基因總覽
ROS1（ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase）是位於第 6 號染色體的蛋白質編碼基因，其產物屬於蛋白激酶超家族中的酪胺酸蛋白激酶，並歸於 insulin receptor subfamily。ROS1 蛋白是單次跨膜的 I 型膜蛋白，具有大型胞外區、跨膜螺旋及胞質區；胞質端包含蛋白激酶結構域。這種受體構造使其能將細胞外刺激與細胞內訊號相連。ROS1 的基本角色與上皮細胞分化有關，並可在內源性配體 NELL2 刺激下啟動胞內訊號。其具體下游作用與相關生物學過程見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000368507 ★ | 117,287,353–117,425,942 | 44 |
| ENST00000368508 | 117,287,353–117,425,946 | 43 |
| ENST00000956999 | 117,287,353–117,425,946 | 44 |
| ENST00000957000 | 117,287,353–117,425,946 | 44 |
| ENST00001141812 | 117,287,353–117,425,946 | 44 |
| ENST00000403284 | 117,328,420–117,337,340 | 3 |
| ENST00001113552 | 117,350,688–117,425,946 | 28 |
| ENST00001113553 | 117,350,688–117,425,946 | 26 |
| ENST00001113554 | 117,350,688–117,425,946 | 27 |
| ENST00001113555 | 117,350,688–117,425,946 | 28 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ROS1 是受體酪胺酸激酶，能催化蛋白質上的酪胺酸殘基磷酸化；反應中 ATP 提供磷酸基，並生成 ADP 與 H⁺。這項酵素活性構成其胞外刺激轉為胞內訊號的分子基礎。來源指出，NELL2 是 ROS1 的內源性配體；在 NELL2 刺激下，ROS1 啟動胞內訊號，促進附睪上皮分化，並進一步支持精子成熟。這項附睪相關功能標註為依相似性推定，應視為具有證據限制的功能描述。
ROS1 也與近端附睪上皮的分化及區域化相關。除上述組織情境外，資料指出 ROS1 可能啟動多種與細胞分化、增殖、生長及存活相關的下游路徑，其中包括 PI3 kinase-mTOR signaling pathway。ROS1 可介導 PTPN11 磷酸化，而 PTPN11 被描述為此路徑的活化因子；因此，這項磷酸化關係提供了 ROS1 連結下游訊號的具體例子，但來源對路徑啟動使用「可能」的表述。
在其他訊號分支中，ROS1 可能磷酸化並活化轉錄因子 STAT3，以控制非貼附依賴性細胞生長。ROS1 也介導 VAV3 的磷酸化與活化；VAV3 是調節細胞形態的鳥嘌呤核苷酸交換因子。來源另列出 AKT1、MAPK1、MAPK3、IRS1 與 PLCG2，指出 ROS1 可能活化這些下游訊號蛋白。整體而言，資料將 ROS1 的功能連結至上皮分化及多種細胞行為，但各下游效應的確定程度並不相同，對於以「可能」描述的機制不宜視為已確立。
Promoter 與基因調控
>ROS1 ENST00000368507 GRCh38 chr6:117425842-117426942 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTGTACCCCATAAATACATACACCTACTATGTACCCACAAAAATTAAAAAACAAACAAACAAAAATCCA ATCAAAAGACGTTCAGCTCAAAACAAAACCTCATGCATGTGTTACTCATAGGGAGAACCTTATATCATTA AGAAAAGGTTAAGTTACATTTAGTATAATTTATTTAAGAAAACAAGGAGGTTGGCCTGTTGTACCGCGGT GGCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTTTGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATCGAGAC CACTCTGGGCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGC GTCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAG TGAGCTGGGATCATGCCACTGCACTGTAGCCTGGGCGACAGACAGAAATTCAGTCTCAAAGAAAGAGAGA GAGAGAGAGAGAGGAAGGAAGGCAGGCAGGAAGGAAGCTTGTACAATGTTTCCTTCTCAAAGCAGACACT TGAACATATCTTAGGTTTCTGGTAACTAGTTTCAGCTGTCTCGATAGACCTGATAAGTCAGTATTTTAGT TAATATGTAGTAAAGTTCTGAGAGTACTCTAACCAACTTCCTTGTTTTTAACTCTCTCCCAGGGTATTTG TCTATTAATTTCAGCTTTGTTTGCTCTTAAATTTAAAAATATGTATTTGGCTTCTGAGTTCTGTTTTCTC TCTCAGTTGCATTGCTTGATTTGGGTGCCTCTATTTTTCCAATAATTCTTTATTATAATAGTGCTACTGT TTGCTAAAGCATACGTGGTCAAAACCCAATTCCCTGCAGAGCTGAAAAGAGCTCAGAGAAGTAAGGTGGT GGACGACCCACTGAAATGTTCCAGTTTCAGACTGCATGTGTCACACCCTTGCTGAAATACAATTCGTTTT CTTTAATTTCCATGTGAAGTGCACTTCTAAGAACTAACCTTTAGTCACTGGGTGACTTTATGGGAGTAAA AGGAAGCTGTTATGAAATAGCTCTTATGGAACTGTTACAAGCTTTCAAGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ROS1_4 ↗ | 6:117,344,033 | 負股 | 117,344,023–117,344,082 |
