基因總覽
RPE 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribulose-5-phosphate-3-epimerase。其產物屬於 Ribulose-phosphate 3-epimerase 家族，主要與 D-ribulose 5-phosphate 和 D-xylulose 5-phosphate 之間的可逆轉換相關。這項基本反應角色使其與碳水化合物降解相聯繫。蛋白質以同源二聚體形式存在；現有資料未提供其胺基酸長度、結構域或其他序列特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000359429 ★ | 210,002,638–210,022,260 | 6 |
| ENST00000354506 | 210,002,565–210,027,529 | 5 |
| ENST00000452025 | 210,002,565–210,027,529 | 7 |
| ENST00000435437 | 210,002,565–210,019,961 | 6 |
| ENST00000867610 | 210,002,565–210,027,529 | 7 |
| ENST00000867611 | 210,002,565–210,027,529 | 6 |
| ENST00000924218 | 210,002,565–210,027,529 | 6 |
| ENST00000924219 | 210,002,565–210,027,529 | 7 |
| ENST00001008513 | 210,002,565–210,027,529 | 8 |
| ENST00001008514 | 210,002,565–210,027,529 | 7 |
| ENST00001048407 | 210,002,565–210,022,341 | 8 |
| ENST00001048409 | 210,002,565–210,022,256 | 7 |
顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPE 的產物催化 D-ribulose 5-phosphate 與 D-xylulose 5-phosphate 之間的可逆差向異構化。反應可朝任一方向進行，涉及兩種磷酸戊糖的立體構型轉換；資料所列的反應式亦以等號呈現兩者的互轉。此酵素作用於碳水化合物代謝相關底物，其註解將此功能歸入碳水化合物降解。
每個蛋白質次單元可結合一個二價金屬陽離子。資料指出，Fe(2+) 可支持酵素活性；Mn(2+)、Zn(2+) 與 Co(2+) 也可能支持活性，但這些金屬的描述帶有不確定性，不能視為同等程度的確證。來源未進一步說明不同金屬對反應效率或底物轉換方向的影響。
蛋白質以同源二聚體形式存在，而金屬結合量以每個次單元計。現有資料未交代二聚體組成與催化步驟之間的關係，也未提供細胞或生物體層級的實驗情境。因此可據以描述的功能重點，是可逆的磷酸戊糖差向異構化、每個次單元結合二價金屬的特性，以及其與碳水化合物降解的關聯；更廣泛的生理影響則無法由這些資料判定。
Promoter 與基因調控
>RPE ENST00000359429 GRCh38 chr2:210001638-210002738 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGCAGCATTCCCTCCTCCTGGATATGGGATAGAACCTTCTCTAGAAGAGGAGTTTTATAACCTACAGTTG AGATGGGTCAAATAATTTATGGCCAGTTTTTACACAGAAAGGTGGAGGAAAGTTAGAGTAATGCTTTTGG GTTTTGTGTCTGGCTTCAGGGAAAGGGGGTTCCGGTTTCAATGACTCTTCTTAGGGAAGATGGGCTCCAG TTTCTATGACCTGCCTCCTAGAATGAGACTGAGAAGAGAGCAGGGCAGGAAGTCAGAGAAACACTGTTGC GTCTGAGGCCTTCACTTTGGGCTATCATTTTCTGAGCCTCAACAGAGGGAAAAACAAAAAAGGTAAGGAG GAACTGCAAAGGCAGAAAAAGAGGGTAATATAATAATAACTACCATTTTGTACTGAGCACCAGGCATCCT GCTGGGCGCATTACCTGGCTTCACTCATTTAATACAACCCTAAAGCTGGGCACTGTCTTTACAGATGAGA AAACCGAAGTTAAGAAGTGATTTGCCAGGTCACCCAGCTAGTATCTGGCAGAGCCAGGGTTCCTCCAGCT CAAAAGAAGAGCTCTAGGAGAAATACGAGGAAGAAAGGTTTTTAATTGTTGTTTTAAAGGGCCAGCATAG GCGCTGGAGAGGAAAGAAAGGCATATGCAAAGGGTGGAGAAACAAAAAGTGATGTTAAGTCAAGAGCCGA GGAGAGGGAACTGCAGGAGAAGCAAAGTGAAAAAAGGTTAAGAAACGCCTTGAGTACTGCGAGGACGTTA AGATCCAAACAGCACAAGAAGGAAGGTCAAAATCAGGTGTACGAGGCCCGTGTGCCCCGCCCCGCCCCAG GCGGACGGCTGACAGCGCCCCACCCCAGGAGGAGGCGGGACTTCCTCACCGCAGAGTGGCTGCTTCCGGT AGAATCCGGAAGCCTGTACGGAGAAGGGGCGGGGCCAAAACTGCGCGCCCAATCGGGGTGACGCTCTAGC CTTGCCGGGGACTCGTGGGTAACTTGCTTTTGGGAGCCAGCGGTATGGCGTCGGGCTGCAAGATTGGCCC GTCCATCCTCAACAGCGACCTGGCCAATTTAGGGGCCGAGTGCCTCCGGAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPE_1 ↗ | 2:210,002,643 | 正股 | 210,002,594–210,002,653 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_B3JN99 · promoter · 210002075–210002667 · regulatory
· motif · 210002538–210002547 · motif
