演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL10NOV

ribosomal protein L10

RPL10 是位於 Xq28 的蛋白質編碼基因,產物屬於普遍存在的核糖體蛋白 uL16 家族,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiensXq28UniProt P27635
OFFICIAL SYMBOL
RPL10
CHROMOSOME
X
UNIPROT
P27635
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL10 是位於 Xq28 的蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L10。其產物屬於普遍存在的核糖體蛋白 uL16 家族,並構成大型核糖體次單元的一部分。現有資料支持其核糖體組成與活躍核糖體形成相關的角色;資料未提供蛋白質長度、結構域或更細部的結構描述。

Official symbol
RPL10
Gene name
ribosomal protein L10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10298
UniProt
P27635
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NOVQMDXS648EDXS648FLJ23544L10uL16

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq28
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegRPL10pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:154,389,955–154,409,168
Gene span
19,214 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000369817 ★154,398,377–154,402,3327
ENST00000948710154,398,264–154,402,3397
ENST00000890573154,398,270–154,402,3397
ENST00000890574154,398,270–154,400,9177
ENST00001030134154,398,270–154,400,9167
ENST00001061945154,398,270–154,400,9176
ENST00001097450154,398,270–154,402,3395
ENST00001097454154,398,270–154,402,3397
ENST00000436473154,398,367–154,400,8117
ENST00000344746154,398,372–154,402,3396
ENST00000890575154,398,372–154,402,3396
ENST00000890576154,398,372–154,400,9176

顯示 12/56 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL10 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體負責蛋白質合成;現有資料指出,RPL10 也參與形成正在進行翻譯的核糖體。這項描述支持其與核糖體進入活躍翻譯狀態有關,但資料未進一步說明其分子作用方式或參與的具體步驟。

資料另指出,RPL10 可能參與胚胎腦部發育。這項表述帶有不確定性,並未提供其作用機制或發育過程中的特定細胞與階段,因此不能據此推定更具體的生物學作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 154398377 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL10 ENST00000369817 GRCh38 chrX:154397377-154398477 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTGCGCTCGAGCAGGATTTCCTCCCGTCCTTCCTGTCAAAGGACGGGAAGACTTTGTTACCCCACCGCGC
CCCACCTGCAGAATGGTGGACAGATACCTCCAGATGCCACTTCCCCCAGGACGCCCGCCTGCTCTGCGCA
CCTCTCCCCGGATGCTGCCCCGTGGGCGGGTGGGGGCGGCCCTGCTTCCCCACGACCCCCAGACGCACCC
GGAGGGACTCTTGAGCACAGTGGAGTGGGAAGGGCGAGGTGGGGCGGTGCCCAGGCGAGAGCGGCTCATG
GGAGGCGGCGCCCGAGACGCAGCTGGTCGGGACGGTGCGGGTCAGGGTGGGCGGAGCGGGGCTAGAGATG
CCCCGGGGTTTCCCAGGCCATGAGTCTCCGTGGAGATTTCTCCTCGACCTCTTCCCCGCGGCAATGTGCG
AACCCTGGGTCTCCAGGAAACGGGGATACGGGGCATGGCTCCCAGCAAGGCCTGGTCCAGCCTCTCCGGT
AGGGGAATGGGTCTCCCCCTCCGGCCTCCCGGGTTGACAAAGGAACGCGGGCCCAGATCCCCGTATGGCG
CTTCACCGCCGGGGCCTCTAGCCTAGAAGGAGGCACGGAGCGCGTGTCCGAGACCCGTGCAAGCTCAGGG
ACACTCTCGCGGTCGCCGGGAGGCCCACCTAGGGTACTTTCCTTTTTTCCACTCTCAGAAATATACGTCT
GTCACAGTTAACGGCAAAGCCTAGGGCAAGAGTTCTACGCCCAAGATGGCCAGCCGGAAGCGGGCTTCTC
GCGACCATGTGGCGAAGCCCCATTCGTCAGCTGGCCGCCCGCGGCCCTGGTACCCGGTCACCTCTCTGAT
CTGCGCATGTGCTGGGCTACGCCCGGGCGCAAGCGCCAAGAGCGGCTGCGTCTATGGTCATGACGTCTGA
CAGAGCGTCCACCCGTCTTCGACAGGACTCTATGGTTCTTACGCGCGCAGACAGACCGCCTATATAAGCC
ATGCGCAGGCGGAGGAGCGCCTCTTTCCCTTCGGTGTGGTGAGTAAGCGCAGTTGTCGTCTCTTGCGGTG
CCGTTGCTGGTTCTCACACCTTTTAGGTCTGTTCTCGTCTTCCGTTCCGAC
RPL10 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL10_1 ↗X:154,398,377正股154,398,328–154,398,387
RPL10_2 ↗X:154,398,487正股154,398,438–154,398,497

