基因總覽
RPL28 是蛋白質編碼基因,其產物為 ribosomal protein L28,屬於真核生物核糖體蛋白 eL28 家族。此蛋白是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體本身是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質。現有資料未提供 RPL28 蛋白的序列長度或更具體的結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344063 ★ | 55,385,932–55,392,085 | 5 |
| ENST00000929176 | 55,383,856–55,388,373 | 5 |
| ENST00000929177 | 55,383,869–55,388,370 | 5 |
| ENST00000929178 | 55,383,916–55,388,373 | 5 |
| ENST00000967861 | 55,383,916–55,388,370 | 5 |
| ENST00000967862 | 55,384,318–55,388,375 | 5 |
| ENST00000929179 | 55,385,509–55,388,369 | 6 |
| ENST00000929180 | 55,385,575–55,388,373 | 6 |
| ENST00000431533 | 55,385,884–55,387,036 | 3 |
| ENST00000428193 | 55,385,884–55,387,610 | 4 |
| ENST00000558815 | 55,385,884–55,391,803 | 5 |
| ENST00000560583 | 55,385,884–55,388,888 | 4 |
顯示 12/49 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL28 的產物 ribosomal protein L28 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,其主要工作是在細胞內合成蛋白質。因此,來源支持 RPL28 蛋白屬於執行蛋白質合成的核糖體裝置;但資料沒有進一步說明它在核糖體中的具體位置、分子作用方式,或對蛋白質合成各步驟的個別影響。
Promoter 與基因調控
>RPL28 ENST00000344063 GRCh38 chr19:55384932-55386032 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGAGCCCTGGGGAGGTGACACAGGCACCCTCATTCCTTTTGTTCAGTAGGAGTCTCTGAGGCCTCCCCAG CACCATGCCGCGTGGGTGAGGCCGAGGACACAGAGAAATATCAGGCAAGGCTCCTGCCCCCTTAGGGTGG CCCTGACAACGGATCATAACCTCCCAGGGAGCTGATGGGGTGTGACAGGCACACCATAGGCTGGAGGCAC AGGTGGAGGGCAGGGAAGAGGACCGGCAAATCTATAGAATCCTAAAGGGAGCCAAGAGAAGCCACATGCA AATCTCCCTCCCTCCAAACAATTCTCCCTTAGAGGGCATCCGCGCTCCCCTGGGGTGGCAGTCAGCGAGA AGTTTCCGTGTAGGTTCTCCCCAGGCTTAAACAGTTTAAGAGTTTTATTTCAAGAAAACCCTGGGGAGGG CGAACTGCAAGAGGGCTGCCAGGATTAGCCGAGGGATTCCGAATGAAGACGGAGTATTTCCGAACATACA CACCTCTCCCAAGAGCGTTTCCGGAGGGTTCCGAAAATACCCGAGCGGGCCTCGGCGCCCTCATTGGCCA TCACCGCGAGGGCTTACGAAGACCGGAAATATCCAAAGGTGCCGGGGCTAGGCTTATATAGTTCACGCAT TCACCAGTTCATTCATAAAACAAATGTTTGTTGAGCGCCCATCATATGCCAATCACAGTGACAAGTGCTG GGTGAGCAATACTGGAGAGATAACGCTGAGGTATGGGTCCCAGGACCTCTCGAATTGGAGCCACTCGGAA ATCCAGCGGTAGAGTTTCGAAAACTTCCGAACGGTTCCCGGAATACGCTCTCGGCCCTCTAACCGAAGAG TTCCGAATATTCCCGAGCGTTGAGCGAATTTTCGGCGGAAGCAGCCGAACATCATCGAGCCGCCTCGGAG GTGGGGACCGACAACTCCTGTCGTGCCCGCCCGGAGAGGAAGCGGAAATGCGTGTACGGTATTAAAGGCG TCGCCTCGCCCCTCGCCTTCCTCTTTCCGTCTCAGGTCGCCGCTGCGAAGGGAGGTGAGCGTTCGTCTTC CTCGCGTGGTCGCCATCTCCGGCCCGCCGCGCACTCCCTCTCAGTCCTCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL28_1 ↗ | 19:55,385,932 | 正股 | 55,385,883–55,385,942 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9RZJL · promoter · 55384282–55384782 · regulatory
ENSR19_BDZR2 · promoter · 55385442–55386367 · regulatory
