基因總覽
RPL9 是一個蛋白質編碼基因，其產物為 ribosomal protein L9，屬於普遍存在的 uL6 核糖體蛋白家族。這個蛋白質是大型核糖體次單元的組成成員；核糖體本身是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體。現有資料將 RPL9 的基本角色定位於核糖體組成，並指出核糖體負責在細胞中合成蛋白質；來源未提供此蛋白質的結構域或序列特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000295955 ★ | 39,454,124–39,458,922 | 8 |
| ENST00000645496 | 39,450,679–39,458,954 | 8 |
| ENST00000503277 | 39,450,679–39,458,954 | 7 |
| ENST00000449470 | 39,450,679–39,458,888 | 7 |
| ENST00000508595 | 39,450,679–39,458,920 | 7 |
| ENST00000894376 | 39,450,679–39,458,954 | 8 |
| ENST00000894377 | 39,450,679–39,458,954 | 8 |
| ENST00000894378 | 39,450,679–39,458,954 | 8 |
| ENST00000894379 | 39,450,679–39,458,893 | 8 |
| ENST00000894380 | 39,450,679–39,458,882 | 6 |
| ENST00000928672 | 39,450,679–39,458,954 | 8 |
| ENST00000928673 | 39,450,679–39,458,954 | 7 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL9 的產物 ribosomal protein L9 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體由 RNA 與蛋白質共同構成，負責在細胞中合成蛋白質；因此，來源所支持的功能重點，是 RPL9 作為核糖體組成蛋白，位於執行蛋白質合成的細胞機器之中。
目前提供的資料未進一步說明 ribosomal protein L9 如何參與核糖體的組裝、如何與核糖體 RNA 或其他蛋白質作用，也未描述其對翻譯步驟、合成效率或特定蛋白質產物的影響。因此，不能據此推定更細部的分子機制或特定生理效應。現有資訊支持的結論限於：RPL9 編碼的蛋白質屬於大型核糖體次單元，而該核糖核蛋白複合體負責細胞內的蛋白質合成。
Promoter 與基因調控
>RPL9 ENST00000295955 GRCh38 chr4:39458822-39459922 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTTGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCGCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTGGC GAGTAGCTGGGACTACAGGCGCACGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGGCGGGGTT TCACCATGTTGGCCAGGATGAACGTTTTTACTTTCTAGGTTACATTGTTTCTGTGTTTGAACGTGGCAGT CAAGAACATAAGAAATCATGGTATTCGGCTTTTACATCTGAACACAAACGTGTATGAGATAGCCAAAACA CTACAAAATCCACGAGTCTGCACATGTATCTCAAAAGAACCTTCGACAACTCAAAGAGTGCCTGTTAGGG TGTTGCACGATTGCTACTGCACTTCTCAATGTCTGCCGCTGAAGCCTAGCGGACAGGTTTGTGTTCTCTG CGGCTAGAGTGGTGTCTCACACACAGTAAGAGTCCAAGACAGAATAGCTATGTGGGGTGCTCACTGCAGT GCTCCATAAATATAGGGTACAAACCACTCTAAGCAGAAAATAAGTCCTCGGTGCTGGCCCAGAGAGACTT GCAAACAAACTGATGCCAGAGACTCTATATCATGGGGCTGGCGGGATAATTACATGAGATTACACGAAAA ACGTTTAAAACTGCCGTTGGCTAGTAGTAAATGTTCAGTAAATGCACTGGCCTTTATTATTGGGCATGGG CGCTCTGAAGGGATAGGATCCCCCCACCCCACGCCCAAACCCGTTCGCCCCGCCGCTCACCCGGGGCCCC AGGGTGCGGGCTGCATCCCCGCAGCGTAGAGACATTTCCTCTTTAGGACTAGCGCAGTGCAGGGGTTGAG GGATCGCTAACTCCCGGGAAAGGACAGGTCGAAATTACGTCGCTCCATTTATGACAAGCAGCCAAGCTGC TCCACGATTGGCTGCTTTAGCCTTACGTGCGTCGCGCACTCATGACGCAATACGCAGGCCCCTTACGCGA TACAAGTACGTAATGACGACAGACGTTCTTTCTTTGCTGCGTCTACTGCGAGGTAAGGATGTTTCTGTGC TCGTGGGGGTACTGGGAATCTGAAACCATCTGCTCTGGGAAAGGCTGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL9_1 ↗ | 4:39,458,915 | 負股 | 39,458,905–39,458,964 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_836BQ3 · promoter · 39458878–39459119 · regulatory
ENSR4_C5WPF · enhancer · 39459120–39460306 · regulatory
· motif · 39453931–39453945 · motif
· motif · 39453938–39453949 · motif
· motif · 39458483–39458494 · motif
· motif · 39458532–39458543 · motif
· motif · 39458532–39458543 · motif
