基因總覽
ROCK2(Rho associated coiled-coil containing protein kinase 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 protein kinase 超家族中的 AGC Ser/Thr protein kinase。這種蛋白質具有多個功能區域:N 端包含 protein kinase domain 與 AGC-kinase C-terminal domain,後段則有 REM-1、RhoBD 和 PH domains,另含 Phorbol-ester/DAG-type zinc finger。這些結構註解呈現其多區域的蛋白質架構;來源亦標示部分區段具有無序特性。ROCK2 的主要角色與細胞骨架及細胞極性的調節相關,並涉及平滑肌收縮等生物學活動。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000315872 ★ | 11,179,759–11,344,636 | 33 |
| ENST00000697790 | 11,179,759–11,215,086 | 20 |
| ENST00000697752 | 11,179,759–11,344,989 | 34 |
| ENST00000401753 | 11,179,759–11,234,670 | 29 |
| ENST00000944889 | 11,179,759–11,344,989 | 34 |
| ENST00000944890 | 11,179,759–11,344,989 | 33 |
| ENST00000944891 | 11,179,759–11,344,989 | 32 |
| ENST00001056340 | 11,179,759–11,344,989 | 31 |
| ENST00001125731 | 11,179,759–11,344,701 | 33 |
| ENST00001145037 | 11,179,759–11,344,989 | 33 |
| ENST00001056339 | 11,179,778–11,344,989 | 34 |
| ENST00001056341 | 11,181,632–11,344,989 | 35 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ROCK2 是調節 actin cytoskeleton 與細胞極性的 protein kinase。它可藉由磷酸化多種蛋白質,參與平滑肌收縮、actin cytoskeleton 組織,以及 stress fiber 和 focal adhesion 的形成;來源列出的受質包括 ADD1、BRCA2、CNN1、EZR、DPYSL2、EP300、MSN、MYL9/MLC2、NPM1、RDX、PPP1R12A 和 VIM。ROCK2 也會磷酸化 SORL1 與 IRF4。這些作用與細胞黏附、細胞移動及 neurite retraction 有關。
在血管與肌肉相關過程中,ROCK2 是 VEGF 誘導之 angiogenic endothelial cell activation 的負向調節因子;在 myogenic differentiation 期間,則正向調節 p42/MAPK1-p44/MAPK3 與 p90RSK/RPS6KA1 的活化。它也參與 centrosome duplication 的適時啟動。於角質細胞中,ROCK2 抑制 terminal differentiation;來源另指出,它可能透過組織 actomyosin bundles,調節眼瞼及腹側體壁閉合。
在神經與血管功能方面,ROCK2 對 hippocampus 中 spine 和 synaptic properties 的調節具有重要作用。它亦透過調節 myosin light chain phosphorylation,參與形成 aortic myofilament Ca(2+) sensitivity 與血管收縮性的晝夜節律。這些功能描述涵蓋細胞骨架、分化、發育相關閉合,以及組織層級的收縮調節;來源未進一步說明各作用之間的因果關係。
Promoter 與基因調控
>ROCK2 ENST00000315872 GRCh38 chr2:11344536-11345636 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGGACAACTGGGCCCATTCCCAGGTTTTGGTCATCACGAACATTGTGAATAGCCCTGCTGTTAACATCT TTCTGCAAGTTCTCCCCCTTCTTCGCCCTTTGGATCATTTCCTTGGAAATGTACTTCCTTAAATGGGTTT ACTGGGTCAAAGGGGCTCTATGAACGGTTTTATAGCTCTTGGCACATAATTTTCGGATTGCGCCCTGGGC GGATCTAAGCGATGGCACCGGCCGCCGAGAGGGCAGGAATGCGGCGGAACGGTCCCGATAACCACCCCTC TTCCGCCCCCCAAAAGGAGAAGACCCCGCGAAGGCCTGCGGCTGGAAAGCCTTTTTCCGGTGCTCTCCCG TTCTCTTGAAGTGGTTAGTGTCTAAGCCGGGCAGAAACGCTTTCAGGATCCCAGGCCCTCCTGCCCCAGG ACTAGGATTCCACCCGCCTCCGCTAATTCGGAATCCCAGACACCCAGGGCCCCCTCTCAGGCTCGCCTCG AAACCCCCGGCCCTGCGGCCCCTCGCGGGCGCCGAGCTCGGTCGCTATTATTTGGGCGCGGGTGAGGCGA GGCCCGCATAGCTGCGCGCTGAGTCAGCGGGGGCCGCGGCGGGGGGCGCGGCCGGGCTCCCCCCCAGCGC ACGGTGCGCTGGGCCCGGCGTCTGGGGTTCCGCCTCGGGGCCGCGGGGTAGTCCGCGGGGTCCGGCGGGA GGGGCAGGGGGCGCGCGGAAGGACCCGGCCTGGGTGCGTCTCCCCTCCCCCAGCAGGAGCTCGGCCGTGA CCGCGCGCCCGGCTATTCGCCTCAGAGAACCTCGCCAGGGGGAGGAGGCGAGGGCGGGCGAGGAAGGGGC GCAGAGGAGAAAGCGGAGCGGGACAGACGCAGGAAGGGAAAGAAAGGGAGGAAGCGCGGTGCGCGGGGCG GGGCGGGGCGGAGCGCGCGCAGGGCCGGCGGGGACGCGCGCCGGCGGCTGCGGGCGGAGGGGCTTGTGGG TAGCGGCGGCGCGCGGCCGGAGACGGGCGGCCGCGCGGGAGTGTGTGCGCCGGGAGCTGGCTGAGGGACT GCAAGGCGGCCGGCGGCGACCATGGCAGCGGGCCGGCGGCGGCCGTAGTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ROCK2_2 ↗ | 2:11,227,321 | 負股 | 11,227,311–11,227,370 |