| ROS1_1 ↗ | 6:117,403,182 | 負股 | 117,403,172–117,403,231 |
| ROS1_3 ↗ | 6:117,418,563 | 負股 | 117,418,553–117,418,612 |
| ROS1_6 ↗ | 6:117,425,671 | 負股 | 117,425,661–117,425,720 |
| ROS1_5 ↗ | 6:117,425,867 | 負股 | 117,425,857–117,425,916 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：2347 aa
ROS1 蛋白長 2,347 個胺基酸，N 端含訊號肽，胞外區延伸至跨膜螺旋之前；胞質端包含蛋白激酶結構域。胞外區註記有九個 Fibronectin type-III 結構域，胞質末端另有一段無序區域。家族分類上，ROS1 屬於蛋白激酶超家族的 Tyr protein kinase family，並歸於 Insulin receptor subfamily。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ROS1 位於細胞膜，屬於單次跨膜的 I 型膜蛋白。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- PTPN1P18031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPN6P29350 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ROS1 與 PTPN6 透過其 SH2 1 domain 直接互作，且此互作促進 ROS1 去磷酸化；此描述標註為依相似性推定。ROS1 也與 PTPN11 互作，並可能藉此活化 PI3 kinase-mTOR signaling pathway。ROS1 與 VAV3 則有持續性的互作，並介導 VAV3 磷酸化。
疾病與遺傳關聯
ROS1 相關染色體異常曾見於一個 glioblastoma multiforme 樣本。染色體內缺失 del(6)(q21q21) 可形成 GOPC-ROS1 嵌合蛋白；該蛋白位於 Golgi，並具有持續性受體酪胺酸激酶活性。非小細胞肺癌細胞中也發現 SLC34A2-ROS1 嵌合蛋白，並保留持續性激酶活性；同類細胞中另鑑定出 CD74-ROS1 嵌合蛋白。這些資料描述染色體異常與嵌合蛋白，不代表單獨證明 ROS1 對疾病的因果關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ROS1 是受體酪胺酸激酶，參與上皮細胞分化及近端附睪上皮區域化；NELL2 為其內源性配體。依相似性推定，NELL2 刺激 ROS1 後會啟動胞內訊號，促進附睪上皮分化及後續精子成熟。ROS1 可能活化與分化、增殖、生長和存活相關的下游路徑，包括 PI3 kinase-mTOR signaling pathway，並介導 PTPN11 磷酸化；也可能磷酸化並活化 STAT3，以控制非貼附依賴性細胞生長。ROS1 亦介導 VAV3 磷酸化與活化，並可能活化 AKT1、MAPK1、MAPK3、IRS1 和 PLCG2。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor tyrosine kinase (RTK) that plays a role in epithelial cell differentiation and regionalization of the proximal epididymal epithelium. NELL2 is an endogenous ligand for ROS1. Upon endogenous stimulation by NELL2, ROS1 activates the intracellular signaling pathway and triggers epididymal epithelial differentiation and subsequent sperm maturation (By similarity). May activate several downstream signaling pathways related to cell differentiation, proliferation, growth and survival including the PI3 kinase-mTOR signaling pathway. Mediates the phosphorylation of PTPN11, an activator of this pathway. May also phosphorylate and activate the transcription factor STAT3 to control anchorage-independent cell growth. Mediates the phosphorylation and the activation of VAV3, a guanine nucleotide exchange factor regulating cell morphology. May activate other downstream signaling proteins including AKT1, MAPK1, MAPK3, IRS1 and PLCG2 PMID 11094073 ↗ · PMID 16885344 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 11094073 ↗ · PMID 16885344 ↗ |