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_53CBJ75 · CTCF_binding_site · 154397469–154397490 · regulatory

ENSRX_9499MD · promoter · 154397887–154398387 · regulatory

ENSRX_9499MJ · enhancer · 154398388–154398827 · regulatory

ENSRX_7C45LD · promoter · 154398828–154398900 · regulatory

ENSRX_53CBJFS · CTCF_binding_site · 154398917–154398938 · regulatory

ENSRX_53CBJGQ · CTCF_binding_site · 154399113–154399134 · regulatory

· motif · 154397372–154397381 · motif

· motif · 154397447–154397456 · motif

· motif · 154397471–154397487 · motif

· motif · 154397533–154397546 · motif

· motif · 154397543–154397556 · motif

· motif · 154397698–154397711 · motif

· motif · 154398085–154398100 · motif

· motif · 154398127–154398138 · motif

· motif · 154398127–154398138 · motif

· motif · 154398129–154398138 · motif

· motif · 154398218–154398229 · motif

· motif · 154398218–154398229 · motif

· motif · 154398242–154398253 · motif

· motif · 154398242–154398253 · motif

· motif · 154398358–154398369 · motif

· motif · 154398358–154398369 · motif

· motif · 154398436–154398448 · motif

· motif · 154398438–154398460 · motif

· motif · 154398438–154398460 · motif

· motif · 154398441–154398450 · motif

· motif · 154398842–154398851 · motif

· motif · 154398842–154398853 · motif

· motif · 154398919–154398935 · motif

· motif · 154398972–154398981 · motif

· motif · 154398972–154398981 · motif

· motif · 154398972–154398981 · motif

· motif · 154398972–154398981 · motif

· motif · 154399115–154399131 · motif

· motif · 154399541–154399556 · motif

· motif · 154400029–154400037 · motif

· motif · 154400653–154400666 · motif

· motif · 154401182–154401189 · motif

· motif · 154401331–154401342 · motif

· motif · 154401356–154401368 · motif

· motif · 154401582–154401593 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:214 aa

ribosomal protein L10 屬於普遍存在的核糖體蛋白 uL16 家族。現有資料未提供其胺基酸長度、具體結構域或其他序列註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LI=1-214

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

資料將 RPL10 蛋白定位於細胞質,未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NOVRPL10ATXN1SRC
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL10 是大型核糖體次單元的組成成分。成熟核糖體由 40S 小次單元與 60S 大次單元構成:40S 約含 33 種蛋白質及一個 18S RNA 分子;60S 約含 49 種蛋白質及 28S、5.8S、5S 三個 RNA 分子。資料未指出 RPL10 與特定分子間的直接結合關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RPL10 的基因變異與 X-linked autism 5 的疾病易感性相關,但此基因僅在罕見病例中涉及自閉症。曾在自閉症類群障礙家庭中發現兩種影響翻譯過程的低功能變異,提示異常翻譯可能參與疾病機制,並非證明其為普遍原因。另有資料指出,影響 RPL10 的變異可造成 X-linked syndromic intellectual developmental disorder 35。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPL10 是大型核糖體次單元的組成成分,並參與形成正在進行翻譯的核糖體。資料另指出它可能參與胚胎腦部發育;此發育作用以可能性描述,未提供更具體的機制。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. Plays a role in the formation of actively translating ribosomes. May play a role in the embryonic brain development

PMID 25316788 ↗ · PMID 26290468 ↗ · PMID 12962325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPL10 是大型核糖體次單元的組成成分。成熟核糖體由 40S 小次單元與 60S 大次單元構成:40S 約含 33 種蛋白質及一個 18S RNA 分子;60S 約含 49 種蛋白質及 28S、5.8S、5S 三個 RNA 分子。推論支持
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. Mature ribosomes consist of a small (40S) and a large (60S) subunit. The 40S subunit contains about 33 different proteins and 1 molecule of RNA (18S). The 60S subunit contains about 49 different proteins and 3 molecules of RNA (28S, 5.8S and 5S)