| ROCK2_1 ↗ | 2:11,344,636 | 負股 | 11,344,626–11,344,685 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_DK79 · enhancer · 11342325–11344625 · regulatory
ENSR2_54N35R · CTCF_binding_site · 11344046–11344067 · regulatory
ENSR2_96HKM · promoter · 11344626–11345055 · regulatory
ENSR2_C35DP · enhancer · 11345056–11346460 · regulatory
ENSR2_54N3BP · CTCF_binding_site · 11345115–11345136 · regulatory
· motif · 11339695–11339706 · motif
· motif · 11340808–11340821 · motif
· motif · 11342581–11342594 · motif
· motif · 11342581–11342596 · motif
· motif · 11343133–11343148 · motif
· motif · 11343155–11343166 · motif
· motif · 11343191–11343200 · motif
· motif · 11343191–11343200 · motif
· motif · 11343325–11343338 · motif
· motif · 11343325–11343339 · motif
· motif · 11343408–11343417 · motif
· motif · 11343866–11343877 · motif
· motif · 11343868–11343877 · motif
· motif · 11343950–11343962 · motif
· motif · 11344048–11344064 · motif
· motif · 11344648–11344663 · motif
· motif · 11344865–11344881 · motif
· motif · 11345047–11345061 · motif
· motif · 11345047–11345061 · motif
· motif · 11345117–11345133 · motif
· motif · 11345384–11345393 · motif
· motif · 11345639–11345648 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1388 aa
ROCK2 蛋白長 1,388 個胺基酸,包含位於 92–354 的 Protein kinase domain、357–425 的 AGC-kinase C-terminal domain、497–573 的 REM-1 domain、979–1047 的 RhoBD,以及 1150–1349 的 PH domain;PH domain 範圍內另註有 Phorbol-ester/DAG-type zinc finger。來源亦標示 N 端 1–27 與 C 端 1345–1388 為無序區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ROCK2 被標示位於細胞質、細胞核與細胞膜,並可作為周邊膜蛋白;細胞質中的定位紀錄另包括 microtubule organizing center 與 centrosome。 來源也記載 ROCK2 與 actin microfilaments 及 plasma membrane 相關,但未提供不同條件下定位變化的說明。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- JAK2O60674 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- STAT3P40763 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ROCK2 被註記可形成同源二聚體,並與 IRS1、RAF1、RHOA(活化型)、RHOB、RHOC、PPP1R12A、EP300、CHORDC1、BRCA2、NPM1、SORL1、PJVK 及 FOXM1 isoform 5(FOXM1D)互作。部分關係標示為 By similarity;其中 NPM1 互作可增強 ROCK2 活性,而 FOXM1D 互作可促進 ROCK2 活化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ROCK2 是 actin cytoskeleton 與細胞極性的關鍵調節激酶,透過磷酸化多種蛋白質參與平滑肌收縮、細胞骨架組織、stress fiber 與 focal adhesion 形成,以及 neurite retraction、細胞黏附和移動。它也磷酸化 SORL1、IRF4;抑制 VEGF 誘導的血管新生內皮細胞活化,並參與肌肉分化、中心體複製、角質細胞分化、眼瞼與腹側體壁閉合、海馬突觸特性及主動脈收縮節律調節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Protein kinase which is a key regulator of actin cytoskeleton and cell polarity. Involved in regulation of smooth muscle contraction, actin cytoskeleton organization, stress fiber and focal adhesion formation, neurite retraction, cell adhesion and motility via phosphorylation of ADD1, BRCA2, CNN1, EZR, DPYSL2, EP300, MSN, MYL9/MLC2, NPM1, RDX, PPP1R12A and VIM. Phosphorylates SORL1 and IRF4. Acts as a negative regulator of VEGF-induced angiogenic endothelial cell activation. Positively regulates the activation of p42/MAPK1-p44/MAPK3 and of p90RSK/RPS6KA1 