基因總覽
RPL3 是蛋白質編碼基因，產物名稱為 ribosomal protein L3，屬於 universal ribosomal protein uL3 family。此蛋白質是大型核糖體次單元的組成成分；核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000216146 ★ | 39,312,882–39,319,623 | 10 |
| ENST00000401609 | 39,312,870–39,318,614 | 9 |
| ENST00000871468 | 39,312,870–39,319,663 | 9 |
| ENST00000871469 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
| ENST00000871470 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
| ENST00000871471 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
| ENST00000871472 | 39,312,870–39,319,663 | 9 |
| ENST00000871473 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
| ENST00000871474 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
| ENST00000871475 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
| ENST00000871476 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
| ENST00000926227 | 39,312,870–39,319,663 | 10 |
顯示 12/37 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL3 的產物 ribosomal protein L3 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質；因此，來源支持其作為核糖體組成部分，與細胞蛋白質合成所在的複合體相關。現有資料未進一步描述 ribosomal protein L3 在核糖體中的具體分子作用方式，也未指出它對蛋白質合成某一階段的專一影響，因此不宜據此推定更細的機制或功能。
Promoter 與基因調控
>RPL3 ENST00000216146 GRCh38 chr22:39319523-39320623 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGAT CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACACCGTCTCCACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAA AAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATTCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAC TGCTTGAACTGGGAACCGGTAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCGACAGAGCGAGAC TCCGTCTCAAAAAAGAGATTTGTAAGGGACCAGCCTGGAAGCAGGGAATCGGTCAGGATCCGAGTCACCC TGGAGCCTAGGCAGAGATCAGCGAAAGCCCTCGCTGATGCATAGGTCTGGAAGGCGTGGGGCTCCGGGAG GCTGAGCAGCTGGACTCGGCATGACCAGAGGTCGTGAGGCCGTTCCGCAGGCTTGGGACGCTCCTGACCC TCAGAATCAAGCGCGGGCCACTGCATTAGCATGGGAGAAATGGCAGAGATAGGGCTTGAGGGAGGGATGC CCGAGATTAAAGGTATTAAAGGTAAATTGGTGTCGCCGCAAAACCAGCGTGGGAGCCAGGAAACGAGAGT TTCAGTCTTTCTTCGCTAATTCCAGAGATAGCTGCATATCACAGGAGGAGAAGCGACGCAGCCATTTTTC TTCGTTATTATCAAATTTGGCTGCTGCCGGACGCCGTAGATTTGTGGCTCACCCACCCTTAGCCCACCTC TCCGCGGCTTTTCACTAAGTTTGAACCCGACCCCTCGCCGTAGAGTGTGTAATTTCTGTCTCCGAAGCTG ACGTCAACTTCTGAACGAAAGCTAGGAGCGGAAGAGCGTGCGTGGAAATGGCGCTCGGTACGTGCCCCCG ACCTGTCGTCTGCCGCGGGGGCGCGCTCGCACGCCGGAAGGGGCGGGGCCAGATTTGGCTTTATATAGCG GACCCGTAAGGCCGACCGGCCTCTACCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGGTATGTGTTGTAATGGCGGCC GTTTCATTGTCACCGGCGTCGGCACGGCTGAATCCGCGACGCATCGCCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL3_3 ↗ | 22:39,318,448 | 負股 | 39,318,438–39,318,497 |
| RPL3_2 ↗ | 22:39,318,613 | 負股 | 39,318,603–39,318,662 |
| RPL3_1 ↗ | 22:39,320,335 | 負股 | 39,320,325–39,320,384 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_5C8N85 · CTCF_binding_site · 39314824–39314845 · regulatory
ENSR22_5C8NJ9 · CTCF_binding_site · 39316584–39316605 · regulatory
ENSR22_5C8NM3 · CTCF_binding_site · 39317186–39317207 · regulatory
ENSR22_9KLCZ · promoter · 39318604–39319104 · regulatory
ENSR22_5C8P39 · CTCF_binding_site · 39319611–39319632 · regulatory
