演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL15RPL10

ribosomal protein L15

RPL15 編碼 ribosomal protein L15,屬於真核生物 eL15 家族,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiens3p24.2UniProt P61313
OFFICIAL SYMBOL
RPL15
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P61313
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL15 是蛋白質編碼基因,產物為 ribosomal protein L15,屬於真核生物核糖體蛋白 eL15 家族。它是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的複合體。來源資料未提供此蛋白質更詳細的結構或家族特徵,因此不進一步推定其分子作用方式。

Official symbol
RPL15
Gene name
ribosomal protein L15
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10306
UniProt
P61313
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RPL10RPLY10RPYL10EC45L15eL15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p24.2
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegRPL15pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr3:23,916,591–23,924,374
Gene span
7,784 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000307839 ★23,917,132–23,920,9894
ENST0000042221823,916,591–23,919,2864
ENST0000091352723,916,609–23,919,5494
ENST0000061105023,916,804–23,920,8564
ENST0000045653023,916,804–23,924,3745
ENST0000041571923,916,804–23,919,5475
ENST0000088902323,916,804–23,920,8394
ENST0000091352023,916,804–23,923,6915
ENST0000091352123,916,804–23,920,8474
ENST0000109225623,916,804–23,924,2725
ENST0000109225723,916,804–23,924,2723
ENST0000109225823,916,804–23,924,2724

顯示 12/61 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL15 的產物 ribosomal protein L15 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質;因此,來源所支持的功能定位是參與核糖體的構成,而非提供其在蛋白質合成各步驟中的具體作用方式。

這項資料將 ribosomal protein L15 的角色放在核糖體整體功能之中:核糖體承擔細胞內蛋白質合成,而 RPL15 產物屬於其大型次單元。來源未進一步說明它如何與核糖體 RNA 或其他蛋白質協同,也沒有描述其對翻譯效率、特定 RNA 或特定蛋白質產物的影響,因此不能據此延伸出更細的分子機制。

現有資料亦未指出 RPL15 在特定細胞類型、生理條件或發育階段中的作用差異。據此可確認的功能範圍,限於其作為大型核糖體次單元成分,並納入負責細胞內蛋白質合成的核糖體複合體;其他生物學過程或功能後果則未由這筆來源說明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23917132 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL15 ENST00000307839 GRCh38 chr3:23916132-23917232 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATATGATGTGGGAAAAAAGATAATCAAAACCGCTACGATTAAGAGATAATGATTCTCTTAAGCCTTTGCC
ACATCTGAACGCATAATCTGGAAGGAAATTAAAGCCACATGACTTAAATTAAAGCCAAGTGAAAATATTC
TGGAGAAACAAAGTAAGCCAGTAACCTATTTCTCAATTTAAAAAAAAACCCGCAACGCAAAATGCCAGCA
TTTTCTCGGCATTTCTTCTCTAAAACATTCACACCTGCCAAACAGGTCTTGGCAAATAAACATTCTGCTC
TTCTGAAAAACTGTGGTTCTCATGTTAGCAAATTTGGGACGAAATCCGTATGCAGAAAAAGCGCCGGGCC
GCCCGCAATCCACCCACTCCATGACCCTTTTTTAGGACAAAATCCCTGGGCGCTGGGGCCTGCTGGAGGA
GCTTCACGCAGTCTGGAGCTGAAGGGACACAGCGAGCGCCCCGACCCGCGACGCCCCGACTCCGCGAAGG
CCTCCCTGGGAGGCTGGGGAAGCGTCGGGGGATCTCTCAGCGCAGCTCTGGGGCCCAGATTTCTGCGCCC
GTCGTGCGGTGGCCAGAGAGGGACAGCGCAGCGCGGAGACGCGGAGACGCAGAGACTCCGCAGGGGGAGA
GCCCGCGGTGCGTGAAACAAACCTGTTCTCTCCTCAGACCTCAAAGACAGCGGCTCCACCGCGGTACGCG
GCCACCGGCTTTGGAGCCTGGACCCCAACTTGCCTCCTCTCGCGGAGAGACAGTCGCCGACGCTCGCTTA
GCCGCCGAGACCTCGCCGCCAACTCTCTCACCTCTCGAGACGCCCAGGCCGCTCAGGCTCGAATCTTGCG
GAGCAGGGGGCGGGACAATAGCGGCCGCGGCGCCCCACTCGGCAGAACTCCGCCACCAGGCGCGATGCCG
GAACTACATGTCCCATGACGCTCTGGGAGGCCGCAGCTTTCCACCGGAAAGAGGGTGGCTGAGGTGGGGG
AGGAGCCCAAAAGGCATTGTGGGAGTACAGCTCTTTCCTTTCCGTCTGGCGGCAGCCATCAGGTAGGCTG
CGTTGAGGATCTTTGCTCTTCCATCCGCCTTTGATCGTCTTCCTCTTCAGC
RPL15 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL15_1 ↗3:23,917,148正股23,917,099–23,917,158

