基因總覽
RPL32 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 ribosomal protein L32。它所編碼的蛋白質屬於真核生物核糖體蛋白 eL32 家族,並被註記為大型核糖體次單位的組成成員。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體;來源將其描述為細胞內合成蛋白質的複合體。現有資料未提供 RPL32 蛋白質的序列長度、結構域或其他結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000429711 ★ | 12,834,485–12,841,565 | 4 |
| ENST00001068389 | 12,834,467–12,841,587 | 5 |
| ENST00001143171 | 12,834,485–12,841,587 | 4 |
| ENST00000396957 | 12,834,946–12,841,587 | 4 |
| ENST00000935875 | 12,835,013–12,841,587 | 4 |
| ENST00001100517 | 12,836,020–12,841,587 | 4 |
| ENST00001068369 | 12,836,025–12,841,587 | 4 |
| ENST00000935876 | 12,836,026–12,841,587 | 5 |
| ENST00000935878 | 12,836,026–12,841,587 | 5 |
| ENST00000935879 | 12,836,026–12,841,539 | 5 |
| ENST00000935886 | 12,836,026–12,841,517 | 4 |
| ENST00000935888 | 12,836,026–12,841,503 | 4 |
顯示 12/46 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL32 的產物是大型核糖體次單位的組成成員。核糖體是一種大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;因此,來源支持的功能範圍是 RPL32 蛋白質作為核糖體組成部分,參與這個蛋白質合成複合體的工作。
目前提供的資料未進一步說明 RPL32 在蛋白質合成中的具體分子作用方式,也未描述其對特定生物學過程或細胞狀態的影響。因此,不能據此推定它在核糖體中的位置、與 RNA 或其他蛋白質的直接作用,或其功能改變所造成的後果。
Promoter 與基因調控
>RPL32 ENST00000429711 GRCh38 chr3:12841465-12842565 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTAATTATTTTATTTTTTGTAGAGACAGGGTCTTACTATGTTGCCTAGGCCGGTCTTGAACTCCTGGGCT CAAGCAAATCTCCCACCTCAGACTCCCAAAGTATTGGAATTATAGGTGTGAACCATAGTGCTCAGCCAAT TTGCACAATAATCTTAAATACAAAAGCTAAGCAAAACAAATCAAGAGCATCTTTAAAAACTAGGCAGTCT GGGAGGCAGGGGCTGCCGTGAGCCGTGAGATGGCACCTTTGCATTCCAGCCTAGGTGACAGAGGGAGGCC CTGTCTAAAAAAAACCAAAAACCAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACATCTAGGCAGTAGCTCGTGCCCG TAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCGAGAGAATCGTTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGC AACAGAGTGAGACCCCATTTCTAAAAAATGAACAAAGAAAAACTAGGCAGTTTCGCCCAGTGGTTAGAAG CGTGGAGTTTGGAGTCAAGTCTCCAAATTTCATCTTCCACATATGCAAAATGGAGACAATAATAGGGGTA CGTTATAGAATTGTGGTAGGCATAGTGAACTCCATCGCATGTTAGCTGTTTTCGTTACTATTTACTGTCT AAATTCGGTGATGAAATTATTAGGAAGTCTCTGTCTTGTTCTCTTCTGACCACTAAGAGGCGCACTTCGG AGTAGAAGAAACGCGGGCGGAAATAGCCCAAAAGCGGATTGGCTTCGACTTCTGGCGGAAGTAAATTCCT CCCTCCACCAGGTCTTATTAGCTCAGAAAGAATTCCAAATTTCTACGTAGTCCCAAGGATAGGTAGAATA CATTTCTCAGTCCTATTCCTAGTTATTATTGTCTATTAAAACATGTATACTCAGAATTTTTGCGGCATTA TTTTTTGACGTGTCTTTATTTTATTTAAAAGAGCCGGAGCCGGAAGTGCTTGCCTTTTTCCCTGCTAGGA CCCAGGGGTTACGACCCATCAGCCCTTGCGCGCCACCGTCCCTTCTCTCTTCCTCGGCGCTGCCTACGGA GGTGGCAGCCATCTCCTTCTCGGTAAGTGTTAATCCGTGGCAATCCGCATT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL32_1 ↗ | 3:12,841,541 | 負股 | 12,841,531–12,841,590 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_8D77F · enhancer · 12839650–12839896 · regulatory
ENSR3_C39DT · enhancer · 12840232–12841518 · regulatory
ENSR3_B4JRW · promoter · 12841519–12842072 · regulatory
ENSR3_552JXS · CTCF_binding_site · 12841804–12841825 · regulatory
ENSR3_552K37 · CTCF_binding_site · 12842317–12842338 · regulatory
