演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL37L37

ribosomal protein L37

RPL37 編碼核糖體蛋白 L37,是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體負責細胞內蛋白質合成。

Homo sapiens5p13.1UniProt P61927
OFFICIAL SYMBOL
RPL37
CHROMOSOME
5
UNIPROT
P61927
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL37 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L37。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL37 家族,並是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成。RPL37 蛋白質長 97 個胺基酸,序列中有一段 C4 型鋅指結構。

Official symbol
RPL37
Gene name
ribosomal protein L37
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10347
UniProt
P61927
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L37eL37

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55p13.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegRPL37pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:40,822,128–40,835,336
Gene span
13,209 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000274242 ★40,825,262–40,835,2224
ENST0000109600840,825,262–40,835,2694
ENST0000113217640,825,262–40,835,2694
ENST0000109600940,827,733–40,835,2694
ENST0000109601040,830,499–40,835,2694
ENST0000050987740,832,103–40,835,2693
ENST0000109601940,832,448–40,835,2694
ENST0000109601340,832,452–40,835,2694
ENST0000109601440,832,452–40,835,2694
ENST0000109601640,832,452–40,835,2694
ENST0000109601740,832,453–40,835,2694
ENST0000091632540,832,454–40,835,2694

顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL37 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體為大型核糖核蛋白複合體,由 RNA 與蛋白質構成,負責細胞內蛋白質的合成;因此,RPL37 所屬的核糖體蛋白參與構成執行這項工作的細胞複合體。

現有資料支持 RPL37 與核糖體及蛋白質合成之間的關聯,但未提供其在核糖體中的具體分子作用方式,也未說明它是否直接參與特定合成步驟。因此,這裡可將其功能描述為大型核糖體次單元的組成角色,不進一步推定其作用機制或其他生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 40835222 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL37 ENST00000274242 GRCh38 chr5:40835122-40836222 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCTCAGTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCCGTCATCCAAGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTC
ACTGCAACCTCCACCTTCCGGGTTCAAGCCTCCCTCCACCTCCACCCCCTGAGTAGCTGGGTTGGCAGGC
GCGCGCCACCACGCCTGGATAATTTTTTGTATTTTTTTTGTAGCGACAGTGTCTCCCTATGTTGCCCAGG
CTGGTCTCCAACGCCTGGGCTCAAGAGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT
AAGCCACGGCGCCAGGCCCTTGGAAACTATATTGAACAAGTTCCATGTGTGATTCCTTGGCACAATGAAA
TATGGGATCAGATAACTTGCCTCTGATTTACTACAGTAACAACAACAACAAAATCACTGTCTGCTTTTCC
CTTTATATTCTAAGCTCCAGCTCCATGCCTCCGTACTCCTAGCGACCTCTCGCAGGGAAAGTCAGCGTCG
GCCAAAAGCCTCCGGGATCGGAATGAGGAGGCTGCTGGAGAAGTTGCTTTCTCCTAAAAGGGATTATCCC
AGGCGCACACGGTCATTACACGCCGGGGACGCTCAGTCGGTGCGGGTACCCCTGGGCAGGGCCAGCCCCG
CATTCCAGGTTCTCCATGTGCCTAGAAGACAGTAATCGACGGTATAGCAACAGATCTGACTGCTAACGTG
CGAAACCGATCAGTAGTAGCAGTAGCACCAGCAACAGCAGCACGAAAAGCAAAACTGTAATCTAAACGGC
CCTCAGGGTCTAAGCAGGCCCGACGAAGACTCGCCCATCCGGTCGCCAGAAAACTGGGAGTCCCGCCCGC
CTTTCCGGCACTGAAACGCGATCGGCCCTGCCTGGTACCGCATCCTCCTCTTGACCCCACCTACACTACG
ACGACGGACGCTCGAGAACGCTGCACCGCGCCCCGCAGGAAGTGCTTCCCTGGGCGGAAGCTTCTGAGCG
TGATATAGCGGAAGTGCCTTCTCTTCCGGTCTTTCTGGTCTCGGCCGCAGAAGCGAGATGGTGAGTTGTG
ACTGTGGTGTTTGTGAATCGCGTTCCATCCTCGTCCTTTGTGCCTCTCTGT
RPL37 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL37_1 ↗5:40,835,212負股40,835,202–40,835,261

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_837F6L · enhancer · 40831885–40832099 · regulatory