during myogenic differentiation. Plays an important role in the timely initiation of centrosome duplication. Inhibits keratinocyte terminal differentiation. May regulate closure of the eyelids and ventral body wall through organization of actomyosin bundles. Plays a critical role in the regulation of spine and synaptic properties in the hippocampus. Plays an important role in generating the circadian rhythm of the aortic myofilament Ca(2+) sensitivity and vascular contractility by modulating the myosin light chain phosphorylation PMID 10579722 ↗ · PMID 15699075 ↗ · PMID 16574662 ↗ · PMID 17015463 ↗ · PMID 19131646 ↗ · PMID 19997641 ↗ · PMID 21084279 ↗ · PMID 21147781 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | ROCK2 可形成同源二聚體,並與 IRS1、RAF1、活化型 RHOA、RHOB、RHOC、PPP1R12A、EP300、CHORDC1、BRCA2、NPM1、SORL1、PJVK 及 FOXM1 isoform 5(FOXM1D)互作。依相似性推定的關係包括同源二聚體、IRS1、RAF1、RHOA、RHOB、RHOC 與 PJVK;NPM1 互作增強 ROCK2 活性,FOXM1D 互作則促進其活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer (By similarity). Interacts with IRS1 (By similarity). Interacts with RAF1 (By similarity). Interacts with RHOA (activated by GTP), RHOB and RHOC (By similarity). Interacts with PPP1R12A. Interacts with EP300. Interacts with CHORDC1. Interacts with BRCA2. Interacts with NPM1; this interaction enhances ROCK2 activity. Interacts with SORL1. Interacts with PJVK (By similarity). Interacts with FOXM1 isoform 5 (FOXM1D); the interaction promotes ROCK2 activation PMID 10579722 ↗ · PMID 16574662 ↗ · PMID 17015463 ↗ · PMID 19131646 ↗ · PMID 20230755 ↗ · PMID 21084279 ↗ · PMID 21147781 ↗ · PMID 27399334 ↗ |
| 細胞定位 | ROCK2 的定位紀錄包括細胞質、細胞膜與細胞核,並可作為周邊膜蛋白;細胞質內亦記載其位於細胞骨架、microtubule organizing center 與 centrosome。另有紀錄指出 ROCK2 與 actin microfilaments 及 plasma membrane 相關,來源未提供定位變化的條件或動態。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm; Cell membrane / Peripheral membrane protein; Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasmic, and associated with actin microfilaments and the plasma membrane |
核酸與蛋白質序列
AGACGGGCGGCCGCGCGGGAGTGTGTGCGCCGGGAGCTGG40CTGAGGGACTGCAAGGCGGCCGGCGGCGACCATGGCAGCG80GGCCGGCGGCGGCCGTAGTGGCCCAGGCCTGGGCTTCAGC120CTCCCGGGGCCCCAGAGGGCGGGGCGGTCCGGGCCGCGGC160GGTGGCGGCGCCACTTCCCTGCTCCCGCCCGAGGACTCCT200GCGGGCACTCGCTGAGGACCAGCGGACCGGCGGCGCGAAT240CTGACTGAGGGGCGGGGACGCCGTCTGTTCCCCGCCGCTC280CCGGCAGGGCCGGGCCGGGCTGGGCCGGGCTGGGCCGGGC320GGGCCCCTGGGAGCAGCCCCCAGGCGGGGGACCGCCTTGG360AGACCCGAAGCCGGAGCTAGAGGCAGGCGGTGGGCCCGGG400TGGAGTCCCGGCCGGAGCTGGTGGTTCGGGGGCGGTGCTA440GGCCCCGAGGCTGCGGGACCTGAGCGCGAGGAGCCTGAGT480GCGGGTCCAGCGGTGGCGGCATGAGCCGGCCCCCGCCGAC520GGGGAAAATGCCCGGCGCCCCCGAGACCGCGCCGGGGGAC560GGGGCAGGCGCGAGCCGCCAGAGGAAGCTGGAGGCGCTGA600TCCGAGACCCTCGCTCCCCCATCAACGTGGAGAGCTTGCT640GGATGGCTTAAATTCCTTGGTCCTTGATTTAGATTTTCCT680GCTTTGAGGAAAAACAAGAACATAGATAATTTCTTAAATA720GATATGAGAAAATTGTGAAAAAAATCAGAGGTCTACAGAT760GAAGGCAGAAGACTATGATGTTGTAAAAGTTATTGGAAGA800GGTGCTTTTGGTGAAGTGCAGTTGGTTCGTCACAAGGCAT840CGCAGAAGGTTTATGCTATGAAGCTTCTTAGTAAGTTTGA880AATGATAAAAAGATCAGATTCTGCCTTTTTTTGGGAAGAA920AGAGATATTATGGCCTTTGCCAATAGCCCCTGGGTGGTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。