基因總覽
ROBO1（roundabout guidance receptor 1）是蛋白質編碼基因，產生屬於 ROBO family、同時歸入免疫球蛋白超家族的膜受體。其蛋白質長 1,651 個胺基酸，具有單次穿膜架構：大型胞外區包含五個 Ig-like C2-type 結構域及三個 Fibronectin type-III 結構域，跨膜區連接至細胞質區。這種胞外與細胞內分區，使 ROBO1 能作為細胞接收分子導引訊號的受體；其主要角色與細胞移動及神經發育時的軸突導引相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000464233 ★ | 78,597,239–79,767,998 | 31 |
| ENST00000495273 | 78,595,957–79,019,015 | 29 |
| ENST00000467549 | 78,595,957–79,018,544 | 29 |
| ENST00000436010 | 78,595,957–79,019,459 | 29 |
| ENST00000618846 | 78,595,957–79,019,459 | 29 |
| ENST00001144589 | 78,595,957–79,768,025 | 31 |
| ENST00000472273 | 78,627,407–78,634,580 | 4 |
| ENST00000495961 | 78,667,883–78,670,242 | 4 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ROBO1 是 SLIT1 與 SLIT2 的受體，能介導細胞對分子導引訊號的反應，並參與細胞移動。在神經發育期間，這項作用涉及軸突於神經管腹側中線的導航，以及軸突向不同區域投射，讓細胞能依導引訊號調整移動方向。
ROBO1 也與軸突吸引訊號的調節有關。它和 FLRT3 的胞內區域互作，可介導軸突朝向表現 NTN1 的細胞移動。在軸突生長錐中，SLIT2 對 NTN1 吸引作用的抑制，可能需要 ROBO1-DCC 複合體形成；此一機制為相似性推論，並非來源所述的確定結論。
在細胞移動調節方面，ROBO1 與 MYO9B 互作，並抑制 MYO9B 對 RHOA GTPase 活性的刺激。因此，活化且結合 GTP 的 RHOA 水準會增加。此結果連結 ROBO1 與細胞內 RHOA 活性調控，但來源未進一步說明其在不同細胞或生理情境中的具體效果。
此外，ROBO1 可能是肺部發育所需因子；這項作用依據相似性推論，應視為可能的功能，而非已確立的結論。
Promoter 與基因調控
>ROBO1 ENST00000464233 GRCh38 chr3:79767898-79768998 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCTTTTCCTCCACAAAATTAAAGGTCAAAGAAAACAGCATGTTTAAGACTTCAAATTAATATATATTAA GATTCAGCATTTAATATTCTAATTCTTAAAATAACTGGCTTTACCGATGATGAACTAAAGTGATTTTGCA CACTATTACAATATTTCAAATTGCTAGTCACCACAGGTCGGCCTCACTTTAAATCTCCTTGTTATGCCAA TTTGCATTACTAATGAACTTGCTAAGAGAGAAACTGTAAAAAGATAATGTAGCAATTAATAGTAAATGCT TGACATACTGTGACATTATAATACCTTTATGTTGATTTATATCTTTATGTCAATATTTACAAGGAAAATA TTTTTGAATTTCTAATTTTGCGAAGTAAAAATGATGCTGACGCCATTGTCATTGATGGAATTTTTTCTGT AGCATTTGACTAATATAACCCGTGTTTTATAATTGGTAGACTCATATTTTAGCTTCTACTATCTACTACC CATGTAAGGTATTTTATTTGTAGTAGCTATGAATTGTAAATACAATTGGGTGTTGTGTGTACCTACGTGA AGTGCAGAAGTATTTGATTATATAAAATTTCCTGGATTTATATGAGAATAATGCATAATAGAGAGCAAAA GAGGGTTTTCCTGCCAAAAGTGTCTGTGTGAATTTTCCTTCGAAAATGTTCTTTTAAAATCCTTTGTATG ATCAAAGCCACTCCACACAGACAATTAAAAGCAGCTATGGAATGATAGATCACATGACAGGAGTTAAATG TAAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTCCCCCCTCGGTTAAACATCGCAGCAGGCATTACAATACCAGAGG TAACGAATCAATTAAATCCATTTTCCCCTCGGCGTCTCCAAAGCTGCGTGCCTAGTGTTGCTGTGTAGTT TAGACCGGAGCAGTAGGACCCAGGGGCCTCCGCAGCCACCAATAGAAGCGCACACTTGGACCTATTTGTA TGCAATGCCTTCTGCTCTGCGCATTAATAGTAATACAGATAACGGGTTTGAAAGAATTCTCTACTGAAGA AGGATTGAATTTTTCCAGGGTGCTGATACAGAGAAGAAACCCGACTTCACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ROBO1_1 ↗ | 3:79,019,017 | 負股 | 79,019,007–79,019,066 |
| ROBO1_2 ↗ | 3:79,767,993 | 負股 | 79,767,983–79,768,042 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_5NQKG3 · CTCF_binding_site · 79766861–79766882 · regulatory
ENSR3_BKSFG · enhancer · 79767168–79767987 · regulatory
ENSR3_5NQKKR · CTCF_binding_site · 79767662–79767683 · regulatory
ENSR3_84CBP4 · promoter · 79767988–79768195 · regulatory
· motif · 79766863–79766879 · motif
· motif · 79767664–79767680 · motif
· motif · 79768232–79768245 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1651 aa