ENSR22_9KLD9 · promoter · 39319613–39320113 · regulatory
ENSR22_5C8P6T · CTCF_binding_site · 39320382–39320403 · regulatory
· motif · 39314826–39314842 · motif
· motif · 39315374–39315387 · motif
· motif · 39316525–39316533 · motif
· motif · 39316586–39316602 · motif
· motif · 39317188–39317204 · motif
· motif · 39318201–39318212 · motif
· motif · 39318259–39318273 · motif
· motif · 39318259–39318273 · motif
· motif · 39318431–39318439 · motif
· motif · 39318593–39318604 · motif
· motif · 39318675–39318686 · motif
· motif · 39318900–39318913 · motif
· motif · 39319109–39319117 · motif
· motif · 39319109–39319126 · motif
· motif · 39319320–39319328 · motif
· motif · 39319574–39319584 · motif
· motif · 39319613–39319629 · motif
· motif · 39319665–39319675 · motif
· motif · 39319672–39319681 · motif
· motif · 39319689–39319702 · motif
· motif · 39319728–39319738 · motif
· motif · 39319740–39319751 · motif
· motif · 39320014–39320031 · motif
· motif · 39320131–39320143 · motif
· motif · 39320161–39320176 · motif
· motif · 39320384–39320400 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：403 aa
ribosomal protein L3 長 403 個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uL3 family。序列第 1 至 37 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein L3 的定位資料列出細胞核、核仁與細胞質；來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ribosomal protein L3 是大型核糖體次單元的組成成分，並有與 DHX33 及 GRWD1 互作的記錄。來源未進一步說明這些互作是否發生於核糖體複合體內，或其功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L3 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L3 是大型核糖體次單元的組成成分，並與 DHX33 及 GRWD1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. Interacts with DHX33. Interacts with GRWD1 PMID 23349634 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 26100019 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 33693809 ↗ · PMID 35674491 ↗ · PMID 40174224 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 細胞定位 | ribosomal protein L3 的定位資料列出細胞核、核仁與細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTACCGGCGGGATTTGATGGCGTGATGTCTCACAGAAA40GTTCTCCGCTCCCAGACATGGGTCCCTCGGCTTCCTGCCT80CGGAAGCGCAGCAGCAGGCATCGTGGGAAGGTGAAGAGCT120TCCCTAAGGATGACCCGTCCAAGCCGGTCCACCTCACAGC160CTTCCTGGGATACAAGGCTGGCATGACTCACATCGTGCGG200GAAGTCGACAGGCCGGGATCCAAGGTGAACAAGAAGGAGG240TGGTGGAGGCTGTGACCATTGTAGAGACACCACCCATGGT280GGTTGTGGGCATTGTGGGCTACGTGGAAACCCCTCGAGGC320CTCCGGACCTTCAAGACTGTCTTTGCTGAGCACATCAGTG360ATGAATGCAAGAGGCGTTTCTATAAGAATTGGCATAAATC400TAAGAAGAAGGCCTTTACCAAGTACTGCAAGAAATGGCAG440GATGAGGATGGCAAGAAGCAGCTGGAGAAGGACTTCAGCA480GCATGAAGAAGTACTGCCAAGTCATCCGTGTCATTGCCCA520CACCCAGATGCGCCTGCTTCCTCTGCGCCAGAAGAAGGCC560CACCTGATGGAGATCCAGGTGAACGGAGGCACTGTGGCCG600AGAAGCTGGACTGGGCCCGCGAGAGGCTTGAGCAGCAGGT640ACCTGTGAACCAAGTGTTTGGGCAGGATGAGATGATCGAC680GTCATCGGGGTGACCAAGGGCAAAGGCTACAAAGGGGTCA720CCAGTCGTTGGCACACCAAGAAGCTGCCCCGCAAGACCCA760CCGAGGCCTGCGCAAGGTGGCCTGTATTGGGGCATGGCAT800CCTGCTCGTGTAGCCTTCTCTGTGGCACGCGCTGGGCAGA840AAGGCTACCATCACCGCACTGAGATCAACAAGAAGATTTA880TAAGATTGGCCAGGGCTACCTTATCAAGGACGGCAAGCTG920ATCAAGAACAATGCCTCCACTGACTATGACCTATCTGACA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。