGTCCTGGCCTTGTCTGTGGAGA840
841CGGATTACACCTTCCCACTTGCTGAAAAGGTCAAGGCCTT880
881CTTGGCTGATCCATCTGCCTTTGTGGCTGCTGCCCCTGTG920
921GCTGCTGCCACCACAGCTGCTCCTGCTGCTGCTGCAGCCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。