ROBO1 蛋白質含 1,651 個胺基酸，N 端訊號肽位於第 1–25 位，胞外區為第 26–897 位；第 898–918 位是螺旋型跨膜區，之後為細胞質區。胞外區具有五個 Ig-like C2-type 與三個 Fibronectin type-III 結構域。序列註解另標示多段無序區，包括細胞質端多個區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ROBO1 是單次穿膜蛋白，位於細胞膜，也見於軸突細胞突起；在丘腦神經元的生長錐曾偵測到 ROBO1。 PRRG4 可阻止 ROBO1 到達細胞表面，兩者則在細胞核附近的內質網／高基氏體區域共定位；此調控描述為相似性推論。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, axon。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- SLIT2O94813 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SRGAP2O75044 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- USP33Q8TEY7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ROBO1 可形成同源二聚體，二聚化由胞外區介導，且不依賴 SLIT 配體結合。來源另記載其與 SLIT1、SLIT2、FLRT3 及 MYO9B 互作；其中 ROBO1 與 MYO9B 的互作涉及 MYO9B 的 Rho-GAP 結構域。這些互作紀錄不等同於所有對象共同組成同一複合體。
疾病與遺傳關聯
ROBO1 相關變異與多種疾病有關，但證據對因果程度的描述不同。Neurooculorenal syndrome 為自體隱性疾病，來源指出由影響 ROBO1 的變異所致；表現可包括先天腎臟異常、神經發育缺陷、智能障礙、心臟缺陷及眼部異常，部分胎兒病例有腎缺如與嚴重結構性腦異常。先天性自體隱性眼球震顫 8 型則是可能由 ROBO1 變異造成，患者可有雙側水平眼球震顫，且無其他神經症狀、腦部影像正常。Pituitary hormone deficiency, combined or isolated, 8 為自體顯性疾病，也僅被描述為可能與 ROBO1 變異相關；特徵包括生長激素缺乏所致身材矮小、其他腦下垂體荷爾蒙缺乏及腦下垂體異常。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ROBO1 是 SLIT1 與 SLIT2 的受體，介導細胞對分子導引訊號的反應，並參與細胞移動，包括神經發育期間軸突在神經管腹側中線的導航及向不同區域投射。與 FLRT3 胞內區域互作可介導軸突朝向表現 NTN1 的細胞；SLIT2 抑制 NTN1 吸引作用可能需要 ROBO1-DCC 複合體。ROBO1 透過與 MYO9B 互作抑制其刺激 RHOA GTPase 活性的作用，使活化、結合 GTP 的 RHOA 增加；也可能參與肺部發育。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for SLIT1 and SLIT2 that mediates cellular responses to molecular guidance cues in cellular migration, including axonal navigation at the ventral midline of the neural tube and projection of axons to different regions during neuronal development. Interaction with the intracellular domain of FLRT3 mediates axon attraction towards cells expressing NTN1. In axon growth cones, the silencing of the attractive effect of NTN1 by SLIT2 may require the formation of a ROBO1-DCC complex (By similarity). Plays a role in the regulation of cell migration via its interaction with MYO9B; inhibits MYO9B-mediated stimulation of RHOA GTPase activity, and thereby leads to increased levels of active, GTP-bound RHOA. May be required for lung development (By similarity) PMID 10102268 ↗ · PMID 24560577 ↗ · PMID 26529257 ↗ |
| 交互作用 | ROBO1 可形成同源二聚體，二聚化由胞外區介導，且不受 SLIT 配體結合影響。它與 SLIT1、SLIT2、FLRT3 及 MYO9B 互作；其中與 MYO9B 的互作經由其 Rho-GAP 結構域。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Dimerization is mediated by the extracellular domain and is independent of SLIT liganding. Interacts with SLIT1 (By similarity). Interacts with SLIT2. Interacts with FLRT3. Interacts with MYO9B (via Rho-GAP domain) PMID 10102268 ↗ · PMID 11404413 ↗ · PMID 17848514 ↗ · PMID 24560577 ↗ · PMID 24673457 ↗ · PMID 26529257 ↗ |
| 細胞定位 | ROBO1 是單次穿膜蛋白，定位於細胞膜、軸突細胞突起及內質網－高基氏體中間區室膜；在丘腦神經元的生長錐曾被偵測到。PRRG4 會阻止 ROBO1 到達細胞表面，兩者在細胞核附近的內質網／高基氏體區域共定位；此調控敘述為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Cell projection, axon; Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane / Single-pass membrane protein; Detected at growth cones in thalamus neurons. Detected at growth cones in thalamus neurons (By similarity). PRRG4 prevents cell surface location and both colocalize in the Endoplasmic reticulum/Golgi adjacent to the cell nucleus (By similarity) PMID 24560577 ↗ |