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_C4D43 · enhancer · 23915516–23916704 · regulatory

ENSR3_73DZ8F · promoter · 23916705–23916814 · regulatory

ENSR3_8NZLT · promoter · 23916914–23917158 · regulatory

ENSR3_9CHBK · promoter · 23917215–23917715 · regulatory

ENSR3_57LW4H · CTCF_binding_site · 23917559–23917580 · regulatory

ENSR3_D3738 · enhancer · 23920993–23923127 · regulatory

· motif · 23914059–23914073 · motif

· motif · 23914059–23914073 · motif

· motif · 23914224–23914238 · motif

· motif · 23914224–23914238 · motif

· motif · 23914312–23914323 · motif

· motif · 23915580–23915590 · motif

· motif · 23915587–23915600 · motif

· motif · 23915587–23915600 · motif

· motif · 23915623–23915637 · motif

· motif · 23915623–23915638 · motif

· motif · 23915641–23915654 · motif

· motif · 23916797–23916814 · motif

· motif · 23916820–23916835 · motif

· motif · 23916900–23916917 · motif

· motif · 23916977–23916987 · motif

· motif · 23917036–23917047 · motif

· motif · 23917038–23917047 · motif

· motif · 23917084–23917093 · motif

· motif · 23917218–23917232 · motif

· motif · 23917227–23917243 · motif

· motif · 23917358–23917368 · motif

· motif · 23917561–23917577 · motif

· motif · 23917654–23917668 · motif

· motif · 23917657–23917668 · motif

· motif · 23917657–23917668 · motif

· motif · 23918203–23918216 · motif

· motif · 23919749–23919764 · motif

· motif · 23920419–23920430 · motif

· motif · 23920704–23920715 · motif

· motif · 23921152–23921160 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:204 aa

1 aa204 aa功能區域
依 P61313 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein L15 屬於真核生物核糖體蛋白 eL15 家族。序列註解指出,其第 165 至 186 位胺基酸區段為無序區域;此資訊描述的是序列特徵,來源未提供該區段的具體功能。

功能區域Disordered165–186 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LN=1-204

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

來源將 RPL15 產物定位於細胞質,未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RPL10RPL15ATXN1HTTMEOX2MEOX2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL15 是大型核糖體次單元的組成成分,屬於核糖體複合體的一部分。另有資料記載它與 IFIT1 互作,並指出互作涉及 IFIT1 的 TPR repeats 1–4;來源未說明此互作的功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RPL15 變異與 Diamond-Blackfan anemia 12(DBA12)相關。此病為自體顯性遺傳的先天性低增生性貧血,通常在嬰兒早期發病,可呈中度至重度大球性貧血與紅系芽球減少,並伴隨惡性腫瘤風險增加。約 30% 至 40% 患者有身材矮小或先天異常,常見異常包括顱顏特徵、Pierre-Robin syndrome、顎裂,以及拇指或泌尿生殖系統異常。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L15 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體為大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;此資料未進一步描述該蛋白質在合成過程中的具體作用。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L15 是大型核糖體次單元的組成成分,並有資料記載其與 IFIT1 互作;該互作涉及 IFIT1 的 TPR repeats 1–4。來源未說明這項互作的功能後果。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. Interacts with IFIT1 (via TPR repeats 1-4)