· motif · 12838053–12838066 · motif
· motif · 12838053–12838066 · motif
· motif · 12839914–12839936 · motif
· motif · 12839914–12839936 · motif
· motif · 12839958–12839970 · motif
· motif · 12839960–12839982 · motif
· motif · 12839960–12839982 · motif
· motif · 12840443–12840455 · motif
· motif · 12840445–12840452 · motif
· motif · 12840445–12840458 · motif
· motif · 12840450–12840462 · motif
· motif · 12840508–12840515 · motif
· motif · 12840508–12840523 · motif
· motif · 12840712–12840725 · motif
· motif · 12840712–12840725 · motif
· motif · 12840727–12840742 · motif
· motif · 12840802–12840817 · motif
· motif · 12840802–12840817 · motif
· motif · 12840807–12840819 · motif
· motif · 12841128–12841137 · motif
· motif · 12841174–12841187 · motif
· motif · 12841174–12841187 · motif
· motif · 12841454–12841467 · motif
· motif · 12841568–12841581 · motif
· motif · 12841568–12841581 · motif
· motif · 12841608–12841617 · motif
· motif · 12841608–12841619 · motif
· motif · 12841608–12841619 · motif
· motif · 12841803–12841812 · motif
· motif · 12841803–12841814 · motif
· motif · 12841803–12841814 · motif
· motif · 12841806–12841822 · motif
· motif · 12842319–12842334 · motif
· motif · 12842319–12842335 · motif
· motif · 12842441–12842453 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPL32 蛋白質的定位註記為細胞質。 來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RPL32 被註記為大型核糖體次單位的組成成員。資料未指出它與哪些特定分子直接結合,也未提供其他交互作用或功能關係的描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL32 的產物是大型核糖體次單位的組成成員。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;資料未進一步描述 RPL32 在此過程中的具體分子作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | RPL32 被註記為大型核糖體次單位的組成成員。這項描述支持其屬於該次單位的資訊,但未指出它與其他特定分子的直接結合關係。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL32 蛋白質的細胞內定位註記為細胞質。此資料未說明定位是否會隨條件改變,也未提供不同異構型的定位差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGCCCTTGCGCGCCACCGTCCCTTCTCTCTTCCTCGGCGC40TGCCTACGGAGGTGGCAGCCATCTCCTTCTCGGCATCATG80GCCGCCCTCAGACCCCTTGTGAAGCCCAAGATCGTCAAAA120AGAGAACCAAGAAGTTCATCCGGCACCAGTCAGACCGATA160TGTCAAAATTAAGCGTAACTGGCGGAAACCCAGAGGCATT200GACAACAGGGTTCGTAGAAGATTCAAGGGCCAGATCTTGA240TGCCCAACATTGGTTATGGAAGCAACAAAAAAACAAAGCA280CATGCTGCCCAGTGGCTTCCGGAAGTTCCTGGTCCACAAC320GTCAAGGAGCTGGAAGTGCTGCTGATGTGCAACAAATCTT360ACTGTGCCGAGATCGCTCACAATGTTTCCTCCAAGAACCG400CAAAGCCATCGTGGAAAGAGCTGCCCAACTGGCCATCAGA440GTCACCAACCCCAATGCCAGGCTGCGCAGTGAAGAAAATG480AGTAGGCAGCTCATGTGCACGTTTTCTGTTTAAATAAATG520TAAAAACTGCCATCTGGCATCTTCCTTCCTTGATTTTAAG560TCTTCAGCTTCTTGGCCAACTTAGTTTGCCACAGAGATTG600TTCTTTTGCTTAAGCCCCTTTGGAATCTCCCATTTGGAGG640GGATTTGTAAAGGACACTCAGTCCTTGAACAGGGGAATGT680GGCCTCAAGTGCACAGACTAGCCTTAGTCATCTCCAGTTG720AGGCTGGGTATGAGGGGTACAGACTTGGCCCTCACACCAG760GTAGGTTCTGAGACACTTGAAGAAGCTTGTGGCTCCCAAG800CCACAAGTAGTCATTCTTAGCCTTGCTTTTGTAAAGTTAG840GTGACAAGTTATTCCATGTGATGCTTGTGAGAATTGAGAA880AATATGCATGGAAATATCCAGATGAATTTCTTACACAGAT920TCTTACGGGATGCCTAAATTGCATCCTGTAACTTCTGTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。