· motif · 39458534–39458543 · motif
· motif · 39458962–39458971 · motif
· motif · 39459466–39459488 · motif
· motif · 39459466–39459488 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：192 aa
ribosomal protein L9 屬於普遍存在的 uL6 核糖體蛋白家族。現有資料未提供其胺基酸序列、長度、結構域或其他序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 RPL9 產物的定位標示為細胞質；未提供定位變化條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
- BACH2Q9BYV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BICDL2A1A5D9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CALCOCO2Q13137 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBY2Q8NA61 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC184Q52MB2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
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- CTTNQ14247-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DHPSP49366 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- DRAP1Q14919 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HMBOX1Q6NT76 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- HOMEZQ8IX15-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KXD1Q9BQD3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PNMA2Q9UL42 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PPP1R27Q86WC6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PSTPIP1O43586 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RALYQ53GL6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNRPFP62306 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SREK1IP1Q8N9Q2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRSF3P84103 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STAC3Q96MF2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TIFAQ96CG3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TNFAIP8L1Q8WVP5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPL9 產物被列為大型核糖體次單元的組成成員。資料未指出其與特定分子直接結合，亦未提供超出次單元組成關係的互作或功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L9 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L9 是大型核糖體次單元的組成成員。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ribosomal protein L9 位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGACGTTCTTTCTTTGCTGCGTCTACTGCGAGAATGAAGA40CTATTCTCAGCAATCAGACTGTCGACATTCCAGAAAATGT80CGACATTACTCTGAAGGGACGCACAGTTATCGTGAAGGGC120CCCAGAGGAACCCTGCGGAGGGACTTCAATCACATCAATG160TAGAACTCAGCCTTCTTGGAAAGAAAAAAAAGAGGCTCCG200GGTTGACAAATGGTGGGGTAACAGAAAGGAACTGGCTACC240GTTCGGACTATTTGTAGTCATGTACAGAACATGATCAAGG280GTGTTACACTGGGCTTCCGTTACAAGATGAGGTCTGTGTA320TGCTCACTTCCCCATCAACGTTGTTATCCAGGAGAATGGG360TCTCTTGTTGAAATCCGAAATTTCTTGGGTGAAAAATATA400TCCGCAGGGTTCGGATGAGACCAGGTGTTGCTTGTTCAGT440ATCTCAAGCCCAGAAAGATGAATTAATCCTTGAAGGAAAT480GACATTGAGCTTGTTTCAAATTCAGCGGCTTTGATTCAGC520AAGCCACAACAGTTAAAAACAAGGATATCAGGAAATTTTT560GGATGGTATCTATGTCTCTGAAAAAGGAACTGTTCAGCAG600GCTGATGAATAAGATCTAAGAGTTACCTGGCTACAGAAAG640AAGATGCCAGATGACACTTAAGACCTACTTGTGATATTTA680AATGATGCAATAAAAGACCTATTGATTTGGACCTTCTTCT720TAAA724cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。