| 疾病關聯 | Neurooculorenal syndrome（NORS）是自體隱性疾病，臨床表現不一，可包括先天腎臟異常、神經發育缺陷、智能障礙、心臟缺陷及眼部異常。部分患者在子宮內即有腎缺如與嚴重結構性腦異常，且病況與生命不相容。來源指出此病由影響 ROBO1 的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neurooculorenal syndrome NORS An autosomal recessive syndrome characterized by variable clinical features including congenital renal anomalies, neurodevelopmental defects, intellectual impairment, cardiac defects, and ocular anomalies. Some affected individuals present in utero with renal agenesis and structural brain abnormalities incompatible with life. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620305 PMID 29194579 ↗ · PMID 35227688 ↗ |
| 疾病關聯 | 先天性自體隱性眼球震顫 8 型（NYS8）可能由影響 ROBO1 的變異造成。眼球震顫是出生時或出生後前三個月出現的共軛、自發且不自主眼球擺動；患者可有輕度視力下降、斜視、散光，偶爾伴隨點頭。NYS8 患者呈雙側水平眼球震顫，沒有其他神經徵象或症狀，腦部影像正常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nystagmus 8, congenital, autosomal recessive NYS8 A form of nystagmus, a condition defined as conjugated, spontaneous and involuntary ocular oscillations that appear at birth or during the first three months of life. Other associated features may include mildly decreased visual acuity, strabismus, astigmatism, and occasionally head nodding. NYS8 patients manifest bilateral horizontal nystagmus in the absence of other neurologic signs or symptoms. Brain imaging is normal. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 257400 PMID 35348658 ↗ |
| 疾病關聯 | Pituitary hormone deficiency, combined or isolated, 8（CPHD8）是自體顯性疾病，特徵包括生長激素缺乏造成身材矮小、程度不一的其他腦下垂體荷爾蒙缺乏及腦下垂體異常。許多患者有腦下垂體柄中斷症候群，表現為腦下垂體功能不足、腦下垂體柄變薄或中斷、前葉發育不全及後葉異位。此病可能由影響 ROBO1 的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pituitary hormone deficiency, combined or isolated, 8 CPHD8 An autosomal dominant disorder characterized by short stature due to growth hormone deficiency, variable deficiencies of other pituitary hormones, and pituitary abnormalities. Many CPHD8 patients present with pituitary stalk interruption syndrome that is characterized by pituitary gland insufficiency, thin or discontinuous pituitary stalk, anterior pituitary hypoplasia, and ectopic positioning of the posterior pituitary gland. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620303 PMID 28402530 ↗ · PMID 31448886 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCATTAATAGTAATACAGATAACGGGTTTGAAAGAATTCT40CTACTGAAGAAGGATTGAATTTTTCCAGGGTGCTGATACA80GAGAAGAAACCCGACTTCACTCTCTCCCTATTTCCCCACT120CTTAGGTTTAAAAGTCTGTCACCTTTCGCTTGGTTTAAAC160TCGGAAAGGTCTCAGTGCACAGCAAAGTTGCAGGGCTGCG200TCTGCACTACGGAGCCTCTAGATTGCTGAAAACAGTCTTA240TGGAAGGATAACACATTGTCTGTCACTGGCTGGTTGTAAT280GCAAGGAAGGGACAAAGATGAAATGGAAACATGTTCCTTT320TTTGGTCATGATATCACTCCTCAGCTTATCCCCAAATCAC360CTGTTTCTGGCCCAGCTTATTCCAGACCCTGAAGATGTAG400AGAGGGGGAACGACCACGGGACGCCAATCCCCACCTCTGA440TAACGATGACAATTCGCTGGGCTATACAGGCTCCCGTCTT480CGTCAGGAAGATTTTCCACCTCGCATTGTTGAACACCCTT520CAGACCTGATTGTCTCAAAAGGAGAACCTGCAACTTTGAA560CTGCAAAGCTGAAGGCCGCCCCACACCCACTATTGAATGG600TACAAAGGGGGAGAGAGAGTGGAGACAGACAAAGATGACC640CTCGCTCACACCGAATGTTGCTGCCGAGTGGATCTTTATT680TTTCTTACGTATAGTACATGGACGGAAAAGTAGACCTGAT720GAAGGAGTCTATGTCTGTGTAGCAAGGAATTACCTTGGAG760AGGCTGTGAGCCACAATGCATCGCTGGAAGTAGCCATACT800TCGGGATGACTTCAGACAAAACCCTTCGGATGTCATGGTT840GCAGTAGGAGAGCCTGCAGTAATGGAATGCCAACCTCCAC880GAGGCCATCCTGAGCCCACCATTTCATGGAAGAAAGATGG920CTCTCCACTGGATGATAAAGATGAAAGAATAACTATACGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。