基因總覽
RPL19 是蛋白質編碼基因,其產物為 ribosomal protein L19,屬於真核生物核糖體蛋白 eL19 家族。它是大型核糖體次單元的組成成員;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。現有資料未提供更多關於此蛋白質結構或其他分子特性的說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000225430 ★ | 39,200,283–39,204,732 | 6 |
| ENST00000579374 | 39,200,283–39,204,727 | 6 |
| ENST00000869076 | 39,200,283–39,204,726 | 6 |
| ENST00000869077 | 39,200,283–39,204,727 | 6 |
| ENST00000912393 | 39,200,283–39,204,731 | 6 |
| ENST00000912394 | 39,200,283–39,204,731 | 6 |
| ENST00000912395 | 39,200,283–39,204,727 | 4 |
| ENST00000912396 | 39,200,283–39,204,727 | 6 |
| ENST00000912397 | 39,200,283–39,204,727 | 5 |
| ENST00000912398 | 39,200,283–39,204,727 | 5 |
| ENST00000912399 | 39,200,283–39,204,727 | 6 |
| ENST00000912400 | 39,200,283–39,204,727 | 4 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL19 的產物 ribosomal protein L19 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體由 RNA 與蛋白質組成,是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體;因此,現有資料將 RPL19 的功能定位於核糖體的組成,而非描述其獨立執行的催化或調控作用。
資料指出核糖體負責細胞內蛋白質合成,但沒有進一步說明 ribosomal protein L19 如何參與這項過程,也未提供其與核糖體 RNA 或其他核糖體蛋白質的特定分子作用方式。來源亦未描述 RPL19 對蛋白質合成效率、核糖體組裝或其他生物學過程的獨立影響。因此,對其功能的說明應限於它是大型核糖體次單元的成員,以及該複合體負責細胞內蛋白質合成。
Promoter 與基因調控
>RPL19 ENST00000225430 GRCh38 chr17:39199283-39200383 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTTCTTCTTGGATTTTTACATTGGGTGTTCCAGATCAGAAGAAAAGGACTGCTTTTTTTTTTTTTTTGAG ACGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTC CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAAGCACGCGCCGCTACGCCC GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGAC CTCAAGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCGAGCCCAACCC AATTTTTTTTTTTTTTAATTTTACTTTCTGCAATCATTCATCCATTCAGCCAGTGCGGTATTTCTGAGGT GTGTTCGATCGCGGATCCATGCCTGCCGCAGTACAGTTGTGAGCCAAATGAGACTGAGACTAGTTCCCGC CCTCCAAGAGCTTGCAAGACCCGCAGTGGCGTAAAAACACTAACATCTTTTAGTGATCGATTCTGCACTC CAGGGGTTTTCAATCTACTACAAGAGTGAATAAGAGTTCGCCTTTGTCTGATATCTGTTGTCATTCTCTC TCGCTTCTTTAACTGATTTTTTCTCAGCTAATAAAACATCCACCCACAACCCCCCGAACGCCCGCAAACA CCAGGCCACTCTAGCAAAACCTCTCTCACTCCGCCTGCGCAATCCAGCTGACTTCCGGTTACAGATAACC ACGTGATTGGGAACCCTTGCTGCGCATGTCTAGTAGGAAGTCGGACTATACCACTTTCCCTACGGAAGGG GTACTTTTTTATGTTTTTAAGTTTAAAACCGATTTCTGATATTTGACTTTTATCATTTCAGGCCTATATG GAGGCTATGAGTGAGTTTAGTGTGGCAGAAGATGAAAGAACCGGACAGGAATACGGACGAAATTGGAGCA GGGTTTGGGCTCTCCCCTTCGCAGATAATGGGAGGAGCCGGGCCCGAGCGAGCTCTTTCCTTTCGCTGCT GCGGCCGCAGCCATGAGGTGAGGGCGAGCTGGTCTCCATCAGGCGCTGACG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL19_2 ↗ | 17:39,200,061 | 正股 | 39,200,012–39,200,071 |
| RPL19_1 ↗ | 17:39,200,317 | 正股 | 39,200,268–39,200,327 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_5C7X2N · CTCF_binding_site · 39197013–39197034 · regulatory
ENSR17_B9R2Z · promoter · 39197659–39198192 · regulatory
ENSR17_83656Q · enhancer · 39199193–39199327 · regulatory