PMID 12962325 ↗

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細胞定位RPL10 蛋白定位於細胞質。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

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疾病關聯RPL10 變異與 X-linked autism 5 的疾病易感性相關,但該基因僅在罕見自閉症病例中涉及。自閉症類群障礙家庭曾發現兩種影響翻譯過程的低功能變異,提示異常翻譯可能參與疾病機制;此證據不表示其為普遍原因。該疾病涉及社交互動與溝通受損、受限且刻板的興趣與活動,以及三歲前出現的發育異常;多數患者另有中度智能障礙。含實驗來源
證據與來源

Autism, X-linked 5 AUTSX5 A complex multifactorial, pervasive developmental disorder characterized by impairments in reciprocal social interaction and communication, restricted and stereotyped patterns of interests and activities, and the presence of developmental abnormalities by 3 years of age. Most individuals with autism also manifest moderate intellectual disability. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. RPL10 is involved in autism only in rare cases. Two hypomorphic variants affecting the translation process have been found in families with autism spectrum disorders, suggesting that aberrant translation may play a role in disease mechanisms MIM: 300847

PMID 16940977 ↗ · PMID 21567917 ↗

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疾病關聯影響 RPL10 的基因變異可造成 X-linked syndromic intellectual developmental disorder 35。此症候群的特徵包括智能缺損、心理動作發展遲緩、語言能力不佳及外貌特徵異常。含實驗來源
證據與來源

Intellectual developmental disorder, X-linked, syndromic 35 MRXS35 A syndrome characterized by intellectual deficit, delayed psychomotor development, poor speech, and dysmorphic features. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 300998

PMID 25316788 ↗ · PMID 25846674 ↗ · PMID 26290468 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000369817 · 2,164 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCTTTCCCTTCGGTGTGCCACTGAAGATCCTGGTGTCGC40
41CATGGGCCGCCGCCCCGCCCGTTGTTACCGGTATTGTAAG80
81AACAAGCCGTACCCAAAGTCTCGCTTCTGCCGAGGTGTCC120
121CTGATGCCAAGATTCGCATTTTTGACCTGGGGCGGAAAAA160
161GGCAAAAGTGGATGAGTTTCCGCTTTGTGGCCACATGGTG200
201TCAGATGAATATGAGCAGCTGTCCTCTGAAGCCCTGGAGG240
241CTGCCCGAATTTGTGCCAATAAGTACATGGTAAAAAGTTG280
281TGGCAAAGATGGCTTCCATATCCGGGTGCGGCTCCACCCC320
321TTCCACGTCATCCGCATCAACAAGATGTTGTCCTGTGCTG360
361GGGCTGACAGGCTCCAAACAGGCATGCGAGGTGCCTTTGG400
401AAAGCCCCAGGGCACTGTGGCCAGGGTTCACATTGGCCAA440
441GTTATCATGTCCATCCGCACCAAGCTGCAGAACAAGGAGC480
481ATGTGATTGAGGCCCTGCGCAGGGCCAAGTTCAAGTTTCC520
521TGGCCGCCAGAAGATCCACATCTCAAAGAAGTGGGGCTTC560
561ACCAAGTTCAATGCTGATGAATTTGAAGACATGGTGGCTG600
601AAAAGCGGCTCATCCCAGATGGCTGTGGGGTCAAGTACAT640
641CCCCAGTCGTGGCCCTCTGGACAAGTGGCGGGCCCTGCAC680
681TCATGAGGGCTTCCAATGTGCTGCCCCCCTCTTAATACTC720
721ACCAATAAATTCTACTTCCTGTCCACCTATGTCTTTGTAT760
761CTACATTCTTGACGGGGAAGGAACTTCCTCTGGGAACCTT800
801TGGGTCATTGCCCTTTCACTTCAGAAACAGGTTGACAACT840
841CAGCCCTGCTCATGAGGCAGCAAACCCTGCAAAGGGCTGG880
881GACTGGTGGCCTTATGTCAGTTGTCTACTCTGGAGCTTGA920
921CTTGGACCTCCCCAGGTCCTAGGCAGTAGGTTGAAAAACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。