ENSR19_9RZKW · enhancer · 55388799–55389119 · regulatory
· motif · 55384072–55384081 · motif
· motif · 55384321–55384333 · motif
· motif · 55384323–55384330 · motif
· motif · 55384339–55384348 · motif
· motif · 55384918–55384926 · motif
· motif · 55385511–55385522 · motif
· motif · 55385513–55385522 · motif
· motif · 55385880–55385891 · motif
· motif · 55385880–55385891 · motif
· motif · 55385926–55385939 · motif
· motif · 55385989–55385999 · motif
· motif · 55386270–55386286 · motif
· motif · 55386351–55386361 · motif
· motif · 55386620–55386628 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:137 aa
ribosomal protein L28 屬於真核生物核糖體蛋白 eL28 家族。現有資料僅提供家族歸屬,未列出其結構域、功能區域或序列特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 RPL28 蛋白定位於細胞質;未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- DCCP43146 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAPTP10636 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RPL4P36578 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPL28 是大型核糖體次單元的組成成分,支持其參與核糖體複合體。現有資料未指出與哪些分子直接結合,也未提供其他互作或功能關係的細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L28 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體為大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質;此資料未進一步說明該蛋白在核糖體中的具體作用方式。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L28 是大型核糖體次單元的組成成分。此敘述支持它屬於核糖體複合體,但未提供直接結合對象或其他互作細節。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ribosomal protein L28 的定位記載為細胞質;此資料未描述定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTTTCCGTCTCAGGTCGCCGCTGCGAAGGGAGCCGCCG40CCATGTCTGCGCATCTGCAATGGATGGTCGTGCGGAACTG80CTCCAGTTTCCTGATCAAGAGGAATAAGCAGACCTACAGC120ACTGAGCCCAATAACTTGAAGGCCCGCAATTCCTTCCGCT160ACAACGGACTGATTCACCGCAAGACTGTGGGCGTGGAGCC200GGCAGCCGACGGCAAAGGTGTCGTGGTGGTCATTAAGCGG240AGATCCGGCCAGCGGAAGCCTGCCACCTCCTATGTGCGGA280CCACCATCAACAAGAATGCTCGCGCCACGCTCAGCAGCAT320CAGACACATGATCCGCAAGAACAAGTACCGCCCCGACCTG360CGCATGGCAGCCATCCGCAGGGCCAGCGCCATCCTGCGCA400GCCAGAAGCCTGTGATGGTGAAGAGGAAGCGGACCCGCCC440CACCAAGAGCTCCTGAGCCCCCTGCCCCCAGAGCAATAAA480GTCAGCTGGCTTTCTCACCTGCCTCGACTGGGCCTCCCTT520TTTGAAACGCTCTGGGGAGCTCTGGCCCTGTGTGTTGTCA560TTCAGGCCATGTCATCAAAACTCTGCATGTCACCTTGTCC600ATCTGGAGGTGATGTCAATGGCTGGCCATGCAGGAGGGGT640GGGGTAGCTGCCTTGTCCCTGGTGAGGGCAAGGGTCACTG680TCTTCACAGAAAAAGTTTGCTGACTTGTGATTGAGACCTA720CTGTCCCATTGTGAGGTGGCCTGAAGAATCCCAGCTGGGG760CAGTGGCTTCCATTCAGAAGAAGAAAGGCCTTTTCTAGCC800CAGAAGGGTGCAGGCTGAGGGCTGGGCCCTGGGCCCTGGT840GCTGTAGCACGGTTTGGGGACTTGGGGTGTTCCCAAGACC880TGGGGGACGACAGACATCACGGGAGGAAGATGAGATGACT920TTTGCATCCAGGGAGTGGGTGCAGCCACATTTGGAGGGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。