· motif · 210002548–210002561 · motif
· motif · 210002550–210002561 · motif
· motif · 210002550–210002561 · motif
· motif · 210002966–210002981 · motif
· motif · 210003041–210003052 · motif
· motif · 210003041–210003052 · motif
· motif · 210003043–210003052 · motif
· motif · 210003184–210003201 · motif
· motif · 210003193–210003201 · motif
· motif · 210003240–210003255 · motif
· motif · 210003388–210003401 · motif
· motif · 210003388–210003401 · motif
· motif · 210007039–210007054 · motif
· motif · 210007039–210007054 · motif
· motif · 210007040–210007054 · motif
· motif · 210007099–210007113 · motif
· motif · 210007445–210007457 · motif
· motif · 210007510–210007522 · motif
· motif · 210007512–210007534 · motif
· motif · 210007512–210007534 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：228 aa
RPE 產物屬於 Ribulose-phosphate 3-epimerase 家族。現有蛋白質特徵資料僅提供家族歸屬，未列出結構域、功能區域或序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- PLEKHF2Q9H8W4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
資料將 RPE 蛋白質描述為同源二聚體，表示其複合體由兩個相同的蛋白質次單元構成；未提供其他實體結合夥伴或額外的功能性互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPE 產物催化 D-ribulose 5-phosphate 與 D-xylulose 5-phosphate 之間可逆的差向異構化反應，反應可朝兩個方向進行。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the reversible epimerization of D-ribulose 5-phosphate to D-xylulose 5-phosphate PMID 20923965 ↗ |
| 分子活性 | D-ribulose 5-phosphate = D-xylulose 5-phosphate | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 每個蛋白質次單元可結合一個二價金屬陽離子。酵素在 Fe(2+) 存在時具有活性；Mn(2+)、Zn(2+) 與 Co(2+) 也可能支持活性，但此可能性並非確定描述。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Binds 1 divalent metal cation per subunit. Active with Fe(2+), and probably also with Mn(2+), Zn(2+) and Co(2+). |
| 分子活性 | RPE 產物的功能註解涉及碳水化合物降解；此項描述未提供特定底物、反應條件或更詳細的生物學情境。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AACTTGCTTTTGGGAGCCAGCGGTATGGCGTCGGGCTGCA40AGATTGGCCCGTCCATCCTCAACAGCGACCTGGCCAATTT80AGGGGCCGAGTGCCTCCGGATGCTAGACTCTGGGGCCGAT120TATCTGCACCTGGACGTAATGGACGGGCATTTTGTTCCCA160ACATCACCTTTGGTCACCCTGTGGTAGAAAGCCTTCGAAA200GCAGCTAGGCCAGGACCCTTTCTTTGACATGCACATGATG240GTGTCCAAGCCAGAACAGTGGGTAAAGCCAATGGCTGTAG280CAGGAGCCAATCAGTACACCTTTCATCTCGAGGCTACTGA320GAACCCAGGGGCTTTGATTAAAGACATTCGGGAGAATGGG360ATGAAGGTTGGCCTTGCCATCAAACCAGGAACCTCAGTTG400AGTATTTGGCACCATGGGCTAATCAGATAGATATGGCCTT440GGTTATGACAGTGGAACCGGGGTTTGGAGGGCAGAAATTC480ATGGAAGATATGATGCCAAAGGTTCACTGGTTGAGGACCC520AGTTCCCATCTTTGGATATAGAGGTCGATGGTGGAGTAGG560TCCTGACACTGTCCATAAATGTGCAGAGGCAGGAGCTAAC600ATGATTGTGTCTGGCAGTGCTATTATGAGGAGTGAAGACC640CCAGATCTGTGATCAATCTATTAAGAAATGTTTGCTCAGA680AGCTGCTCAGAAACGTTCTCTTGATCGGTGAAACCATAAG720GAGCCCAGTGTTCCTGTTCATGAAATCTCCCTTTTACTGG760AAAACAGGAATATTGACTACCAAATCACAATGCAATTGAA800GCCGTACTGCTTTTTTGAGCAGTTATTCATTCCAGTGATT840AAAACTGATTGTGCAGAATATTCTAAGAGGTCAGAAATTG880GTGTGTATAACTACATTTTTAGTGATGCAATTTATTGATT920AGTGAGTAAGATACTGTTTTTATTGAGAGATTTGATTTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。