ENSR5_9L7LS · promoter · 40835202–40835712 · regulatory

· motif · 40831242–40831251 · motif

· motif · 40831902–40831915 · motif

· motif · 40831906–40831919 · motif

· motif · 40831906–40831919 · motif

· motif · 40831923–40831935 · motif

· motif · 40832092–40832100 · motif

· motif · 40832204–40832226 · motif

· motif · 40832325–40832335 · motif

· motif · 40832484–40832492 · motif

· motif · 40834297–40834312 · motif

· motif · 40834306–40834328 · motif

· motif · 40834306–40834328 · motif

· motif · 40834755–40834770 · motif

· motif · 40834983–40835000 · motif

· motif · 40835077–40835090 · motif

· motif · 40835202–40835219 · motif

· motif · 40835213–40835222 · motif

· motif · 40835227–40835236 · motif

· motif · 40835227–40835238 · motif

· motif · 40835227–40835238 · motif

· motif · 40835227–40835240 · motif

· motif · 40835269–40835278 · motif

· motif · 40835323–40835335 · motif

· motif · 40835325–40835332 · motif

· motif · 40835325–40835340 · motif

· motif · 40835410–40835419 · motif

· motif · 40835466–40835486 · motif

· motif · 40835516–40835528 · motif

· motif · 40835674–40835685 · motif

· motif · 40836129–40836140 · motif

· motif · 40836129–40836140 · motif

· motif · 40836161–40836170 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:97 aa

1 aa97 aa鋅指
依 P61927 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RPL37 蛋白質長 97 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL37 家族。其序列第 19 至 37 位胺基酸區段被註記為 C4 型鋅指。

鋅指C4-type19–37 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · Lj=1-97

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

RPL37 的定位註記為細胞質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L37RPL37
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL37 被註記為大型核糖體次單元的組成成分。這項資料支持其屬於該核糖體複合體,但未提供特定的直接結合夥伴或其他分子互作資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPL37 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成;這項註記說明 RPL37 與執行蛋白質合成的核糖體複合體相關。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPL37 被註記為大型核糖體次單元的組成成分。此敘述指出它屬於該核糖體次單元,但未進一步描述特定結合夥伴或互作方式。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPL37 的細胞內定位註記為細胞質。這筆資料僅提供其定位資訊,未說明定位變化的條件、時間動態或不同異構型之間的差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000274242 · 7,573 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCTTCCGGTCTTTCTGGTCTCGGCCGCAGAAGCGAGATG40
41ACGAAGGGAACGTCATCGTTTGGAAAGCGTCGCAATAAGA80
81CGCACACGTTGTGCCGCCGCTGTGGCTCTAAGGCCTACCA120
121CCTTCAGAAGTCGACCTGTGGCAAATGTGGCTACCCTGCC160
161AAGCGCAAGAGAAAGTATAACTGGAGTGCCAAGGCTAAAA200
201GACGAAATACCACCGGAACTGGTCGAATGAGGCACCTAAA240
241AATTGTATACCGCAGATTCAGGCATGGATTCCGTGAAGGA280
281ACAACACCTAAACCCAAGAGGGCAGCTGTTGCAGCATCCA320
321GTTCATCTTAAGAATGTCAACGATTAGTCATGCAATAAAT360
361GTTCTGGTTTTAAAAAATACATATCTGGTTTTGGTAAGGT400
401ATTTTTAATCAATTAGGCTTGTAGTATCAGTGAAATACTG440
441TAGGTTTAGGGACTGGGCTAGCTTCATATCAGATTTACTT480
481GTTAAGTGACTGTTTTGGAATGTTTACTTTTGGACTGGGT520
521TTGTAACACGGTTAAAGGCAATGAGAAACAAGCAGAATTC560
561CAGGAGTCCTTGAAGCAGAGGGCACTGGAAGACAATATAG600
601CAGATTAAAATAGCACAGCTCATGTGGCATAGGTGGGTAT640
641TTTAGATGTTTGAGTAAATTTGAAAGAGTATGATGTTTAA680
681ATTACCTTTAGCAACATGTTCATCTGCTATGCTGTCATGA720
721CTAGGGGGATGATTATTAGTCACATAGAGCTTGGGAGTAC760
761CACTGGAAACGTATGGGTAGGAGTTTAGGTGGCTTCTGTT800
801TTTCAAAAGATGATCTTATCCTAGTATCTGTAATGCTCAC840
841TTGGCACACCTGACTTGTGGGCTGTGTGTAAGGTGGCTAG880
881CTAAGTGAAAAAAGCCTGCTAGGTGTGAGTCAACTTAAGA920
921ATATGTAAATAGGTTTGAGAAAAAGTAGGGCTTGGGTGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。