演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL27AL27A

ribosomal protein L27a

RPL27A 編碼 ribosomal protein L27a,屬於 universal ribosomal protein uL15 family,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiens11p15.4UniProt P46776
OFFICIAL SYMBOL
RPL27A
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P46776
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL27A 是蛋白質編碼基因,其產物為 ribosomal protein L27a。此蛋白質屬於 universal ribosomal protein uL15 family,並是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;因此,ribosomal protein L27a 是此蛋白質合成複合體的一部分。

Official symbol
RPL27A
Gene name
ribosomal protein L27a
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10329
UniProt
P46776
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L27AuL15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.4
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegRPL27Apq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:8,682,732–8,714,759
Gene span
32,028 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000314138 ★8,682,792–8,689,8725
ENST000005319788,682,732–8,685,4154
ENST000005323598,682,732–8,685,8485
ENST000009215448,682,732–8,686,8475
ENST000010914908,682,732–8,685,8493
ENST000010914918,682,732–8,685,8472
ENST000010914928,682,732–8,685,8555
ENST000010914938,682,732–8,685,8545
ENST000010914948,682,732–8,685,8535
ENST000010914958,682,732–8,685,8533
ENST000010914978,682,732–8,685,8494
ENST000010914998,682,732–8,685,8484

顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ribosomal protein L27a 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體本身是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質;來源所提供的功能資訊指出,RPL27A 的產物屬於這個複合體。

現有資料未進一步說明 ribosomal protein L27a 在核糖體中的具體分子作用,也未提供其參與蛋白質合成各步驟的細節。因此,依據這些資訊可確認的功能範圍,是其作為大型核糖體次單元成分,隸屬於負責細胞內蛋白質合成的核糖體。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 8682792 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL27A ENST00000314138 GRCh38 chr11:8681792-8682892 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TACATAAGGGTTATACTAGATTGTGTGGTGGTACAGGTGGGGAAGCGAGCAACTGTCTGCATTGTGTCCA
GGAAAGGGTCACAGGCGTGTTATGTAGATTCTGGAGAAAATTCAAAAATAGCATTTATTTTTACTTATTT
ACTTTTGTATGTGGAGACGAGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTGTTGAACTACTCGCCTCAAGAAA
TCCTCCCGCCTCGACCTCCCAAAGTGTTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTAAATGTGGC
ATTTAGAAAAAGTATTTACAACATCTGCATTAAAAGGACCATAAAGCAACCAGGCATCTAAGTCCCTGAA
GCAATTTAAGTTGCTCAAACTTGAGAGGACAACCAAATGATAGCAAAAGGGCAAAAGAGAAAGGAAGCTG
CAGTGCCCACTCAGAAGTGTGAGAGCGGGAGAAGGCATTTCGGGAGCCGCCCGAGCTTCAGGAAACCGAG
CGAGACACCAGGTGGGCACACTGAGGATTAAAGAGGGCCTCGCGGTTCCGCACTGCGGCCGGGAGACAAA
CCAGTAGCCACTATCACCAGCCCCGGGCAGACCACTAAGAACTGTGGAGGTGCGCGGGGCGGCTCAGGGC
TGGCGCATTTGGTGAGGAGCTCAGACAACGAGGCCCTTAGGGTCGGCTTAGGCGGTTCCCTGACCAAGGC
GCCAGAAAAGGGCCTGGCTCAAGCAAGCACGGGCGGCGTGCAGTACAGCACACCTAGCCCCGATTCTTCA
ACAGTTCTCGCCCTCCGAGCCTAGCACAACGAGCCTCACCGAAACCGTACACCGCCACCAGGACACTCCG
TGATGGGGGATCACCACCCTCAGAAAGAGGAAGCGACTAGCAGGCGCGCAATCCCGCGAGACCAGGAGGC
CCCGCCCGAAGCCCGGCCTCTGTGACCGGAAGTGAGGCGTTTTGCCCCGCCCCCGTGGCCGATACCTCGC
GAGACTTGGCGAAGGCCTTCCTTTTTCGTCTGGGCTGCCAACATGGTAGGTGTTTCGTTTCTTGCCTCCT
CTTCCTTGCCGGCGGAGACCCCTAAGCTGTATTCCCATTGCCCCTAGTCAT
RPL27A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL27A_1 ↗11:8,682,792正股8,682,743–8,682,802