| 交互作用 | ROS1 透過 SH2 1 domain 與 PTPN6 直接互作，並促進 ROS1 去磷酸化；此互作描述依相似性推定。ROS1 也與 PTPN11 互作，可能活化 PI3 kinase-mTOR signaling pathway。此外，ROS1 與 VAV3 有持續性互作，並介導 VAV3 磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PTPN6 (via SH2 1 domain); the interaction is direct and promotes ROS1 dephosphorylation (By similarity). Interacts with PTPN11; may activate the PI3 kinase-mTOR signaling pathway. Interacts with VAV3; constitutive interaction mediating VAV3 phosphorylation PMID 11094073 ↗ · PMID 16885344 ↗ |
| 細胞定位 | ROS1 是位於細胞膜的單次跨膜 I 型膜蛋白。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | 一個 glioblastoma multiforme 樣本中發現涉及 ROS1 的染色體異常。染色體內缺失 del(6)(q21q21) 形成位於 Golgi 且具持續性受體酪胺酸激酶活性的 GOPC-ROS1 嵌合蛋白。非小細胞肺癌細胞中也有保留持續性激酶活性的 SLC34A2-ROS1 嵌合蛋白，並另鑑定出 CD74-ROS1 嵌合蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving ROS1 is found in a glioblastoma multiforme sample. An intra-chromosomal deletion del(6)(q21q21) is responsible for the formation of GOPC-ROS1 chimeric protein which is localized to the Golgi and has a constitutive receptor tyrosine kinase activity. A SLC34A2-ROS1 chimeric protein produced in non-small cell lung cancer cells also retains a constitutive kinase activity. A third type of chimeric protein CD74-ROS1 was also identified in those cells PMID 12661006 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCACTTCTAAGAACTAACCTTTAGTCACTGGGTGACTTTA40TGGGAGTAAAAGGAAGCTGTTATGAAATAGCTCTTATGGA80ACTGTTACAAGCTTTCAAGCATTCAAAGGTCTAAATGAAA120AAGGCTAAGTATTATTTCAAAAGGCAAGTATATCCTAATA160TAGCAAAACAAACAAAGCAAAATCCATCAGCTACTCCTCC200AATTGAAGTGATGAAGCCCAAATAATTCATATAGCAAAAT240GGAGAAAATTAGACCGGCCATCTAAAAATCTGCCATTGGT280GAAGTGATGAAGAACATTTACTGTCTTATTCCGAAGCTTG320TCAATTTTGCAACTCTTGGCTGCCTATGGATTTCTGTGGT360GCAGTGTACAGTTTTAAATAGCTGCCTAAAGTCGTGTGTA400ACTAATCTGGGCCAGCAGCTTGACCTTGGCACACCACATA440ATCTGAGTGAACCGTGTATCCAAGGATGTCACTTTTGGAA480CTCTGTAGATCAGAAAAACTGTGCTTTAAAGTGTAATGAT520ACTTATGCCACCGTTTGTGAGCGGGAGTCGTGTGAGGTTG560GCTGTAGCAGCGCGGAAGGTGCATATGAAGAGGAAGTACT600GGAAAATGCAGACCTACCAACTGCTCCCTTTGCTTCTTCC640ATTGGAAGCCACAATATGACATTACGATGGAAATCTGCAA680ACTTCTCTGGAGTAAAATACATCATTCAGTGGAAATATGC720ACAACTTCTGGGAAGCTGGACTTATACTAAGACTGTGTCC760AGACCGTCCTATGTGGTCAAGCCCCTGCACCCCTTCACTG800AGTACATTTTCCGAGTGGTTTGGATCTTCACAGCGCAGCT840GCAGCTCTACTCCCCTCCAAGTCCCAGTTACAGGACTCAT880CCTCATGGAGTTCCTGAAACTGCACCTTTGATTAGGAATA920TTGAGAGCTCAAGTCCCGACACTGTGGAAGTCAGCTGGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。