基因總覽
RPL14 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L14。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL14 家族,並是核糖體大型次單位的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質;因此,RPL14 的基本特徵是作為核糖體結構組成的一員,而非獨立的合成系統。來源未提供其在核糖體中的具體分子作用或調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396203 ★ | 40,457,339–40,468,587 | 6 |
| ENST00000338970 | 40,457,292–40,468,587 | 6 |
| ENST00001104424 | 40,457,333–40,468,587 | 4 |
| ENST00000416518 | 40,457,354–40,462,280 | 6 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL14 的產物是核糖體大型次單位的組成成分。核糖體為大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質;因此,RPL14 的功能資訊指向其作為核糖體一員,參與承載蛋白質合成作用的複合體。來源未進一步說明它在大型次單位中的具體位置、與 RNA 或其他蛋白質的分子接觸方式,也未指出它對蛋白質合成各步驟的個別影響,故不宜將整個核糖體的功能細節延伸為 RPL14 特有的機制。
Promoter 與基因調控
>RPL14 ENST00000396203 GRCh38 chr3:40456339-40457439 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCATGGTGGCTCACGCCGGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCGAGACGAGAGGATCGTCTTCACTCAGAA GTTAGAGGCTGCAGGGAACCATGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCGACTGAGGGAGACCCTGTCT CTATAAAAGAATGTAACGCCAGGCACGGCGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAAGCTGAGGGA GGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAT GCAAAAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCGGCTACTTGGGAGGCTGAGGCTGGAGA ATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCGGTGAGCCAAGCCCCCGCCACTGCACTCCAACCTGGGCAAC AGACCGAGACTCCGTCTTTAAAAAAAAAAAAATGTAGCGATAGAAGGACATCATGTCGGCAATTTCCTTT CAAATGATATAGCACATGCAAAACGTTAACATTTGTGGAATCTAGAAGGGTTTGTGGGAATTATTTGTAC TAGTTTAGCAATATTTCTGTAACTGTGAATTACTTGAAAATGAAAGGTTAACAAAGTTACTGAGATTAGG AGAGAACGTGAGGAGCGAACAGACCTAGCCATGAATAACCAACAAATAAAACTCGAGGAAATAAAAAGGA ACTCAAATGGCATGCGACCAACGGAAGACATAGCTTCTGTACTCTTAACCCTAAATTACTAAGCGATGAC CCTCCTGCAGCTTTCTAATCCAAATCACCAAAAACAATCTCGCCGCCCAACTTTGCCAAAAAGCAACTTA ACGCCAGCCGACTCCGCCATGTTTTCCCAGTGAGCTTGCGAGCGCGTGCGTACGCACGCACGCACGCACG CACCAACCAATCGGTGCTCACGTCGGTGACTCGTTACCGCAGGGGCGGTGCGTTCTTCTACACATGCGCA GGGTTGGGCGGGTCTTCTTCCTTCTCGCCTAACGCCGCCAACATGGTGAGTCTTACTGTTGCGGGCTCCG GGGCCGTCGACCATGCCGCTCGACCTCCACCTCCGCTGGGAAGCTGAGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL14_1 ↗ | 3:40,457,339 | 正股 | 40,457,290–40,457,349 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:215 aa
ribosomal protein L14 長 215 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL14 家族。序列註解將第 161–215 位標示為無序區域;其中第 171–190 位有四組五胺基酸串聯重複,第 193–198 位有兩組三胺基酸串聯重複。來源未提供這些區域的具體功能說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 RPL14 的蛋白質定位記載於細胞質,未提供定位改變條件、異構型差異或細胞內動態的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- H1-4P10412 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LRRK2Q5S007 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PHLDA1Q8WV24 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RPL4P36578 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
RPL14 被記載為核糖體大型次單位的組成成分,屬於複合體組成關係。現有資料未指出它與特定分子的實體結合,也未描述其他功能性互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL14 是核糖體大型次單位的組成成分;核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 交互作用 | RPL14 是核糖體大型次單位的組成成分;此資料描述其複合體組成關係,未提供特定結合對象或其他互作細節。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL14 的蛋白質定位記載於細胞質;該資料未說明其他定位或定位變化的條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTCTCGCCTAACGCCGCCAACATGGTGAGTCTTACTGTT40GCGGGCTCCGGGGCCGTCGACCATGCCGCTCGACCTCCAC80CTCCGCTGGGAAGCTGAGGCGCCAAACGGCTCCCAGAGGG120TCCCGGGAAGCGCATGGTGTTCAGGCGCTTCGTGGAGGTT160GGCCGGGTGGCCTATGTCTCCTTTGGACCTCATGCCGGAA200AATTGGTCGCGATTGTAGATGTTATTGATCAGAACAGGGC240TTTGGTCGATGGACCTTGCACTCAAGTGAGGAGACAGGCC280ATGCCTTTCAAGTGCATGCAGCTCACTGATTTCATCCTCA320AGTTTCCGCACAGTGCCCACCAGAAGTATGTCCGACAAGC360CTGGCAGAAGGCAGACATCAATACAAAATGGGCAGCCACA400CGATGGGCCAAGAAGATTGAAGCCAGAGAAAGGAAAGCCA440AGATGACAGATTTTGATCGTTTTAAAGTTATGAAGGCAAA480GAAAATGAGGAACAGAATAATCAAGAATGAAGTTAAGAAG520CTTCAAAAGGCAGCTCTCCTGAAAGCTTCTCCCAAAAAAG560CACCTGGTACTAAGGGTACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC600TGCTGCTGCTAAAGTTCCAGCAAAAAAGATCACCGCCGCG640AGTAAAAAGGCTCCAGCCCAGAAGGTTCCTGCCCAGAAAG680CCACAGGCCAGAAAGCAGCGCCTGCTCCAAAAGCTCAGAA720GGGTCAAAAAGCTCCAGCCCAGAAAGCACCTGCTCCAAAG760GCATCTGGCAAGAAAGCATAAGTGGCAATCATAAAAAGTA800ATAAAGGTTCTTTTTGACCTGTTGACAAATGTATTTAAGC840CTTTGGATTTAAAGCCTGTTGAGGCTGGAGTTAGGAGGCA880GATTGATAGTAGGATTATAATAAACATTAAATAATCAGTT920CCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。