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_B3PJ4 · enhancer · 8681613–8682621 · regulatory

ENSR11_B3PJ7 · promoter · 8682622–8683211 · regulatory

ENSR11_95G3P · promoter · 8683769–8684269 · regulatory

· motif · 8681306–8681317 · motif

· motif · 8682288–8682297 · motif

· motif · 8682396–8682405 · motif

· motif · 8682598–8682608 · motif

· motif · 8682603–8682618 · motif

· motif · 8682653–8682666 · motif

· motif · 8682724–8682735 · motif

· motif · 8682724–8682735 · motif

· motif · 8682726–8682735 · motif

· motif · 8682821–8682831 · motif

· motif · 8683219–8683230 · motif

· motif · 8683234–8683251 · motif

· motif · 8683378–8683391 · motif

· motif · 8683508–8683523 · motif

· motif · 8684807–8684822 · motif

· motif · 8684807–8684822 · motif

· motif · 8685209–8685220 · motif

· motif · 8685210–8685221 · motif

· motif · 8687687–8687702 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:148 aa

1 aa148 aa功能區域
依 P46776 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein L27a 全長 148 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uL15 family。其第 1 至 38 位胺基酸區段被註記為無序區域;資料未提供其他結構域或功能區域資訊。

功能區域Disordered1–38 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · La=1-148

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

ribosomal protein L27a 的定位資料為細胞質;來源未提供其他定位或定位變化條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L27ARPL27ACAND1GTF2F2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL27A 產物是大型核糖體次單元的組成成分。現有資料只支持其屬於該次單元,未指出特定的直接結合對象或其他蛋白質互作關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L27a 是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體則是負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。資料未進一步描述該蛋白質在此過程中的具體作用。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L27a 是大型核糖體次單元的組成成分。這項資訊說明其與該次單元的組成關係,未提供特定結合夥伴或其他互作細節。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein L27a 的細胞內定位記載為細胞質。此筆資料未說明定位變化的條件、時間動態或其他細胞區域。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000314138 · 4,535 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTTTTCGTCTGGGCTGCCAACATGCCATCCAGACTGAGG40
41AAGACCCGGAAACTTAGGGGCCACGTGAGCCACGGCCACG80
81GCCGCATAGGCAAGCACCGGAAGCACCCCGGCGGCCGCGG120
121TAATGCTGGTGGTCTGCATCACCACCGGATCAACTTCGAC160
161AAATACCACCCAGGCTACTTTGGGAAAGTTGGTATGAAGC200
201ATTACCACTTAAAGAGGAACCAGAGCTTCTGCCCAACTGT240
241CAACCTTGACAAATTGTGGACTTTGGTCAGTGAACAGACA280
281CGGGTGAATGCTGCTAAAAACAAGACTGGGGCTGCTCCCA320
321TCATTGATGTGGTGCGATCGGGCTACTACAAAGTTCTGGG360
361AAAGGGAAAGCTCCCAAAGCAGCCTGTCATCGTGAAGGCC400
401AAATTCTTCAGCAGAAGAGCTGAGGAGAAGATTAAGAGTG440
441TTGGGGGGGCCTGTGTCCTGGTGGCTTGAAGCCACATGGA480
481GGGAGTTTCATTAAATGCTAACTACTTTTTCCTTGTGGTG520
521TGAGTGTAGGTTCTTCAGTGGCACCTCTACATCCTGTGTG560
561CATTGGGAGCCCAGGTTCTAGTACTTAGGGTATGAAGACA600
601TGGGGTCCTCTCCTGACTTCCCTCAAATATATGGTAAACG640
641TAAGACCAACACAGACGTTGGCCAGTTAAACATTTCTGTT680
681TATAAAGTCAGAATAATACCTGTTGATCACTGAAAGGCCT720
721GCATGTATTGTACTCTGAATTTTACAGTGAATGAGAGAAT760
761GTACCCTAATTGTTCAACAGGGCTCAAAAGGAAAGATTCC800
801ATTTTGATGGGTCACATTCTAAAGAGGGGCAGTGTGATAG840
841GAATGAGATGGTCCTTTAGGACTTAAGTTCTCAGCCCAAG880
881GTTTTTCCACGTGGCCCCCTCATCTTTTTTTTTTTTTTAA920
921ACGGAGTCTCTCTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。