基因總覽
RPL23 是蛋白質編碼基因，其正式名稱為 ribosomal protein L23。此基因產物屬於普遍存在的 uL14 核糖體蛋白家族，並是大型核糖體次單元的組成部分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體；RPL23 所編碼的蛋白質因此是該細胞機器的組成成員。現有資料未提供其胺基酸序列、結構域或其他更細部的結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000479035 ★ | 38,847,860–38,853,721 | 5 |
| ENST00000716859 | 38,847,860–38,853,829 | 5 |
| ENST00000716860 | 38,847,860–38,853,829 | 5 |
| ENST00000716862 | 38,847,860–38,853,829 | 5 |
| ENST00001058427 | 38,847,860–38,853,829 | 5 |
| ENST00001058430 | 38,847,860–38,853,829 | 5 |
| ENST00001095849 | 38,847,860–38,853,829 | 4 |
| ENST00001143463 | 38,847,860–38,853,829 | 5 |
| ENST00001050555 | 38,847,861–38,853,829 | 5 |
| ENST00000394332 | 38,847,865–38,853,829 | 6 |
| ENST00000394333 | 38,847,865–38,853,829 | 4 |
| ENST00001058432 | 38,847,865–38,853,829 | 5 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL23 的產物是大型核糖體次單元的組成部分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成，負責在細胞內合成蛋白質；因此，RPL23 所編碼的蛋白質屬於參與此蛋白質合成機器的組成成員。來源將其描述為核糖體次單元的組成部分，未進一步說明它在蛋白質合成過程中的具體分子作用，也未提供可據以描述其調控方式、作用步驟或特定生物學情境的資訊。
Promoter 與基因調控
>RPL23 ENST00000479035 GRCh38 chr17:38853621-38854721 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATAAGGAAAAGAATGTTGATCTATTTTGTTCTCTGATGTAATCCGCTGTACGCCCTGGACAGAACCTGC TGTAAAGTAGGAGCTCAATAAGTATGTGAATTAATGTATCGTGGGAAGGAAAGAACCCAGAGAATAAGGG GCGGCTGAAGCTGTGAAAGGAGCAATTAGGCCTGGCGCGGGGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGA GGGACCAAGGCGGGCAGATCACTTGAGATCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATAACATGGCGAAACC CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCCAGCGTTGTGGCGGGCGCCTGTGGTCTCAGGTACTCTGAG GCTGAGACAGAGAATTGCTTGAACCCGGAAGACGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCTCGCCACTATACTC CAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCGGTCTCAAAAAAAGAAAAAAAGAGTGTGTGTTGGGGGGGACGGGT CAATAAATAGAGCAATACTGTATATGTAAAATACAGAATGGTATGATACCAAGAACACATAGATGGAATG ATCTGCAGCACTTCTCAACTGTATTACATTCAACGAAACCGTTTAGAGCTTGTTCTCCCTCCCTCCCCCA CTTTCTTTGTTCCTTGGGGAACCCCCACACGGCACAAACCGTGTTTTAATTCCTATTCTCTAGTGTGCAG ATAAGTGCCTGGCACTATTAAGTGGTCAAAAGAGGTCGTGAGCAAGTTAACAAATCACTGTTTCCATGTC CCTAACTACTCTTAAGCTCGTAGAGAAGATACTTCCTATCTCTTGCGCTTCTACCTCAACTCCCACTTCG CAGAGAGGGCTAAAAGCGACGTCGTAAACTTATTACGTAATAAGGCAGCGCCCAGAGGCGGAAGAGGCCG GTTTTTGCTCCGGCCACGTGAGGAGGGTGGGCGGGGCGTTAAAGTTCATATCCCAGTGTCCTTTGAATCG ACTTCCTTTTTTCTTTTTTCCGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGGTGAGGTTTTGTTTCTGGAGGATCCT CCACCATCTGTCGTGCAGTGGCTGGCGGATTCGTCAGGAGCGGTGGCCCTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL23_1 ↗ | 17:38,853,721 | 負股 | 38,853,711–38,853,770 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B9P6F · enhancer · 38848221–38848761 · regulatory
ENSR17_B9P77 · promoter · 38853418–38854232 · regulatory
ENSR17_5C5Q7K · CTCF_binding_site · 38853980–38854001 · regulatory
ENSR17_9KFDT · enhancer · 38855194–38855651 · regulatory