PMID 21612406 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位來源將此蛋白質定位於細胞質,未提供其他定位條件或變化資訊。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯RPL15 變異與自體顯性遺傳的 Diamond-Blackfan anemia 12(DBA12)相關。此先天性低增生性貧血通常在嬰兒早期發病,特徵包括中度至重度大球性貧血、紅系芽球減少及惡性腫瘤風險增加;約 30% 至 40% 患者有身材矮小或先天異常,常見於顱顏、拇指及泌尿生殖系統。含實驗來源
證據與來源

Diamond-Blackfan anemia 12 DBA12 An autosomal dominant form of Diamond-Blackfan anemia, a congenital non-regenerative hypoplastic anemia that usually presents early in infancy. Diamond-Blackfan anemia is characterized by a moderate to severe macrocytic anemia, erythroblastopenia, and an increased risk of malignancy. 30 to 40% of Diamond-Blackfan anemia patients present with short stature and congenital anomalies, the most frequent being craniofacial (Pierre-Robin syndrome and cleft palate), thumb and urogenital anomalies. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615550

PMID 23812780 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000307839 · 2,155 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGAGTACAGCTCTTTCCTTTCCGTCTGGCGGCAGCCATC40
41AGGTAAGCCAAGATGGGTGCATACAAGTACATCCAGGAGC80
81TATGGAGAAAGAAGCAGTCTGATGTCATGCGCTTTCTTCT120
121GAGGGTCCGCTGCTGGCAGTACCGCCAGCTCTCTGCTCTC160
161CACAGGGCTCCCCGCCCCACCCGGCCTGATAAAGCGCGCC200
201GACTGGGCTACAAGGCCAAGCAAGGTTACGTTATATATAG240
241GATTCGTGTTCGCCGTGGTGGCCGAAAACGCCCAGTTCCT280
281AAGGGTGCAACTTACGGCAAGCCTGTCCATCATGGTGTTA320
321ACCAGCTAAAGTTTGCTCGAAGCCTTCAGTCCGTTGCAGA360
361GGAGCGAGCTGGACGCCACTGTGGGGCTCTGAGAGTCCTG400
401AATTCTTACTGGGTTGGTGAAGATTCCACATACAAATTTT440
441TTGAGGTTATCCTCATTGATCCATTCCATAAAGCTATCAG480
481AAGAAATCCTGACACCCAGTGGATCACCAAACCAGTCCAC520
521AAGCACAGGGAGATGCGTGGGCTGACATCTGCAGGCCGAA560
561AGAGCCGTGGCCTTGGAAAGGGCCACAAGTTCCACCACAC600
601TATTGGTGGCTCTCGCCGGGCAGCTTGGAGAAGGCGCAAT640
641ACTCTCCAGCTCCACCGTTACCGCTAATATAAGTAAAGTT680
681TGTAAAATTCATACTTAATAAACAATTTAGGACAGTCATG720
721TCTGCTTACAGGTGTTATTTGTCTGTTAAAACTAGTCTGC760
761AGATGTTTCTTGAATGCTTTGTCAAATTAAGAAAGTTAAA800
801GTGCAATAATGTTTGAAGACAATAAGTGGTGGTGTATCTT840
841GTTTCTAATAAGATAAACTTTTTTGTCTTTGCTTTATCTT880
881ATTAGGGAGTTGTATGTCAGTGTATAAAACATACTGTGTG920
921GTATAACAGGCTTAATAAATTCTTTAAAAGGAGAGAACTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。