ENSR17_B9R3B · promoter · 39199793–39200517 · regulatory
ENSR17_B9R43 · enhancer · 39205005–39205626 · regulatory
· motif · 39195865–39195878 · motif
· motif · 39195865–39195878 · motif
· motif · 39196783–39196796 · motif
· motif · 39196808–39196821 · motif
· motif · 39196987–39197000 · motif
· motif · 39197015–39197031 · motif
· motif · 39197831–39197840 · motif
· motif · 39198381–39198396 · motif
· motif · 39198386–39198398 · motif
· motif · 39198390–39198403 · motif
· motif · 39198406–39198415 · motif
· motif · 39198412–39198425 · motif
· motif · 39198918–39198929 · motif
· motif · 39199971–39199986 · motif
· motif · 39200012–39200023 · motif
· motif · 39200012–39200023 · motif
· motif · 39200032–39200041 · motif
· motif · 39200032–39200043 · motif
· motif · 39200032–39200043 · motif
· motif · 39200032–39200045 · motif
· motif · 39200073–39200084 · motif
· motif · 39200073–39200084 · motif
· motif · 39200374–39200390 · motif
· motif · 39200467–39200482 · motif
· motif · 39200582–39200591 · motif
· motif · 39200582–39200591 · motif
· motif · 39200687–39200696 · motif
· motif · 39200687–39200696 · motif
· motif · 39205282–39205295 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:196 aa
ribosomal protein L19 長 196 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL19 家族。序列註解指出第 157 至 176 位胺基酸區段為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ribosomal protein L19 定位於細胞質;未提供其他定位或定位變化的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MRPL49Q13405 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TERF1P54274 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RPL19 的產物是大型核糖體次單元的組成成員。資料未指出它與特定分子的實體結合、其他複合體,或超出核糖體組成角色的功能性關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L19 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L19 是大型核糖體次單元的組成成員。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ribosomal protein L19 位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCAGATAATGGGAGGAGCCGGGCCCGAGCGAGCTCTTTCC40TTTCGCTGCTGCGGCCGCAGCCATGAGTATGCTCAGGCTT80CAGAAGAGGCTCGCCTCTAGTGTCCTCCGCTGTGGCAAGA120AGAAGGTCTGGTTAGACCCCAATGAGACCAATGAAATCGC160CAATGCCAACTCCCGTCAGCAGATCCGGAAGCTCATCAAA200GATGGGCTGATCATCCGCAAGCCTGTGACGGTCCATTCCC240GGGCTCGATGCCGGAAAAACACCTTGGCCCGCCGGAAGGG280CAGGCACATGGGCATAGGTAAGCGGAAGGGTACAGCCAAT320GCCCGAATGCCAGAGAAGGTCACATGGATGAGGAGAATGA360GGATTTTGCGCCGGCTGCTCAGAAGATACCGTGAATCTAA400GAAGATCGATCGCCACATGTATCACAGCCTGTACCTGAAG440GTGAAGGGGAATGTGTTCAAAAACAAGCGGATTCTCATGG480AACACATCCACAAGCTGAAGGCAGACAAGGCCCGCAAGAA520GCTCCTGGCTGACCAGGCTGAGGCCCGCAGGTCTAAGACC560AAGGAAGCACGCAAGCGCCGTGAAGAGCGCCTCCAGGCCA600AGAAGGAGGAGATCATCAAGACTTTATCCAAGGAGGAAGA640GACCAAGAAATAAAACCTCCCACTTTGTCTGTACATACTG680GCCTCTGTGATTACATAGATCAGCCATTAAAATAAAACAA720GCCTTAATCTGCCTTCC737cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。