· motif · 38848898–38848909 · motif
· motif · 38852891–38852900 · motif
· motif · 38852891–38852900 · motif
· motif · 38853392–38853400 · motif
· motif · 38853392–38853409 · motif
· motif · 38853729–38853742 · motif
· motif · 38853742–38853756 · motif
· motif · 38853762–38853777 · motif
· motif · 38853764–38853777 · motif
· motif · 38853775–38853785 · motif
· motif · 38853816–38853827 · motif
· motif · 38853839–38853852 · motif
· motif · 38853839–38853852 · motif
· motif · 38853841–38853850 · motif
· motif · 38853841–38853850 · motif
· motif · 38853977–38853990 · motif
· motif · 38853982–38853998 · motif
· motif · 38853992–38854014 · motif
· motif · 38853992–38854014 · motif
· motif · 38854093–38854103 · motif
· motif · 38854339–38854350 · motif
· motif · 38854339–38854350 · motif
· motif · 38857614–38857626 · motif
· motif · 38857616–38857623 · motif
· motif · 38857616–38857631 · motif
· motif · 38857780–38857792 · motif
· motif · 38857832–38857845 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 RPL23 蛋白質的細胞內定位記為細胞質；未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- BCCIPQ9P287 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- MDM2Q00987 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPL5P46777 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RPL23 被描述為大型核糖體次單元的組成部分，支持其屬於該複合體。現有資料未指出與哪些分子直接結合，也未提供其他互作或功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL23 的產物是大型核糖體次單元的組成部分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質；資料未描述 RPL23 在此過程中的具體作用機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | RPL23 的產物被標註為大型核糖體次單元的組成部分。這項敘述指出它與該次單元的組成關係，沒有提供其是否直接結合其他分子或參與何種特定功能的細節。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL23 蛋白質的細胞內定位標註為細胞質。這筆資料只指出其定位，未說明定位所依據的條件、是否會改變，或不同異構型之間是否存在定位差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CGGCGTTCAAGATGTCGAAGCGAGGACGTGGTGGGTCCTC40TGGTGCGAAATTCCGGATTTCCTTGGGTCTTCCGGTAGGA80GCTGTAATCAATTGTGCTGACAACACAGGAGCCAAAAACC120TGTATATCATCTCCGTGAAGGGGATCAAGGGACGGCTGAA160CAGACTTCCCGCTGCTGGTGTGGGTGACATGGTGATGGCC200ACAGTCAAGAAAGGCAAACCAGAGCTCAGAAAAAAGGTAC240ATCCAGCAGTGGTCATTCGACAACGAAAGTCATACCGTAG280AAAAGATGGCGTGTTTCTTTATTTTGAAGATAATGCAGGA320GTCATAGTGAACAATAAAGGCGAGATGAAAGGTTCTGCCA360TTACAGGACCAGTAGCAAAGGAGTGTGCAGACTTGTGGCC400CCGGATTGCATCCAATGCTGGCAGCATTGCATGATTCTCC440AGTATATTTGTAAAAAATAAAAAAAAAAACTAAACCCATT480AAAAAGTATTTGTTTGCAGTGCTTGTCTCCCTGTTCACTT520CCAGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTAAGTA560GCTGGGATTACAGGCACCTGCCGTCATGCCTGGCTAGTTT600TTGTATTTTTGGTGGAGACAGGGTTTCACCATGTTTGCCA640AACGACTCAAACTCCTGATCTCAAGTGATCTGCCCACCCA680GGCCTCTACAGTGTTTTTGACATACCCTGACCATCACTTT720TCTGAAATGGAAACTCTGGGCATTTTTTTTTTAAAGCAAT760CCTTGCTTTTTTGTGAGTTTGCAGACTTTCAGCATCTTCC800AATTGCTGTATTTACAATTTTGGCCTCAAAAAGTATTATT840TGGGTTTTGAGTCCCAAAAATAATAGTAGATACTGCTCAA880TGACTGGCTATACATGGTAGCTTCTCCTGGAGTGAGGAAG920GCATTCAAATGGCTGGGCGCGGTAGCTGGCACCTGTAATC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。